合成生物学高通量测序工程师岗位招聘考试试卷及答案

合成生物学高通量测序工程师岗位招聘考试试卷及答案一、填空题（每题1分，共10分）1.Illumina测序的核心原理是______。2.基因组DNA片段化常用方法包括超声破碎和______。3.RNA-seq中去除rRNA的方法有rRNA探针法和______。4.测序数据QC常用工具是______。5.基因组拼接常用软件举1例：______。6.CRISPR编辑效率检测常用______测序。7.单细胞RNA-seq捕获平台有10xGenomics和______。8.亚硫酸氢盐处理将未甲基化的______转化为尿嘧啶。9.测序文库接头的作用是______。10.RNA-seq基因定量常用工具：______。二、单项选择题（每题2分，共20分）1.第三代长读长测序技术是？A.IlluminaNovaSeqB.PacBioSMRTC.IonTorrentD.Sanger2.文库末端修复不包括？A.平末端化B.去突出端C.加A尾D.连接接头3.导致RNA-seq偏差的操作是？A.立即提RNAB.-80℃冻存C.室温放2hD.RNase-free试剂4.用于序列比对的工具是？A.FastQCB.TrimmomaticC.STARD.MultiQC5.甲基化胞嘧啶经亚硫酸氢盐处理后______。A.变尿嘧啶B.保持胞嘧啶C.变胸腺嘧啶D.降解6.检测染色质开放区域的文库是？A.ATAC-seqB.ChIP-seqC.RNA-seqD.WGBS7.低质量reads的Phredscore通常低于？A.10B.20C.30D.408.CRISPR筛选用______测序。A.靶向B.全基因组C.外显子组D.单细胞9.PacBio测序的特点是？A.读长短B.无PCRbiasC.准确率>99.9%D.通量高10.单细胞RNA-seq的优势是？A.群体平均表达B.检测细胞异质性C.成本极低D.通量极高三、多项选择题（每题2分，共20分）1.文库构建关键步骤包括？A.片段化B.末端修复C.接头连接D.扩增E.质量检测2.第二代测序特点是？A.读长长B.通量高C.准确率高D.成本低E.无PCRbias3.RNA-seq需要的酶是？A.反转录酶B.DNA聚合酶C.RNA聚合酶D.RNaseHE.限制酶4.单细胞RNA-seq应用包括？A.细胞异质性B.稀有细胞鉴定C.基因表达谱D.甲基化检测E.变异分析5.甲基化测序类型是？A.WGBSB.RRBSC.ChIP-seqD.MeDIP-seqE.ATAC-seq6.测序数据QC内容包括？A.碱基质量B.GC含量C.接头污染D.序列长度E.比对率7.变异检测工具是？A.GATKB.SAMtoolsC.STARD.VarScanE.FastQC8.CRISPR编辑检测内容包括？A.编辑效率B.脱靶效应C.插入缺失D.基因表达E.甲基化9.长读长测序优势是？A.覆盖重复序列B.完整基因组拼接C.检测结构变异D.准确率高E.通量高10.文库质量检测方法是？A.琼脂糖电泳B.毛细管电泳C.qPCRD.分光光度计E.测序验证四、判断题（每题2分，共20分）1.Illumina读长比PacBio长。（×）2.OligodT富集仅捕获polyA+RNA。（√）3.未甲基化胞嘧啶经亚硫酸氢盐处理变胸腺嘧啶。（√）4.FastQC用于序列比对。（×）5.单细胞cDNA可直接测序。（×）6.ChIP-seq检测蛋白-DNA互作。（√）7.PCR扩增会引入碱基错误。（√）8.10xGenomics可捕获数千个细胞。（√）9.靶向测序成本比全基因组高。（×）10.PacBioCCS可提高准确率。（√）五、简答题（每题5分，共20分）1.简述Illumina测序基本流程。答案：①文库制备：DNA片段化→末端修复→加A尾→连接接头；②簇生成：flowcell上桥式PCR扩增形成DNA簇；③边合成边测序（SBS）：荧光标记dNTP合成碱基→激发荧光成像；④数据读取：解析荧光信号→生成FASTQ数据。2.简述polyA+RNA-seq文库构建步骤。答案：①总RNA提取；②oligodT磁珠捕获polyA+RNA；③RNA片段化（镁离子加热）；④反转录合成第一链cDNA；⑤第二链cDNA合成；⑥末端修复→加A尾→连接接头；⑦PCR扩增；⑧质量检测（电泳、qPCR）。3.简述测序数据QC主要内容。答案：①碱基质量：Phredscore分布（>20为合格）；②序列长度：符合预期；③GC含量：与参考一致；④接头污染：残留量低；⑤duplication率：PCR重复比例；⑥比对率：与参考基因组比对情况。4.单细胞RNA-seq与bulkRNA-seq的区别。答案：①样本：bulk是群体细胞，单细胞是单个细胞；②数据：bulk是群体平均表达，单细胞检测异质性；③文库：bulk直接处理RNA，单细胞需先捕获单个细胞再扩增；④应用：bulk用于群体表达分析，单细胞用于细胞亚型、发育轨迹分析。六、讨论题（每题5分，共10分）1.高通量测序文库构建失败的常见原因及解决方法。答案：常见原因：①RNA降解（样本保存不当）→立即冻存-80℃；②接头连接差（末端修复不足）→优化修复时间、接头比例；③扩增失败（引物错误）→检查引物特异性、调整退火温度；④污染（基因组DNA污染）→DNaseI处理RNA；⑤片段长度不符→重新片段化或调整PCR循环数。2.如何评估测序数据可靠性？答案：实验层面：①文库质量：电泳片段长度、qPCR浓度符合预期；②生物学重复（3个以上）；③阳性对照（已知序列验证）。数据分析层面：①QC指标合格（FastQC）；②比对率>70%（RNA-seq）；③重复相关性>0.8；④变异检测一致性（Sanger验证部分变异）。---答案一、填空题1.边合成边测序（SBS）2.转座子介导片段化（或限制酶酶切）3.OligodT富集法4.FastQC5.SPAdes（或SOAPdenovo）6.Sanger（或深度）7.Drop-seq（或Smart-seq2）8.胞嘧啶（C）9.与测序仪引物结合，实现扩增和测序10.STAR（或Salmon