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文档简介
siRNAvs (mRNAvssiRNAvs humanbrachyuryoranyothergene
Brachyuryknockdowninα-
BySuleiPax6knockdowninpax6pax61.5relativerelativemRNA0.5
10.91
0.53
0.740scramble pax6- pax6- pax6-11717-22-7-22-11RNAInfected 6- relativerelativemRNA1
Infectedon 0
pax6-8-22-11
pax6-
(RepeatrelativemRNArelativemRNA110
8-30-
Infectedon pax6-(Repeatpax6-Protein Establishdirect&conditionalshRNAknock-Makesconstructs(addtargetsequencestoSico/SicoRandseuencin andtesttheInfectyourcellsandchecktheknockdownoftargetgenesandmTORshRNAcandidate•7•7• •7•7• • •7•7•7•7•7•7•8 •7••7•7•7•8• •7•7•7
•7•8•7•7•750%40%30%20%10%0%pSicoR-mTOR-50%40%30%20%10%0%pSicoR-mTOR-shRNA-pSicoR-mTOR-shRNA-pSicoR-mTOR-shRNA-pSicoR-mTOR-shRNA-pSicoR-2-shRNApSicoRintactclone Abortedclone100%100%90%percentagepercentageof70%60%mTOR- (Zhouetal,PNAS,(Zhouetal,PNAS, 激 HumanKinomeshRNA(>700humankinase,3,700shRNAconstructs)
Intracellular
Sox-
Oct-KinomeprovidestheentrypointforhESCchemical
humankinomeshRNA smids
2293T
Colonyspread(16kinasewasidentified,unpublishedsiRNA:Dharmacon公司SmartpoolshRNA:SigmapLKOAmbionsiRNAtargetfinderOligoMaker建议:尽量选用已 shRNA48hsiRNAshRNA48h mRNA水平:最好选用定量蛋白水平:多个时间点的Westernblotting ’OE“挽救”干扰表型实验’55CodingCoding 列withwith
PickupSingle
First1 2 3 4 5 61234561 2 3 4 5 6 1234567 8 9 7 8 9 789789Singlecoloniesformedfromsingle
Third
InIn
Second
Selectedknock-downstablecelllines(MILLERJC,Naturebiotechnology,2011;MOSCOUMJ,Science,BOCHJ,Science,2009;LIT,Nucleicacidsresearch,
名名
SUNN,MolecularbioSystems,CRISPRsclusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats WeiC,etal.JGenetGenomics.CRISPRgRNA Guidesequence的接头序列与载体BbsI ZhangLab,NatProtoc.2
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