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文档简介
基因启动子序列的查找 一 基因序列查找 NCBI 选择 Gene 输入基因的名字 eg p53 Search 基因序列查找 选择特定物种的p53基因 eg TP53 human 基因序列查找 获得TP53基因的详细信息 基因名称 全称 别名 类型等 下拉获得更多详细信息 基因序列查找 基因组结构 不同版本中 此基因在染色体中的位置 转录方向等 基因序列查找 基因组区域 转录 产出 p53基因在不同转录本中的信息 点击GenBank GenBank 获得基因详细信息 位置 定义 登录号 版本 特征 碱基序列等 基因序列查找 FASTA 获得基因的全部序列 包括非转录区序列 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 查找P53的基因序列 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 选择特定物种的P53基因 例如human 启动子序列的查找 1 在NCBI中查找所需的基因 以p53为例 获得humanp53基因的详细信息 启动子序列的查找 2 确定此基因在染色体上的位置和转录方向 正向 反向 在染色体上的位置 Chromosome17 NC 000017 11转录方向 从右向左 反向转录 说明启动子区与第一外显子区位于此段基因的右侧 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 获得FASTA格式的序列信息 右侧为此段基因的长度 7668402 7687550bp 启动子区位于基因5 端2000bp 即7687550 7689550bp 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 查找第一外显子的位置 在p53基因的详细信息页面中查找mRNA的详细信息 确定其在基因序列中的位置 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因mRNA的详细信息界面 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因mRNA的详细信息界面 找到exon 第一外显子 的位置 1 174bp 启动子序列的查找 3 确定启动子区与第一外显子区的长度 进入P53基因FASTA信息的界面 确定第一外显子的长度 第一外显子位于基因5 端1 174bp的位置 由于基因为从右向左反向转录 第一外显子位于启动子 7687550 7689550bp 的左侧174bp 7687376 7687550bp 第一外显子 启动子 7687376 7689550bp 启动子序列的查找 4 下载启动子区与第一外显子区的序列 数据保存为FASTA格式 启动子序列的查找 4 下载启动子区与第一外显子区的序列 数据保存为FASTA格式 用word打开 启动子序列的查找 4
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