论文资料：利用DNA分析技术和形态鉴别确定拖鞋龙虾叶状幼体的最后阶段.doc

1. 利用DNA分析技术和形态鉴别确定拖鞋龙虾叶状幼体的最后阶段=Scyllarus arctus (Crustacea: Decapoda: Scyllaridae) final stage phyllosoma identified by DNA analysis, with morphological description 关键词DNA，条码技术，无螯下目， 蝉虾科， 拖鞋龙虾本实验对采自西地中海的蝉虾科拖鞋龙虾进行其线粒体16S rDNA的核苷酸序列分析，确定了该物种叶状幼体的最后阶段，并对该阶段的形态和其他特征进行了描述。我们发现拖鞋龙虾的叶状幼体与美洲蝉虾Scyllarus depressus及澳洲的Scyllarus sp.在亲缘关系上更为接近。（/action/displayAbstract?fromPage=online&aid=7577712&fulltextType=RA&fileId=S0025315410000287，2010）2. 蜕皮动物高血糖激素家族的分子进化=Molecular evolution of the crustacean hyperglycemic hormone family in ecdysozoans 关键词甲壳动物，高血糖激素，分子进化甲壳动物高血糖激素家族是甲壳动物特有的神经多肽激素家族，协同调控者甲壳动物的生长、繁殖与蜕皮等生理生化过程。本研究利用分子克隆技术构建腮足动物Daphnia magna和弹尾目昆虫Folsomia candida 编码CHH多肽的基因序列并导入数据库中进行比对，提出了泛甲壳动物的系统发生假说：蜕皮动物的CHH家族基因起源于含两个外显子的基因；节肢动物CHH基因则起源于含三个外显子的基因；软甲纲动物CHH基因进化包含多次复制、插入及缺失。（/1471-2148/10/62，2010）3. 盐度对雌性长臂淡水虾生殖周期的影响= Effects of Salinity on the Reproductive Cycle of Female Freshwater Shrimp, Palaemonetes argentines 关键词淡水入侵，卵巢周期，淡水长臂虾，种群存活，繁殖可塑性 南美洲大陆的淡水长臂虾可以在很广的盐度范围内进行生存繁殖。本研究对来自两种水域的雌性淡水虾进行不同盐度（1,15,25ppt）下的生存与繁殖测试，发现两种淡水虾的生存率都很高；而盐度越高，虾的卵巢发育越晚，且卵巢成熟需时越长。当环境盐度为25ppt时Vivorat Creek水域的淡水虾出现了卵巢重吸收现象，这可能并非盐离子浓度引起的。以上研究结果表明该种虾可能出于淡水入侵的进化早期。（/doi/abs/10.1651/09-3174.1，2010）4. 三叶真蟹的氨基酸代谢研究=Amino Acid Analysis in the Shore Crab Carcinus maenas (Decapoda: Brachyura) 关键词氨基酸，三叶真蟹，短尾亚目，蛋白质代谢本文首次介绍了蟹类氨基酸流量模型的构建。通过对三叶真蟹喂食不同的饲料（冷冻的紫贻贝和新鲜的鲑鱼肉），来研究不同饲料与蟹类蛋白质转化和氨基酸代谢的关系。结果表明正常喂养条件下蟹类每天摄取的氨基酸是其体内游离氨基酸的7倍，蛋白质合成所需氨基酸和降解释放氨基酸分别是体内游离氨基酸的4倍和2倍。尽管如此，蟹类摄取氨基酸并转化为蛋白质的效率仍低于其他十足目甲壳动物。（/doi/abs/10.1651/09-3258.1，2010）5. 文莱水域野生斑节对虾的虾类病毒流行性研究=Prevalence of shrimp viruses in wild Penaeus monodon from Brunei Darussalam 关键词斑节对虾，对虾，病毒，PCR，文莱本研究在南中国海采集野生斑节对虾，并提取其鳃、肝胰腺和腹肢处的DNA和反转录RNA，通过常规PCR来检测野生对虾的病毒感染情况。结果显示该海域斑节对虾体内共检测到9种病毒，但并不包括对斑节对虾危害最大的WSSV和YHV两种病毒。因此文莱海域的野生斑节对虾可用来进行无特定病原体优良品系的选育。（/，2010）6. 尼罗罗非鱼性别相关分子标记的遗传图谱及物理图谱=Genetic and Physical Mapping of Sex-Linked AFLP Markers in Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) 关键词AFLP，性染色体，罗非鱼，性别相关分子标记尼罗罗非鱼的性别决定基因的鉴定对养殖业有重要的经济意义。我们已知该物种的XX/XY性别决定位点在连锁群1上一段10cM的间隔片段上。本研究利用新型的AFLP marker及群体分离分析法，再次验证了尼罗罗非鱼的XX/XY性别决定位点的精确位置。（/，2010）7. 桡足类动物Tisbe biminiensis的蛋白酶比较研究=Proteases from the Harpacticoid Copepod Tisbe biminiensis: Comparative Study with Enzymes from Farmed Aquatic Animals 关键词桡足亚纲，生理学，蛋白酶，胰蛋白酶为研究桡足类动物Tisbe biminiensis粗提液中的不同蛋白酶，本实验用BApNA作底物测定其胰蛋白酶活性，发现胰蛋白酶在低于50时是热稳定的，且能被特定的抑制剂所抑制。而对粗提液进行SDS-PAGE电泳时发现了另外8种蛋白酶，其中有4种蛋白酶不能被胰蛋白酶抑制剂所抑制。这表明Tisbe biminiensis体内含有胰蛋白酶类蛋白酶等多种蛋白酶。（/doi/abs/10.1651/08-3127.1，2010）8. 大西洋鲑鱼-actin启动子的克隆及其在鲑鱼细胞和转基因斑马鱼中的应用= Isolation of the Atlantic salmon -actin promoter and its use to drive expression in salmon cells in culture and in transgenic zebrafish关键词-actin启动子，CHSE-214细胞，斑马鱼，转基因，大西洋鲑鱼 本研究从大西洋鲑鱼染色体DNA中分离克隆出-actin启动子，并在离体培养的大鳞大马哈鱼胚胎细胞和转基因斑马鱼荧光蛋白的表达都表现出很强的活性。这表明-actin启动子可应用于不同细胞株系间的基因转移，这就使经济鱼类鲑鱼的基因改造成为可能。（/，2010）9. 雄性尼罗罗非鱼体色与繁殖成功率的关系=The effect of male colouration on reproductive success in Nile tilapia (Oreochromis niloticus) 关键词繁殖成功率，交配选择，色彩，选型交配，尼罗罗非鱼本文主要介绍了雄性罗非鱼体色与其繁殖成功率间关系的研究情况。在半自然繁殖条件下，雌性罗非鱼选择野生型雄性罗非鱼或红色雄罗非鱼作为第一交配对象，两者的繁殖成功率并无差异；相反，野生型雌性罗非鱼和红色雌性罗非鱼在选择第二交配对象时有明显差别。这对尼罗罗非鱼在养殖环境下的产卵情况研究提供了重要依据。（/，2010）10. 群居细菌的细胞密集度和运动性拮抗抗生素= Cell density and mobility protect swarming bacteria against antibiotics关键词群集运动，抗生素抗性，群体特性，表面活性剂，生物膜群居细菌生活于多细胞群体中，并表现出对多种抗生素产生自适应耐药性。分析这一现象表明：高密度的细胞可以保护细菌承受不同致死浓度的抗生素。我们研究发现即使不在群居状态，高密集度可促进细菌的生存；但移动能力和移动速度，是群居细菌另外一个优势，主要来耐受抗菌剂。没有证据表明当细胞暴露于抗生素时有其它抗性途径或群体效应机制来产生抗性，毕竟这样对细菌损害很大。本研究表明细菌生物膜产生抗生素抗性。（PNAS，107（8）：37763781，2010）11. 细菌的木马机制使线虫致病= A Trojan horse mechanism of bacterial pathogenesis against nematodes关键词杀线虫芽孢杆菌，秀丽隐杆线虫，趋向作用，病原菌宿主相互作用，毒性蛋白酶了解宿主和病原菌间感染机理可为控制它们间关系提供重要信息。由于比脊椎动物模型在遗传背景和实际操作的优势，秀丽隐杆线虫成为研究病原微生物致病性的优异模型。本文研究了微生物在线虫中一种类似于木马的致病机制。研究表明杀线虫芽孢杆菌B16菌通过分泌比普通无害细菌较多的有效挥发性有机物来吸引线虫；确定了产生的17种挥发性有机物诱导剂，其中有7种可以诱导线虫。该菌一但进入线虫肠内便会分泌2种广谱性蛋白酶，但这些酶首先分解肠内必需蛋白而导致线虫死亡。致病菌与线虫间感染的木马形式加深了我们对微生物致病机理的认识。（PNAS，107（ 38）：1663116636， 2010）12. 抑制大肠杆菌RecA 蛋白ATP酶活性的新型抑制剂=Novel Inhibitors of E. coli RecA ATPase Activity关键词抗生素耐药性，ATP酶抑制作用，高通量筛选，微生物耐药性，RecA蛋白，超氧化物应急反应细菌的RecA蛋白以前作为治疗细菌时的药物靶点，不是抗菌剂靶点，但可作为抑制细菌获得耐药性机制得很有潜力辅助目标。为了阐明小分子抑制RecA/单链DNA核蛋白丝的形成，我们改进了磷钼蓝ATP酶分析，以便高通量筛选确定RecA ATP酶对化合物库33,600种物质的活性，从而从35万个结构中选择代表性结构。在40个样品中出现了四个不同的化学型。构效关系分析和进行下一步的化学合成以优化此抑制剂作为抗菌剂佐剂的使用设置。（/pmc/articles/PMC2905775/?tool=pubmed，2010）13. 从黄星天牛中分离的新型打结素类抗菌肽- Psacotheasin及其性质=Isolation and Characterization of Psacotheasin, a Novel Knottin-Type Antimicrobial Peptide, from Psacothea hilaris关键词黄星天牛，Psacotheasin，打结素类蛋白，抗菌肽从黄斑的黄星天牛中分离并分析了一种新型打结素类抗菌肽。鉴定了56-mer的打结素类前导肽，预测的分子量和等电点分别为5.92 kDa和8.28；最终筛选出34-mer的成熟肽，并命名为天年psacotheasin。研究了化学合成的psacotheasin对人类细菌性病原体的抑菌活性。结果表明，psacotheasin对革兰氏阳性和阴性细菌都有强烈的抑菌活性。本研究表明，psacotheasin可开发为新的治疗药物。（http:/www.jmb.or.kr/journal/viewJournal.html?year=2010&vol=20&num=4&page=708，2010）14. 从野生蘑菇-赭杯伞的干子实体中分离的抗菌蛋白及性质=Purification and characterization of an antibacterial protein from dried fruiting bodies of the wild mushroom Clitocybe sinopica关键词蘑菇，子实体，抗菌蛋白，赭杯伞从野生蘑菇-赭杯伞的干子实体中分离了一种分子量44 kDa的新型抗菌蛋白；十二烷基硫酸/聚丙烯酰胺凝胶电泳表明：由两个分子量为22kDa的亚基构成；其N端氨基酸序列SVQATVNGDKML。经DEAE-纤维素离子交换层析、羧甲基纤维素离子交换层析、Q-琼脂糖凝胶离子交换层析和Superdex75凝胶过滤快速蛋白质液相层析进行纯化。该抗菌蛋白能被这三种离子交换剂吸附。经细菌和真菌菌株测试表明该蛋白对发根农杆菌、根癌农杆菌、葡萄土壤杆菌、水稻黄单胞菌、栖菜豆假单胞菌有较强的抑菌活性，其最小抑菌浓度大多低于0.6M。然而，对青枯假单胞杆状细菌、草生欧文氏杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌没有抑菌活性；对玉米大斑病菌、尖镰孢菌、棉花黄萎病菌、玉米小斑病菌、小麦根腐病菌没有抗真菌活性。该蛋白暴露在20-60下，30分钟，pH 49下1小时后对钟根癌农杆菌仍有抗菌活性。（http:/www.actabp.pl/pdf/1_2010/43.pdf，2010）15. Panduratin A 在体外对分离的临床肠球菌抑菌活性=In Vitro Antibacterial Activity of Panduratin A against Enterococci Clinical Isolates关键词抑菌活性，肠球菌，panduratin APanduratin A，从手指根根茎中提取的一种天然查尔酮化合物。依据美国临床和实验室标准协会（CLSI）标准使用了临床分离肠球菌与常用的抗菌剂，比较了最低抑菌浓度（MIC）和最低杀菌浓度（MBC）。根据时间杀灭曲线评估了浓度从0到4倍MIC时的杀菌活性。同时研究了产生生物膜抵抗panduratin的肠球菌。当panduratin的浓度为2mg/ml时抑制了所有分离临床肠球菌的生长，杀死所有菌株的浓度为8m g/ml。时间杀灭曲线显示当浓度为4倍MIC时30分钟内就可杀灭所有菌株。对于产生物膜的肠球菌抑制和根除的浓度分别为4mg/ml和16mg/ml。通过对所有分离的临床肠球菌抗菌活性表明panduratin比普遍常用的抗菌剂有效。Panduratin对产生物膜的肠球菌比达托霉素A和利奈有更强的抑菌活性。抗菌剂Panduratin A对临床肠球菌有较高的体外抑菌活性，包括对其他抗生素耐药的微生物。（http:/www.jstage.jst.go.jp/article/bpb/33/9/33_1489/_article，2010)16. 天然橄榄油中酚类化合物的生物活性=Biological Activities of Phenolic Compounds Present in Virgin Olive Oil关键词天然橄榄油，酚类化合物，健康好处地中海饮食表现出较低的动脉硬化、心血管疾病、神经退行性疾病和某些类型的癌症发病率，这得益于地中海人饮食消费的天然橄榄油。许多研究都聚焦于天然橄榄油中纯在的酚类化合物，以解释地中海传统饮食中较低的死亡率和发病率。研究（人类、动物、在体内和体外）表明，橄榄油中的酚类化合物对某些生理指标有正面影响，如血浆脂蛋白、氧化损伤、炎症标志、血小板和细胞功能、抗菌活性和骨骼健康。本文总结了当前对橄榄油酚类化合物的生物利用度和生物活性的认识。（/pmc/articles/PMC2852848/?tool=pubmed，2010）17. 光谱法在甲壳素和壳聚糖结构分析上的应用=Application of Spectroscopic Methods for Structural Analysis of Chitin and Chitosan 关键词甲壳素，壳聚糖，化学修饰，理化参数，应用光谱法的结构分析甲壳素，世上第二重要的天然聚合物，其N -脱乙酰化壳聚糖衍生物，已经被确定为在医药，农业和食品行业应用广泛的多功能生物高聚物，造成这种情况的主要原因有两个，首先是甲壳素和壳聚独特的化学、物理化学和生物学特性，其次是为他们生产原料的无限量供应。这些聚合物表现出各种不同的理化特性取决于甲壳素来源和壳聚糖生产条件。反应性官能团的存在以及这些生物大分子多糖的性质，使他们接受不同的化学修饰。不利用光谱技术，甲壳素、壳聚糖及其衍生物的一个完整的化学和物理化学描述是不可能的。这次回顾的重点是光谱方法在对这些化合物的结构分析中的应用。（Mar Drugs，8(5): 15671636，2010）1. 海洋表面温度和叶绿素a遥感在西北太平洋的鱿鱼业的应用=Remote sensing of sea surface temperature and chlorophyll-a: implications for squid fisheries in the north-west Pacific Ocean关键词AVHRR，SeaWiFS，海洋表面温度利用1995-2001年的AVHRR和1997-2001年的SeaWiFS数据分析获取的上升暖气流颜色特征,揭示了西北太平洋的海水表层特征和鱿鱼捕获率的时空关系。鱿鱼产量与北海道附近海洋表面温度变化相一致。（/citation.cfm?id=1868121，2010）2. 两个富集基因组文库的多态性微卫星位点对miiuy croaker, Miichthys miiuy (Sciaenidae)的遗传分析 =Polymorphic microsatellite loci from two enriched genomic libraries for the genetic analysis of the miiuy croaker, Miichthys miiuy (Sciaenidae) 关键词Miichthys miiu,微卫星,分子标记在受试群体中，鮸鱼Miichthys miiuy (AG)13和(CA)13富集基因组文库中12个多态微卫星被分离和鉴定。观测和实际杂合度范围分别从0.1923 到 1.0000和从0.2633 to 0.8337 。三个位点背离了哈代温伯格平衡，五对位点间的连锁不平衡极其明显。这些多态的微卫星位点可以用于鮸鱼M. miiuy的遗传多样性分析和分子辅助繁育。（Genetics and Molecular Research 9 (2): 931-934 ，2010)3. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in the hard-shelled mussel, Mytilus coruscus (Mytilidae) =厚壳贻贝多态微卫星的分离和鉴定关键词Mytilus coruscus,微卫星,分子标记厚壳贻贝是中国海洋甲壳类最重要的养殖种之一。使用厚壳贻贝M. coruscus的表达序列标签文库和两个微卫星富集基因组文库，在受试群体中分离和鉴定了12个多态的微卫星；等位基因数目分布为3到7个，观测和预期杂合度范围分别是0.0333 到0.8571和0.3452到0.8267。四个位点偏离了哈代温伯格平衡。这些多态微卫星位点可以用于厚壳贻贝M. coruscus遗传多样性分析和分子辅助繁育。（Genetics and Molecular Research 9 (3): 1388-1391 ，2010)4. 对多食性的捕食者箭鱿Nototodarus gouldi的形态测量的和基于DNA的食性分析技术=Assessing morphological and DNA-based diet analysis techniques in a generalist predator, the arrow squid Nototodarus gouldi关键词箭鱿，食性分析，多食性的捕食者，分子的，形态学的，南冰洋本研究对比了在确定自由分布的多食性捕食者箭鱿(Nototodarus gouldi)食性上形态学方法和DNA分析的效力。结合的方法比单独使用这两种方法更有效。19个唯一的捕食分类群被鉴定，其中6个是两种方法发现的。形态学的方法仅仅发现了被鉴定的捕食分类群总数的50%，DNA方法发现了84%。本研究强调使用结合技术发现和鉴定多食性海洋消费者捕食的好处。（Molecular Ecology Resources，10（3）：466474, 2010）5. 多重的16S rRNA单倍型特异的PCR，一种快速、简便的鉴定鱼类物种的方法：在西非鲱形类幼鱼上的应用= Multiplex 16S rRNA haplotype-specific PCR, a rapid and convenient method for fish species identification: an application to West African Clupeiform larvae关键词16S rRNA，鲱形目，东大西洋区，MHS-PCR，物种鉴定，西非多重的16S rRNA单倍型特异的聚合酶链式反应(MHS-PCR)方法被开发用于鉴定七种生活在热带东大西洋区鲱形目物种，16S rRNA 片段用种特异的引物扩增，产生了种特异的片段，接着用琼脂糖凝胶电泳分离使得可以直接视觉识别目标物种。这种方法在大鲱形目样本的情况下提供了准确，简单和快速的鉴定物种的方法。这种方法适合调查早期鲱形目阶段，热带东大西洋区渔业管理中的物种和鉴定。（Molecular Ecology Resources，10（ 3）：568572, 2010）6. 尖吻鲈 (Lates calcarifer)的标准微卫星板=A standard panel of microsatellites for Asian seabass (Lates calcarifer)关键词遗传多样性，基因型，微卫星，标准化来自泰国，马来西亚，印度尼西亚和澳大利亚的24个个体用28个微卫星标准板选择和鉴定。这些标记的等位基因数目的平均数是10.82 0.71 (范围: 619) ，预期杂合度平均是0.76 0.02 (范围: 0.631.00)。所有微卫星是孟德尔式遗传。另外，八个标准大小的对照被研究，通过克隆一系列微卫星等位基因到pGEM-T载体以校准等位基因大小（等位基因大小因实验室而异，根据要求而获得）。7个多重PCRs,每一个扩增3-5个标记，进行优化以得到精确和快速的基因型微卫星。亲子关系鉴定用10个微卫星进行两次杂交(10 10 和 20 20) 证明这些标记在揭示父母兄弟姐妹关系上的高效性。这个微卫星标准集合将使尖吻鲈的遗传多样性研究标准化，多重PCR将促进亲子关系鉴定。（Animal Genetics，4