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文档简介
1、精选优质文档-倾情为你奉上PCR技术详细步骤从RNA抽提到电泳鉴定RNA抽提一,准备工作1, 实验器具与材料:(1) 移液枪:1ml、200ul、10ul(2) 吸头:1ml、200ul、20ul(3) 吸头台:放置1ml吸头的一个,放置200ul和20ul的吸头一个(4) EP管1.5ml、100ul(5) 玻璃研磨器(6) 容量瓶:1000ml(7) 盐水瓶:100ml(8) 15ml塑料管一个(配75乙醇用)2, 实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37过夜,然后送至高压3次,后在80烘烤箱
2、中烘干(或置于37中8小时左右烘干),试验前将枪头放入吸头台。(2) 玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)先泡酸过夜,冲洗干净后,在1DEPC水中泡8小时左右,37烘干,用蒙锡纸包裹送至干烤3次。(3) 金属制品:(镊子等)先洗干净,再送干烤3次。(不需要泡DEPC水)3, 试剂配制和准备:(1) DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。配75乙醇的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37过夜,送至高压。(2) 75乙醇(要在抽提时现配):用无水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:无
3、水乙醇1:3),然后放于-20备用。(3) 异丙醇:放入棕色瓶(4) 氯仿:放入棕色瓶(5) Trizol:100ml/瓶 存放于4二,抽提时注意事项:全程佩戴一次性手套和口罩,手套要勤换,避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。三,抽提步骤1 匀浆化作用取约100mg鼠脑组织放于玻璃研磨器内,先加0.2ml的Trizol溶液,研磨组织后,倒入1.5mlEP管中,再在研磨器内加入0.8ml的Trizol溶液洗,后全部再倒入EP管中。颠倒混匀10下,室温静置5分钟。2 分离阶段每1mlTrizol中加0.2ml氯仿。盖紧样品管盖,漩涡震荡15秒,使其充分混匀,冰上静置5分钟。后12000rmp离心
4、15分钟。3 RNA的沉淀将上层水相转入新的1.5mlEP管中(约400-500ul),加入0.5ml异丙醇,混匀后放于-20中1小时,后12000rmp离心10分钟。34 RNA的洗脱小心倒掉上清,留取沉淀。加1ml现配的75%的乙醇(预冷)振荡洗涤RNA沉淀一次,后7500rmp离心5分钟。5 RNA的再溶解小心倒掉上清,取沉淀置超净工作台开风机吹干(约30分钟,此时RNA沉淀变透明)。注意不能让RNA沉淀完全干燥(会极大地降低它地可溶性)。再在管中加20ul的DEPC水溶解,在55-60下孵育10分钟助溶。6,RNA的保存提取的RNA保存于-70超低温冰箱中,或立即用于逆转录。TRIzo
5、l法抽提总RNA细胞1×107组织100mg加1mlTRIzol细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块匀浆(要彻底,后转至EP管)(组织匀浆量>100mg时分装1ml/每EP管)颠倒混匀10下,室温5分钟加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)颠倒混匀15S,室温5分钟4,离心12000rmp,15分钟转上层水相(约400-500l)于另一新1.5mlEP管中加等体积异丙醇(约400 -500l),混匀后-20中1小时4,离心12000rmp,10分钟弃上清加冰预冷的75%乙醇(用高压后的DEPC水配)1ml4离心7500rmp,5分钟弃上清,超净工作台开风机
6、干燥约30分钟(不能完全干燥)溶于DEPC水中至20l(10l-20l)(可在55-60水中,<10分钟助溶)立即保存于-70超低温冰箱中,或立即用于逆转录4逆转录(RT)一,准备工作1, 实验器具与材料:(1)移液枪:200ul、10ul(2)吸头:200ul、20ul(3)EP管1.5ml、100ul(4)水浴箱2,实验器具的处理与准备塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37过夜,然后送至高压3次,后在80烘烤箱中烘干(或置于37中8小时左右烘干),试验前将枪头放入吸头台。3,试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实
7、验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37过夜,送至高压,后分装到几个1.5mlEP管中,-20中保存备用。(2)RT中所需要的各种试剂(3)引物浓度计算方法: (新合成的引物的稀释) 假如终浓度为X uM(pmol/ul) 加DEPC水体积(ul)(OD×33×)/(分子量×X)二,RT时注意事项:为避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。三,RT步骤用SS逆转录酶进行RT(20ul体积)1, 准
8、备0.65ml的EP管2, 冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3, 65水浴5分钟后,立刻0冰水浴至少1分钟。4, 短暂离心后,冰上操作:加入4ul 5×First-Strand Buffer,1ul 0.1MDTT,1ul RNAse Inhibitor,1ul SS逆转录酶。5, 短暂离心6, 50水浴60分钟进行逆转录。7, 70水浴15分钟灭活逆转录酶8, -20保存,或立即进行PCR。用AMV逆转录酶进行RT(10ul体积)1, 准备0.65mlEP管2, 加入4.5ul DEPC水,1ul引物,1ul模板R
9、NA3, 稍离心,100沸水裕1min4, 加入0.5uldNTP,2ul 5×Buffer,1ul AMV逆转录酶5, 稍离心,封口膜封口,42水浴90作RT6, 100沸水裕3min灭活AMV7, 立即PCR或-20保存。5聚合酶链式反应(PCR)二,准备工作8, 实验器具与材料:(1)移液枪:200ul、10ul(2)吸头:200ul、20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)EP管1.5ml、100ul2,实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头、EP管等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。3, 试剂配制和准备:(1) 双蒸水: 100ml盐水
10、瓶内装40ml蒸馏水,送至高压,后分装到几个1.5mlEP管中,-20中保存备用。(2) PCR中所需要的各种试剂三,PCR时注意事项:佩戴一次性手套,同时避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。四,PCR步骤1, 准备100ul EP管2, 依次在管中加入:(50ul反应体系)ddH2O 37.5ul ×?10mM dNTP 1ul ×?10×PCR buffer 5ul ×?25mM Mgcl2 (加之前要摇匀) 3ul ×?上游引物 1ul ×?下游引物 1ul ×?模板cDNA 1ul3, 稍离心4, 100沸水浴1分
11、钟5, 趁热加入Tag酶0.5ul(冰上操作)6, 再加入50ul液体石蜡封闭7, 10000rmp离心1分钟8, PCR条件94 1min58 50sec72 1min30sec进行40个循环,然后72 10min 完后4保温。9,10000rmp离心5min10,将下层水相转入新的0.65mlEP管中,-20保存。6电泳鉴定一,准备工作1,实验器具与材料:(1)移液枪:10ul(2)吸头:20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)三角烧瓶:50ml一个(5)琼脂糖2,实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。(2)电泳板及
12、电泳槽:用自来水冲洗干净备用3, 试剂配制和准备:(1) 电泳缓冲液(TAE):先配制0.5mol/L,PH8.0的EDTA溶液:将37.2g EDTA-Na加入160ml蒸馏水中,在搅拌器上剧烈搅拌。在用NaOH调节溶液PH值至8.0(约需4gNaOH)。用蒸馏水定容至200ml。后送至高压灭菌。室温保存。再配制50×TAE溶液:在400ml蒸馏水中溶解121g Tris碱,加入28.55ml冰乙酸和50ml 0.5ml/L EDTA溶液,再加蒸馏水定容至500ml,室温保存。(2)琼脂糖溶液(1.0):50×TAE溶液取10ml,稀释成500ml,取50ml溶解0.5g
13、琼脂糖,电炉上煮至沸腾,溶化的琼脂物冷却至60左右时加入10mg/ml EB 5ul,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的电泳板中,在室温下放置45min左右后进行电泳。(3)溴化乙锭(EB)(10mg/ml):在20ml水中加入0.2g溴化乙锭,磁力搅拌数小时。然后用铝箔包裹容器或将溶液转移至棕色瓶中,室温保存。(4)加样缓冲液(Loading Buffer)一般为6×Loading Buffer二,电泳鉴定时注意事项:佩戴一次性手套,避免皮肤接触EB。无路做胶还是电泳缓冲液尽量用新的,不要超过两周。五,电泳步骤1, 50×TAE取10ml稀释成500ml,取50ml溶解0.5g琼脂糖。电炉上煮沸后加入EB 5ul。另外450ml TAE倒入电泳槽中。9, 用透明胶封
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