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文档简介
1、Enzyme酶酶的概念目前将生物催化剂分为两类酶 、 核酶(脱氧核酶)酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物具有高效催化作用的物质。酶学研究简史公元前两千多年,我国已有酿酒记载。一百余年前,Pasteur认为发酵是酵母细胞生命活动的结果。1877年,Kuhne首次提出Enzyme一词。1897年,Buchner兄弟用不含细胞的酵母提取液,实现了发酵。1926年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。1982年,Cech首次发现RNA也具有酶的催化活性,提出核酶(ribozyme)的概念。1995年,Jack W.Szostak研究室首先报道了具有DNA连接酶活性DNA片段,称为脱氧核酶(deo
2、xyribozyme)。第一节概述Introduction of Enzyme 一、 酶的分子组成蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子(cofactor) 金属离子小分子有机化合物全酶(holoenzyme)结合酶 (conjugated enzyme)单纯酶 (simple enzyme)*各部分在催化反应中的作用酶蛋白决定反应的特异性辅助因子决定反应的种类与性质金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。 金属激活酶(metal-activated enzyme) 金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。 金属离子的作用稳定酶的构象;
3、 参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。小分子有机化合物的作用在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其它基团。小分子有机化合物在催化中的作用 辅助因子分类(按其与酶蛋白结合的紧密程度) 辅酶 (coenzyme):与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。 辅基 (prosthetic group):与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤的方法除去。二、酶的命名1. 习惯命名法推荐名称2. 系统命名法系统名称一些酶的命名举例三、酶的分类1.氧化还原酶类(oxidoreductases)2.转移酶类 (transferases )3.水解酶类 (hy
4、drolases)4.裂解酶类 (lyases)5.异构酶类( isomerases)6.合成酶类 (ligases, synthetases)第二节 酶促反应的特点The Characteristic of Enzyme-Catalyzed Reaction 酶与一般催化剂的共同点在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点。 (一) 酶的不稳定性(二)酶促反应具有极高的效率 (高效性)酶促反应的特点酶的催化效率通常比非催化反应高1081020倍,比一般催化剂高1071013倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶和一般催化剂加速反应的机
5、理都是降低反应的活化能(activation energy)。酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能。 反应总能量改变 非催化反应活化能 酶促反应 活化能 一般催化剂催化反应的活化能 能量 反 应 过 程 底物 产物 酶促反应活化能的改变 活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量。一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶的这种特性称为酶的特异性或专一性。* 酶的特异性(specificity)(三)酶促反应具有高度的特异性根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,酶的特异性可大致分为以下3种类型:绝对特异性(absolute specificity
6、):只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物 。 相对特异性(relative specificity):作用于一类化合物或一种化学键。立体结构特异性(stereo specificity):作用于立体异构体中的一种。(四)酶促反应的可调节性对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包括三方面的调节。第三节酶的作用机制及调节The Mechanism of Action and Regulation on Enzyme 一、酶的活性中心必需基团(essential group)酶分子中氨基酸残
7、基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化学基团。目 录又称活性部位(active site),指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,该区域能与底物特异结合并将底物转化为产物称酶的活性中心。酶的活性中心(active center)活性中心内的必需基团结合基团(binding group)与底物相结合催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。活性中心外的必需基团底 物 活性中心以外的必需基团结合基团催化基团 活性中心 目 录二、酶原与酶原的激活酶原 (zymogen)有些酶在细胞内合成或初分泌时只
8、是酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。 酶原的激活在一定条件下,酶原向有活性酶转化的过程。 酶原激活的机理酶 原分子构象发生改变形成或暴露出酶的活性中心 一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或几个短肽在特定条件下赖缬天天天天甘异赖缬天天天天缬组丝SSSS46183甘异缬组丝SSSS肠激酶胰蛋白酶活性中心胰蛋白酶原的激活过程 酶原激活的生理意义避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并使酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证体内代谢正常进行。有的酶原可以视为酶的储存形式。在需要时,酶原适时地转变成有活性的酶,发挥其催化作用。三、 同工酶* 定义同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化学反应,而酶蛋
9、白的分子结构理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。HHHHHHHMHHMMHMMMMMMMLDH1 (H4)LDH2(H3M) LDH3(H2M2)LDH4(HM3)LDH5 (M4)乳酸脱氢酶的同工酶* 举例:乳酸脱氢酶(LDH1 LDH5)*生理及临床意义心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化1酶活性心肌梗死酶谱正常酶谱肝病酶谱2345(一)变构酶变构效应剂 (allosteric effector)变构激活剂变构抑制剂 变构调节 (allosteric regulation) 变构酶 (allosteric enzyme) 变构部位 (allosteric site)一些代谢物可与某些
10、酶分子活性中心外的某部分可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催化活性,此种调节方式称变构调节。四、酶的调节变构调节的特点 1.含有多个亚基,一般为偶数个,具有 四级结构。 2.变构剂与酶活性中心外的基团以非共价键结合。 3.作用快(二) 酶的共价修饰调节共价修饰(covalent modification)在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,此过程称为共价修饰。 常见类型磷酸化与脱磷酸化(最常见)乙酰化和脱乙酰化甲基化和脱甲基化腺苷化和脱腺苷化SH与SS互变 酶的磷酸化与脱磷酸化 -OHThrSerTyr酶蛋白H2OPi磷蛋白
11、磷酸酶 ATPADP蛋白激酶ThrSerTyr-O-PO32-酶蛋白共价修饰的特点 1.存在无活性(低活性)、有活性(高活性)两种形式 2.需酶的催化,受激素的调节 3.作用快、效率高 4.具有放大效应五、酶促反应的机理(一)酶-底物复合物的形成与诱导契合假说*诱导契合假说(induced-fit hypothesis)酶底物复合物 E + S E + P ES 酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶-底物结合的诱导契合假说 。目 录酶 的 诱 导 契 合 动 画(二)酶促反应的机理1. 邻近效应(proximity effect)与定向排列(or
12、ientation arrange ) 2. 多元催化(multielement catalysis) 3. 表面效应(surface effect)第四节影响酶催化作用的因素Influencing factor of Enzyme-Catalyzed Reaction 影响因素包括有底物浓度、酶浓度、温度、 pH、抑制剂、激活剂等。 研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比。SVVmax目 录一、底物浓度对反应速度的影响随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速。SVVmax目 录当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度。SVVmax目 录(
13、一)米曼氏方程式中间产物 酶促反应模式中间产物学说E + S k1k2k3ESE + P1913年Michaelis和Menten提出反应速度与底物浓度关系的数学方程式,即米曼氏方程式,简称米氏方程式(Michaelis equation)。S:底物浓度V:不同S时的反应速度Vmax:最大反应速度(maximum velocity) Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度,与 酶浓度成正。m:米氏常数(Michaelis constant) VmaxS Km + S 当反应速度为最大反应速度一半时 Km值的推导KmS Km值等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度,单位是mol/L。2K
14、m + S Vmax VmaxSVmaxVSKmVmax/2 (二)Km与Vmax的意义 Km值 Km等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。 意义 a) Km是酶的特征性常数之一; b) Km可近似表示酶对底物的亲和力; c) 可用于判断酶最适底物 d) 反映抑制剂或激活剂的存在。二、酶浓度对反应速度的影响当SE,酶可被底物饱和的情况下,反应速度与酶浓度成正比。关系式为:V = K E0 V E 当SE时,Vmax = k E 酶浓度对反应速度的影响 双重影响温度升高,酶促反应速度升高;由于酶的本质是蛋白质,温度升高,可引起酶的变性,从而反应速度降低 。 三、温度对反应速度的影响最适
15、温度 (optimum temperature):酶促反应速度最快时的环境温度。酶活性0.51.02.01.50 10 20 30 40 50 60 温度 C 温度对淀粉酶活性的影响 四、 pH对反应速度的影响最适pH (optimum pH):酶催化活性最大时的环境pH。0酶活性 pH pH对某些酶活性的影响 胃蛋白酶 淀粉酶 胆碱酯酶 246810五、激活剂对反应速度的影响激活剂(activator)使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质。 必需激活剂 (essential activator) 非必需激活剂 (non-essential activator)六、抑制剂对反应速度的影响
16、酶的抑制剂(inhibitor)凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白 变性的物质称为酶的抑制剂。 区别于酶的变性 抑制剂对酶有一定选择性 引起变性的因素对酶没有选择性 抑制作用的类型不可逆性抑制 (irreversible inhibition)可逆性抑制 (reversible inhibition):竞争性抑制 (competitive inhibition)非竞争性抑制 (non-competitive inhibition)反竞争性抑制 (uncompetitive inhibition)(一) 不可逆性抑制作用* 概念抑制剂通常以共价键与酶活性中心的必需基团相结合,使酶失活。 * 举
17、例有机磷化合物 羟基酶解毒 - - - 解磷定(PAM)重金属离子及砷化合物 巯基酶解毒 - - - 二巯基丙醇(BAL) 有机磷化合物路易士气失活的酶羟基酶失活的酶酸巯基酶失活的酶酸BAL巯基酶BAL与砷剂结合物(二) 可逆性抑制作用* 概念抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。竞争性抑制非竞争性抑制反竞争性抑制 * 类型. 竞争性抑制作用+IEIE + SE + PES反应模式定义抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。这种抑制作用称为竞争性抑制作用。 +EESIESE
18、IE P * 特点抑制程度取决于抑制剂与酶的相对亲和力及底物浓度,增加底物浓度可解除抑制;I与S结构类似,竞争酶的活性中心;动力学特点:Vmax不变,Km增大。 * 举例 丙二酸与琥珀酸竞争琥珀酸脱氢酶琥珀酸琥珀酸脱氢酶FADFADH2延胡索酸 磺胺类药物的抑菌机制与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶二氢蝶呤啶 对氨基苯甲酸 谷氨酸二氢叶酸合成酶二氢叶酸2. 非竞争性抑制* 反应模式E+SESE+P+ S S+ S S+ESIEIEESEP+IEI+S EIS +I* 特点抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合,底物与抑制剂之间无竞争关系;抑制程度取决于抑制剂的浓度;动力学特点:Vmax降低,Km不变
19、。 . 反竞争性抑制* 反应模式E+SE+P ES+IESI+ESESESIEP* 特点:抑制剂只与酶底物复合物结合;抑制程度取决与抑制剂的浓度及底物的浓度;动力学特点:Vmax降低,Km降低。 第五节 酶活性测定The Dtermination of Enzyme Activity 酶活性测定和酶活性单位1.酶的活性是指酶催化化学反应的能力,其衡量的标准是酶促反应速度。2.酶促反应速度可在适宜的反应条件下,用单位时间内底物的消耗或产物的生成量来表示。 3.酶的活性单位是衡量酶活力大小的尺度,它反映在规定条件下,酶促反应在单位时间(s、min或h)内生成一定量(mg、g、mol等)的产物或消耗一定数量的底物所需的酶量。 -酮戊二酸 + 丙氨酸 丙酮酸 +谷氨酸 谷丙转氨酶一个谷丙转氨酶单位:2.5g丙酮酸/30分钟/1ml血清反应条件为pH7.4
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