基因数据测算系统.doc

基因数据测算系统1、 项目情况项目名称：基因数据测算系统。总体要求：本系统整体为“交钥匙”工程，厂商需确保应标方案的完备性。其中：系统通信：高速交换网络速度100Gbs；计算核心:集群总计算核心数236个核心；计算峰值：系统集群理论计算峰值8.75TFlops。2、 资质要求投标人资质要求系统集成三级以上(含三级)资质；质量管理体系认证证书（ISO9001）；ITSS服务符合性证书；注册资金不低于1500万；至少提供一份2013年1月1日以后类似项目业绩合同原件（合同内容须包含并行存储或分布式存储或高性能解决方案）。（以上认证需提供认证证书复印件并加盖公章现场提供原件备查）制造厂商资质要求1.质量管理体系认证证书（ISO9001）2.IT服务管理体系认证（ISO20000）3.信息安全管理体系认证（ISO27001）（以上认证需提供认证证书复印件并加盖设备制造商公章现场提供原件备查）3、 详细技术指标要求 技术指标类型详细技术参数计算节点（5台）CPU单个节点配置2颗CPU,每个CPU性能Intel Xeon E5-2680v4 (2.4GHz/14c)/9.6GT/35ML3/2400内存单个节点配置内存256GB DDR4 ECC REG 2400MHz内存，单条内存要求32GB；硬盘配置1块120GB 2.5寸 MLC固态硬盘；可支持扩展2块2.5英寸SATA/SSD硬盘；RAID支持：集成RAID0，RAID1；网络千兆网口2个；100Gb高速交换网卡1块；服务及售后提供三年原厂工程师上门服务；提供原厂商针对此项目的授权原件及售后服务承诺函原件；计算资源机箱（1个）总体要求全模块化设计，服务器节点、1GbE以太网、10GbE以太网、Infiniband、标准PCIE扩展插槽等多种模块，可根据业务需求灵活扩展。支持14个双路计算节点或7个四路计算节点；支持两路、四路计算节点混插在同一机箱内；内置千兆交换模块1个, 配置2个千兆交换模块时支持冗余，对外支持四千兆4个万兆；内置管理模块1个, 配置2个管理模块时支持冗余；内置PCIE扩展模块支持20个基于 PCI-E x16 的扩展槽位，根据业务需求灵活扩展；管理特性管理模块，支持 IPMI 2.0，KVM over IP, 虚拟媒体等；电源配置8个1350W电源，实现6+2电源冗余；风扇配置8个风扇；产品及售后要求提供中国环境标志产品认证证书并加盖设备制造商公章；提供三年原厂工程师上门服务；提供原厂商针对此项目的授权原件及售后服务承诺函原件；内存计算节点(1台)CPU配置6颗Intel Xeon E7-8860v3 （2.2GHz/16c）9.6GT/40M3处理器，支持单节点8颗CPU扩展（非节点级联方式）内存配置3.84TB DDR4 ECC REG 2133MHz内存，单条内存32GB最大可支持内存插槽数192，最大支持12TB DDR4内存；硬盘配置4块300GB 2.5寸10000转SAS硬盘，最大支持16个2.5寸热插拔SAS/SATA/SSD硬盘；配置1块八通道高性能独立SAS RAID卡（1G缓存），支持raid 1/0/10/5/50/6/60；网络集成4个千兆以太网口，支持I/OAT2高级网络加速功能；支持VMDQ网络虚拟化技术，支持网络唤醒、网络冗余、负载均衡等高级网络特性，独立管理网口；配置1块单端口100Gb 高速互联网卡；扩展26个标准PCI-E3.0插槽，4个全长全高扩展插槽，支持热插拔，可实现在线更换；电源配置8个800W电源，实现4+4冗余服务器低功耗电源；工作良好的风扇、高效冗余热插拔电源提供N+N/N+M等多种冗余方式；工作环境：工作温度5-40 ；管理特性配置远程管理模块，提供远程管理、远程诊断功能，支持 IPMI 2.0，KVM over IP, 虚拟媒体等。产品及售后要求提供SAP HANA认证证书并加盖设备制造商公章；提供CE认证证书并加盖设备制造商公章；提供UL认证证书并加盖设备制造商公章；提供FCC认证证书并加盖设备制造商公章；中国环境标志产品认证证书；提供三年原厂工程师上门服务；提供原厂商针对此项目的授权原件及售后服务承诺函原件；管理节点（2台）CPU单个节点配置2颗CPU,每CPU性能Intel Xeon E5-2609v4(1.7GHz/8c)/6.4GT/20ML3/1866；内存配置64GB DDR4 ECC REG 2400MHz内存，单条内存8GB内存插槽20个；硬盘配置2块300GB 15000转3.5寸 SAS硬盘；可支持扩展24个热插拔2.5英寸或者12个3.5英寸热插拔SATA/SAS/SSD硬盘；高性能独立SAS RAID卡（1G缓存），支持raid 1/0/10/5/50/6/60；网络集成2个千兆网口；配置1块单口100Gb 高速互联网卡；电源配置2个800电源，支持1+1冗余，支持热插拔；管理特性集成管理芯片，支持IPMI2.0、KVM over IP、虚拟媒体等功能；支持外置式可视化管理模块，提供本地可视化系统监控和故障诊断功能；配置服务器管理软件，提供软件著作权登记证书；配置服务器智能备份还原软件，提供软件产品登记证书和著作权登记证书；产品及售后要求3C强制性产品认证；提供CE认证证书并加盖设备制造商公章；提供UL认证证书并加盖设备制造商公章；提供FCC认证证书并加盖设备制造商公章；中国环境标志产品认证证书；中国节能认证证书；提供三年原厂工程师上门服务；提供原厂商针对此项目的授权原件及售后服务承诺函原件；基因数据海量存储系统(1套)体系结构并行存储系统，采用控制器集群全冗余架构设计，性能随节点数量的增加而近线性增加，支持多控制器自动负载均衡及故障自动切换功能；高可用性要求要求系统全冗余，控制器之间必须是高可用配置。当元数据控制器出现故障时，要能自动切换到备用元数据控制器。任何一个控制器出现故障，不影响数据的正常访问处理器：控制器本次配置3个控制器，存储系统控制器数量可并行扩展至不小于5000个；每控制器标配2颗CPU，单CPU至少四核；每个控制器配置64GB缓存，最大支持192GB；每个控制器配置冗余电源每个控制器支持IB、万兆、千兆、FC主机接口，本次配置1个100Gb主机接口；容量要求单一文件系统要求96PB，本次配置51块大容量7200转6TB企业级SATA硬盘；元数据存储配置3块480GB SSD硬盘；管理特性节点之间共享存储空间并能同时访问同一目录，支持全局命名空间； 支持数据副本功能，支持数据副本按机架存储，支持40%的节点同时发生故障，数据持续可访问，并能够进行实际测试；数据冗余保护支持纠删码冗余保护机制；支持数据的自动分层，提升系统IO效率；支持全中文图形管理；可提供Web界面管理功能，可直观的监控和分析系统各层次的性能、状态监控，可实现邮件、SNMP等多种形式的告警，具有远程管理和事件通知功能。使用户对大型系统的管理和维护更加方便、高效。产品及售后要求为了符合整个系统兼容性要求，本设备应于计算资源保持同一品牌；提供三年原厂工程师上门服务；提供原厂商针对此项目的授权原件及售后服务承诺函原件；通信与管理设备Edge/TOR 配置1个Edge Switch 100 Series 24 Port，包含所有连接用线缆；交换机配置1台48口千兆带网管以太网交换机，包含连接用线缆；KVM配置1套四合一KVM切换器及配件；软件部分操作系统64位Linux稳定版本企业级操作系统；集群管理软件1. 采用B/S架构，通过浏览器（IE，firefox等）进行操作，可以管理集群系统中的软硬件资源和用户提交的作业2. 可定制以及动态添加新模块3. 可以控制每个用户可使用的模块，方便进行管理4. 用户可以定制自己的首页面5. 实时监控模块，对集群运行状态进行实时监控，可以投放到电脑屏幕或墙体大屏幕6. 管理节点的文件，可以对文件进行上传、新建、打开、复制、粘贴、重命名、打包、删除和下载等操作。7. 作业提交：提交新作业、可以提交fluent、VASP、ansys、gaussion、atom、sum、CFD、LSF等作业，也可以在后台配置自定义作业内容来进行提交。8.作业管理：该模块负责管理作业，查看系统中的作业状态，并可以对作业进行执行和删除等操作。还可以查看作业的执行日志。9.需和计算节点统一品牌产品，提供软件著作权证书；（以上提供官网截图证明并加盖设备制造商公章）；应用分析软件1. 支持管理端和计算节点的客户端守护进程2. 支持Infiniband驱动，OFED1.5.3版本以上3. 支持Mysql数据库4. 可监控双精度总浮点运算速度5. 可监控单精度总浮点运算速度6. 可监控双精度SSE向量化单元浮点运算速度7. 可监控双精度AVX向量化单元浮点运算速度8可监控单精度SSE向量化单元浮点运算速度9. 可监控单精度AVX向量化单元浮点运算速度10. 可监控双精度AVX向量化率11可监控每指令的时钟周期数12可监控实时内存写带宽13.和计算节点统一品牌产品，提供软件著作权证书；（以上提供官网截图证明并加盖设备制造商公章）；开发套件MPICH：千兆消息传递并行库；MVAPICH2：万兆/IB消息传递并行库；OpenMPI：高性能消息传递库；Intel编译、调试软件 ；Intel C+/Fortran 编译器；Intel MKL数学核心库；GCC编译器；生物一体机软件系统1.要求提供生命科学一体机软件，能够涵盖常见生物信息学软件、生物信息学分析流程以及生物信息学数据集，整合数据分析软件，并构建数据分析流程，各环节可高效自动管理及运行；用户在进行全基因组分析时，只需在图形界面上传初始数据，选取全基因组分析流程，设定参数后，即可一键式输出分析结果；2.软件要求预置不少于以下8种常用生物信息分析流程：包括全基因组重测序分析流程（Whole Genome Resequencing）、外显子分析流程（Whole Exome Sequencing）、基因组从头测序分析流程（Denovo Assembly）、转录组测序分析流程 (Transcriptom Analysis)、小RNA分析流程 (Small RNA Analysis)、数字基因表达谱测序数据分析流程 (Digital Gen