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15TechnicalcodeofpracticeofmolecDB15/T4511—2026I本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定本文件由内蒙古自治区畜牧业标准化技术委员会（SAM/TC1DB15/T4511—20261绒山羊分子标记辅助选择与基因组选择育种技术规程GB/T34796水溶液中核酸的浓度和纯度检测紫外分光光GB/T42060医学实验室样品采集、运送、接收和处理的要求3.1分子标记辅助选择molecularmarker-assisted3.23.33.4候选群candidatepopu3.5DB15/T4511—20262基因组估计育种值genomicestimatedbree4.2系谱信息检查4.3基因型测定样本包括血液、耳组织等可提取DNA的生物样品。样品采集和保存按照GB/T42060的规从生物样品中提取DNA，所提取的DNA质量符合基因分型检测的要求。DNA浓度和纯度的检测方法和采用Plink软件进行基因型数据质控，剔除以下不符合要求的个体及SNP：基因型检出率＜98%的个体；SNP检出率＜98%、最小等位基因频率（MAF5%、哈代温伯格平衡（HWE）检验P值＜10-6的SN4,4分子标记辅助选择优良基因型个体作为育种亲本，从而定向改良后代目标性状。显著SNP位点信息详见附4.5基因组选择无法满足参考群建立的规模要求，可联合多个羊场或育种单位来构建利用基因组育种值主流预测软件，通过GBLUP、ssGBLUP等模型预测基因组育种值，采用5倍交叉验证评估模型的预测准确性。GBLUP、ssGBLUP模型参见附录B，模型验证方法参见DB15/T4511—20263将候选群个体的基因分型数据代入4.5.2中建立的育种值预测算法模型，获得候选群个体的基因组DB15/T4511—20264A→GA→GA→CA→CDB15/T4511—20265DB15/T4511—20266A→CA→GA→CA→GA→CDB15/T4511—20267采用GBLUP、ssGBLUP模型估计基因组育种值，混合模型通用形式见公式y=Xβ+za+e··································································(B.1)2y=Xβ+za+wm+Qc+e·······················································(B.2)2m——母体加性遗传效应向量；DB15/T4511—20268a)将参考群随机均分为若干个亚群；DB15/T4511—20269·············

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