CN119487578A 用于对包括肿瘤异质性、治疗效果和生存统计的患者信息进行生成和可视化的方法和系统 （皇家飞利浦有限公司）

2024.12.30PCT/EP2023/0673812023.06.27WO2024/003004EN2024.01.04一种用于对患者的肿瘤的异质性进行可视基于对所述患者的肿瘤类型的所述识别和对所述患者的肿瘤的所述异质性评估来获得(130)针对所述肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚者的肿瘤的所述异质性评估和所获得的针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚所述系统的用户接口提供(150)所生成的视觉表21.一种用于对患者的肿瘤的异质性和针对所述患者的异质肿瘤的治疗效果进行可视接收(120)关于患者的信息，所接收的信息包括关于所述患者的人口统计信息和临床估包括对所述患者的肿瘤的异质性的分析和对所述肿瘤的两个或更多个亚克基于对所述患者的肿瘤类型的所述识别和对所述患者的肿瘤的所述异质性评估来获得(130)针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆生成(140)对所述患者的肿瘤的所述异质性评估和所获得的针对所述肿瘤的所述两个2.治疗效果图形，其包括对针对所述患者的肿4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述两个或更多个亚克隆通过一种或多种分子亚克隆中的每个亚克隆所特有的所述一种或多种分子和/或组织学变异中的一些或全部的亚克隆所特有的一种或多种分子和/或组织学变异中的组合对所述患者的肿瘤的所述两个或更多个亚克8.根据权利要求1所述的方法，其中，所述肿瘤异9.根据权利要求1所述的方法，还包括以下步骤：中的所选择的一种或多种治疗任选地被报告使用所接收的患者信息和参考生存数据集来计算(2230)针对所述患者相对于第一历3经由所述系统的用户接口提供(2250)所生成的视觉表示，其值前生存时间段内的死亡的百分比标绘图；以及(iii)所述第一历史群组在中值后生存时所述第一历史群组在尾随时间段内的死亡相对于所述第一历史群组在所述尾随时间段开11.一种用于提供对患者的肿瘤的异质性和针对所述患者的异质肿瘤的治疗效果的可的肿瘤的异质性的分析和对所述肿瘤的两个或更多个亚处理器(220)，其被配置为：(i)基于对所述患者的肿瘤类型的所述识和所获得的针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息的2.治疗效果图形，其包括对针对所述患者的肿4的亚克隆所特有的一种或多种分子和/或组织学变异中的一些或全部的5例和实施方式指向生成和提供对患者的异质肿瘤和针对该异质肿瘤的治疗效果的视觉表6者的肿瘤的异质性评估和所获得的针对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治[0007]本文中的各种实施例和实施方式还指向一种生成和提供针对患者的生存的视觉别和对所述患者的肿瘤的所述异质性评估来获得针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息；(iii)生成对所述患者的肿瘤的所述异质性评估和所获得的针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息的视觉对针对所述患者的肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的多种不同治疗中的[0011]根据一个实施例，所述两个或更多个亚克隆通过一种或多种分子和/或组织学变每个亚克隆所特有的所述一种或多种分子和/或组织学变异中的一些或全部的识别。根据7[0014]根据一个实施例，所述肿瘤异质性图形和/或所述治疗效果图形还包括以下各项瘤的所述异质性评估和所获得的针对所述肿瘤的所述两个或更多个亚克隆中的每个亚克述患者信息和参考生存数据集来计算针对所述患者相对于第一历史患者群组在第一时间第一历史群组在所述第一时间段内的Kaplan_Meier估计标绘图；以及(ii)尾随死亡标绘在中值前生存时间段内的死亡的百分比标绘图；以及(iii)所述第一历史群组在中值后生所述尾随死亡标绘图包括所述第一历史群组在尾随时间段内的死亡相对于所述第一历史[0020]4.生存概率图形，所述生存概率图形包括在所述第一时间段内的生存概率标绘8[0025]根据一个实施例，提供所生成的视觉表示包括提供和参考生存数据集来计算针对所述患者相对于第一历史患者群组在第一时间段内的一个第一历史群组在所述第一时间段内的Kaplan_Meier估计标绘图；以及(ii)尾随死亡标绘在中值前生存时间段内的死亡的百分比标绘图；以及(iii)所述第一历史群组在中值后生包括所述第一历史群组在尾随时间段内的死亡相对于所述第一历史群组在所述尾随时间[0033]4.生存概率图形，所述生存概率图形包括在所述第一时间段内的生存概率标绘9[0037]图1是根据一个实施例的用于生成和提供对肿瘤异质性和/或治疗效果的视觉表[0039]图3是根据一个实施例的包括患者信息面板和肿瘤异质性图形面板的视觉表示的[0059]图22是根据一个实施例的用于生成和提供对患者的生存的视觉表示的方法的流[0074]根据一个方面，一种系统和方法被配置为生成和提供对患者的肿瘤的视觉表或更多个亚克隆通过一种或多种分子和/或组织学变异来区分。肿瘤可视化系统获得针对对患者的肿瘤的异质性评估和所获得的针对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆[0076]根据另一方面，提供了一种被配置为生成和提供对生存的视觉表示的系统和方荷兰皇家飞利浦公司获得)，或者被实施为用于患者分析或监测的商业产品的元件或者任[0079]本文描述的或以其他方式设想的方法和系统提供了优于现有的数据生成和可视或生存概率图形的医学显示提供了创造性解决方案来处理关于应接不暇的信息和过于杂乱的可视化和计算机显示的问题。例如，飞利浦在2020年的一项研究(“未来健康指数理，并且35％的年轻健康护理专业人员对于大量的数字患者数据(包括经由患者监测器和可视化方法和系统提供了用于显示海量数据的简化且M(数字0或1)描述肿瘤是否已经转移。该信息可以包括基于细胞在显微镜下的样子的等和一个或多个转移部位)的个体细胞。多区域分子测试方法将检查来自肿瘤的一个或多个分析和/或蛋白质组分析引起对肿瘤的至少两个亚克隆的识别。亚克隆能够被定义为一种变异(要么在单个肿瘤内(肿瘤内异质性)，型的识别和所接收的对患者的肿瘤的异质性评估来识别和获得[0095]治疗效果能够基于一种或多种治疗对肿瘤类型和已识别的亚克隆类型的已知效癌症治疗中的一些或全部在处置特定肿瘤类型的已识别亚克隆类型中的已知或估计效果者基于亚克隆对治疗反应不良而将该治疗与基因突变(或对亚克隆异质性的其他识别)相关联。这些信息对于本文描述的或以其他方式设想的肿瘤可视化系统来说都是重要的信[0098]在该方法的步骤140处，肿瘤可视化系统利用所接收的对患者的肿瘤的异质性评估和所获得的对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息来生成视觉表示。视觉表示包括对患者的肿瘤的异质性评估的表示和对所获得的治疗效果信息的表[0099]对异质性评估和治疗效果信息的一个或多个视觉表示是根据本文描述的或以其图形表示数据的方法和机制来生成这种视觉表示。系统可以利用这些方法和许多其他方[0101]在该方法的步骤150处，肿瘤可视化系统经由用户接口提供所生成的对异质性评[0104]肿瘤可视化系统经由用户接口提供所生成的对患者的肿瘤的异质性评估和对针例，这种识别包括对患者的肿瘤中的每个亚克隆相对于彼此和/或相对于整个肿瘤的相对[0105]肿瘤异质性图形还能够包括例如基于其他患者群组的针对相同肿瘤类型的异质中的一些或全部的识别。种治疗对患者的肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的效果的指示。值得注意的地包括一组能够有利地靶向和/或处置大多数或所有已识别的肿瘤亚克隆的癌症治疗。根连同所有可用选项的证据一起)报告给临床决策支持系统或患者管理系统，以用于将来的然后能够经由用户接口来显示经重新计算和/或重新生成的可视化。许多其他修改也是可供了关于癌症亚克隆的相对大小的基本信息。每个块(c)表示一个亚克隆并且被标记有识击、选择或以其他方式识别了用于信息扩展的亚克隆B。当使用遗传分析识别这些亚克隆在患者信息或异质性评估中能够提供有序数据标绘图530。肿瘤异质性评分的有序数据标质性图形面板包括针对相似患者群组的头颈鳞状细胞癌(HNSC)的肿瘤异质性评分的有序面板710包括关于一种或多种治疗对一个或多个亚克隆的效果的信息，并且示出在药物选克隆E)以及所选择的治疗(来曲唑)对这些亚克隆中的每个亚克隆的效果的指示。这种效果是可能的。使用具有针对药物敏感性的细胞分组的六边形网格。网格单元中心的斑点(d)提供了亚克隆中的每个亚克隆对药物反应的视觉线索。斑点相对于网格单元(c)的大小的收缩程度表择面板720包括能够用于处置这些亚克隆中的一个或多个亚克隆的一种或多种可能的治疗多种可能的治疗中的每种可能的治疗，药物选择面板720示出治疗对不同亚克隆中的每个或其他指示可以指示治疗对由条或块表示的亚[0132]参考图14，在一个实施例中，图14是示出图例1400的治疗效果面板710的任选部[0133]参考图15，在一个实施例中，图15是示出图例1500的药物选择面板720的任选部该实施例中，药物选择面板720包括两种或更多种治疗对这些亚克隆中的一个或多个亚克用。组合药物作用将亚克隆块视觉合并成肿瘤敏感性(深色区)与抗性(浅色区)的融合表治疗中的两种或更多种药物对这些亚克隆中的一个或多个亚克隆的组合效果的可能的可改变其有益情况并且会引起其余药物的列表相应地重微处理器、微控制器、多个微控制器、电路、现场可编程门阵列(FPGA)、专用集成电路[0144]用户接口240可以包括一个或多个用于实现与用户通信的设备。用户接口能够是经由通信接口250被呈现给远程终端。用户接口可以与系统的一个或多个其他部件位于一[0147]显而易见的是，被描述为存储在存储装置260中的各种信息可以额外地或替代地[0148]虽然系统200被示为针对每个描述的部件包括一个这样的部件，但是在各种实施配置为独立地运行本文描述的方法，或者被配置为执行本文描述的方法的步骤或子例程，一服务器中的第一处理器和第二服务器中的第二处理器。许多其他变型和配置也是可能[0149]根据一个实施例，电子病历数据库或系统270是从中可以获得或接收关于患者和模块和/或一个或多个指令，以执行本文描述的或以其他方式设想的方法的一种或多种功[0154]根据一个实施例，患者异质性评估数据和/或指令262b指导系统执行异质性评估文描述的或以其他方式设想的对患者的肿瘤异[0156]根据一个实施例，生成指令264指导系统生成本文描述的或以其他方式设想的一个或多个视觉表示。可以在接收到患者信息并获得了治疗效果信息之后立即执行该操作，可以包括本文描述的或以其他方式设想的一个[0157]根据一个实施例，报告指令265指导系统经由用户接口提供所生成的一个或多个[0158]根据一个实施例，报告指令265指导系统经由用户接口提供用于与所提供的一个同所有可用选项的证据一起)报告给临床决策支持系统或患者管理系统，以用于将来的审如通过创建和评价不同的组合治疗选项来操纵针对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息。治疗指令266能够例如对可能的药物组合对一个或多个亚克隆的获得针对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗效果信息；(iii)生成对患者的肿瘤的异质性评估和所获得的针对肿瘤的两个或更多个亚克隆中的每个亚克隆的治疗对患者的生存的视觉表示的方法2200的流程图。结合附图描述的方法仅作为示例来提供，能够是本文描述的或以其他方式设想的任何系统。本文也公开了和/或以其他方式设想了[0169]在该方法的步骤2230处，生存统计分析系统计算针对患者的一个或多个生存统[0170]系统可以根据需要或者作为编程或其他自动化的结果来计算针对患者的一个或的用户接口。该信息可以包括本文描述的或以其他方式设想的一个或多个生存统计和图[0171]针对患者的一个或多个生存统计是根据本文描述的或以其他方式设想的任何方的参考生存数据集，或者可以将所接收的参考生存数据集存储在本地或远程存储装置中，析的患者或对象相关的患者群组以及与正在对其计算一个或多个生存统计的患者不具有针对患者的生存统计存储在本地或远程存储装置中，以供在该方法的另外的步骤中使用。[0177]对所计算的一个或多个生存统计的一个或多个视觉表示是根据本文描述的或以[0182]生存统计分析系统经由用户接口提供所生成的对所计算的一个或多个生存统计的Kaplan_Meier估计标绘图。Kaplan_Meier估计是一种用于估计随时间的生存函数的统函数图形包括Kaplan_Meier估计3010和尾随图形包括具有特定确定的肿瘤异质性指数1.0的第一历史群有1.0的特定确定的肿瘤异质性指数的第一历史群组，这表明在取样的肿瘤内的细胞的异历史群组在正在计算的时间点处的生存者的总数来计算针对在第一时间段内的多个时间将总时间区间的全部生存者的数量与在每个表示的时间点处的生存者的数量进行比较来过的时间的标记相结合时可以有助于对即将到来的时段的有特定确定的肿瘤异质性指数1.0的第一历史群组，这表明在取样的肿瘤内的细胞的异质中的图形3000中的不同的生存函数标绘图中，每幅生存函数标绘图都包括不同的历史群实际组织形式可能不同于所图示的情况并且比所图示的情况更[0210]存储器2330能够采取任何合适的形式，包括非易失性存储器和/或RAM。存储器器2330可以包括静态随机存取存储器(SRAM)、动态RAM(DRAM)、闪速存储器、只读存储器[0212]通信接口2350可以包括一个或多个用于实现与其他硬件被配置为独立地运行本文描述的方法，或者被配置为执行本文描述的方法的步骤或子例[0216]根据一个实施例，电子病历系统2370是从中可以获得或接收关于患者的信息和/个模块和/或一个或多个指令，以执行本文描述的或以其他方式设想的方法的一种或多种[0219]根据一个实施例，参考生存数据集2363包括关于以下一个或多个历史患者的信[0220]根据一个实施例，计算指令2364指导系统计算针对患者的一个或多个生存统系统可以根据需要或者作为编程或其他自动化的结果来计算针对患者的一个或多个生存处理器运行时使得所述处理器能够执行以下方法，所述方法包括：(i)接收关于患者的信计算针对患者相对于第一历史患者群组在第一时间段内的一个或多个生存统计；并且(iii)生成对所计算的一个或多个生存统计的视觉表示；并且(iv)经由系统的用户接口提[0225]另外，生存统计分析系统能够被配置为连续接收针对参考生存数据集的新数或多种)非瞬态计算机可读存储介质，在所述(一种程图和/或框图的每个框以及流程图和/或框图中的框的组合能够由计算机可读程序指令[0231]本文在说明书和权利要求书中使用的“或”应当被理解为具有与上文所定义的者在权利要求中使用的“由……组成”)将指代包括多个元件或元件列表中的恰好一个元个”应当被理解为表示选自元件列表中的元件中的任何一个或多个元件中的至少一个元语。到用于执行功能和/或获得结果和/或本文描述的优点中的一个或多个优点的各种其他单元和/或结构。这样的变化和/或修改中的每个变化和/或修改都被认为是在本文描述的发