耳缺号、出生日期、.ppt

猪场育种数据的管理与应用 徐宁迎浙江大学动物科学学院 2020年2月19日 种猪场类型 原种猪场一级繁育场二级繁育场 种猪场经营的数据 猪生产性能数据饲料消耗数据兽药消耗数据销售数据 猪生产性能数据 猪生长性能数据猪繁殖性能数据胴体品质数据 猪生产性能数据 猪生长性能数据猪繁殖性能数据胴体品质数据 全国生猪遗传改良计划数据记录表 猪生长性能测定记录表猪体型外貌评分记录表母猪繁殖性能记录表种猪系谱记录表配种妊娠舍日记录表分娩舍母猪日记录表母猪繁殖力指数记录表分娩舍仔猪日记录表分娩 保育 育肥舍猪群生产日记录表后备种猪选留记录表公猪舍生产日记录表 地方猪品种登记表格 1 基本信息2 生长性能3 配种信息4 分娩哺乳5 采精信息6 基因检测7 育肥性能8 胴体肉质9 种猪变更 1 基本信息 23个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 父猪编号 母猪编号 所在分场 所在栏舍 当前状态 品种 品系 类群 性别 出生胎次 同窝活仔数 初生重 kg 左乳头数 右乳头数 遗传损征 来源 出生地点 原场编号 入场日期 离场日期 备注 2 生长性能 18个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 测定类别 测定地点 测定日期 日龄 体重 体长 体高 背高 胸围 胸深 腹围 管围 腿臀围 活体背膘厚 活体眼肌面积 3 配种信息 17个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 胎次 一配日期 配种方式 与配品种 与配公猪 二配日期 配种方式 与配品种 与配公猪 三配日期 配种方式 与配品种 与配公猪 4 分娩哺乳 20个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 胎次 产仔日期 总产仔数 产活仔数 活公仔数 活母仔数 畸形 死胎 木乃伊 出生窝重 寄入 寄出 断奶日期 断奶日龄 断奶头数 断奶窝重 5 采精信息 10个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 采精日期 采精次数 采精量 精子密度 精子活力 精子畸形率 6 基因检测 9个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 检测时间 基因名称 检测结果 检测单位 备注 7 育肥性能 11个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 始测日期 始测体重 结测日期 结测体重 全程耗料 料重比 日增重 8 胴体肉质 30个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 测定日期 宰前活重 胴体重 左胴体重 右胴体重 胴体长 背膘厚1 背膘厚2 背膘厚3 平均背膘 眼肌面积 骨重 皮重 皮厚 瘦肉重 肥肉重 肉色评分 肉色L值 肉色a值 肉色b值 大理石纹评分 肌内脂肪含量 pH1 pH24 滴水损失 肌肉含水量 9 种猪变更 11个性状 个体编号 耳缺号 出生日期 所在分场 转出舍栏 当前状态 变更日期 转入分场 转入舍栏 转后状态 猪场最基本数据 系谱数据生长性能数据繁殖性能数据 猪场数据管理的软件 GBSGPSPIGWINHerdsman 用Excel进行猪场数据管理 免费个性化操作简单 工作簿是计算和储存数据的文件3个工作表工作表可以对数据进行组织和分析表格256列和65536行组成 工作簿和工作表 数据工作表的建立 通常在工作表的第一行输入数据的标志 即性状 然后从第二行开始输入数据 数据输入方法 直接在工作表中输入利用数据记录单输入 直接在工作表中输入数据 对于标志在一页内的表可以直接输入 对于标志超过一页的可以采用冻结表中第一列的方法输入 当输入的数据超过一页时 可采用冻结第一行的方法来输入数据 这样可以解决在数据输入时 无法看到数据的标志及数据对应个体号等问题 超过一页 一页以内 冻结表中第一行的方法 选中单元格A2 执行 窗口 冻结窗格 命令即可 冻结表中第一列的方法 选中单元格B1 执行 窗口 冻结窗格 命令即可 冻结表中第一行第一列的方法 选中单元格B2 执行 窗口 冻结窗格 命令即可 利用数据记录单输入数据 执行 数据 记录单 命令 单击确定即可 育种数据的应用 为家畜个体遗传评定提供信息为选种选配提供信息为估计群体遗传参数提供信息为评价不同的杂交组合提供信息为评价畜群的生产水平提供信息 表型数据的分析 用工具栏的求和图标用粘贴函数用数据分析宏 用工具栏的求和图标进行数据的计算 用工具栏的求和图标进行数据的计算 求和可以用工具栏的求和图标 选中要进行计算的区域 单击求和图标 下一个单元格就出现了计算结果 此外 求和 平均数 最大值 最小值等 选中要进行计算的区域 在状态栏中单击鼠标右键 根据弹出的菜单 选择需要计算的内容单击即可 1 AVERAGE计算算术平均值2 SUM计算总和3 STDEV计算样本标准差4 VAR计算样本的方差5 GEOMEAN计算几何平均数6 HARMEAN计算调和平均数7 MAX计算最大值8 MIN计算最小值9 MEDIAN计算一组给定数字的中位数10 MODE计算一组数据的众数11 SLOPE计算给定数据的直线回归系数12 INTERCEPT计算直线回归的截距13 CORREL计算两组数据的相关系数14 COUNT计数15 DEVSQ计算离均差平方和 常用粘帖函数 用粘贴函数进行数据的计算 插入粘贴函数对话框 用粘贴函数进行数据的计算 计算平均数对话框 用粘贴函数进行数据的计算 计算总和对话框 用粘贴函数进行数据的计算 计算标准差对话框 数据库统计粘贴函数 数据库统计粘贴函数的使用格式 函数名 数据区域 数据列 条件区域 例如 DAVERAGE A1 F11 E1 A13 A14 DMAX A1 F11 C1 A13 A14 DMIN A1 F11 F1 A13 A14 DPRODUCT A1 F11 E1 A13 A14 DSUM A1 F11 E1 A13 A14 生长性能测定数据DAVERAGE A1 J158 G1 E160 E161 要求结测体重大于100kg 生长性能测定数据DAVERAGE A1 J158 G1 D160 E161 增加了一个日期条件 用数据分析宏进行数据的分析 打开数据分析宏对话框 用数据分析宏进行数据的分析 描述统计对话框 用数据分析宏进行数据的分析 描述统计分析结果 用数据分析宏进行数据的分析 多个性状的描述统计分析结果 数据库记录的抽取1 自动筛选2 高级筛选 学生成绩 自动筛选的步骤 单击数据清单中的任一单元格 从 数据 菜单中选中 筛选 再单击 自动筛选 自动筛选 自动筛选 高级筛选的步骤 1 在条件区域中的第一行建立筛选值的标志列2 在标志列下面的一行中建立筛选的条件条件规则如下 同一行上的条件为 且 的关系不同行上的条件为 或 的关系3 单击数据清单中的任一单元格 从 数据 菜单中选中 筛选 再单击 高级筛选 4 填写 高级筛选对话框 在原有区域显示筛选结果将筛选结果复制到其它位置 高级筛选对话框 生长性能 1 达100kg日龄 2 100kg活体背膘厚 3 100kg活体眼肌面积 这3个性状可根据猪只在85 115kg体重范围内时测定的实测值校正得到 繁殖性能 4 总产仔数 5 21日龄窝重 根据实际断奶窝重校正得到 生猪遗传改良计划的必测性状 生长性能 1 30 100kg日增重 2 100kg肌内脂肪含量 3 采食量 4 饲料转化效率 繁殖性能 5 活产仔数 6 产仔间隔 7 初产日龄有条件的种猪场还可进行胴体和肉质性状的测定 生猪遗传改良计划的建议测定性状 长白 斯格 大白种公猪 广东省种猪测定中心采用的表型值综合指数 杜洛克种公猪 日增重 100kg体重时背膘厚 测定期同栏饲料转化率 同品种 同期测定结束种猪平均日增重 100kg体重时背膘厚 测定期同栏饲料转化率的最小二乘均值 校正日增重 测定体重范围 30kg 100kg平均日增重 单位 g d 保留一位小数实际测定中 入试体重范围 27kg 33kg 结束体重 90kg 105kg计算日校正增重时 入试和结束体重分别校正到30kg 100kg达30kg和100kg体重的日龄也进行同步校正 b值分别为 杜洛克猪 1 536 长白猪 1 565 大白猪 1 550 校正日增重 达30kg日龄的校正公式 校正日增重 达100kg日龄的校正公式如下 CF计算公式如下 某杜洛克公猪入试体重29 5kg 入试日龄70天 d 结束体重107 5kg 结束日龄170天 d 根据计算日增重公式 该公猪测定期日增重为780 0g d 计算的达30kg和100kg体重校正日龄分别为70 326天和163 505天 校正日增重751 24g d 校正日增重 某杜洛克公猪入试体重29 5kg 入试日龄70天 d 结束体重107 5kg 结束日龄170天 d 根据计算日增重公式 该公猪测定期日增重为780 0g d 计算的达30kg和100kg体重校正日龄分别为70 326天和163 505天 校正日增重751 24g d 校正日增重 某杜洛克公猪入试体重29 5kg 入试日龄70天 d 结束体重107 5kg 结束日龄170天 d 根据计算日增重公式 该公猪测定期日增重为780 0g d 计算的达30kg和100kg体重校正日龄分别为70 326天和163 505天 校正日增重751 24g d 校正日增重 B型超声波测定仪倒数第3肋至4肋之间 距背中线5cm处校正公式转换成100kg体重活体背膘厚 校正背膘厚 校正背膘厚A值和B值 校正背膘厚 个体育种估计 动物模型是指模型中的随机遗传效应为个体的育种值 对于达100kg体重日龄模型 可将其表示为 动物模型BLUP 其中y中是所有个体达100kg体重日龄的观测值的向量 b是所有场 年 季节 性别效应的相量 w是所有窝效应的相量 a是所有个体育种值的向量 注意在a中可以包含没有性状观测值的个体 Z1和Z2分别是w和a的关联矩阵 动物模型BLUP 对于达100kg体重日龄模型 其中 和分别为窝效应方差 性状的加性遗传方差和剩余效应方差 I代表单位矩阵 A是所有个体间的加性遗传相关矩阵 假设 模型中的G和R可写为 动物模型BLUP 动物模型BLUP 混合模型方程组为 对此方程组求解 即可得到育种值的BLUP估计值 父系指数 SLI 和母系指数 DLI 达100kg体重日龄 100kg体重背膘厚和总产仔数 个体选配 父本和母本都只提供一半遗传物质 后代的成绩是二个亲本的综合 既受父本 母本加性效应 又受二者间的互作影响 所以 要想取得理想的下一代 不仅需要通过选种技术选出育种价值高的亲本 还要特别注重亲本间的交配体制 交配体制亦即亲本间的交配组合 为了达到特定目的 人为确定个体间的交配体制称为选配 选配的概念和作用 选配即是有明确目的地决定公母畜的配对 它是有意识地组合后代的遗传基础 以达到培育 利用和改良品种的目的 通过选种 可以选出优秀的公母种畜 选种可以改变群体的基因频率 但不可改变后代的基因型频率 而选配可以改变后代基因型频率 对后代的基因频率没有作用 亲缘选配的原则 1 母猪配种前需进行公母猪亲缘系数配对计算 安排相互间亲缘系数较小的公母猪进行配种 绝对避免亲子交配和同胞 包括半同胞 交配 尽量避免有共同祖父 母 或外祖父 母 的公母猪间的交配 2 有意识的保留一定血统数量 这样是照顾种猪销售中客户对公猪血统数量的需求 同时也能避免过度集中使用某个种公猪造成近交的局面 3 坚决不在出现遗传缺陷的窝中选择后备猪 这样可以逐步淘汰隐性有害基因 如果某个家系出现比较明显的遗传缺陷 就要考虑及时将生产缺陷后代的公母猪一律淘汰 4 加强基因交流 开展联合育种 从国内外引进经过遗传评估的优秀公猪精液进行输精 这样相当于在公猪水平上扩大基础群规模 减少近交的风险 5 加快核心群种公猪的更新速度 6 限制种公猪在核心母猪群中的最高配种比率 亲缘选配的原则 猪主要性状的近交衰退量 现有11头猪组成的一个群体 其系谱结构如下表 试计算所有个体的近交系数 群体平均近交系数 并计算3503号公猪与3712 3580号母猪 3361号公猪3112 3514母猪交配的后代的近交系数 在15头猪中 3501 3120 3361 3580和3842号猪为近交个体 其近交系数为0