笔记三十六策第27策半壁江山学员cui

1、一、回颖+成熟模式lncRNA、circRNA、miRNA（调控性RNA）+外泌体现阶逻辑创新顶峰 加入嵌套细胞交互作用，提高故事深度。二、间接机1.间接机制的研一、回颖+成熟模式lncRNA、circRNA、miRNA（调控性RNA）+外泌体现阶逻辑创新顶峰 加入嵌套细胞交互作用，提高故事深度。二、间接机1.间接机制的研究主要聚焦于检通路分子的磷酸化蛋白及总蛋白的表达情况，如蛋的磷酸化/总量比值，提示通路的活化或抑制的情况由变量与通路之间一定存在能够介导磷酸化过程的酶（推论自然，所以可偷懒省略）2.主变量存在修饰作用的时候，是否存在省略做法1）举例：DNA甲基化研究主变量发生变化的原因，上游

2、找启动子区CpG岛甲基化测，通过启动子位点甲基化状态的变化，解为什么被封印/解封印，那是否必须去）也可测（类似间接2）举例：组蛋白甲基化，也可以只检测组蛋白位点甲基化状态3）举例：RNA修饰，蛋白修饰三、细胞交互的半套机制1.从哪里来到哪里只研究一 某个循环分子，这个分子作为疾病3）先提出发现一个分子，伴随疾病的发生，有特异性表达增高的现象（致病），明这个分子作为biomarker，关的表型过程。3）共同套：先建立一个循环分子与疾病临床特征之间的相关性 主变量依旧是循环分子，作为biomarker，需要符合临床意义的原则（断、预后评价、治疗疗效等） 三表一图（数据套餐：基线资料表、分析表、分析

3、表、预后生存曲线图Cox回归分ROC曲线（方法与金标准对效能如何阈值AUC）：AUC正常范围1（0.5-效能低，0.7-0.9正常，大于性相当好），纵坐标敏感度（真阳率），横Cox回归分ROC曲线（方法与金标准对效能如何阈值AUC）：AUC正常范围1（0.5-效能低，0.7-0.9正常，大于性相当好），纵坐标敏感度（真阳率），横坐标1-特异度（假阳性率a.交互细胞两种：供体细主变量、受体细胞接受主变量调控机一般来说机制解释：先下后上；真实：分子功能特性决定研究做上还是做下故事开头主变量的临床意义先解释清楚，一个价值的biomarker分子，一定是应分子么否定，它可以是一个表型伴随的产物，甚至是

4、废物关注下游效应的受体细胞途径，适变量是信号分子，作用是在细胞间传递号。当主变量没有特定的信号传递的功能下，解答上游如环，成为优先考往上往下由信号分子决定，信号分子可上可下，半套必然做下；非信号分子不能下，只能做上基础研究范畴里，大部分故事的主变量是具有信号传导功能的，往下游找受体细胞机 制是半套研究里更加常见的。循环分子里存在特殊分子，代谢组学（尿液），泌他们（找上游）。b.交互形式：供体细胞主入/破碎流出，受体细胞膜上接受信号/信号分子具体细节问题结合文献探索。不需要寻找新的交互形式，寻找文献模板参考举例蛋白信号肽外泌体胞内多泡小体与细胞膜融合，中间有关键的蛋白调控过程，阻断关蛋白，可以验证分子是否由某些细；细胞间交互模式来源3）验证主变量与表型关上游：验证表型的出现与主变，由主变量的分子类型决的关下游：主变量被受体细胞接受后，与表型获得之间的关操作细节：gain of function（受体细胞）一般做法是载体过表达，细胞交互课题直接将循环分子加入培养上清策略，两种策略都要做double check，增加说服上游与下游的区别在于表型与分子之间的因果关系颠上游：表型出现与分子在培养上清中表达变化之间关系，建立模诱导细胞，然去检测上