DNA启动子终止子PPT学习教案

1、会计学1 DNA启动子终止子启动子终止子PPT课件课件 启动子：RNA聚合酶特异性和结合的DNA序列。 启动 子是基因的一个组成部分，控制基因表达的起始时间和 表达的程度。 外显子：断裂基因中的编码序列。外显子是真核生物 基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋 白质生物合成过程中被表达为蛋白质。 内含子：断裂基因的非编码区，可被转录，但在 mRNA加工过程中被剪切掉，故成熟mRNA上无内含子 编码序列。 第1页/共24页 怎样利用互联网中 的网站或软件分析 该序列中的外显子 、内含子和启动子 呢？ 现有人基因组 中的一段序列 GGTATGGGG CCAAGAGATA TATCTT .

2、 第2页/共24页 一、根据一段碱基序列一、根据一段碱基序列 找到其对应的基因名或找到其对应的基因名或 其序列号其序列号 第3页/共24页 任选浏览器搜索“NCBI”找到后点击进入，出现如上 界面点击“BLAST”（Basic Local Alignment Search Tool, BLAST） 第4页/共24页 当出现如上界面时，点击“nucleotide blast” 第5页/共24页 打开页面后，在检索框中输入需要查找的序列，如图所示 第6页/共24页 根据索要查询的基因来源，选定需要查询的基因（人类基因） 点击“BLAST”打开 第7页/共24页 u 出现页面后向下滑动直至 出现图1

3、 u 寻找Ident(一致性）最高的 一项 u 点击进入 第8页/共24页 点击进入后见 所查序列名称 以及序列号 据此进行操作 第9页/共24页 二、已知基因的基因名 或序列号找到其启动子 、外显子和内含子 第10页/共24页 1 1、输入网址进入、输入网址进入UCSCUCSC网站网站 第11页/共24页 2 2、点击、点击Genome BrowserGenome Browser 第12页/共24页 3 3、点击进入后可看到以下页面、点击进入后可看到以下页面 （1 1）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等）选择是何种生物的基因（如人类，老鼠等） （2）输入你所需要查询的基因名）输入你所需要查

4、询的基因名 称称 输入完毕，点击输入完毕，点击SUBMITSUBMIT 第13页/共24页 4 4、可看到以下页面、可看到以下页面 （1 1）将）将Ensembl GenesEnsembl Genes设置为设置为densedense（显示（显示 ） （2 2）点击）点击refreshrefresh 第14页/共24页 5 5、可看到以下页面、可看到以下页面 找到找到Ensembl Genes Ensembl Genes 点击所对应的序列图点击所对应的序列图 形形 第15页/共24页 6 6、可看到以下页面、可看到以下页面 继续点击所对应的序列图继续点击所对应的序列图 形形 第16页/共24页

5、7 7、可看到以下页面、可看到以下页面 选择选择Genomic Genomic Sequence Sequence 第17页/共24页 8 8、可看到以下页面、可看到以下页面 （2 2）选择表现形式（如）选择表现形式（如 外显子大写，其余都小写外显子大写，其余都小写 ） （1 1）根据需要选择所要展现）根据需要选择所要展现 的内容（如外显子、内含子）的内容（如外显子、内含子） （3 3）点击）点击submitsubmit 第18页/共24页 9 9、可看到以下页面、可看到以下页面此为此为HBBHBB基因的全部序列基因的全部序列 第一第一段段大写大写 部分为第一部分为第一 个个外显子外显子。 第一个外显第一个外显 子子前面的所前面的所 有小写部分有小写部分 为该序列的为该序列的 启动子启动子。 大写部分之大写部分之 间间夹杂的小夹杂的小 写部分写部分为该为该 序列的序列的内含内含 子子。 第19页/共24页 三、检验所得序列 是目的序列 第20页/共24页 1 1、验证、验证 利用利用wordword输入我们所得到序列的第一个外显子输入我们所得到序列的第一个外显子 的部分序列进行验证，看是否与原题序列匹配的部分序列进行验证，看是否与原题序列匹配 第21页/共24页 验证完成后，确认匹配后可继续利验证