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Oncomine数据库的应用,一、账号注册,需要非盈利机构邮箱(大学邮箱)注册账号,二、登陆,三、登陆后的用户主界面,四、键入要搜索的基因,五、限制搜索条件,1、AnalysisType-DifferentialAnalysis-Cancervs.NormalAnalysis,3、CancerType-ProstateCancer,4、SampleType-ClinicalSpecimen,5、DataType-mRNA,我们选定的条件会出现在筛选框中,点击搜索,右边的界面如下图,六、按限定的条件搜索,右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果,勾选各研究机构所做的研究,七、对多组数据进行meta分析,对所勾选的结果进行合并,进行meta分析,研究结果为该基因高表达的机构,研究结果为该基因相对低表达的机构,选择一个较为可信的机构作数据统计并分析,八、结果分析,展开该机构右边的下拉箭头,点击其下方的研究,会出现右边所示柱状图,将鼠标移至每个柱子上,会分别跳出一个说明框,统计每个柱子的Expressionvalue,分别统计正常前列腺和前列腺癌的expressionvalue并用GraphPadPrism5作图,九、作散点图,录入正常前列腺和前列腺癌的expressionvalue,点击Graphs下方的Data1即显示最侧散点图,点击Results出现右方对话框,点击OK,继续点击OK,自动计算出P值,按P0.05,差异有统计学意义,十、结论,对于该基因,YuProstate机构的研究表明,该基
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