第1章绪论药学信息

第一章绪论：什么是药学信息挖掘技术生命科学与技术学院生物信息学教研室方慧生计算机科学的出现将已有的学科打得七零八落!中国药科大学前副校长、我国药物分析学的泰斗、我的恩师安登魁教授：具体地：它将传统科学的“二元研究”分化为“三足鼎立”状态。理论实验理论传统实验计算机实验化学化学信息学Chemoinformatics生物学生物信息学Bioinformatics医学医学信息学Medicineinfomation

神经学神经信息学Neuroinformatics

经济学经济信息学Economicsinformatics

神经信息学Neuroinformatics分子神经信息学Molecularneuroinformatics系统神经信息学Systematicneuroinformatics。药学药学信息学PharmacyinformaticsPharminformatics药物信息学Pharmacoinformatics

药学信息学（Pharmacyinformatics，PIX），又称药物信息学（pharmacoinformatics），指的是运用计算机来存储、检索和分析药物信息（druginformation）。PIX系统能够帮助药剂师（pharmacist）管理的信息不仅包括病人的医闻保险（medicalinsurance）记录、药物相互作用（druginteraction）数据，还包括处方（prescription）数据。药学信息学研究的是卫生保健（healthcare）领域内的自然系统（naturalsystems）与工程系统（engineeredsystems）之间相互作用，并着眼于药学护理（pharmaceuticalcare）和改善病人安全（patientsafety）。

药学信息学定义（一）药学信息学定义（二）Pharmainformaticsisthecombinationofbiology,chemistry,mathematicsandinformationtechnologythatisessentialforefficientdatamanagement,processingandanalysisinthepharmaceuticalindustry药学信息学药学信息：药学数据库如何从海量的药学信息学中提取人们感兴趣的方法即药学信息挖掘技术(DataMining)药品专利库

提供药品专利相关信息药品行政保护库

提供药品行政保护相关信息药品包装库

提供药品包装相关信息国内新药库

提供国内新药相关信息药品出口库

提供我国药品出口相关信息药品进口库

提供我国药品进口相关信息化工原料出口库

提供我国化工原料出口相关信息化工原料进口库

提供我国化工原料进口相关信息药品原料及中间体库提供我国药品原料及中间体相关信息PharmacyDataBase用药指南对用药常识，药品评价，推荐用药，药用食品等四个方面收录了大量的资料。用药常识：介绍家庭日常生活用药时应注意的方方面面。药品评价：针对各科疾病讨论用药的方法、药效、不良反应、注意事项等等。推荐用药：新特效药，专家推荐。药用食品：民间流传，强身健体。药品检索对现有的各类药物进行查询药品企业查询对全国的药品企业，包括医药企业，包装企业化工医药，药店进行查询药品查询通过药品名称和适应症来对药物进行查询药店查询通过药店名称，所在地域以及区县来进行查询共约117个数据库药物与药物设计数据库ANTIMIC：自然抗微生物药物肽数据库AOBase：反义寡聚核苷酸选择与设计APD：抗微生物肽数据库DART：药物不良反应靶点数据库TTD：治疗靶点数据库ChEBI-ChemicalEntitiesofBiologicalInterest：与生物学有作用的化合物条目DefensinsKnowledgebase：有关抗菌肽数据库DrugBank：药物与药物作用靶点组成数据库GLIDA：G藕联蛋白受体（G-proteincoupledreceptors简称GPCRs）与相应的配体相关信息数据库HIVDrugResistanceDatabase:HIV药物耐受数据库HIVMolecularImmunologyDatabase:HIV分子免疫数据库IUPHAR-RD:TheInternationalUnionofPharmacologyrecommendationsonreceptornomenclatureanddrugclassification

Peptaibol：(Peptaibols是一类富含非蛋白质氨基酸,具有广谱抗菌活性的离子通道类抗菌肽):包括其序列与结构PharmGED:PharmacoGeneticEffectDatabase

PharmGKB:ThePharmacogeneticsandPharmacogenomicsKnowledgeBase(遗传药理学与药物基因组学数据库）Scorpion：Databaseofscorpiontoxins（蝎子毒性数据库）SuperDrug：Thedatabasecontainsapproximately25003D-structuresofactiveingredientsofessentialmarketeddrugs.Forselectionpurposesandforcorrelationofstructuralsimilaritywithmedicalapplication,theassignmentoftheAnatomicalTherapeuticChemical(ATC)classificationcodestoeachstructureaccordingtotheWHO-schemeisapplied.Toaccountforstructuralflexibilitytheyarerepresentedby10(5)structuralconformers.

SuperNatural:50,000naturalcompounds

TTD-TherapeuticTargetDatabase:BSD-BiodegradativeStrainDatabase:Microorganismsthatcandegradearomaticandotherorganiccompounds(降解芳香族与其有机化合物的微生物）DART-DrugAdverseReactionTargets（药物不良反应靶点数据库）药学信息与药学信息挖掘技术之间的关系：一个核心两个方面第一个方面：只有挖掘技术没有药学信息：巧妇难为无米之炊二个方面第二个方面：只有药学信息没有挖掘技术：生米煮不成熟饭如果你挣了一大笔钱？

存在银行里？（没有利息、贬值）再投资？药学信息就是一个大金库！！！该出手时就出手！

范蠡一个核心：如何挖掘？同样的药学信息，不同的人应用同样的方法提取出的信息是不尽相同的治冻疮药

不能用语言来描述的知识解析型知识可视型知识描述型知识药学信息（药学数据库）：描述型知识药学信息挖掘将描述型知识转化为可理解的描述型知识将描述型知识转化为可视型知识将描述型知识转化为解析型知识将描述型知识转化为可理解的描述型知识一氧化二氢描述型知识水：无色，无味，可解渴，可用来煮饭，洗衣服，发电，闹水灾可理解的描述型知识例1WelcomeyoucometoCPU欢迎您到中国药科大学来解释型,易于表达，理解与学习，属于最简单一类，但有时印象不深，要求简洁明了欧阳修要求编史要简洁二、将描述型知识转化为可视型知识ATOM1NARGA528.89713.60840.9381.0079.08N

ATOM2CAARGA528.65914.98940.5211.0080.22C

ATOM3CARGA529.12615.29039.0931.0080.30C

ATOM4OARGA530.32215.19938.7961.0081.46O

ATOM5CBARGA529.33015.95641.5041.0081.71C

ATOM6CGARGA529.52717.37540.9761.0082.97