Pubmed数据库检索课件

1、美国医学文献数据库PubMed一 认识Pubmed数据库 Pubmed的基本检索 1、初步检索 2、检索结果过滤器 3、结果显示设置 4、结果输出 5、更多信息 三 Pubmed的高极检索（检索历史功能）四 期刊数据库的检索五 Mesh主题词检索六 单引文匹配器（题录检索）主要内容一、数据库概况NIH： National Institutes of Health （国立卫生研究所） NLM： National Library of Medicine（国立医学图书馆） NCBI：National Center for Biotechnology Information（美国国立生物技术信息中心）

2、NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，是NIH底下的NLM的部门之一。Pubmed是NCBI数据库之一。（一）主办单位：NLM创建的生物医学文献书目型数据库（二）收录范围：年限：1949-今文献量： - 收录全球80多个国家和地区的5200多种生物医学期刊，大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 - 累积了2200多万篇文献，年收录文献约40万篇，涉及37个语种，回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库47%

3、为美国本土出版的文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文摘要。 PubMed是一个免费的生物医学文摘数据库，约10%论文提供全文（ PubMed Central, PMC），大部分论文提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。学科范围： - 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。 - 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 - 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。（三）PubMed数据来源MEDLINE（完整的核心数据）是美国

4、国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库，PubMed主体部分，1966至今的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE（早期的旧数据）1949-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有PubMed-OLDMEDLINE （三） PubMed数据来源MEDLINE Inprocess（正在被标引的数据）PubMed每天收录由Medline的期刊出版商提供的尚未经规范处理的数据，该库中的记录只有简单的书目信息和文摘，又称PreMedline 。该库中的数据每周一次转入MEDLI

5、NE，同时从PreMedline中删去。当进入MEDLINE时就会被标引，每条记录标有PubMed-in process。Not MEDLINE（数据商提供的数据）出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数据。出版商一般提供的是整本期刊的信息，一部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存。每条记录标有PubMed-as supplied by publisher。Pre-MedlineNew DataPubMedProcessMedlineCollect Not MedlineOldMedlinePubMed数据收录情况点击数据库名

6、称基本检索框高级检索题录检索主题词检索期刊检索输入检索式例1：检索有关心瓣膜疾病（heart valve disease）诊断（diagnosis）方面的文献。点击“Search”文献类型文献可获取内容读者评论出版时间物种语言性别主题期刊来源检索字段年龄 例2：检索近两年有关细胞凋亡的综述文献，要求检出免费全文 内容特征： apoptosis 外部特征： last 2 years review free full text 显示设置输出格式摘要文本格式摘要文摘文本格式文摘网页格式排序时间相关度出版时间第一作者通讯作者期刊标题结果输出文本剪贴板邮箱文献管理软件标题含有检索词文献 按收入时间/相关

7、度排序切换 按年统计的文章图表查找相关文献详细检索过程最近检索行为点击See more点击“URL”点击“Create alert”点击注册帐户点击注册输入用户名和密码点击登录显示用户名点击保存点击“My NCBI”二、高级检索1、检索式编制(search builder)通过字段限定和索引选词构建复杂检索式例3：研究更年期抑郁症激素替代疗法的非中文文献 内容特征 激素替代疗法 Hormone Replacement 更年期抑郁症 Involutional Depression 外部特征 非中文 NOT chinese输入检索词：hormone replacement直接编辑检索式执行检索执行

8、检索结果预览例4：检索2000年以来美国斯安那州Pennington Biomedical Center 的Smith SR在期刊Diabetes上发表了多少篇文献。五、主题词检索（MeSH Database）确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展主题词、主要主题词例5：欲查近5年研究肾衰竭饮食疗法并进一步观察其疗效的相关文献。 内容特征： renal failure diet therapy treatment outcome 外部特征： last 5 years 输入自由词：renal failure点按规范词可获详细注解主题词注释副主题词选择检索式构建盒加权扩展

9、树：不进行下位词扩检入口词：该规范词所代替的非规范词主题词树形结构表：显示该词的学科隶属关系 一篇文献的所有主题词中，论述文献中心的主题词称主要主题词（major topic headings） ,如以下三篇文献的所有主题词中红色框里带星号的就是主要主题词将组配检索式放入检索盒中输入新主题词：Treatment outcome进一步检索肾衰竭综合疗效观察（treatment outcome）选择逻辑组配符通过MeSH Database检索的结果，共85篇检索结果更为专指六、单引文匹配（ Single Citation Matcher)输入文献外部特征信息，查找特定文献。刊名要准确，缩写要标准著者姓名大小写不敏感例6：查找黄国俊2006年发表在中华肿瘤杂志上的文献1、查找“