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文档简介
1、1、将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓 度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。2、至少3次以上冻溶。3、IFCC推荐法:收集细胞悬液,4C低温离心(3000rpm,5min),弃上清,加入一定量PBS (200ul),轻轻吹 打混匀,-200C冷冻30 min,370C解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。4、用液氮冻融三四次就可以了,细胞冻住后,取出放37度水浴,溶解后震荡,再冻二、超声波处理法1、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这 些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数2
2、0次。2、每个样本超声时间5秒,每个间隔5秒,粉碎5次。3、100ml菌液离心,用8ml缓冲液悬浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超声处理。750W40% 功率。5秒超声,9秒间隔。超声至少90min。4、综合冻融和超声的方法:1500g离心,弃除上清。冰上,用小体积PBS重悬细胞。将重悬液集中,1500g离心浓缩,弃除上清。液氮骤冷。用约5倍体积的PBS缓冲液重悬细胞, 并搅拌。可选择:4C下超声破碎细胞。加入终浓度为0.25M的KCl,15mM的DTT4C下111500gX60min 离心裂解液。取出上清。过柱子。Purification of GST-Fusion Proteins
3、 from E. coli-Alternate Protocol三、渗透法:冰冷的 20 mmol/L Tris-Cl (pH8.0),2.5 mmol/L EDTA 处理,冰浴放置 10min。精编分子生物学实验指南四、裂解液处理法:1、细胞裂解液:50 mmol/L Tris-Cl pH 6.8,100 mmol/L DTT,2% SDS,0.1%漠酚蓝,10%甘油。 SDS是阴离子型表面活性剂、极易促溶、强变性作用。2、在loading buffer加SDS,100度5分钟,是变性方法。SDS与蛋白等量结合,可以通过条 带位移判断蛋白大小,考染不会影响结果。3、如果是做小量菌液,跑PAG
4、E胶看其表达情况的话,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5 分钟即可,需注意的是上样前要离心12000rpm至少5分钟,然后上样时,枪头别吸最底下的。4、20 毫升细胞裂解液配方:40 L 0.5M EDTA (PH8.0),4 ml 10% SDS,1 ml 1M Tris-cl(PH6.8),14.96 ml蒸馏水。5、我始终未明白楼主如果想收集全蛋白,而不考虑包涵体的话,为何要用超声呢?直接水煮不 就可以了吗?6、将1ml菌离心弃上清,留大概50ul,再加50ul 2X上样缓冲液,煮10min,取20ul上样, 就可以了。7、检测蛋白诱导:从培养的不同时期各取出1ml,120
5、00gX1min离心。将沉淀重悬于100ul 1XSDS上样缓冲液(50mM Tris-Cl (pH6.8),100mM DTT,2%SDS,0.1%漠酚蓝,10%甘油)中,100C加热 3min,然后 12000gX1min 离心。上样 15ul,6%SDS电泳。分子克隆P8268、5-10秒离心,弃除上清,用50ul蒸馏水重悬沉淀。加入1ul PMSF,再加入50ul热的2XSDS 上样缓冲液(100C加热)。迅速混匀后100C加热3-5min。将样品冰上放置(或-20C放置), 然后再溶解,煮沸1min。离心30秒。上样5ul进行SDS电泳。2XSDS 上样缓冲液:250mMTris-C
6、l,6.2%(w/v) DTT,8%SDS,0.002%(w/v)漠酚蓝,40% 甘油。Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli。9、裂解液:50mMTris-HCl(pH8.59.0),2mMEDTA,100mMNaCl,0.5%TritonX-100,1mg/ml 溶菌 酶。10、我们用NP40 (NP40: NONIDET p-40乙基苯基聚乙二醇,是一种非离子表面活性剂。)加DTT 和蛋白酶抑制剂裂解细胞,冰上放30 60min,然后13000rpm离心15min,取上清定量。11、 裂解液配方是:50mmol/L Tirs-HC
7、I (PH 8.0),150mmol/L NaCI,0. 02% 叠氮钠,100口 g/ml PMSF,川 g/ml Aprotinin, 1% Triton X-100 ( or NP-40)。12、对于组织培养中生长的细胞,最有效的裂解方法是用去污剂(表面活性剂)进行处理,溶解 细胞膜并溶解蛋白质。50mmol/L Tirs-HCl(PH 8.0)、150mmol/L NaCl、0. 02% 叠氮钠、100口 g/ml PMSF、1 口 g/ml Aprotinin、1% Triton X-100 ( or NP-40),这种裂解液可能是最常用的裂解 缓冲液。13、 细胞裂解液的主要目的:
8、(1)利用去污剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;(2)溶解蛋白; (3)蛋白变性使其稳定;(4)抑制蛋白酶活性。推荐 RIPA buffer:50 mM Tris-HCl pH 7.4 (缓冲体系),150 mM NaCl (等渗体系),1 mM PMSF (强大的蛋白酶抑制剂),1mMEDTA (变性剂和稳定剂),5 Mg/ml Aprotinin (蛋白酶抑制剂),5 Pg/ml Leupeptin(蛋白酶抑制剂),1% Triton x-100 (破坏细胞),1% Sodium deoxycholate (中度变性剂和蛋白溶解剂),0.1% SDS (强变性剂和蛋白溶解剂)。14、裂解 bu
9、ffer: 50mM HEPES pH7.0,1mM 甘油,1mM DTT (还原剂),7M 尿素,2M 硫脲(可以 提高膜蛋白的融解),1mM EDTA(金属鏊合剂),1mM PMSF,1mg/ml leupeptin,1mg/ml aprotinin, 1mg/ml pepstatin(蛋白酶抑制剂),50mM NaF(ph7.0) (anti hemoaggulating),1mM Na3VO4(ph7.0)(inhibitor of phosphatases) , 2mM benzamidine (inhibitor of trypsin)。15、可选择:取0.5ml诱导的细胞并离心2
10、min。弃除上清,用100ul 1XSDS上样缓冲液重悬, 冰上放置。6000rpmX10min离心培养物。弃除上清,用10ml预冷的裂解液重悬沉淀。液氮骤冷细胞或-20C 冷冻细胞。在冷水中溶解细胞。15秒、4次超声处理细胞。冰浴降温4C, 9000gX30min离心。 取上清。裂解液:5 mM DTT, 15 mM KCl, 5 mM MgCl2, 50 mM HEPES, pH 7.9, 1 mM EDTA, 10 mg/ml 溶 菌酶(临用前加上DTT和溶菌酶)。Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli-Basic Protocol16、收集细胞。在液氮中突然冷冻细胞
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