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文档简介

1、癌、炎外周血白细胞免疫损伤特征与鉴别诊断标志,一、项目背景与立项依据,癌、炎鉴别的临床需要 活检对人体的侵害及成本,一、项目背景与立项依据,外周血,血清/血浆,全血/PMBC,CD8T细胞,（可侵害性小、可重复取样）,（候选基因，诸如循环蛋白质、循环miRNA等，含量低、变异性大）,（血细胞组分比例改变信号）,（癌、炎存在不同的功能损伤特征。提示可从中寻找标志）,现有的寻找癌症标志策略,一、项目背景与立项依据,利用特征基因的绝对表达水平,分析基因表达秩序关系,（受批次效应及检测技术波动影响，难以跨平台）,（严重的高维问题，导致假阳性与过拟合问题）,一、项目背景与立项依据,个体化诊断标志与个体化

2、通路分析,前期研究发现正常样本中基因表达秩序具有广泛的稳定性，而这种稳定性在疾病样本中被广泛扰动,方法：拟发展利用基因表达秩序关系分析个体化通路,对象：癌、炎的CD8T细胞,二、研究目的与研究内容,识别癌、炎外周血CD8T细胞中基因表达协调关系显著异常的通路 发展通路异常的个体化判断方法及鉴别癌、炎的CD8T细胞通路标志 识别外周血CD8T细胞中的癌、炎鉴别的个体化基因对标志,三、研究方法及技术路线,已收集癌、炎及正常外周血CD8T细胞表达谱数据集,正常中跨平台稳定基因对训练过程,跨平台稳定基因对,疾病（癌或炎）样本i,逆转基因对,疾病（癌或炎）相关失调通路,基因列表,候选诊断通路中的稳定、逆

3、转基因对,候选 个体化 诊断基因对,特征筛选、分类器构建,胃癌、胃炎,候选 个体化诊断通路,特征筛选、分类器构建,个体化通路富集分析,疾病（癌或炎）个体化扰动通路,功能富集,疾病（癌或炎）vs.正常,正常,稳定基因对,疾病,显著逆转基因对,注释,逆转,稳 定,显著 逆转,验证,验证,四、拟解决的关键问题,揭示癌症与炎症在外周血CD8T细胞上免疫功能损伤差别的普遍性； 证实正常外周血CD8T细胞中基因表达丰度存在广泛、稳定的秩序关系； 解决基于基因表达秩序关系筛选疾病标志的维数灾难问题。,实用性,五、项目特色与创新点,创新性,稳健性,开展面向转化医学的疾病标志 分析癌、炎之间的差异性分子特征,拟识别的基因对标志是基于基因表达秩序关系的，可跨实验室使用,拟提

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