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文档简介
SDS-电泳的根本原理及浓缩胶浓缩样品的原理
SDS■(十二烷基硫酸钠■聚丙烯酰胺凝胶电泳)是目前最常用的分别
蛋白质的电泳技术
SDS-聚丙烯酰胺凝较电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS,
SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级构造,强
复原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在确定浓度的含有强
复原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结合,形成带负电荷的SDS・
蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量的SDS,使蛋白质丧失了原
有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块,从而降
低或消退了各种蛋白质分子之间自然的电荷差异,由于SDS与蛋白
质的结合是按重量成比例的,因此在进展电泳时,蛋白质分子的迁移
速度取决于分子大小。当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质
的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式
中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,假设将分子量的
标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知
蛋白质在一样条件下进展电泳,依据它的电泳迁移率即可在标准曲线
上求得分子量。
SDS-电泳成功的关键是什么?
①溶液中SDS单体的浓度SDS在水溶液中是以单体和SDS-多肽胶
束的混合形式存在,能与蛋白质分子结合的是单体。为了保证蛋白质
与SDS的充分结合,它们的重量比应当为1:4或1:3。②样品缓
冲液的离子强度由于SDS结合到蛋白质上的量仅仅取决于平衡时
SDS单体的浓度,不是总浓度,而只有在低离子强度的溶液中,SDS
单体才具有较高的平衡浓度。所以,SDS目泳的样品缓冲液离子强度
较低,常为10-100mMo③二硫键是否完全被复原只有二硫键被
完全复原以后,蛋白质分子才能被解聚,SDS才能定量地结合到亚基
上从而给出相对迁移率和分子质量对数的线性关系。Samplebuffer
中的如筑基乙醇的浓度常为4-5%,二硫苏糖醇的浓度常为2-3%o
前者有挥发性,最好使用前参与。
SDS-缓冲液系统的选择,Tris-Glycine.Tris-Tricine.Tris-硼酸盐或
者其他?
一般来说,在被分析的蛋白质稳定的pH范围,但凡不与SDS发生相
互作用的缓冲液都可以使用,但缓冲液的选择对蛋的分别和电泳的速
度是格外关键的。Tris-甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。Tris-
甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。假设要测定糖蛋白的分
子量,最好承受Tris-硼酸盐缓冲系统,对于分子质量小于15kDa的
蛋白样品,可以使用SDS•尿素系统,也可以承受Tris-tricine缓冲系
统。
积层胶(或称浓缩胶)的作用原理?
在缓冲系统中的弱酸,如甘氨酸,在pH6.7时很少解离,其有效泳动
速率很低,而氯离子却有很高的泳动速率,蛋白质的泳动速率介于两者
之间。加上电压以后,作为先导离子的氯离子和跟随离子的甘氨酸离子
分别开来,并在其后面留下一个导电性较低的区带。由于导电性和电场
强度成反比,这一区带便获得较高的电压梯度,加速甘氨酸离子的泳动,
使其赶上氯离子,建立起甘氨酸和氯离子的电压梯度和泳动速率乘积
相等的稳定态(我不太明白这句话),使这些带电颗粒以一样的速度
泳动,两种离子之间有明显的边界。当甘氨酸、氯离子界面通过样品
进入浓缩胶时,在移动界面前有一低电压梯度,界面后有一高电压梯
度。由于在移动界面前的蛋白质分子泳动速率比氯离子低,因此氯
离子能快速越过。移动界面后的蛋白质处于较高的电压梯度中,其泳
动速率比甘氨酸快。因此,移动的界面将蛋白质分子积存到一起,形
成一条狭窄的区带。蛋白质在移动界面中的浓度作用仅取决于样品和
浓缩胶中Tris・HCI的浓度(为什么?),而与样品中蛋白质的最初浓
度无关。由于浓缩胶为大孔凝胶,故对蛋白样品没有分子筛作用。当
移动的界面到达浓缩胶和分别胶的界面时,凝胶的pH明显增加,导
致甘氨酸大量解离。此时,甘氨酸的有效泳动速率明显增加,超越蛋
白分子,直接在氯离子后移动。由于凝胶孔径变小,蛋白质分子的迁
移速率降低,落在后面的蛋白质便在均一的电压梯度和
pH环境中泳动,并依据其固有的电荷与分子大小进展分别。
SDS-电泳小问答Q:SDS-电泳的
根本原理?
A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS
(十二烷基硫酸钠),SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质
的二级和三级构造,强复原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白
质在确定浓度的含有强复原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结
合,形成带负电荷的SDS-蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量
的SDS,使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为
特征的负离子团块,从而降低或消退了各种蛋白质分子之间自然的电荷
差异,由于SDS与蛋白质的结合是按重量成比例的,因此在进展电
泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。当分子量在15KD到
200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合
下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为
常数,假设将分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获
得一条标准曲线,未知蛋白质在一样条件下进展电泳,依据它的电泳
迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?
A:在SDS-不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL
缓冲系统,浓缩胶是PH6.7,分别胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris
—甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸
解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两
者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于
导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋
白质分子聚拢到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分别胶后,由
于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接
紧随氯离子之后,同时由于分别胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋
白分子依据其固有的带电性和分子大小进展分别。
所以,pH对整个反响体系的影响是至关重要的,试验中在排解
其他因素之后仍不能很好解决问题的状况,应首要考虑该因素。
Q:样品如何处理?A:
依据样品分别目的不同,主要有三种处理方法:复原SDS处理、非
复原SDS处理、带有烷基化作用的复原SDS处理。
1、复原SDS处理:在复原剂中参与SDS和DTT(或Beta筑基乙醇)
后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分
子,在电泳中,只依据分子量来分别。一股电泳均按这种方式处理,
样品稀释适当浓度,参与上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心
加样。
2、带有烷基化作用的复原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很
好的并经久结实的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕
集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。lOOul样品缓冲液中10ul
的碘乙酸胺,并在室温保温
20%30mino
3、非复原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1%
SDS沸水中煮3min,未加复原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不行作
为测定分子量来使用。
Q:SDS-电泳凝胶中各主要成分的作用?
A:聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳供给载体,其凝固的
好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境亲热相关;
制胶缓冲液:浓缩胶选择PH6.7,分别胶选择pH8.9,选择tris-HCL
系统,具体作用后面介绍;
TEMED与AP:促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固;
十二烷基硫酸钠(SDS):阳离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、
解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。
Q:提高SDS-电泳区分率的途径?
A;1、聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的区分率。建议做法;待
凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4
度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。一般
凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
2、一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同
染料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编著的《蛋白质电泳
技术手册》P82-103。
Q:”微笑〃(两边翘起中间凹下)形带缘由?
A:主要是由于凝胶的中间局部凝固不均匀所致,多消灭于较厚的凝
胶中。
处理方法:待其充分凝固再作后续试验。
Q:''皱眉"(两边向下中间鼓起)形带缘由?A:
主要消灭在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡
未排解干净。
处理方法:可在两板间参与适量缓冲液,以排解气泡。
Q:为什么带消灭拖尾现象?A:
主要是样品融解效果不佳或分别胶浓度过大引起的。
处理方法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促
溶剂;电泳缓冲液时间过长,重配制;降低凝胶浓度。
Q:为什么带消灭纹理现象?A:
主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理方法:加样前离心;加适量样品促溶剂。
Q:什么是“鬼带〃,如何处理?
A:''鬼带〃就是在跑大分子构象简洁的蛋白质分子时,常会消灭在泳
道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉
淀,主要由于复原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被
解离的蛋白质分子重折叠结合和亚基重缔合,聚合成大分子,其分子
量要比目标条带大,有时不能进入分别胶C但它却于目标条带有一样
的免疫学活性,在WB反响中可见其能与目标条带对应的抗体作用。
处理方法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta筑基乙醇,
以补充缺乏的复原剂:或可加适量EDTA来阻挡复原剂的氧化。
Q:为什么溟酚蓝不能起到指示作用?A:
我们在试验中常会遇到澳酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来
的现象。主要与缓冲液和分别胶的浓度有关。
处理方法:更换正确pH值的Buffer;降低分别胶的浓度。
Q:为什么电泳的条带很粗?A:
电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的缘由。
处理方法:适当增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确
(6.7h适当降低电压;
Q:为什么电泳电压很高而电流却很低呢?
A:这种现象一般初学者易消灭。比方电压5
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