转录组测序技术原理及应用ppt课件

RNA测序技术的原理和应用，1，遗传学的中心规律，基因组-转录组-表观遗传组-蛋白质组级别，2，转录组是什么？3，RNA，protein，phenotype，genotype，DNA，4，RNA排序技术，5，WorkflowofRNA-Seq，样本RIN7，新的angelen 2200TapeStation系统是下一代排序(NGS)、生物微阵列芯片分析和qPCR工作流程、蛋白质纯化和抗体生产过程中生物样品质量控制(QC)的理想解决方案。可扩展通量-16个或96个孔微滴定板快速结果-每个样品平均在1分钟内获得结果易于使用-使用直接可用的ScreenTape预制带简化工作流程样品用量少-每次运行不需要2ul样品，7，测试报告-合格样品，ScreenTape磁珠通过MPC(磁选机)从溶液中分离。MRNA与磁珠结合后，使用tris-HCl在加热条件下溶出溶液。链霉亲合物包，磁珠生物素标签Oligo(dT)25 poly(A)，11，原核mRNA纯化，AmbionMICROExpressKit，LNA扣锁探针，12，mRNA逆转录-添加1l的stopbuffer退出反应。添加沉淀剂(NaAc糖原绝对乙醇)沉淀产物。RTdscDNA，13，末端修复(防磁)cDNA3 末端连接a适配器，14，第一天，DNA消化，mrna分离，mRNA破坏，cDNA合成，15，WorkflowofRNA-Seq，准备示例测试库clustering stationlluminsequencing生物信息分析，16，his eq2500，applicationsofrna-see Unigene (transcript)功能注释Unigene的GO分类Unigene调节路径分析预测编码蛋白质框(CDS)Unigene表达差异分析(两个或多个样品)Unigene的样品之间的差异GO分类(需要两个或多个样品)和path wwen 统计基因表达注释基因表达分析基因结构优化可变剪接分析预测新转录cSNP分析，转录meresequencing信息分析的主要内容，29，转录组注释信息分析流程，30，应用-转录组注释信息优化，基因结构exon 1，exon 2，exon 3，exon 1，exon 3，common reads，junction reads，mRNA，33，识别基因融合，34 24h在每个时间点提取的样本均匀混合排序策略：Illumina排序，1g data，38，1 . highlight 2 . heat 3 . cold 4 . salt 5 . drought，阻力相关可变分割，39，外包膜蛋白16 ，40，AS调节机制，CCA1，与空气时钟相关的基因，例如调节空气球的开关等，41，RNA-Seq单边排序是数字表示谱(DGE)，42，WorkflowofRNA-Seq单边排序(取样：成熟期开花时5，10，15周葡萄葡萄果实成熟的三个时期(postsetting、veraison、ripening)数据量：超过59Mreads数据，长度在36-44bp之间RNA-Seq技术，47、表-d-reads的基因组分布，表1排序数据，葡萄RNA-Seq单端排序，48、浆果开发3个阶段共有，特定基因表达分布，基因表达分布，49、表达簇的分类分布，差异表达的基因GO功能笔记-19个功能组-根据3个不同时期的基因表达趋势进行分类，分为8个集群。将基因表达与它控制的一个生理功能联系起来。，50，RNA-Seq验证浆果标记基因，使用RNA-Seq的数据验证报告的10个浆果成熟期的标记基因。RNA-S