结核分枝杆菌基因组学课件

结核分枝杆菌基因组学结核分枝杆菌基因组学1结核分枝杆菌基因组学黄海荣国家结核病参比实验室结核分枝杆菌基因组学2提纲一、结核分枝杆菌基因组总论目前一些相关实验室技术的遗传学背景1基因分型技术2耐药的分子生物学诊断3新近的新疫苗、免疫诊断技术提纲3GenomeofM.tuberculosisMoreThanMapsof4,000genesotherspp.nearlyidenticalM.tuberculosis4,411.529bpColeetal.(1998)Nature393:537-544GenomeofM.tuberculosis4AdiameteLargegroove(-2A34LengthofoneSmallgrooveppositepolarityAxisA5TheStructureofDNA5′endbasesCminorgroove3endp-O0.34nmmajorgrooveAGA0-P-OO=P-Ohydrogenbondphosphodiester5′endFigure4-5.MolecularBiologyoftheCell,4thEditionTheStructureofDNA6TABLE11.1ThegeneticCodeFirstThirdPositionecondPositio(5-end)Positio(3’end)UUUPheUCUSerUAUTyrUGUCYSUUCPheUCCSeUACTVIUGCC\UUALeuUCASerUAAStopUGAStopUUGLeuUCGSerUAGStopUGGTrpGCUULeuCCUProCAUHisCGUArgCUCLoCCCProCACHisCGCArgCUALetCCAProCAAGInCGAArgCUGLeuCCGProCAGGInCGGArgAUUlleACUThrAAUAsnAGUSerAUClleACCThiAACAsnAGCSerAAUAleACAThrAAAIAGAArgAUGMetaACGThrAAGLvAGGArgUCAGUCAGUCAGUCAGUUValGCUAlaGAUAspGGUGlyGUCValGCCAlaGACAspGGCGlyGUAValGCAAlaGAAGluGGAGIGUGValGCGAlaGAGGluGGGGlyTABLE11.1ThegeneticCode7NativedoubleStrandsDoublehelixstrandsreformedHeatMCoolDenaturationRenaturationNativedouble8HierarchicalShotgunSequencingMethod这GenomicdNABACLibraryCreatecontigmiSequenceeachcontiwithShotgunAppoachAlignContiguousSequencesGCHTICGAGILHCCHGACRACOGGTACTGAGGACCCRAGAGCF.rjHierarchicalShotgunSequencin9WholegenomeshotgunsequencingofshotgunicDNApartialdigestionoverlappingDNA了Nf1-2kbWholegenomeshotgunsequencin10WholegenomeShotgunSequencingMethodGenomicdnaSequenceEachFiagmentwithShotgunApproachCCATVICGAGTIACCTGGACRACCAGTlignContiguousSequencesTSP.GtnelateFmishedsecnutctWholegenomeShotgunSequencin11结核分枝杆菌基因组学课件12结核分枝杆菌基因组学课件13结核分枝杆菌基因组学课件14结核分枝杆菌基因组学课件15结核分枝杆菌基因组学课件16结核分枝杆菌基因组学课件17结核分枝杆菌基因组学课件18结核分枝杆菌基因组学课件19结核分枝杆菌基因组学课件20结核分枝杆菌基因组学课件21结核分枝杆菌基因组学课件22结核分枝杆菌基因组学课件23结核分枝杆菌基因组学课件24结核分枝杆菌基因组学课件25结核分枝杆菌基因组学课件26结核分枝杆菌基因组学课件27结核分枝杆菌基因组学课件28结核分枝杆菌基因组学课件29结核分枝杆菌基因组学课件30结核分枝杆菌基因组学课件31结核分枝杆菌基因组学课件32结核分枝杆菌基因组学课件33结核分枝杆菌基因组学课件34结核分枝杆菌基因组学课件35结核分枝杆菌基因组学课件36结核分枝杆菌基因组学课件37结核分枝杆菌基因组学课件38结核分枝杆菌基因组学课件39结核分枝杆菌基因组学课件40结核分枝杆菌基因组学课件41结核分枝杆菌基因组学课件42结核分枝杆菌基因组学课件43结核分枝杆菌基因组学课件44结核分枝杆菌基因组学课件45结核分枝杆菌基因组学课件46结核分枝杆菌基因组学课件47结核分枝杆菌基因组学课件48结核分枝杆菌基因组学课件49结核分枝杆菌基因组学课件50结核分枝杆菌基因组学课件51结核分枝杆菌基因组学课件52结核分枝杆菌基因组学课件53结核分枝杆菌基因组学课件54结核分枝杆菌基因组学课件5531、只有永远躺在泥坑里的人，才不会再掉进坑里。——黑格尔

32、希望的灯一旦熄灭，生活刹那间变成了一片黑暗。——普列姆昌德

33、希望是人生的乳母。——科策布

34、形成天才的决定因素应该是勤奋。——郭沫若

35、学到很多东西的诀窍，就是一下子不要学很多。——洛克31、只有永远躺在泥坑里的人，才不会再掉进坑里56结核分枝杆菌基因组学结核分枝杆菌基因组学57结核分枝杆菌基因组学黄海荣国家结核病参比实验室结核分枝杆菌基因组学58提纲一、结核分枝杆菌基因组总论目前一些相关实验室技术的遗传学背景1基因分型技术2耐药的分子生物学诊断3新近的新疫苗、免疫诊断技术提纲59GenomeofM.tuberculosisMoreThanMapsof4,000genesotherspp.nearlyidenticalM.tuberculosis4,411.529bpColeetal.(1998)Nature393:537-544GenomeofM.tuberculosis60AdiameteLargegroove(-2A34LengthofoneSmallgrooveppositepolarityAxisA61TheStructureofDNA5′endbasesCminorgroove3endp-O0.34nmmajorgrooveAGA0-P-OO=P-Ohydrogenbondphosphodiester5′endFigure4-5.MolecularBiologyoftheCell,4thEditionTheStructureofDNA62TABLE11.1ThegeneticCodeFirstThirdPositionecondPositio(5-end)Positio(3’end)UUUPheUCUSerUAUTyrUGUCYSUUCPheUCCSeUACTVIUGCC\UUALeuUCASerUAAStopUGAStopUUGLeuUCGSerUAGStopUGGTrpGCUULeuCCUProCAUHisCGUArgCUCLoCCCProCACHisCGCArgCUALetCCAProCAAGInCGAArgCUGLeuCCGProCAGGInCGGArgAUUlleACUThrAAUAsnAGUSerAUClleACCThiAACAsnAGCSerAAUAleACAThrAAAIAGAArgAUGMetaACGThrAAGLvAGGArgUCAGUCAGUCAGUCAGUUValGCUAlaGAUAspGGUGlyGUCValGCCAlaGACAspGGCGlyGUAValGCAAlaGAAGluGGAGIGUGValGCGAlaGAGGluGGGGlyTABLE11.1ThegeneticCode63NativedoubleStrandsDoublehelixstrandsreformedHeatMCoolDenaturationRenaturationNativedouble64HierarchicalShotgunSequencingMethod这GenomicdNABACLibraryCreatecontigmiSequenceeachcontiwithShotgunAppoachAlignContiguousSequencesGCHTICGAGILHCCHGACRACOGGTACTGAGGACCCRAGAGCF.rjHierarchicalShotgunSequencin65WholegenomeshotgunsequencingofshotgunicDNApartialdigestionoverlappingDNA了Nf1-2kbWholegenomeshotgunsequencin66WholegenomeShotgunSequencingMethodGenomicdnaSequenceEachFiagmentwithShotgunApproachCCATVICGAGTIACCTGGACRACCAGTlignContiguousSequencesTSP.GtnelateFmishedsecnutctWholegenomeShotgunSequencin67结核分枝杆菌基因组学课件68结核分枝杆菌基因组学课件69结核分枝杆菌基因组学课件70结核分枝杆菌基因组学课件71结核分枝杆菌基因组学课件72结核分枝杆菌基因组学课件73结核分枝杆菌基因组学课件74结核分枝杆菌基因组学课件75结核分枝杆菌基因组学课件76结核分枝杆菌基因组学课件77结核分枝杆菌基因组学课件78结核分枝杆菌基因组学课件79结核分枝杆菌基因组学课件80结核分枝杆菌基因组学课件81结核分枝杆菌基因组学课件82结核分枝杆菌基因组学课件83结核分枝杆菌基因组学课件84结核分枝杆菌基因组学课件85结核分枝杆菌基因组学课件86结核分枝杆菌基因组学课件87结核分枝杆菌基因组学课件88结核分枝杆菌基因组学课件89结核分枝杆菌基因组学课件90结核分枝杆菌基因组学课件91结核分枝杆菌基因组学课件92结核分枝杆菌基因组学课件93结核分枝杆菌基因组学课件94结核分枝杆菌基因组学课件95结核分枝杆菌基因组学课件96结核分枝杆菌基因组学课件97结核分枝杆菌基因组学课件98结核分枝杆菌基因组学课件99结核分枝杆菌基因组学课件100结核分枝杆菌基因组学课件101结核分枝杆菌基因组学课件102结核分枝杆菌基因组学课件103结核分枝杆菌基因组学课件104结核分枝杆菌基因组学课件105结核分枝杆菌基因组学课件106结核分