医学文献检索2010

医学文献检索与利用温州医学院图书馆潘鹏程Tel:660949E-mail:panpengcheng@126.com学习目的与意义1、《文献检索》就是一种培养学生“找知识”的知识课Ifyougivehimthefish,hewillhaveasinglemeal.Ifyoutechhimhowtofish,hewilleatallhislife."“授人以鱼，不如授之以渔”，授人以鱼只救一时之急，授人以渔则可解一生之需。2、信息改变生活,信息创造生活，培养、提高学生的信息素质信息素质指能够意识到何时需要信息，能够查找，评价，利用信息的一系列能力。它能够引发、支持和维系终身学习。关于信息素质的解释有很多,综合起来就是三个方面:运用信息的能力，学习信息技术的能力，利用信息解决问题的能力。3.为科研文献检索与科研做准备科技文献检索与科研美国科学基金会凯斯工学院基金委员会

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日本国家统计局的数字

思考计划7.7%一个研究人员的全部工作时间中

一个研究人员的全部工作时间中查阅文献50.9%一个研究人员的全部工作时间中科学实验32.1%一个研究人员的全部工作时间中编写报告9.3%科技文献检索与科研

科技人员要从浩如烟海的文献洪流中快、全、准地查到与课题有关资料，就应该了解文献检索的知识和方法，掌握检索基本功。教学要求教学方式：讲课与实习结合考核方式：平时成绩占20%，上机考试成绩占80%。地点：理论与实践课均在图书馆电子阅览室A202课程进度文献信息检索基本知识CBM数据库检索和实习CNKI数据库检索和实习VIP数据库检索和实习万方数据库检索和实习MEDLINE数据库检索和实习PubMed检索和实习网络信息检索第一章、医学信息检索基础1.1信息、知识、情报、文献

1.2文献的类型

1.3文献检索基本知识

1.4计算机信息检索技术

1.5编写检索式与调整检索策略

1.6参考工具书

1.1信息、知识、情报、文献信息（information）：是自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在的，是泛指一切事物（包括物质的或精神的）运动的状态及运动的方式。简而言之，是指事物存在和运动状态及其特征的反映。根据来源分类：信息分为自然信息、生物信息、电子信息和社会信息四大类。

信息无时不在，无处不有，充斥着整个宇宙。现在，人们将信息视同与物质、能源一样重要的三大资源之一。

知识（knowledge）：知识是人类对客观事物的认识、实践经验的总结，它来源于信息。知识是一种特定的人类信息，它是对信息进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高和深化，形成较为完整的科学知识体系。知识按其内容可分为自然科学知识和社会科学知识，医学知识属于自然科学的范畴。情报（information、intelligence）:情报来源于知识，必须在特定的时间内经过及时传递，并能为用户所接受和利用。最初用于战争，“战时敌情之报告”。后来应用领域越来越广，如经济情报、科技情报等等。国内图书情报界对情报的解释常不同，我们把情报定义为“解决一个特定问题所需要的知识，是激活了的知识“医学情报，则指获取所需的医学知识情报具有三个特性：知识性、传递性、效用性。文献(1iterature):文献是指记录有知识的一切载体，是用文字、图表、可视图像、符号、声频、视频等手段，记录知识和信息的物质形态，或者说以一定方式将人类知识和信息记录于一定载体之上所形成的物体文献三个要素：知识、载体和记录3个方面相辅相承，缺其一不能成为文献医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体，如医学图书、期刊、会议录等信息、知识、情报、文献之间有什么关系？综上所述，信息〉知识〉情报，文献是信息、知识、情报的主要载体形式。人类社会利用文献或文献进行交流，其实质是利用和交流文献中的信息、知识和情报。1.2文献的类型1、按文献载体类型划分纸张型文献缩微型文献声像型文献机读型文献（数字化文献）2、按文献出版形式划分图书专利文献期刊学位论文科技报告技术档案会议文献政府出版物3、按文献加工层次划分零次文献、一次文献、二次文献、三次文献零次文献——未经加工、出版发行的文献，手稿、实验记录、原始录音录象，会议记录等一次文献（原始文献）——著者以本人的研究成果为素材写成的原始创作。专著、期刊论文、学位论文、科技报告等二次文献——将一次文献收集整理加工著录其特征（著者、篇名、分类、主题等）并按一定顺序加以编排而成的检索工具。目录、索引、文摘、相应数据库；Yahoo、Google等

二次文献是供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式。三次文献——科技人员围绕某一专题，利用二次文献的检索，在吸取一次文献内容的基础上撰写的新文献。综述、指南、字典、教科书、百科全书、年鉴、手册等参考工具书。三次文献信息含量大、综合性强、参考价值大网络信息资源网上图书馆和馆藏目录电子图书刊网络数据库专业网站网络信息检索工具网络信息导航新兴的网络资源：blog、论坛、viki、播客等举例：馆藏机读目录的使用打开图书馆首页/library或点击温州医学院主页（）中“学校导游”下面的“图书馆”，再点击“信息查找”下面的“书目查询”，系统进入“馆藏书刊目录查询”。如下图所示。馆藏书刊目录查询主页1.3文献检索基本知识广义的信息检索是指将信息接一定的方式组织和贮存起来，并根据信息用户的需要找出有关信息的过程,又称为“信息存储与检索”。狭义的信息检索则仅指后半部分，即从信息集合中找出所需信息的过程。文献源存贮（Storage)查找（Search)检索工具文献检索原理

原始文献主题概念文献特征标识检索课题主题概念检索提问标识检索结果检索工具文献标识提问标识标识比较存贮过程检索过程分析标引存贮分析转换检索

数据库的结构和类型数据库是由若干个文档构成，存贮于磁盘、光盘等载体上，并能满足特定目的或特定数据处理系统需要的数据集合。是网络信息检索的重要组成部分。一个数据库相当于一种书本式手工检索工具。数据库的结构文档（Files）是数据库的组成部分。按其编排结构与功能分为顺排文档和倒排文档。其中顺排文档是数据库中的主文档，是大量记录的集合。记录（Records）是数据库中一个完整的信息单元，由一系列字段构成。一条记录代表一篇文献。字段（Fields）是著录文献各项目的名称及其内容，是描述文献内外特征的各项标识内容。各字段都有相应的字段标识符，如题名(TI)、著者(AU)、地址(AD)、出处(SO)、主题词(MeSH)、主要主题词(MMH，MJME)、关键词(KW)、特征词(TG)、出版年(PY)、语种(LA)、摘要(AB)等等。数据库→文档→记录→字段（由大到小）

文献数据库的类型书目数据库

事实数据库

数值型数据库

全文型数据库

图像数据库

书目数据库（BibliographicDatabase）主要指二次文献数据库，包括各种机读版的题录、文摘、目录等形式的数据库，仅提供原始文献的线索或简要的内容，指引用户去查原始文献。如MEDLINECD-ROM，CBMdisc等。事实数据库（FactDatabase）或称指南数据库(DirectoryDatabase)，提供问题的答案，如人物、机构、事件、疾病的诊断和治疗、药物的用法和副作用等信息。。如:机构指南、产品目录数值数据库（NumericDatabase）提供数值性的信息，包括各种统计数据，科学实验数据、人口数据、化学品理化参数等。例如美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性数据库RTECS，包含了10万多种化学物质的急、慢性毒力试验数据。全文数据库（FullTextDatabase）存储的是原始文献的全文，有的是印刷版的电子版，有的则是纯电子出版物《中国学术期刊全文数据库（CNKI）》图像数据库(ImageDatabase,Atlasonline)是以图像信息为主，适当配以简短的文字说明如人体解剖图谱、心脏病图谱、眼科图谱、手术图谱、CT图谱、血液学图谱、中草药图谱等等。这些图谱一般都可在因特网上免费查到。文献检索途径和检索语言检索途径：以文献记录中某一特征作为检索切入点所进行的检索，检索途径通常体现为字段检索。检索语言：检索语言就是为沟通文献标引与文献检索而编制的人工语言，也是连接信息存储和检索两个过程中标引人员与检索人员双方思路的渠道，是用于文献标引和检索提问的约定语言题名（书名、篇名）著者，机构名称代码（专利号、报告号、标准号）引文（被引作者姓名和引用文献出处）外表特征分类语言主题语言标题词关键词叙词内容特征检索语言外表特征语言是以文献上标明的、显而易见的特征，如题名、著者姓名、文献序号等作为文献的标识和检索的依据，供人们进行标引和检索，它们具有客观性和内容上的唯一性在揭示文献特征与表达信息提问方面，具有更大的深度。在用来标引与检索时，更需要依赖标引与检索人员的智力判断，更带有主观性（一）分类语言检索分类检索语言是将表达文献信息内容和检索课题的大量概念，按其所属的学科性质进行分类和排列，并用号码（分类号）来表示概念及其在系统中的位置，甚至还表示概念与概念之间关系的检索语言。

常用分类法：

《中国图书馆分类法》《中国科学院图书馆图书分类法》《美国国会图书馆图书分类法》》《杜威十进制分类法》中图法类目体系五个基本部类，22个基本大类标记符号采用拉丁字母与阿拉伯数字相结合的混合号码制类目简表A马克思、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论B哲学、宗教C社会科学总论D政治、法律E军事F经济G文化、科学、教育、体育H语言、文字I文学J艺术K历史、地理Z综合性图书N自然科学总论O数理科学和化学P天文学、地球科学Q生物科学R医药、卫生S农业科学T工业技术U交通运输V航空、航天X环境科学、安全科学Z综合性图书中图法－医药卫生R医药、卫生R0一般理论R1预防医学、卫生学R2中国医学R3基础医学R4临床医学R5内科学R6外科学R8特种医学R9药学

R5内科学

R56呼吸系统疾病

R57消化及胸部系统疾病

R571食管疾病

R573胃疾病

R573.1溃疡

R573.2消化道出血

R573.3胃炎胃疾病的上位类胃疾病的下位类(二)自由词检索是作者写文章时选用的自然词语包括标题词（Titleword）关键词（Keyword）文摘词（Abstractword）全文词（FullTextword）★不受主题词表约束，同一概念用词取决于著者的偏爱特点：在文献各字段中必须有与输入的相同的字、词，才能命中，只要有一个字母不同，检出的结果就完全不同；

若在字段中作些限定，查准率较高；肺炎inti

其缺点是查全率较低，一些同义词、近义词都会被漏检

AIDS艾滋病爱滋病获得性免疫缺陷综合症（三）主题词检索主题词也叫叙词(descriptor)指从自然语言中优选出来并经过规范化处理的名词术语。规范化处理使得一个概念只用一个词表达或一个词只表达一个概念。避免了一词多义、一义多词现象，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下，较好的实现查全率和查准率。肿瘤关键词表达：carcinoma,tumor,cancer，neoplasms主题词表达：neoplasms艾滋病关键词表达：艾滋病，爱滋病，AIDS，获得性免疫缺陷综合症主题词表达：获得性免疫缺陷综合症主题词表：主题词语言所涉及的各种概念以规范的词或词组固定下来，构成叙词表。常用医学主题词表：中医药主题词表医学主题词表《医学主题词表》(MedicalSubjectHeadings，简称MeSh)，是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据，编制《医学索引》（IndexMedicus）及建立计算机文献联机检索系统MEDLINE数据库。《MeSh》汇集著名医学专家、医学编辑和医学图书馆专家推荐的，使用频繁而又是使用者认可的约19,000多个医学主题词。医学主题词表副主题词，又称限定词(Qualifiers)，主要与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性

如：neoplasms——

neoplasms/therapy检索副主题词表，每年略有变化，目前使用的副主题词是92个。Mesh规定了每个副主题词的组配范围和原则。并非每个副主题词都可与所有的主题词组配，两者之间要有必然的逻辑联系。药物治疗可以与疾病类主题词如“肾疾病”组配，但不能与解剖类主题词如“肾”组配。MeSH的参照系统同义词、近义词、异形词等非主题词（款目词）用参照系统联系起来，帮助用户准确的选择规范化的主题词用代参照，指引检索者将非正式主题词用正式主题词。用“See”表示，逆参照用“X”表示。款目词see主题词，主题词X款目词例如，CancerSeeNeoplasms；NeoplasmsXCancer。通过用代参照处理，从若干同义关系的词或词组中，选定一个科学而通用的名称作为主题词，供检索文献用，其他的同义词作为款目词。相关参照：处理词间的相关关系，指引检索者从一个主题词去参考有关的其他主题词，以扩大选词范围。用“Seerelated”表示，逆参照用“XR”表示。主题词seerelated主题词，主题词XR主题词例如，Contraception(节育)seerelatedpopulationcontrol,populationcontrolXRContraception.再如检索Alopecia（脱发）这一概念时，要把它的相关参照AlopeciaMucinosa（斑秃）、Baidness（脱发）、HairDiseases（毛发疾病）Hypotrichosis（毛发稀少）等4个相关参照词下的内容看清楚，才能达到查全的目的。主题词检索的优点:输入非主题词（款目词）能引见到规范化主题词；livercancerseeliverneoplasms；输入不甚确切的相近词，或仅输入词的前半部，就会显示相近的规范主题词输入正确的主题词，就出现该主题词为首的其他相近词.对所选词的含义是否确切可通过“所选词详解”以确定是否选用；对所选词的内容范围，可采用单主题词检索，也可通过扩展树，进行扩大范围检索；通过副主题词表，选择副主题词，以确定检索范围大小和提高查准率。著者检索(AuthorSearching)就是用文献上署名的作者或编者姓名作为检索入口词中文用全称郑树外文按规则转换

一般是姓在前，名在后，且名多用首字母如

如：WilliamHenrySmithSmithWH

中文姓名转换规则与外文一样(四)著者检索著者检索有四种情况限定在著者字段状态下，以文献的著者姓名为检索词进行检索。在默认或缺省状态下，检索时在著者姓名后加inAU，如郑树inAU。这就是凡作者字段出现郑树的文献都为命中文献。但在所检的文献中可能包括郑树森、郑树清等不同著者的文献都会被检出。若在姓名后不加inAU，则指在各字段中凡有该人姓名的文献(如在题名或文摘等字段中提及郑树的文献）都为命中文献。这实际上“郑树”相当于一个自由词或一个索引词。若用AU=郑树，则检出的都是以郑树为著者的文献。引文检索(CitationSearching)：引文检索有引用文献检索和被引文献检索

引用文献---参考文献(被引用文献)可以查一篇文献的参考文献，也能查一篇文献被哪些文献引用也可以作为评价手段(五)引文检索(六)机构检索：以机构名称为检索词，来查该机构学者发表的文献。指作者所在机构的名称，其字段名称为作者单位(Address，地址)，按地址字段检索，可以获得某单位、城市发表的文献(七)刊名检索：指检索某特定期刊上发表的论文。(八)默认检索：在检索系统预告设定的多个字段进行检索(九)限定检索limit检索功能(十)其它检索途径：除上述外尚有特征词、分子式、专利号等检索途径等。1.4计算机信息检索技术1.布尔逻辑检索逻辑或逻辑与逻辑非运算符or+and*not-检索式AorBA+BAandBA*B

AnotBA-B命中A和B有一个出现或两个都出现的记录A和B都出现的记录只出现A而不出现B的记录图示优先级（）>not>and>or2、位置算符位置算符(proximationoperator),又称邻近符，表示其连接的两个检索词之间的位置关系。不同检索系统的位置算符不尽相同，winspirs系统中的位置算符有near,with等。仅用于自由词检索。

同句检索：near要求参加检索运算的两个检索词必须在同一自然句中出现。有的数据库用same,sentence表示语法检索词nearN

检索词

检索词near检索词例1：tonguenear3base

舌根(tonguebase,baseoftongue,baseofthetongue)例2：informationnear2retrieval信息检索（informationretrieval,retrievalofinformation）同字段检索：with要求左右两个检索词出现在同一字段，词序也可颠倒，比near的检索范围宽。有的数据库中用“filed”表示如：womenwithhepatoma（肝细胞瘤）

3.字段限定符

语法：检索词in字段标识符或字段标识符=检索词

例：肺癌inTIAU=郑树郑树inTI年份限定

范围运算符：=、>、<、<=、>=例：PY>2000，PY=2000-2005期刊范围限定

默认为全部，有些数据库分重要期刊和核心期刊

文献数据库中常见字段字段名英文全称缩写题目titl