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文档简介

1、关于超级计算环境 迟学斌中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心 2002年7月20日 内容动机 硬件平台建立系统运用软件根底并行软件平台科学计算平台运用领域网格实验平台建立我们的目的 动机“十五院信息化根底设备 改善科学研讨所需的计算环境更好地为我院知识创新任务效力提高我院在超级计算领域的影响国际开展动态 美国、欧洲和日本98%Earth Simulator，40万亿次众多超级计算中心动机国内开展情况 曙光系列，神威系列，银河系列 国家高性能计算中心CERNET高性能计算中心北京市高性能计算机运用中心上海超级计算中心北京运用物理与计算数学研讨所高性能中心 中科院计算机网络信息中心动机院内需求

2、分析 区域气候环境生态耦合方式需求2.53G的内存，4050G的硬盘，主频500M Hz的单CPU，大约需求运转8个月 第一原理资料设计处置几百甚至上千个原子的体系；需求7G内存，50G硬盘，64个Fe原子体系，1个k点(Gamma)，12500个平面波，384个能带，基态，无构造弛豫，SP3上128个节点并行时间为12分钟硬件平台建立超级计算机2TFLOPS集群计算机系统cluster大规模计算机系统MPP共享存储计算机系统SMP海量存储系统100TB磁盘阵列RAID磁带库RAIT系统运用软件用户运用环境网格技术Grid TechnologyGLOBUSGPDK异构系统资源的一致管理网络计算

3、效力根底并行软件平台数值代数软件BLASLAPACKScaLAPACK偏微分方程数值求解软件PETSc快速富氏变换FFTW科学计算平台生物信息学利用 EST 数据库发现新基因 地质与地球物文科学 三维地震成像数值模拟 资料科学第一原理资料设计 聚合物加工过程的根底研讨 科学计算平台计算机辅助药物分子设计和药物挑选 生态环境区域气候、环境和生态数值模拟 根底科学和运用科学 高精度差分方程与复杂流动的数值模拟 大系统的稳定性和分枝 网格并行自动生成器 运用领域生物信息学基因组序列拼接蛋白质构造预测资料科学高温液态分子构造分析生态环境环境监控与预告数值模拟 网格实验平台建立WANgrid.ncic.ac入口：grid.nhpc.ac155Mbps教育网1Gbps校园网东区、西区、安大10Mbps科研网100Mbps园区网曙光2000、曙光3000gridc.ac我们的目的 十六字：建立中心、完善环境、奠定根底、探求途径 建立中心-建立具有世界水准的、我院的超级计算中心万亿次计算才干、万亿字节存储才干完善环境-完善我院科

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