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文档简介

1、,荧光定量PCR,1,学习交流PPT,相对定量实验分析方法相对定量实验设计摘要,2,学习交流PPT,PCR定量实验概述,相对定量,3,学习交流PPT,相对定量PCR实验目的和要求,相对定量实验的目的优点:目的4、利用交流PPT、相对定量原理(I)、内参基因(=内源性对比)可规范化样品间的差异。Step 1:相同样本中目标基因和基准基因的浓度Step 2:不同样本中目标基因的含量差异可由基准基因修正,基准基因可修正。样本起始量的差异样本中核酸回收率的差异样本中,可能的RNA在其他样本中分解核酸质量的差异,5,学习交流PPT,学习基准基因的选择,理想的比较基因:表达水平在所有样本中持续稳定。正常组

2、织对肿瘤组织表达水平不受实验条件变化的影响。样本处理与未处理的样本歌词基因(Housekeeping genes):编码具有基础细胞功能的蛋白质,6,学习通信PPT,Reference gene selection,normalization of gene expression menesLab Invest。2005 85(1): 154-159 reference genes identified in sh-sy5y cells using custom-made gene arrays with validation by qp crhoernesAnal Biochem。2004

3、335(1): 30-41 determination of an internal control to apply reverse transcription quantitative PCR to study stress responsiondes Roche n,beltramo c,Guzzo j . j microbiol methods . 2005 60(3)3360325-33 . evaluation of potential reference genes in reareas6:21 . selection of reference genes for quantit

4、ative real-time PCR in bovine preimplantation embryos . goossens k,van pou cks vandesompelpelsBMC devbiol.2005 53360 27。7,学习AC PPT,使用calibrator进一步统一最终分析结果,在同一个实验中校准目标基因和基准基因的检测灵敏度,在多个实验之间校准run to run fixed dynamic range。benefit of in-run Standard(Inter-Assay Calibration),43,学习AC PPT,相对定量原理相对定量实验分析方法LightCycler Software操作相对定量实验设计总结, 通过44内参基因均匀化,徐璐补偿不同样品源核酸质量和含量的差异,通过样品均匀化,考虑徐璐不同实验布局和试剂批次之间差异放大效率的扩增效率修正e=2 in case PCR efficiencies of target and reference are different and E2 edit e value standard curvs terminology used in different software summ

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