GCBI文献查询与基因分析

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3、为我所用？我们一起来试一试！关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理这篇文章我很关注，且有这么多的样本！对于我的研究很有帮助，要好好利用？这个编号好熟悉，去NCBI下数据！关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理你out了，GEO数据库下下来你能直接用吗？一堆原始数据看得懂吗？接下来看我的关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理发送到我的实验室去看看？实验室是什么实验室是什么？赶紧去注册一个赶紧去注册一个账号玩玩吧！账号玩玩吧！关注文献中的样本处理关注文献中的样本处理看看它在实验室里能发生什么GC-Lab能能为你做什为你做什么？么？导入样本数据处理获取结

4、果GC-Lab ？pGC-Lab是什么?对生物数据进行信息学解读，你可以在线自己操作的实验室pGC-Lab能做什么？设计具有可行性逻辑的思路对样本数据进行分析，想怎么玩就这么玩结果报告导出，为我所用GC-Lab 数据处理中心数据处理中心GC-lab怎么用？创建个人实验室、加入别人实验室创建个人实验室、加入别人实验室p样本：nine human immune cell subsets (neutrophils, eosinophils, monocytes, B cells, NK cells, CD4 T cells, CD8 T cells, mDCs and pDCs)p目的：identi

5、fy cell-type specific mRNAp检测平台：Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 ArrayGSE28490结果GC-Lab 分析分析思路设计思路设计创建、编辑创建、编辑项目项目GC-Lab 分析分析思路设计思路设计简便的方简便的方案设计，案设计，一键运行一键运行剩下的事交给实验室差异及聚类结果差异及聚类结果对运算结果不满意，参数任你调GC-Lab 分析思路设计分析思路设计小case，添加两个节点轻松帮你解决！想看看差异表达基因参与那些功能、通路？GC-Lab 本地数据本地数据上上传传放心，让你数据挖掘不求人文献数据处理了，我的实验室数

6、据还在本地呢！p对已有检测样本数据对已有检测样本数据p直接选择样本数据上传直接选择样本数据上传检测 基因芯片 二代测序 实验实验数据数据Sciencep高通量检测14个样本HTA 2.0芯片2个样本RNA-seqp检测数据都做了些什么？实验数据处理实验数据处理样本编号说明GSM1308838human_monocytes_0day in DC cultureGSM1308839human_cells_1day in DC cultureGSM1308840human_cells_2day in DC cultureGSM1308841human_cells_3day in DC culture

7、GSM1308842human_cells_5day in DC cultureGSM1308843human_dendritic cells_7day in DC cultureGSM1308844LV control_rep1GSM1308845LV control_rep2GSM1308846LV linc-DC RNAi_rep1GSM1308847LV linc-DC RNAi_rep2GSM1308848DMSO_rep1GSM1308849DMSO_rep2GSM1308850STAT3 inhibition _rep1GSM1308851STAT3 inhibition _re

8、p2验证样本实验样本数据利用数据利用http:/ GCBI科研工作者A：Science文章里检测了一大批样本， 但是只用到了差异分析，似乎有点可惜！科研工作者C：你们想些什么呢，你以为你想用就能用吗？科研工作者B：这些数据能为我所用吗？科研工作者：实验室我们可以随便用，看看去！到我的实验室去折腾折腾看看： GCBIpMonocytes经过6个时间点分化为Dendritic CellpHTA 2.0 芯片检测，获得mRNA、lncRNA表达数据p可分析mRNA、lncRNA随分化时间而发生表达变化的趋势p对mRNA进行GO、Pathway分析p分析lncRNA调控mRNA的共表达网络，找到核心调

9、控lncRNA和mRNA样本分析样本分析样本编号说明GSM1308838human_monocytes_0day in DC cultureGSM1308839human_cells_1day in DC cultureGSM1308840human_cells_2day in DC cultureGSM1308841human_cells_3day in DC cultureGSM1308842human_cells_5day in DC cultureGSM1308843human_dendritic cells_7day in DC culture有了对样本的深入分析，开工吧！http:/ 图形展示结果图形展示结果红色显示为显著性变化趋势，作为重点关注对象。点击可以查看显著性趋势中所属基因详细信息GC-Lab 可下载的分析结果可下载的分析结果结果报告下载到本地GC-Lab 可下载的分析结果可下载的分析结果完整下载结果报告，随意查看各部分详细结果核心基因核心基因 FOSB发现核心基因CCL22、TFRC、SELL、IL23A、FOSB分析共表达网络这些线索可以带给我什么？对对FOSB在免疫方面的研究就三篇文献在免疫方面的研究就三篇文献文献库中，发现以Immune为关键词进行查询共有905027篇，限制研究基因CCL22(36