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文档简介

基因芯片技术和应用dnamicroarraytechnologyandisapplication,南医科大学遗传工程研究所所长教授,博士生导师马文莉博士,第一,背景介绍2,应用领域3,展望,第一,背景介绍,1,基因芯片概念,打印基因芯片,in situ光刻基因芯片,1,背景介绍,第一个方案是用斯坦福大学P.Brown实验室的点阵打印基因芯片合成DNA,然后制作点样品液体,将微点拍摄到平方厘米的固体介质表面。2,基因芯片技术开发概述,1,背景介绍,第二个程序由美国Affymetrix开发。其原理类似于使用激光诱导原位光刻技术将DNA片段的序列扩展到原位合成的计算机芯片。2,基因芯片技术开发概述,1,背景介绍,小型化,集成高吞吐量,并行度同时检测多个基因的变化,2,基因芯片技术开发概述,1,背景介绍,快速发展,平均年增长94%,平均年增长57二是改变生命科学的研究方式,革新医学诊断和治疗,大大提高人口素质和健康水平的基因芯片。2,基因芯片技术开发概述,1,背景介绍,2,基因芯片的应用领域,科学研究,临床疾病诊断,环境检查,药物研发,法医鉴定,动植物检疫,食品检验,军事应用,医疗保健,体育医学,研究基因多态性与疾病易感性的关系,研究特殊SNP谱,1,基因芯片在科学研究中的应用,2,基因芯片的应用,(2)mCGH的应用:comparativegenomehybridization(CGH)是比较基因组杂交。将比较基因组杂交和DNA芯片技术结合起来,能够高速比较基因组的结构和构成的mCGH技术开始在肿瘤和新药研究、药物敏感性、新疗法的开发中发挥重要作用。1,基因芯片在科学研究中的应用,二,基因芯片应用,(3)基因表达配置文件芯片:可以高吞吐量检测基因表达信息。1,基因芯片在科学研究中的应用,二,基因芯片的应用领域,(4)功能基因组研究:为基因芯片的高吞吐量、并行性、快速化等功能基因组研究提供了可靠性平台,从而实现了对各种物种功能基因组的大规模研究。1,基因芯片在科学研究中的应用,二,基因芯片的应用领域,(5)生物信息学研究:基因芯片应用过程中生成的庞大数据为生物信息学研究提供了良好的平台。根据数据的分类分析基因表达或比较基因组的差异,可以探讨这些差异反映的生物学功能或机制。当前的主要瓶颈是软件开发。1,基因芯片在科学研究中的应用,2,在临床疾病诊断中的应用,2,基因芯片的应用,(1)早期诊断,组织,器官,个体身体,2,在临床疾病诊断中的应用,2,基因芯片还可以发现早期的肠呼气病例,为血液银行检查提供了更精密的技术,从而确保血液银行血液的生物安全性。2,应用于临床疾病的诊断,2,基因芯片的应用,(1)早期诊断,肿瘤的早期诊断:整个基因组芯片可以在分子水平扫描整个基因组,发现基因组或基因表达水平的最早差异。因此,也称为分子水平CT,可用于肿瘤的早期发现。2,在临床疾病诊断中的应用,二,基因芯片的应用领域,(1)初步诊断,根据基因芯片的高吞吐量,将多种病原体的基因探针微整合到同一芯片中,可以诊断多种相关病原体,进行鉴别诊断。2,在临床疾病诊断中的应用,第二,基因芯片的应用,(2)鉴别诊断,呼吸道感染消化系统感染,鉴别诊断,第二,在临床疾病诊断中的应用,第二,基因芯片的应用,2003年4月,严重急性呼吸系统,对于SARS coronavirus全长基因组,要快速准确地诊断和隔离多个目标探针检查网站,2,在临床疾病诊断中的应用,2,基因芯片的应用,(3)急性传染病的快速诊断,SARS的发病,快速感染,传染病患者,才能有效地消除感染源。现有临床诊断技术灵敏度低,产生假阳性或假阴性,目标抗原或目标基因座有限,快速敏感,准确诊断不易。2,应用于临床疾病诊断,二,基因芯片的应用,(3)快速诊断急性传染病,根据TOR2菌株SARS coronavirus,设计了30个具体的60mer oligod (oligo),并按参考顺序进行了SARS-、ATCGTCCAGTACT。2,2,应用于临床疾病诊断,2,基因芯片的应用领域,(3)急性传染病的快速诊断,(4)慢性疾病检查和康复效果评价,心血管疾病,骨质疏松症,糖尿病,2,应用于临床疾病诊断,第二,基因芯片应用领域,医疗疾病治疗-人的治疗,以下疾病治疗。我们的祖先认识到了对疾病的重要性3,基因芯片在健康管理中的应用,2,开发基因芯片的应用领域,发达国家-预防医学,促进大众健康,日本每330人:1名营养治疗师,英国:美国家庭医生,3,基因芯片在健康管理中的应用,2,2,全基因组基因芯片(44K),3,基因芯片在健康管理中的应用,2,基因芯片的应用,构建健康人的全基因组表达谱,环境检查药物研发生物武器防御法医鉴定动植物检疫,4,基因芯片在其他领域的应用,2,基因芯片的应用,基因芯片的迅速1998年6月29日,美国宣布生物芯片计划正式启动,世界各国也增加了投资,基于基因芯片的生物芯片产业正在全球兴起。,第三,展望,国际情况,三,展望,进入GM公司基因技术领域700亿美元,代码链接基因芯片技术,

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