病毒的分类和命名专家讲座

第四章病毒分类和命名P21~43病毒的分类和命名专家讲座第1页第四章病毒分类和命名病毒是一类比较原始、有生命特征、能够自我复制和严格细胞内寄生非细胞生物病毒定义伴随分子病毒学发展而不停延伸类病毒、卫星病毒、朊病毒发觉丰富了病毒学内容病毒分类学是伴随病毒学尤其是分子病毒学发展而建立起来，并逐步走向成熟。病毒的分类和命名专家讲座第2页生物资源种类类群已知种预计种已知种占百分比%病毒54504000001.3细菌66601000006.7真菌7200015000005藻类4000040000010被子植物27000032000084原生动物4000020000020线虫150005000003昆虫950000800000012鱼类190002400080鸟类91989500~

100哺乳动物41704300~100仅从1994年不完全统计，已经有新发觉约40种病毒对人类健康组成新威胁；AIDS、疯牛病、肝炎、感冒、SARS；病毒的分类和命名专家讲座第3页本章关键点了解病毒分类现实状况病毒分类与其它微生物分类区分病毒分类主要依据病毒的分类和命名专家讲座第4页第四章病毒分类和命名一、病毒分类与命名沿革二、关于病毒密码程式三、病毒分类进展及最新分类系统病毒的分类和命名专家讲座第5页一、病毒分类与命名沿革1.1961以前各自研究领域科学家提出或建立一些分类系统，进展迟缓，缺乏国际间协作；2.1962~1966借助国际微生物学术会议(1966,莫斯科)，建立国际病毒命名委员会(ICNV，InternationalCommitteeforNomenclatureofVirus)3.1966~1970Wildy任ICNV主席期间，组织国际间协作，发表ICNV第一次汇报4.1971~今病毒分类与命名工作得到巩固和发展病毒的分类和命名专家讲座第6页一、病毒分类与命名沿革1961以前植物病毒分类法(1)Johnson＆Hoggan提出分类标准(1935):病毒传输方式及昆虫介体自然寄主植物范围及判别寄主在活体外存活期致死温度症状特点病毒的分类和命名专家讲座第7页一、病毒分类与命名沿革1961以前植物病毒分类法(2)Hansen(1956):强调拉丁双名法属名应反应出寄主类别、传输方式及病毒颗粒形态，分4目：蚜传病毒目(Aphivirales)叶蝉传病毒目(Cicavirales)无介传病毒目(Invirales)介传传病毒目(Xenovirales)病毒的分类和命名专家讲座第8页一、病毒分类与命名沿革1961以前动物病毒分类法依据组织胚胎学与病毒组织亲和性，将脊椎动物病毒分为8个类群临床及流行病学分类法（依据病毒传染路径、侵染部位及所致症状分10群）昆虫病毒分类法(依据病害类型、包含体有没有及形状分4~5属）(1)外胚层病毒群(2)外胚层及内胚层病毒群(3)中胚层及内胚层病毒群(4)外胚层向神经性病毒群(5)内胚层向神经性病毒群(6)中胚层病毒群(7)血流感染病毒群(8)致肿瘤病毒群(1)呼吸道病毒群(2)肠道病毒群(3)肝炎病毒群(4)皮肤及黏膜病毒群(5)虫媒病毒群(6)神经系统病毒群(7)眼病毒群(8)唾液腺病毒群(9)慢病毒群(10)肿瘤病毒群(1)波氏病毒属：多角形包涵体(2)史氏病毒属：折光性和多态性包涵体(3)勃氏病毒属：细胞质内有颗粒状包涵体(4)瓦氏病毒属：昆虫痘病毒(5)摩氏病毒属：无包涵体病毒的分类和命名专家讲座第9页一、病毒分类与命名沿革2.1962~1966成立国际病毒命名委员会(ICNV），制订4项基本方针：必须明确列出病毒组（或属）提出这些组代表组员（种）提出各组（或属）名称探讨利用密码进行分类方法存在问题：（1）存在显著不调和态度（2）脊椎动物病毒分类与其它病毒分类差异显著（3）需同时应用专门知识并采取共同路径（4）制订病毒学工作者愿意采取病毒名称病毒的分类和命名专家讲座第10页一、病毒分类与命名沿革1966~1970Wildy任ICNV主席,第一次汇报——病毒分类与命名，描述并划定43个属（或相当于属组、群）及其它组员；《病毒学论文集》第5卷采取了密码进行分类（每个密码包含4对符号）；经过了“国际病毒命名法则”，共18项。病毒的分类和命名专家讲座第11页一、病毒分类与命名沿革4.1970~国际病毒命名委员会(ICNV)改为国际病毒分类委员会(ICTV,1973)；第三届国际病毒学代表大会，ICTV汇报特点：从实际工作出发，首先按宿主分五大类；病毒化学组成、形态结构、生理生化仍是主要依据；增加了科、属、种、群名词词源；设置七个小组委员会。ICTV八次汇报(年7月），不停修改。寄生于一个以上寄主只寄生于脊椎动物只寄生于无脊椎动物只寄生于细菌只寄生于植物病毒的分类和命名专家讲座第12页病毒分类国际组织机构1病毒命名分会委员会（SCNV)1951

SubcommitteeonVirusNomenclature巴西里约热内卢：第五届国际微生物学会议病毒的分类和命名专家讲座第13页SCNV推荐病毒分类8条标准：1、形态和复制方法2、化学成份和物理性质3、免疫学性质4、对物理、化学因子敏感性5、自然传输方式6、与寄主、组织或细胞关系7、包含内含体形成病理学8、症状学（1951年第五届国际微生物学会）把早期分类学上生物学特征，尤其是症状学特征降到相对次要地位病毒的分类和命名专家讲座第14页病毒分类国际组织机构国际病毒分类委员会

病毒命名筹备委员会(PCNV)1963PreparatoryCommitteeforNomenclatureofVirus国际病毒命名委员会(ICNV)1966InternationalCommitteeforNomenclatureofVirus国际病毒分类委员会(ICTV)1973年InternationalCommitteeonTaxonomyofVirus病毒的分类和命名专家讲座第15页PCNV推荐病毒分类8条标准：1、核酸类型、结构和分子量；2、病毒粒子形状和大小；3、病毒粒子结构；4、病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂敏感性；5、血清学性质和抗原关系；6、病毒在细胞培养上繁殖特征；7、对除脂溶剂以外理化因子敏感性；8、流行病学特征。（1963年国际微生物学命名委员会病毒分会）病毒的分类和命名专家讲座第16页ICNV宗旨：1、建立一个国际公认病毒分类系统2、为各分类组群确定一个国际公认名称3、经过举行会议、出版汇报、交流病毒学家关于病毒分类和命名最新结果

病毒的分类和命名专家讲座第17页二、关于病毒密码程式cryptogram核酸类型核酸分子量病毒粒子外形寄主种类：：：核酸链类型核酸含量核衣壳外形传输方式/传输介体

R/1:2/5:E/E:S/ORNA/SS:200万Da/5%:截头杆状/截头杆状:种子植物/确切介体不详R/1:2.3/5+0.6-1.3/5:E/E:S/Ne(TRV)1966年，国际病毒命名委员会ICNV建立“编码子委员会”1977年底止病毒的分类和命名专家讲座第18页三、病毒分类进展及最新分类系统1、病毒命名与分类依然很乱，不够统一命名：地名(马尔堡，布尼亚)、人名(Rous,Epstein&Barr)症状或病理特征(花叶，登革热，脊髓灰质炎等)病毒粒子形态(弹状、丝状等)宿拼字、字母、数字(Bromo,T4,ΦX174)分类：动物病毒分类等级——科、属、种植物病毒——组、亚组、种病毒的分类和命名专家讲座第19页三、病毒分类进展及最新分类系统95年以前植物病毒不设目95年采取科、属、种分类系统1991年ICTV第5次汇报设1个目：

单分子负链RNA病毒目Mononegavirales1999年第7次分类汇报：认可病毒约4000种，设3个目将全部已知病毒，依据核酸类型分为八大类群:DNA病毒——ssDNA病毒DNA病毒——dsDNA病毒DNA与RNA逆转录病毒RNA病毒——dsRNA病毒RNA病毒——负链、ssRNA病毒RNA病毒——正链、ssRNA病毒裸露RNA病毒类病毒另增设亚病毒因子(subviralagent)病毒的分类和命名专家讲座第20页2、病毒最新分类系统：1999年第7次分类汇报：3个目、64科、233属有尾噬菌体目caudovirales3科dsDNA单分子负链RNA目mononegavirales

4科-ssRNA套病毒目nidovirales2科+ssRNA未确定目55科未确定目、科（独立属）29属亚病毒感染因子：subvirus卫星病毒satellites类病毒viroids2科朊病毒prions不是全部病毒都必须隶属某个目，在没有适当目标情况下，科能够是最高病毒分类等级年，在巴黎召开ICTV会议，产生6个新科，8个新属另有3个属名发生改变病毒的分类和命名专家讲座第21页2、病毒最新分类系统：年第8次分类汇报(1259页)：5450个病毒3个目；73科、11亚科；289属1950种最大特点：深入明确了“种”作为病毒分类系统中最小分类阶元，在每一个确定种下面列出了最少1个、至多几十个不一样分离物以及它们在GenBank上登录号，增加了许多反应病毒基因序列同源性关系系统树图，并将原子分辨率粒子三维结构插入到对应科/属中，使读者对病毒粒子空间结构有更详细了解。病毒的分类和命名专家讲座第22页三、病毒分类进展及最新分类系统1、病毒“种species”定义：Avirusspeciesisdefinedas“apolytheticclassofvirusesthatconstitutesareplicatinglineageandoccupiesaparticularecologicalniche”

组成一个复制谱系——系统进化特征(共同祖先）占据特定小生境——特定生物学特征、地理分布、寄主范围、致病机理等含有多个分类特征——多标准分类“Species”:一个基本分类单元，一大群表型特征高度相同，亲缘关系极其靠近，与同属内其它物种有显著差异菌株总称。病毒的分类和命名专家讲座第23页植物病毒曾使用：1、俗名法寄主俗名+症状特点+“病毒”烟草花叶病毒Tobaccomosaicvirus2、目录法寄主俗名+“病毒”+在寄主上发觉次序TMVTobaccovirus1TEVTobaccovirus7(etch蚀纹）3、拉丁双名法寄主属名+病毒TMVNicotianavirus3、病毒命名不统一病毒的分类和命名专家讲座第24页4、病毒命名普通规则：病毒命名不是采取Linnaeus创建双名法．地名、人名(如Rous、EB)症状或病理特征(如花叶、登革热、脊髓灰质炎)病毒粒子形态(如弹状、丝状、纺锤状)宿拼字、字母、数字(如T4)为了使病毒命名能够统一，ICTV在原有病毒分类和命名规则基础上，于1996年8月在耶路撒冷召开第十届国际病毒大会上，公布了病毒分类和命名38条规则。1998年在ICTV常务委员会提议下，又同意了41条新分类和命名规则。（普通规则、种规则、属规则、科规则…书写规则…）病毒的分类和命名专家讲座第25页4、病毒命名普通规则：1、分类和命名应是国际性．并普遍适合用于全部病毒；2、国际病毒分类系统采取目(order)、科(family)、亚科(subfamily)、属(genus)、种(species)分类阶元；3、ICTV不负责病毒种以下分类和命名，病毒种以下血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株名称由公认国际教授小组确定；4、人工产生病毒和试验室构建杂种病毒在病毒分类上不予考虑，它们分类由公认国际教授小组负责；5、分类阶元只有在病毒代表种特征得到充分了解和在公开出版物上进行过描述，以