Material_Studio的安装

1、第二章 Material Studio的安装要求：能自行安装Material Studio for Windows和Linux，并能进行简单的配置，能查看Gateway一、客户端系统要求（Materials Visualizer）：操作系统:Windows 2000 Professional - SP4 Windows XP Professional - SP2 （Windows 2003)Windows Vista - SP1 (Windows 2008)硬件：Intel Pentium III or compatible processor running 1G HZ800 600 分辨率

2、显示系统 (推荐1024 768) 512 MB RAM (推荐1 GB) 730 MB 硬盘空间（完全安装）16-bit / 65536 colors （显示卡）系统要求：一、客户端系统要求：操作系统:Windows 2000 Professional - SP4 Windows XP Professional - SP2 （Windows 2003)Windows Vista - SP1 (Windows 2008)硬件：Intel Pentium III or compatible processor 1G HZ800 600 分辨率显示系统 (推荐1024 768) 512 MB RA

3、M (推荐1 GB) 730 MB 硬盘空间（完全安装）16-bit / 65536 colors （显示卡）二、服务器端系统要求：操作系统:Windows servers(单机): Windows 2000 Professional , Server - SP4 Rollup 1 Windows 2003 Server, all editions - SP2 and R2 Windows XP Professional - SP2 Windows Vista - SP1 Windows 2008 - Sp1 Windows servers(Cluster): Microsoft High P

4、erformance Computing (HPC) Server作业调度软件LSF(Load Sharing Facility)在无网络连接的机子上要实现并行，则需要安装在无网络连接的机子上要实现并行，则需要安装Loopbackhttp:/ 系统比Windows系统效率高Linux 服务器:x86 (32-bit) 处理器 (包括 clusters) :Red Hat Enterprise Linux AS, ES, and WS - 3.0 (update 9) Red Hat Enterprise Linux AS, ES, and WS - 4.0 (updates 5 and 6)

5、SuSE Linux Enterprise Server - 9 (SP4) and 10 (base or SP1) x86-64 处理器 (包括 clusters) :Red Hat Enterprise Linux AS, ES, and WS - 4.0 (updates 5 and 6) Red Hat Enterprise Linux 5 (base and update 1) Red Hat Enterprise Linux Desktop 5 (base and update 1) SuSE Linux Enterprise Server - 9 (SP4) and 10 (b

6、ase or SP1) Itanium 2 处理器 :Red Hat Enterprise Linux AS, ES, and WS - 4.0 (updates 5 and 6) Red Hat Enterprise Linux 5 (base and update 1) Red Hat Enterprise Linux Desktop 5 (base and update 1) SuSE Linux Enterprise Server 10 (base or SP1) 推荐：CentOS http:/ libstdc+-3.2.3-59其它：PBS Pro，torque我们的系统2：硬件：

7、Intel(R) Xeon(R) CPU E5420 2.50GHz 2493 MHz 4x2=8 核；1.5G/核，SAS硬盘软件： Windows 2008 (64bit) + hpmpiMaterial Studio 4.3 硬件：Intel Pentium III or compatible processor 1G HZ512 MB RAM (推荐1 GB) 730 MB 硬盘空间（推荐10G）视计算对象而定，1G/cpu128原子(CASTEP, Dmol3)我们的系统1：硬件：Intel(R) Xeon(R) CPU E5420 2.50GHz 2493 MHz 4x2x3=24

8、 核；1G/核；千兆双网卡；软件： CentOS 5.2 (64bit) + hpmpi + torque，Beowulf cluster构架，Material Studio 4.2 ModuleModuleparallel?parallel? WindowsWindows Linux Linux IA32IA32Linux Linux IA64IA64ModuleModuleparallel?parallel? WindowsWindowsLinux Linux IA32IA32Linux Linux IA64IA64Materials Visualizer ONETEP Adsorptio

9、n Locator Polymorph Amorphous Cell QMERA Blends QSAR and QSAR PlusCASTEP and NMR CASTEP Reflex-Pattern Processing and Powder Diffraction COMPASS Reflex-Powder Indexing CCDC Reflex-Powder Refinement Conformers Reflex Plus Discover Reflex QPA DMol3 Sorption DPD Synthia Equilibria VAMP Forcite X-Cell G

10、aussian Mesotek GULP Morphology MesoDyn Windows下安装：Setup(Client and Server)安装完成后，把msi.lic或msilic.lic拷贝到安装目录的子目录.LicensePackLicenses中。Server对应的进程Apache(Material studio Gateway)Linux下安装(不能用root账号安装，而用普通帐户比如msemsi):$ ./Install (如果是在cluster上安装，则运行$./Install type cluster)按照缺省安装至结束，切换到root账号进行配置：使gateway自

11、启动：cp /./Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/msgateway_control_18888 /etc/rc.d/init.d;cd /./Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/; /sbin/chkconfig -add msgateway_control_18888;复制你的license文件到/./Accelrys/License_Pack/licenses （目录要与安装License管理软件的目录相一致），复制一份license文件为msilicense.dat(网上说把license改名为 msilicens

12、e.dat，但是对于ms4.2版，必须ms.lic和msilicense.dat都存在)配置运行环境：eval /Accelrys/MaterialsStudio42/share/license/data/lic_setup.sh -s sheval /Accelrys/MaterialsStudio42/share/bin/ms_setup.sh -s shmkdir /usr/temp；chmod 777 /usr/temp (设置计算的临时目录)TMPDIR=/usr/temp；export TMPDIRDMOL3_DATA=/./Accelrys/MaterialsStudio42/D

13、ata/Resources/Quantum/DMol3export DMOL3_DATADMOL_TMP=/usr/temp；export DMOL_TMPMESODYN_HOME=/Accelrys/MaterialsStudio42/Data/Resources/Mesoscale/MesoDynexport MESODYN_HOME/Accelrys/MaterialsStudio42/Gateway/msgateway_control_18888 restart;安装或运行时最重要的是查看出错信息，有些信息不会在客户端显示，这时候可以查看Gateway上的信息比如http:/210.4

14、5.126.32:18888，点jobs,会看到正在运行的任务（注意：出错后先不要把出错窗口关掉，因为一关掉，Gateway上的信息就会自动删除），选择出错的任务，然后看std_err.txt，也可能在其它的txt文件里。可参见：http:/ ConsoleGateway的数据也可以的数据也可以通过修改通过修改gw-info.sbd和和gwparams.cfg来实现。来实现。查看任务信息：查看任务信息：信息包含文档：fromdsd.txt std_out.txt todsd.txt std_err.txt 任务进度信息任务进度信息 ：ToolsServer ConsolGateway的权限控制（任务提交权限）：的权限控制（任务提交权限）：IP控制和用户控制控制和用户控制IP控制（只允许特定网址的客户端提交任务）：修改控制（只允许特定网址的客户端提交任务）：修改allow.conf用户控制（用户须输入帐户密码才能提交任务）：用户控制（用户须输入帐户密码才能提交任务）：