第十四章-RNA的生物合成省公开课金奖全国赛课一等奖微课获奖课件

第一章

RNA生物合成1/103转录基本特点转录条件原核生物转录真核生物转录RNA转录产物加工RNA复制2/103RNA生物合成两种方式转录：DNA指导RNA合成，生物体内主要合成方式。RNA复制：RNA指导RNA合成，常见于病毒。RNA前体（RNAprecursor）：转录产生初级转录本，需经加工为成熟RNA后才含有生物学活性与功效。3/103不对称转录（asymmetrictranscription）：转录时，只以双链DNA中一条链作为模板进行转录，将遗传信息由DNA传递给RNA现象。第一节转录基本特点RNA分子只有一条链可转录，模板链并不总是在同一单链上。每个基因转录都受到相对独立调控。

4/103模板链(templatestrand)及反（无）意链(antisensestrand)：指导RNA合成DNA链，又称为负链（－链）。编码链(codingstrand)及有意链(sensestrand)：不作为转录模板另一条DNA链，又称为正链（+链）。有意链与反意链并非固定不变。5/103转录连续性RNA转录合成时，以DNA作为模板，在RNA聚合酶催化下，从头连续合成一段RNA链（不需要引物），各条RNA链之间无需再进行连接。单顺反子：合成RNA中只含一个基因遗传信息。多顺反子：合成RNA中含有几个基因遗传信息。6/103转录单向性：RNA转录合成时，只能向一个方向进行聚合，所依赖模板DNA链方向为3’→5’，而RNA链合成方向为5’→3’。转录不需要引物有特定起点和终点开启子(promotor)：RNA聚合酶特异识别、结合和开始转录一段DNA序列。终止子(terminator)：提供转录停顿信号DNA序列，在DNA模板特异位点处终止RNA合成。转录单位（transcript）：DNA链上从开启子到终止子为止一段DNA序列。7/103转录起点（startpoint）：与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上碱基，此点通惯用+1表示；上游（upstream）：转录起点前面（5’末端）序列，用负数表示；下游（downstream）：转录起点后面（3’末端）序列，用正数表示。8/103阻遏蛋白LacI

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OLacZLacYLacAP1RNA聚合酶阻遏蛋白和乳糖复合物乳糖或IPTG转录LacI

P2

OLacZLacYLacAP1操纵子（operon）：原核生物基因转录功效单位，结构上包含调整基因、开启子、操作基因、多顺反子（结构基因区）和终止子等功效区。9/103第二节转录条件一、底物四种脱氧核糖核苷酸，即ATP，GTP，CTP和UTP。（NMP）n+NTP（NMP）n+1+PPi二、模板转录反应需要DNA作为模板，且不一样RNA聚合酶对DNA两股链以及不一样DNA段落都有一定选择性。10/103三、RNA聚合酶RNA聚合酶特点可开启RNA合成，不需引物；只以一条DNA链或其一段DNA为模板；碱基互补配正确标准：A与U，G与C配对；合成方向：5’→3’；合成是连续进行；无校读功效；需要Mg2+或Mn2+离子可与各种调整转录蛋白因子相互作用。11/103大肠杆菌RNA聚合酶每个细胞中约有3000个RNA聚合酶分子；组成：全酶由2个α、β、β’、、σ5种亚基组成，椭圆球形，可结合约60个核苷酸；全酶关键酶（α2ββ’

）σ因子σ因子与其它部分结合不紧密，它易于与α2β’β

分离；12/103关键酶：没有σ亚基酶，只催化RNA链延长，对转录起始无作用；各亚基功效α：识别开启子并与其牢靠结合；β：聚合作用催化位点，催化形成磷酸二酯键；β’：全酶或关键酶与DNA模板结合部位；σ：特异地识别开启子，起始转录；：？13/103

RNA聚合酶作用识别开启子：依赖于亚基，亚基参加转录起始，并决定转录方向。与DNA结合并使之解旋、解链，另外还含有重新使DNA螺旋化作用。催化RNA聚合反应，负责三种RNA合成。关键酶与不一样亚基结合，识别不一样开启子。14/103真核生物RNA聚合酶三种RNA聚合酶：Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ。每个酶分子有两个大亚基，还有10个左右小亚基。RNA聚合酶Ⅰ：位于核仁中，活性最显著，负责转录rRNA基因。RNA聚合酶Ⅲ：负责合成tRNA和核内小RNAs，其活性可被高浓度α-鹅膏蕈碱所快速抑制。RNA聚合酶Ⅱ：位于核浆中，负责hnRNA（mRNA前体）合成，其活性可被低浓度α-鹅膏蕈碱所快速抑制。15/103由8~14个亚基组成，分子质量为500KDa。250KDa与模板结合；与转录起始、延伸相关。130KDa与DNA、底物和新生RNA结合。40KDa40KDa负责酶装配。C末端结构域(CTD)：最大亚基C末端含有7个氨基酸（Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser）

重复序列（酵母重复26次，哺乳类重复52次），含有多个Ser和Thr磷酸化位点。16/103CTD去磷酸化：RNA聚合酶II易与DNA结合，这种构象适于转录起始；CTD磷酸化：可使RNA聚合酶II与DNA结合变得松弛，形成适于延伸构象。17/103噬菌体RNA聚合酶仅由一条多肽链组成；合成速度很快，在37℃时可达约200核苷酸/秒；噬菌体RNA聚合酶只能识别噬菌体本身所含有开启子，不能识别其它开启子。线粒体和叶绿体中RNA聚合酶和细胞核中酶完全不一样，分子较小。类似于噬菌体RNA聚合酶。18/103抑制剂靶酶抑制作用利福霉素细菌全酶与σ亚基结合，阻止起始链霉溶菌素细菌关键酶与β亚基结合，阻止延长放线菌素D真核RNA聚合酶Ⅰ与DNA结合，阻止延长α-鹅膏蕈碱真核RNA聚合酶Ⅱ与RNA聚合酶Ⅱ结合惯用转录抑制剂19/103

四、开启子原核生物开启子在基因表示调控中，转录起始是关键，基因能否表示决定于在特定开启子起始过程。不一样开启子对RNA聚合酶亲和力各不一样，对转录起始频率（基因表示程度）有主要调控作用。RNA聚合酶与开启子结合模式图20/103开启子共同次序：是开启子关键部位，在RNA转录起点上游大约10bp和35bp处有两个共同次序（-10和-35序列）-35区：T85T83G81A61C69A52（-35bp，-35序列）-10区：T89A89T50A65A65T100（-10bp，-10序列）-35序列：RNA聚合酶全酶识别位点，对全酶有很高亲和性，提供RNA聚合酶识别信号。-10序列：又称TATA盒（Pribnowbox），是RNA聚合酶全酶紧密结合位点，有利于DNA局部双链解开，决定着双链解开速度和转录方向。

21/103开始转录TTGACAAACTGT-35区TATAATPuATATTAPy-10区1-30-5010-10-40-205

3

3

5

原核生物开启子保守序列RNA-pol识别位点5

5

RNA聚合酶保护区结构基因3

3

22/103二者共同决定了开启子强度，也调控了转录速度和RNA分子数。上游次序：起始位点上游50到150bp之间次序；是一些RNA聚合酶激活蛋白（CAP-cAMP复合物）结合部位，也是拓扑异构酶结合部位，这有利于转录起始超螺旋状态产生。上游次序所引发DNA结构微细改变，可在双螺旋上被传导到相当远距离，影响到-10和-35区DNA结构细节。结合位点TTGACATATAAT起始位点-10~18b--5~8bp--35序列-10序列CAP-cAMP23/103真核生物开启子真核生物三种RNA聚合酶都有各自开启子。RNA聚合酶Ⅰ开启子：又称rRNA基因开启子或Ⅰ型开启子。不一样真核生物Ⅰ型开启子序列有较大差异，缺乏保守性，当前发觉有两个区域是转录必需。关键开启子（关键元件）：-45至+20序列，富含GC序列，决定转录起始准确位置。上游控制元件(upstreamcontrolelement，UCE)：-187至-107序列，富含GC序列，影响转录频率。24/10325/103RNA聚合酶Ⅱ开启子：又称蛋白质基因开启子或Ⅱ型开启子。关键开启子TATA盒（Hognessbox）：位于-25~-35bp，基本上由AT组成，极少数开启子中有GC；共有序列为85A97T93A85（A63/T37）A83（A50/T37）；决定转录方向和准确起始位点。起始子（initiator，Inr）：与转录起点重合短较保守序列，位于-3~+5，常有Py2CAPy5序列，其中A是mRNA中第一个碱基；被转录因子TFⅡD识别，与转录起始点选择相关，影响开启子强度。26/103上游开启子元件（upstreampromoterelement，UPE）：又称上游激活序列（upstreamactivatingsequence，UAS）位于关键开启子上游，主要包含CAAT框和GC框，各自保守序列与结合蛋白因子各不相同，其功效是控制转录起始频率。CAAT框：位于上游-70~-80区，其保守序列为GGCCAATCT；GC框：位于-80~-110区，其保守序列为GGGGCGG，是转录因子SP1结合位点。既无TATA框也无起始子基因转录速率通常很低，其起始点也不固定。27/103增强子（enhancer）：增强真核生物开启子活性DNA次序。长约100～200bp，其关键组件常为8～12bp，能够单拷贝或多拷贝串联形式存在。特点：增强效应显著；可远距离调控；增强作用与其序列方向无关；有组织和细胞特异性；无基因专一性；受外部信号调控。远端调控区：一些基因开启子远上游或下游区域（-100bp以上）可调整开启子活性。28/103缄默子（silencer）：抑制基因表示活性DNA序列，起与调控蛋白结合后可抑制转录起始复合物活化；其作用不受距离和取向限制。应答元件：真核细胞DNA上存在能对特定环境原因作出应答反应DNA序列。能专一结合特异性蛋白因子，从而调控基因特异表示，如：糖皮质激素应答元件、金属应答元件、血清应答元件等。29/103真核生物开启子保守序列30/103上游元件多样性：真核RNA聚合酶II开启子包含着TATA盒、CAAT盒、GC盒以及其它序列元件之间不一样组合，没有哪一个上游元件是全部开启子所共同必需。31/103RNA聚合酶Ⅲ开启子（III型开启子）分为三个亚类；5SrRNA和tRNA基因开启子是内部开启子，位于转录起始位点下游，都由两部分组成；snRNA开启子由三个部分组成，位于转录起始位点上游。snRNA5SrRNAtRNA32/103原核生物终止子：在终止位点之前都有一个回文序列，由RNA形成发夹结构。

四、终止子33/103依赖ρ因子终止子：终止位点之前成发夹结构。不依赖ρ因子终止子：称由为简单终止子，DNA模板链中有约6个串连A，转录RNA3’端为寡聚U。34/103真核生物终止子：真核生物转录终止信号和机制了解极少，其主要原因在于大多数RNA在转录后很快进行加工，难确定原初3’-端。加尾信号：DNA上AATAAA+富含CA序列35/103第三节原核生物转录一、转录起始识别全酶与DNA分子随机结合，形成松弛复合物；σ因子在DNA双链上寻找开启子：σ因子识别开启子-35区，促使形成封闭复合物(双螺旋形式)，并滑动到-10区；36/103起始RNA聚合酶全酶促使局部双链解开，“关闭”复合体转变为“开放”复合体（双螺旋解旋，两条链分开，形成“转录空泡”）；催化ATP或GTP与另外一个三磷酸核苷聚合，形成第一个3‘,5’-磷酸二酯键（pppA/GN）。37/103延长：σ因子从全酶上脱离，关键酶继续沿DNA链移动，连续聚合RNA；DNA解链和重复螺旋化。38/1035

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DNA核糖体RNARNA聚合酶原核生物转录过程中羽毛状现象39/103终止因子（terminatorfactors）：帮助RNA聚合酶识别终止信号辅助因子（蛋白质）。ρ因子：六聚体蛋白质，亚基分子量为50kD。该蛋白因子能识别终止信号，并能与RNA紧密结合，造成RNA释放。nusA蛋白：分子量69kD酸性蛋白，它能与RNA及RNA聚合酶相结合，在终止部位使二者被释放。转录终止新RNA链脱落，DNA双链恢复，关键酶脱落后与σ因子结合。40/103依赖ρ因子终止：ρ因子与聚合酶-DNA-RNA复合物结合，向3’端移动，水解ATP解开DNA-RNA杂交体。41/103依赖于特定序列终止：转录RNA形成发卡结构，阻止了转录向下游继续推进；由几个U和几个dA形成RNA-DNA杂交双链很不稳定，于是新生RNA链很快自DNA双链中被排除出来。42/103抗终止：又称通读，RNA聚合酶越过终止子继续转录现象，通读是因为终止子被特异性因子抑制产生。抗终止因子：引发抗终止作用蛋白质。抗转录终止主要方式：破坏终止位点RNA茎－环结构（衰减子作用）；依赖于蛋白质因子转录抗终。43/103转录全过程44/103复制转录原料dNTPNTP模板DNA两条链DNA一条链引物需要RNA引物不需引物新连延伸方向5’→3’5’→3’主要酶类DNA聚合酶解旋、解链酶类DNA连接酶引物酶RNA聚合酶（α2ββˊσ）解旋、解链酶类终止因子(ρ)原核DNA和RNA生物合成比较45/103复制过程转录过程模板DNA解旋与解链，形成复制叉σ因子识别起始点，带动全酶解开DNA双链形成引发体，合成RNA引物促使转录起动；σ因子随之脱落下来；按A=T、G=C碱基配对规则，合成DNA；形成冈崎片段、切除引物、填补空隙、DNA连接酶连接封口，形成长链DNA；按A=U、G=C碱基配对规则，在关键酶催化下，使RNA链不停延长；在Tus蛋白参加下，终止复制ρ因子终止链延长46/103第四节真核生物转录一、转录因子反式作用因子（transactingfactor）：识别并作用于顺式作用元件蛋白质因子，如转录因子。转录因子（transcriptionfactor，TF）：RNA聚合酶在进行转录时所需要一些辅助蛋白质因子。通用转录因子(generaltranscriptionfactors)：RNA聚合酶结合开启子所必需一组蛋白因子，与RNA聚合酶在起始位点周围形成复合体，决定三种RNA转录类别和起始位置。47/103组织细胞特异性转录因子和可诱导性转录因子：这些TF是在特异组织细胞或是受到一些类固醇激素、生长因子或其它刺激后，开始表示一些特异蛋白质分子时，才需要一类转录因子，如：热激因子。TBP：TATA盒结合蛋白。上游因子（Upstreamfactor）：识别并与开启子上游元件结合，与上游元件结合可增加转录起始效率。48/103TBP作用机制：两个结构域形成一个完全二元对称马鞍型结构，与DNA小沟有效结合；TBP与DNA结合，使DNA弯曲了约80°，TATA盒向大沟弯曲，拓宽了小沟。49/103RNAPolI通用转录因子选择因子1（SL1）：由4个亚基组成，TBP（TATA-bindingprotein）是确保RNApol准确结合到起始位点一个关键因子，其它三个亚基TAF为TBP相关因子。上游结合因子（UBF1）：可与UCE和关键元件一段序列结合；两个UBF1经过蛋白－蛋白相互作用而相互结合，造成在两个结合位点间DNA形成一个环状结构。PolITBPTAFIs50/103

RNAPolⅢ通用转录因子

tRNA基因转录因子TFⅢC：识别boxB；TFⅢB：由TBP、BRF、B”组成，与A框上游50kb上游序列结合，其功效是RNA聚合酶Ⅲ真正起始因子。TFIIIC(B’’,TBP,BRF)TFIIIB5srRNA转录因子TFIIIA结合位点为boxC，TFIIIB，TFIIIC。TFIIICTFIIIBTFIIIA51/103RNApolII通用转录因子

TFIIA：含有最少3个亚基，与TFIID结合，稳定TFIID-DNA复合体；可能经过解除TAFs抑制而激活TBP。TFIIB：覆盖靠近起始点开启位置，C端与TFIID和DNA复合物结合，N-端与TFⅡF协同作用募集RNA聚合酶II；TFIIB与TFIID结合，并为RNA聚合酶结合起一个桥梁作用。52/103TFIID：为TBP+TAFs（TBP协同因子），结合在DNA小沟（其它DNA结合蛋白为大沟），识别和结合关键开启子（TATA盒和Inr）。TFIIF：结合PolII并带向开启子；RAP74（ATP依赖性解旋酶），参加DNA双链溶解；RAP30（与细菌

因子有同源性），与RNA聚合酶Ⅱ紧密结合。TFIIE：扩大DNA覆盖区至+30。TFIIH：有激酶活性，使PolIICTD磷酸化，PolⅡ离开开启子区。53/103二、真核生物基因转录过程过程与原核生物基本相同；起始时通用转录因子它们与RNA聚合酶共同组成转录起始复合物，转录在正确位置上开始。三种转录酶起始有差异。54/103RNA聚合酶I基因转录起始55/103RNA聚合酶Ⅲ基因转录起始5sRNA基因转录起始tRNA基因转录起始56/103RNA聚合酶Ⅱ基因转录过程起始首先TBP结合于TATA盒，然后TFⅡA、TFⅡB、TFⅡF、TFⅡE、polⅡ、TFⅡH等依次结合在开启子处形成闭合复合物；TFⅡH作用于起始子位置开始解螺旋形成开放复合物；57/103

RNA聚合酶Ⅱ起始复合物组装开启子TATA盒+TFⅡD

+TFⅡA

+TFⅡB

+（RNA聚合酶Ⅱ+TFⅡF）

+TFⅡE

+

TFⅡH

+TFⅡJDNA解旋、RNA聚合酶ⅡCTD磷酸化

polⅡ从转录因子中释放出来从起始点向下游移动58/103TATA-20-10+10-30-40+20TFIIATBPTAFsTFIIB59/103TFIIFPolIITFIIETFIIH和TFIIJ60/10361/103TFIIH：含有激酶活性，它将RNA聚合酶IICTD多个位点磷酸化，使起始复合物构象改变，促进转录起始阶段过渡进入延伸阶段。62/103组织特异性或诱导转录因子与转录起始63/10364/103延伸延长反应开始后，TFⅡE、TFⅡH释放；加入延长因子与RNA聚合酶、TFⅡF形成延伸复合物，使RNA聚合酶延长期有效率大大促进。终止RNA聚合酶反应终止，RNA聚合酶脱磷酸化，并重新进入下一个循环，准备下一次转录起始。添加多聚A尾：内切酶在mRNA3’端poly（A）添加位点特定部位切开；poly（A）合成酶催化多聚腺苷酸反应合成poly（A）尾。65/103起始延伸AAUAAA5’capAAUAAAAn5’capPoly(A)聚合酶RNA内切酶AAUAAA识别因子AAUAAA序列：初始转录物3’末端保守序列，对转录产物准确切割及加poly（A）是必须。66/103原核生物与真核生物转录区分原核真核聚合酶种类13起始σ因子识别起始点，RNA聚合酶与DNA模板结合TF与开启子结合后，帮助RNA聚合酶与DNA模板结合延长关键酶滑动RNA聚合酶滑动终止依赖ρ因子，ρ因子阻止；不依赖ρ因子RNA发夹结构阻止加尾信号提醒mRNA加PolyA尾、并在尾后切断转录后加工mRNA不加工，tRNA和rRNA需加工mRNA、tRNA、rRNA均加工67/103第五节转录产物加工一、原核生物mRNA前体加工细菌中用于指导蛋白质合成mRNA大多不需要加工，一经转录即可直接进行翻译。也有少数多顺反子mRNA需经过核酸内切酶切成较小单位，然后再进行翻译。如：核糖体大亚基蛋白L10和L7／L12与RNA聚合酶β和β′亚基基因组成混合操纵子，它在转录出多顺反子mRNA后需经过RNaseⅢ将核糖体蛋白质与聚合酶亚基mRNA切开，然后再各自进行翻译。68/103二、原核生物rRNA加工原核生物rRNA基因结构rRNA基因与一些tRNA基因组成混合操纵子；它们在形成多顺反子转录物后，经断链成为rRNA和tRNA前体，然后深入加工成熟；大肠杆菌共有7个rRNA转录单位，它们分散在基因组各处。69/103转录产物经过链内互补序列间碱基配对折叠形成一些茎环结构；一些蛋白质与之结合形成核糖核蛋白复合体；多数这么蛋白质会保持与RNA结合状态并成为核糖体一部分；

70/103结合完成后，开始RNA前体加工：特定碱基甲基化（16SrRNA约含10个甲基化修饰，23SrRNA约20个甲基化修饰）；前体rRNA经过RNaseIII、RNaseP和RNaseF切割释放出16S、23S和5S前体分子；切割下来分子再经过核酸外切酶M16、M23、M5修整而形成成熟rRNA。71/10372/103三、原核生物前体tRNA加工tRNA基因转录单元大多数为多基因，同种tRNA或不一样种tRNA多拷贝组成一个转录单位，转录在一条RNA中。tRNA与rRNA组成转录单位。Ⅰ型tRNA有3’-CCA-OH，Ⅱ型tRNA无3’-CCA-OH。73/103加工过程转录物前体经过折叠形成特征性茎环结构；核酸内切酶E/F在3’端切除一个侧翼序列，在前体3’端留下一个额外9核苷酸序列，然后外切酶RNaseD依次切去3’端7个核苷酸；接着RNaseP切去5’端侧翼序列产生出成熟5’端；随即，RNaseD再除去3’端剩下两个核苷酸，产生出成熟3’端。最终tRNA一系列碱基修饰。74/103tRNA核苷转移酶：催化Ⅱ型tRNA形成稳定3’CCA-OH。75/103断裂基因（splitgene）：真核基因经常是不连续，其编码区（exon）被非编码区（intron）打断。转录时外显子和内含子都能被转录，形成前体RNA。剪接（splicing）：加工时，内含子被切除而外显子被连接在一起过程。四、真核生物tRNA加工76/103真核生物初级转录产物中只含有一个tRNA序列。前体tRNA带有一个16nt5’端前导区，一个14nt内含子和3’端两个额外核苷酸。加工：内切酶识别初生转录产物形成特定茎环二级结构，并切去5’端前导区和3’端2个额外核苷酸；tRNA核苷酸转移酶将5’-CCA-3’序列转移到新生3’末端形成tRNA3’端CCA结构；内含子切除和一系列碱基修饰。77/103Ⅳ型内含子剪接78/103RNAaseP、内切酶79/103五、真核生物rRNA加工真核生物有4种rRNA，即5.8SrRNA、18SrRNA、28SrRNA和5SrRNA。前三者基因组成一个转录单位，产生45S前体RNA；rRNA基因含有内含子，该序列在转录后被切除；80/103甲基化切割rRNA前体修饰与剪接过程81/103内含子切除（Ⅰ型内含子自我剪接）：rRNA基因内含子本身作为核酶起催化作用可进行自动剪接。自我剪接内含子必须折叠成准确立体结构才能完成剪接反应。在体内，一些蛋白质因子与内含子结合，帮助其保持正确立体结构。转酯反应Ⅰ：由游离鸟苷或鸟苷单、双、三磷酸化合物3’－OH攻击5’剪接位磷酸酯键，将其断裂并使鸟嘌呤转移到内含子5’末端；转酯反应Ⅱ：前一外显子3’末端OH攻击剪接位磷酸酯键使其断裂，将两个外显子连接，释放出内含子。82/103I型内含子剪接83/103六、真核生物mRNA前体加工真核生物mRNA前体为hnRNA（heterogeneousnuclearRNA）经过5’端加帽、3’端剪切及加多聚A尾、剪接、编辑等产生出成熟mRNA分子。84/1035’端加帽当前体mRNA从RNA聚合酶II中伸出其5’端时即开始加帽反应。第一步：RNA5’端γ-磷酸基团由RNA三磷酸酯酶去除。第二步：在鸟苷酸转移酶作用下，RNA末端核苷酸β－磷酸基团亲核进攻GTPα－磷酸基团，产生5’－5’对接磷酸二酯键，同时释放出焦磷酸。第三步：在鸟嘌呤甲基转移酶作用下将一个甲基基团加到鸟嘌呤环第7位N原子上，使鸟嘌呤转变成7－甲基鸟嘌呤。85/103I型帽子II型帽子：第二个核苷酸核糖2’－OH被甲基化O型帽子86/103mRNA5’加帽功效：阻止mRNA降解，作为进出细胞核识别标识，提升mRNA剪接效率及翻译效率。3’端加尾加尾信号：5’-AAUAAA-3’。加尾信号下游10～30nt处有一5’-CA-3’二联体，二联体后面有一段富含GU序列。加尾：有各种蛋白质参加切割和加尾两个性质不一样反应（由一个360KD特异性酶切除3’末端一段后，经RNA末端腺甘酸转移酶催化加上约200个ApolyA尾巴）。

87/10388/103起始延伸AAUAAA5’capAAUAAAAn5’capPoly(A)聚合酶RNA内切酶AAUAAA识别因子89/103剪接GU－AG内含子（Ⅱ型内含子）：内含子5’端两个核苷酸是GU，3’端两个核苷酸为AG。90/103Ⅱ型内含子自我剪接真菌、藻类、植物叶绿体和线粒体hnRNA中。转酯反应Ⅰ：分支位点A2’－OH进攻5’剪接位点，使其断裂，同时这个A与内含子第一个核苷酸（G）形成2’，5’－磷酸二酯键，内含子本身成环，形成套索结构。转酯反应Ⅱ：上游外显子3’末端－OH攻击3’剪接位点磷酸二酯键，促使其断裂，使上游外显子5’－0H和下游外显子5’－磷酸基团连接，并释放出内含子，完成剪接过程。被切除内含子随即变成线性DNA，随即被降解。

91/103套索结构92/103hnRNA拼接（Ⅲ型内含子剪接）UsnRNA：富含U小RNA，含107至2