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文档简介
1、SciFinder Web -文献、物质、反应检索,美国化学文摘社 中国代表处 唐蜜,导 航,Part I SciFinder背景介绍 Part II 检索技巧介绍 文献检索 物质检索 反应检索 Part III SciFinder Web 新功能,Part I SciFinder背景介绍,SciFinder的背景-CAS主要产品,原始出版物,CAS 科学家,信息检索者 或用户,SciFinder科学索引过程,题目摘要改写 索引词的编写 物质索引的编写(CAS.No., CAS Role),Preparation of protracted glucagon-like peptide-1 an
2、d exendin-4 analogs containing at least an amino acid, especially lysine, derivatized with four fragments such as carboxyalkanoyl- or imidazol-5-ylalkanoylaminosulfonylalkanoyl-piperidin-4-ylcarbonyl-aminoalkanoyl-l inker and related moieties and their pharmaceutical use for treating diabetes type 2
3、 and related diseases,Peptides derivatized with a-b-c-d- and their therapeutical use,该专利SciFinder与专利原文的题目,原文与SciFinder的摘要,The invention relates to protracted peptide derivatives such as Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1), exendin-4, and analogues thereof, as well as therapeutic uses thereof.The peptide
4、 derivative of the invention comprises a peptide wherein at least one amino acid residue is derivatized with A-B-C-, or A-B-C-D-. These compounds are useful in the treatment or prevention of diabetes type 2 and related diseases. The compounds are potent, have a low ratio of binding affinity to the G
5、LP-1 receptor in the presence of high/low albumin concentrations, have long half-lives, and have a high affinity of binding to albumin, all of which is of potential relevance for the overall aim of achieving long- acting, stable and active GLP-1 derivatives with a potential for once weekly administr
6、ation.,The invention is related to the prepn. of protracted peptide derivs. such as Glucagon-Like Peptide-1 (GLP-1), exendin-4, and their analogs contg. at least one amino acid residue derivatized with four fragments such as carboxyalkanoyl- or imidazol-5-ylalkanoylaminosulfonylalkanoyl-piperidin-4-
7、ylcarbonyl-aminoalkanoyl-l inker and related moieties, e.g., (desaminoHis7,Glu22,Arg26,Arg34)GLP- 1-(7-37)Lys2-2-2-2-2-2-(S)-4-1-(9-Carboxynonadecanoyl)piperidine-4-carbo nylamino-4-carboxybutyrylaminoethoxyethoxyacetylaminoethoxyethoxyacetylamide (I), and to their use in the treatment or prevention
8、 of diabetes type 2 and related diseases. The peptide derivs. of the invention are potent, have a low ratio of binding affinity to the GLP- 1 receptor in the presence of high/low albumin concns., have long half-lives, and have a high affinity of binding to albumin, all of which is of potential relev
9、ance for the overall aim of achieving long- acting, stable and active GLP- 1 derivs. with a potential for once weekly administration. Thus, I was prepd. by derivatization of the peptide sequence obtained by solid phase peptide synthesis with Fmoc-8-amino-3,6-dioxaoctanoic acid (Fmoc = 9H-fluoren-9-y
10、lmethoxycarbonyl) twice, Fmoc-Glu-Ot-Bu, Fmoc-isonipecotic acid, and eicosanedioic acid monotert-Bu ester. I showed albumin binding affinity (EC50 = 300-800 nM) and had a half-life in the range of 12-35 h after s.c. administration in 0.05-17 nmol/mL to db/db mice.,SciFinder的六大数据库,文摘数据库 CAplus (1万种期刊
11、, 61个国家地区的专利,日更新) Medline (4800种生物医学期刊) 物质数据库 Registry (1亿零600万个物质/序列,日更新) Chemcats (3400万条商业物质数据库) ChemList (24.7万种管制品物质数据库) 反应数据库 CAS React (2200万单步及多步反应,周更新),Scifinder 特色,全部记录经过人工编写 更新速度快 提供文献、物质、反应两两之间的链接 提供多种途径的检索方式 提供强大的检索后处理方法 即时跟踪特定研究领域的全球最新科研状态 提供永久的信息分享链接,文献检索 物质检索 反应检索,Part II 检索技巧介绍,登陆网址
12、:,输入用户名,密码,SciFinder的 最新信息,文献检索多种途径,关键词检索 Research Topic 作者姓名检索 Author Name 机构名称检索 Company Name 文献识别 Document Identifier 期刊 Journal 专利 Patent,检索界面:检索文献(默认)检索物质检索反应,输入关键词,限制条件,关键词检索,纳米材料在医药中应用的专利,关键词检索纳米材料在医药中应用的文献,输入 nanomaterial with pharmaceutical,用英文的介词of、with、by、beyond连接关键词,不建议使
13、用布尔逻辑符and,两种输入方法对比,文献检索结果,对文献结果集的后处理操作Analyze/Refine,Analyze: 作者姓名物质 学科名称机构名称 所属数据库文献类型 索引词CA概念标题 期刊名称出版语言 出版年代附加词,Refine途径: 主题词 作者姓名 机构名称 出版年代 语言 所属数据库,对文献结果集的后处理操作Categorize,一级目录,二级目录,使用Refine功能限定文献类型为专利,点击文章标题获得文章摘要,获取文章中涉及的物质;获取文章中涉及的反应; 获取此论文的引用文献;获取引用此论文的文献; 有条件地获取全文,文献来源信息,Keep Me Posted 即时提醒
14、功能,结果的保存和输出,注:存储名称均为英文,最近保存:,检索历史:,文献检索多种途径,关键词检索 Research Topic 作者姓名检索 Author Name 机构名称检索 Company Name 文献识别 Document Identifier 期刊 Journal 专利 Patent,姓必须输入,大小写都可以,名只需输入首字母。,作者姓名检索,姓,名的首字母,在列表中将所有符合条件的简称和全称都选上,去除同名同音现象,文献检索总结,文献检索有多种检索途径:关键词、作者姓名、组织机构名、文章标识、期刊、专利、书签 多个关键词间用介词连接,一般输入35个为宜 文献检索信息量较大,要多
15、用后处理功能进行缩小 从文献摘要中获取有用信息,文献检索 物质检索 反应检索,Part II 检索技巧介绍,物质检索途径,结构式检索 Chemical Structure Markush检索 Markush 分子式检索 Molecular Formula 物质标识 Substance Identifier,结构式检索,物质结构式检索提供了三种方式: Exact search 用途:查询结构式确定的有机化合物,可以检索物质的盐 、同位素、混合物、聚合物 Substructure search 用途:查询母体化合物的衍生物;结果数量多。 Similarity search 用途:查询文献数量少、或
16、者没有文献物质的相似化合 物。,结构式检索界面,单击,注:初次使用需安装JAVA插件,结构式绘制界面,工具栏,常用结构元素,铅笔,元素周期表,可变基团,重复基团,碳链,选择工具,环锁定,正电,橡皮,常用基团,基团定义,可变位置连接,模版,选择工具,原子锁定,环旋转,负电,工具介绍,常用元素,常用环系结构,键的立体构型,已选模板,恢复至碳碳单键,原子旋转,亚结构式检索举例,三唑啉酮类衍生物具有广泛的生物活性,特别是在除草剂方面,以其高效、低毒、环境友好的特点成为当代除草剂研究领域中最热门的课题之一。,亚结构式检索,亚结构检索结果,物质检索中的分析/精选功能,Analysis功能: 是否有商业品来
17、源 物质所有的元素 是否有反应信息 物质的职能符(CAS Role),Refine 功能: 物质结构式 是否包含同位素 是否包含金属元素 是否有商业品来源信息 是否有性质 物性参数 是否有相关文献 原子取代基,点击,对结果集进行亚结构限定,用Refine功能原子取代基限定,用Refine功能原子取代基限定,得到我们需要的物质结果,相似结构检索,如果一个物质公开报道的文献较少或者没有,我们是否可以借鉴与该物质结构类似的物质涉及的相关文献?,分数越高,结构越相似,相似性结构检索结果,相似性结构检索,取代基可能不同,取代基位置可能不同,母核结构略有不同。,物质检索途径,结构式检索 Chemical
18、Structure Markush检索 Markush 分子式检索 Molecular Formula 物质标识 Substance Identifier,物质名称检索,达菲,通用名为磷酸奥司他韦(Oseltamivirphosphate) 。 奥司他韦(Oseltamivir)于1999年在瑞士上市,2001年10月在我国上市。达菲是一种非常有效的流感治疗用药,并且可以大大减少并发症(主要是气管与支气管炎、肺炎、咽炎等)的发生和抗生素的使用,因而是目前治疗流感的最常用药物之一,也是公认的抗禽流感、甲型H1N1病毒最有效的药物之一。 用SciFinder查询Oseltamivir的相关信息。,
19、输入物质的化学名称、俗名、CAS No.,检索结果,点击获取物性参数,点击获取物性参数,物性参数,举例:查询Oseltamivir制备中反应类型为Michael Reaction的文献,由物质获取制备反应,首先获取关于Oseltamivir制备类的文献,应用Categorize功能进行分类,获取Oseltamivir反应类用Michael Reaction合成的文献,Combine功能,举例:查找Roche以外的公司或机构发表的关于Oseltamivir的文章,思路 :查询所有关于Oseltamivir的文章 将公司名称限定为Roche 运用Combine功能,从之前保存的结果中调出关于物质检
20、索Oseltamivir的检索结果,运用refine功能将公司名称限定为Roche,物质检索途径,结构式检索 Chemical Structure Markush检索 Markush 分子式检索 Molecular Formula 物质标识 Substance Identifier,分子式检索,分子式输入规则: 同一组分中的元素,必须有明确的分割符号。对于不含C的物质,按照字母顺序书写;对于含C物质,CH写在前面,其他按照字母顺序; 对于多组分物质,用“.”将不同组分分开,组分排列顺序按照C数的降序排列,C数相同时,按照H数降序排列,H数再一样,则按照第三个元素的字母降序排列。,物质检索总结,
21、物质的检索途径包括:名称、CAS No.、分子式、结构式 检索物质,得到的信息相当有限,只有物质的基本信息、性质、谱图等。 物质检索却是非常好的获取文献和反应的途径。 Get References CategorizeSynthetic ChemistryReactions,文献检索 物质检索 反应检索,Part II 检索技巧介绍,反应检索界面,点击切换至反应检索界面,单击点开反应式面板,绘制反应面板,反应箭头,原子定位,反应官能团,反应角色定义,反应位置,检索具体的反应,反应式检索界面,查询得到两个相关反应,获取反应细节,点击获得文献的信息,或者有条件获取全文,获取相似反应,相似性反应检索结果,反应检索的分析与限定功能,反应分析类型: 作者姓名出版语言 溶剂 出版年代 机构名称 反应步数 文献类型产率 期刊名称催化剂,反应的限定功能: 反应式 产率 反应步数 反应类型 排除的反应类型 不参与反应的基团,用Refine限定反应收率,由反应得到文献,在反应面板上画出所有的反应信息 最开始不画反应物,只画产物。在refine中输入反应物的
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