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文档简介

SDS-电泳的根本原理及浓缩胶浓缩样品的原理

SDS■(十二烷基硫酸钠■聚丙烯酰胺凝胶电泳)是目前最常用的分别

蛋白质的电泳技术

SDS-聚丙烯酰胺凝较电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS,

SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级构造,强

复原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在确定浓度的含有强

复原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结合,形成带负电荷的SDS・

蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量的SDS,使蛋白质丧失了原

有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块,从而降

低或消退了各种蛋白质分子之间自然的电荷差异,由于SDS与蛋白

质的结合是按重量成比例的,因此在进展电泳时,蛋白质分子的迁移

速度取决于分子大小。当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质

的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式

中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,假设将分子量的

标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知

蛋白质在一样条件下进展电泳,依据它的电泳迁移率即可在标准曲线

上求得分子量。

SDS-电泳成功的关键是什么?

①溶液中SDS单体的浓度SDS在水溶液中是以单体和SDS-多肽胶

束的混合形式存在,能与蛋白质分子结合的是单体。为了保证蛋白质

与SDS的充分结合,它们的重量比应当为1:4或1:3。②样品缓

冲液的离子强度由于SDS结合到蛋白质上的量仅仅取决于平衡时

SDS单体的浓度,不是总浓度,而只有在低离子强度的溶液中,SDS

单体才具有较高的平衡浓度。所以,SDS目泳的样品缓冲液离子强度

较低,常为10-100mMo③二硫键是否完全被复原只有二硫键被

完全复原以后,蛋白质分子才能被解聚,SDS才能定量地结合到亚基

上从而给出相对迁移率和分子质量对数的线性关系。Samplebuffer

中的如筑基乙醇的浓度常为4-5%,二硫苏糖醇的浓度常为2-3%o

前者有挥发性,最好使用前参与。

SDS-缓冲液系统的选择,Tris-Glycine.Tris-Tricine.Tris-硼酸盐或

者其他?

一般来说,在被分析的蛋白质稳定的pH范围,但凡不与SDS发生相

互作用的缓冲液都可以使用,但缓冲液的选择对蛋的分别和电泳的速

度是格外关键的。Tris-甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。Tris-

甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。假设要测定糖蛋白的分

子量,最好承受Tris-硼酸盐缓冲系统,对于分子质量小于15kDa的

蛋白样品,可以使用SDS•尿素系统,也可以承受Tris-tricine缓冲系

统。

积层胶(或称浓缩胶)的作用原理?

在缓冲系统中的弱酸,如甘氨酸,在pH6.7时很少解离,其有效泳动

速率很低,而氯离子却有很高的泳动速率,蛋白质的泳动速率介于两者

之间。加上电压以后,作为先导离子的氯离子和跟随离子的甘氨酸离子

分别开来,并在其后面留下一个导电性较低的区带。由于导电性和电场

强度成反比,这一区带便获得较高的电压梯度,加速甘氨酸离子的泳动,

使其赶上氯离子,建立起甘氨酸和氯离子的电压梯度和泳动速率乘积

相等的稳定态(我不太明白这句话),使这些带电颗粒以一样的速度

泳动,两种离子之间有明显的边界。当甘氨酸、氯离子界面通过样品

进入浓缩胶时,在移动界面前有一低电压梯度,界面后有一高电压梯

度。由于在移动界面前的蛋白质分子泳动速率比氯离子低,因此氯

离子能快速越过。移动界面后的蛋白质处于较高的电压梯度中,其泳

动速率比甘氨酸快。因此,移动的界面将蛋白质分子积存到一起,形

成一条狭窄的区带。蛋白质在移动界面中的浓度作用仅取决于样品和

浓缩胶中Tris・HCI的浓度(为什么?),而与样品中蛋白质的最初浓

度无关。由于浓缩胶为大孔凝胶,故对蛋白样品没有分子筛作用。当

移动的界面到达浓缩胶和分别胶的界面时,凝胶的pH明显增加,导

致甘氨酸大量解离。此时,甘氨酸的有效泳动速率明显增加,超越蛋

白分子,直接在氯离子后移动。由于凝胶孔径变小,蛋白质分子的迁

移速率降低,落在后面的蛋白质便在均一的电压梯度和

pH环境中泳动,并依据其固有的电荷与分子大小进展分别。

SDS-电泳小问答Q:SDS-电泳的

根本原理?

A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS

(十二烷基硫酸钠),SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质

的二级和三级构造,强复原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白

质在确定浓度的含有强复原剂的SDS溶液中,与SDS分子按比例结

合,形成带负电荷的SDS-蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量

的SDS,使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为

特征的负离子团块,从而降低或消退了各种蛋白质分子之间自然的电荷

差异,由于SDS与蛋白质的结合是按重量成比例的,因此在进展电

泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。当分子量在15KD到

200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合

下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为

常数,假设将分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获

得一条标准曲线,未知蛋白质在一样条件下进展电泳,依据它的电泳

迁移率即可在标准曲线上求得分子量。

Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?

A:在SDS-不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL

缓冲系统,浓缩胶是PH6.7,分别胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris

—甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸

解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两

者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于

导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋

白质分子聚拢到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分别胶后,由

于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接

紧随氯离子之后,同时由于分别胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋

白分子依据其固有的带电性和分子大小进展分别。

所以,pH对整个反响体系的影响是至关重要的,试验中在排解

其他因素之后仍不能很好解决问题的状况,应首要考虑该因素。

Q:样品如何处理?A:

依据样品分别目的不同,主要有三种处理方法:复原SDS处理、非

复原SDS处理、带有烷基化作用的复原SDS处理。

1、复原SDS处理:在复原剂中参与SDS和DTT(或Beta筑基乙醇)

后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分

子,在电泳中,只依据分子量来分别。一股电泳均按这种方式处理,

样品稀释适当浓度,参与上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心

加样。

2、带有烷基化作用的复原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很

好的并经久结实的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕

集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。lOOul样品缓冲液中10ul

的碘乙酸胺,并在室温保温

20%30mino

3、非复原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1%

SDS沸水中煮3min,未加复原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不行作

为测定分子量来使用。

Q:SDS-电泳凝胶中各主要成分的作用?

A:聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳供给载体,其凝固的

好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境亲热相关;

制胶缓冲液:浓缩胶选择PH6.7,分别胶选择pH8.9,选择tris-HCL

系统,具体作用后面介绍;

TEMED与AP:促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固;

十二烷基硫酸钠(SDS):阳离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、

解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。

Q:提高SDS-电泳区分率的途径?

A;1、聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的区分率。建议做法;待

凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4

度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。一般

凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。

2、一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同

染料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编著的《蛋白质电泳

技术手册》P82-103。

Q:”微笑〃(两边翘起中间凹下)形带缘由?

A:主要是由于凝胶的中间局部凝固不均匀所致,多消灭于较厚的凝

胶中。

处理方法:待其充分凝固再作后续试验。

Q:''皱眉"(两边向下中间鼓起)形带缘由?A:

主要消灭在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡

未排解干净。

处理方法:可在两板间参与适量缓冲液,以排解气泡。

Q:为什么带消灭拖尾现象?A:

主要是样品融解效果不佳或分别胶浓度过大引起的。

处理方法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促

溶剂;电泳缓冲液时间过长,重配制;降低凝胶浓度。

Q:为什么带消灭纹理现象?A:

主要是样品不溶性颗粒引起的。

处理方法:加样前离心;加适量样品促溶剂。

Q:什么是“鬼带〃,如何处理?

A:''鬼带〃就是在跑大分子构象简洁的蛋白质分子时,常会消灭在泳

道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉

淀,主要由于复原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被

解离的蛋白质分子重折叠结合和亚基重缔合,聚合成大分子,其分子

量要比目标条带大,有时不能进入分别胶C但它却于目标条带有一样

的免疫学活性,在WB反响中可见其能与目标条带对应的抗体作用。

处理方法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta筑基乙醇,

以补充缺乏的复原剂:或可加适量EDTA来阻挡复原剂的氧化。

Q:为什么溟酚蓝不能起到指示作用?A:

我们在试验中常会遇到澳酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来

的现象。主要与缓冲液和分别胶的浓度有关。

处理方法:更换正确pH值的Buffer;降低分别胶的浓度。

Q:为什么电泳的条带很粗?A:

电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的缘由。

处理方法:适当增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确

(6.7h适当降低电压;

Q:为什么电泳电压很高而电流却很低呢?

A:这种现象一般初学者易消灭。比方电压5

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