高级生物化学_蛋白质的研究方法

1、整理课件1 蛋白质的研究方法蛋白质的研究方法 整理课件2主要内容v蛋白质对象的选择和样品的获取蛋白质对象的选择和样品的获取v蛋白质的检测和鉴定蛋白质的检测和鉴定v蛋白质的结构分析蛋白质的结构分析v蛋白质生物功能检测蛋白质生物功能检测 整理课件3 蛋白质对象的选择和样品的蛋白质对象的选择和样品的获取获取整理课件4 一、研究对象的选择一、研究对象的选择无论何种来源的生物材料一般都含有成千上万种不同无论何种来源的生物材料一般都含有成千上万种不同的蛋白质分子；的蛋白质分子；在一种生物组织中，同时存在着多种蛋白质组分。虽在一种生物组织中，同时存在着多种蛋白质组分。虽然它们都具有肽链结构，但在然它们都具有

2、肽链结构，但在分子大小分子大小、极性极性以以及及电荷电荷上会有所差异。上会有所差异。 整理课件5 选择研究蛋白的原则选择研究蛋白的原则： 在组织中含量比较高在组织中含量比较高 相对比较稳定的蛋白质（如血液中的相对比较稳定的蛋白质（如血液中的HbHb；肌肉中的；肌肉中的 肌球蛋白和肌动蛋白等）肌球蛋白和肌动蛋白等）从模式生物基因组测序结果来看，每一种生物有机体从模式生物基因组测序结果来看，每一种生物有机体内都还有大量的蛋白质（内都还有大量的蛋白质（5050左右）从来没有被研究左右）从来没有被研究过。过。整理课件6获取蛋白样品的方法获取蛋白样品的方法： u直接从生物组织中提纯蛋白直接从生物组织中提

3、纯蛋白为主为主u根据基因组测序获得的信息根据基因组测序获得的信息 整理课件7应用各种分辨效果好的应用各种分辨效果好的化学化学及及物理化学物理化学方法方法整理课件8直接从生物组织中提纯蛋白直接从生物组织中提纯蛋白蛋白质的分离纯化包括以下过程：蛋白质的分离纯化包括以下过程：1.破碎生物组织，并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来；破碎生物组织，并用适当的缓冲液将蛋白质抽提出来； 2.将有关的蛋白质分级沉淀下来将有关的蛋白质分级沉淀下来; （盐析法或有机溶剂法）（盐析法或有机溶剂法）3.应用应用层析法层析法或或电泳法电泳法使它们各自分开使它们各自分开； 4.蛋白质结晶；蛋白质结晶；5.蛋白质纯度鉴定和含量

4、测定。蛋白质纯度鉴定和含量测定。整理课件9u根据基因组测序获得的信息根据基因组测序获得的信息 （1 1）可以获得所要研究的特定蛋白质的）可以获得所要研究的特定蛋白质的AAAA序列。序列。 先根据推出的先根据推出的AA序列合成对象蛋白序列合成对象蛋白中的一段肽，用它中的一段肽，用它去获去获 得有关的得有关的抗体抗体，然后用抗体去探测蛋白质的存在，然后用抗体去探测蛋白质的存在，甚至可以用抗体通过亲和层析纯化对象蛋白甚至可以用抗体通过亲和层析纯化对象蛋白整理课件10（2 2）去获得有关）去获得有关基因的基因的cDNAcDNA全序列全序列，然后，然后通过重组通过重组DNADNA技术去表达重组蛋白。技术

5、去表达重组蛋白。 有偏差，甚至完全是假象。有偏差，甚至完全是假象。 即使推测得到的蛋白质编码信息是对的，在细胞即使推测得到的蛋白质编码信息是对的，在细胞内还存在转录后的内还存在转录后的RNA加工，翻译后的蛋白质的加工，翻译后的蛋白质的修饰和加工等基因序列上目前还无法反映的信息。修饰和加工等基因序列上目前还无法反映的信息。整理课件11制备过程中注意事项：制备过程中注意事项： 要求自始至终保持在要求自始至终保持在天然状态天然状态 避免一切过激因素避免一切过激因素-如过酸或过碱，高温，如过酸或过碱，高温， 重金属等的影响。重金属等的影响。2. 2. 通常都在低温条件下操作。通常都在低温条件下操作。3

6、. 3. 尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高 水平。水平。整理课件12二、细胞的破碎二、细胞的破碎 少数蛋白质少数蛋白质-存在于细胞外面（如血液和体液中）存在于细胞外面（如血液和体液中） 大多数蛋白质大多数蛋白质-都存在于细胞的里面。都存在于细胞的里面。 一般固形生物材料首先都必须加以破碎，以释放出细一般固形生物材料首先都必须加以破碎，以释放出细胞内的蛋白质组分。胞内的蛋白质组分。 生物材料生物材料 必须新鲜必须新鲜要求：要求： 1. 1. 材料材料 -80-80 2. 2. 或者制成干粉或者制成干粉 3. 3. 低温存放低温存放 破碎的方法：破碎的方法：

7、 机械破碎法机械破碎法： 利用机械力的搅切作用，使细胞研碎利用机械力的搅切作用，使细胞研碎高速搅切器、玻璃匀浆器、家用搅肉器、研钵、高速搅切器、玻璃匀浆器、家用搅肉器、研钵、玻璃珠高速匀浆器以及静压器（高压破碎）玻璃珠高速匀浆器以及静压器（高压破碎）。2.2.渗透破碎法渗透破碎法： 利用低渗条件，使细胞溶胀破碎。利用低渗条件，使细胞溶胀破碎。 红血球放于水中，便发生自溶红血球放于水中，便发生自溶。整理课件143.3.交替冻融法交替冻融法： 生物组织经冻结后，细胞内液结冰膨胀生物组织经冻结后，细胞内液结冰膨胀而使细胞胀破。而使细胞胀破。 4.4.超声波法超声波法： 利用超声波震荡，使细胞膜上所受

8、张力不均而利用超声波震荡，使细胞膜上所受张力不均而解体。解体。 5.5.酶消化法酶消化法： 利用蛋白酶、溶菌酶、蜗牛复合酶等对利用蛋白酶、溶菌酶、蜗牛复合酶等对细胞膜或细胞壁的分解作用，使它们解体细胞膜或细胞壁的分解作用，使它们解体整理课件15按其所在按其所在位置位置大体可分为：大体可分为：两种类型外周蛋白两种类型外周蛋白（通过次级键和外膜脂质的通过次级键和外膜脂质的极性头螯合在一起）极性头螯合在一起） 固有蛋白固有蛋白外周蛋白外周蛋白-选择适当离子强度及选择适当离子强度及pHpH的含有的含有EDTAEDTA的的 缓冲液抽提（高盐溶液）缓冲液抽提（高盐溶液）固有蛋白固有蛋白-嵌合在膜双层中，它

9、通过嵌合在膜双层中，它通过疏水作用疏水作用与与 膜内部脂质层膜内部脂质层的疏水性尾部相结合，的疏水性尾部相结合， 具有具有螺旋结构螺旋结构。三、去污剂处理溶解膜蛋白三、去污剂处理溶解膜蛋白膜蛋白的处理：复杂膜蛋白的处理：复杂 细胞膜的结构细胞膜的结构整理课件17 膜固有蛋白的提取与细胞质蛋白，核蛋白提膜固有蛋白的提取与细胞质蛋白，核蛋白提取不同之处在于它是嵌在膜中的，水溶性不取不同之处在于它是嵌在膜中的，水溶性不好，好，基本方法就是用不同的离心速度去掉胞基本方法就是用不同的离心速度去掉胞质蛋白等，最后用去污剂把蛋白从膜中释放质蛋白等，最后用去污剂把蛋白从膜中释放出来。出来。 去污剂去污剂：一类

10、具有一类具有 亲水性头部亲水性头部 疏性尾巴疏性尾巴 的双亲性（的双亲性（amphipathicamphipathic）脂类分子）脂类分子作用：作用： 既可以破坏细胞的既可以破坏细胞的磷脂双层结构磷脂双层结构，又可以与具有，又可以与具有疏水性表面的疏水性表面的膜蛋白结合膜蛋白结合，从而阻止释放出来的膜蛋，从而阻止释放出来的膜蛋白通过疏水相互作用形成大的、可沉淀的聚集体。白通过疏水相互作用形成大的、可沉淀的聚集体。 整理课件19有的有的去污剂的亲水性头部可离子化去污剂的亲水性头部可离子化（即含有一带电（即含有一带电基团）基团） 如如： 脱氧胆酸钠（脱氧胆酸钠（sodium deoxycholat

11、esodium deoxycholate） 十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠（sodium dodecylsulfatesodium dodecylsulfate，SDSSDS）有的有的去去污剂不能解离，所以分子中缺少带电基团污剂不能解离，所以分子中缺少带电基团， 如：如： Triton X-100Triton X-100， 辛基葡萄糖苷辛基葡萄糖苷( octylglucoside( octylglucoside）整理课件20临界微团浓度临界微团浓度（critical micelle concentration，CMC)： 每一种去污剂都具有一特征性的每一种去污剂都具有一特征性的CMC。 CMCC

12、MC值与其分子中值与其分子中疏水部分疏水部分与与亲水部分亲水部分的的结构结构有有 关。关。 当当 去污剂去污剂 低于此值的时候，去污剂分子在水溶液低于此值的时候，去污剂分子在水溶液中将不形成微团，达到此值的时候，微团开始形成。中将不形成微团，达到此值的时候，微团开始形成。 整理课件21 离子化去污剂（离子化去污剂（SDSSDS）：其其“疏水尾巴疏水尾巴”破坏蛋白质分子的疏水性部分的破坏蛋白质分子的疏水性部分的结构，其带电的结构，其带电的“头部头部”破坏蛋白质分子中的氢破坏蛋白质分子中的氢键和离子键。键和离子键。作用的结果是作用的结果是： 使任何蛋白（不管是膜蛋白还是水溶性蛋白）使任何蛋白（不管

13、是膜蛋白还是水溶性蛋白）都都，并，并溶液中，同时溶液中，同时。在部分情况下，当去污剂被透析掉后，蛋白质可在部分情况下，当去污剂被透析掉后，蛋白质可以复性并恢复生物活性。以复性并恢复生物活性。 整理课件22SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳（聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-polyacrylamide SDS-polyacrylamide gel electrophoresisgel electrophoresis，SDS-PAGESDS-PAGE）：）：就是利用就是利用SDSSDS的这种结合在整个蛋白分子上，并的这种结合在整个蛋白分子上，并使蛋白完全变性的特性。使蛋白完全变性的特性。这样经过这样经

14、过SDSSDS变性的蛋白质在电场中完全变性的蛋白质在电场中完全按大小按大小分离开。分离开。 整理课件23非离子去污剂非离子去污剂：相对温和，一般相对温和，一般不会使蛋白质变性不会使蛋白质变性。只是将蛋白质。只是将蛋白质分子从膜上溶解下来而已。分子从膜上溶解下来而已。当当 去污剂去污剂 其其CMCCMC值的时候，去污剂分子与膜蛋值的时候，去污剂分子与膜蛋白表面的疏水区域结合，使蛋白质在水溶液中溶解白表面的疏水区域结合，使蛋白质在水溶液中溶解而不聚集。而不聚集。当当 去污剂去污剂 其其CMCCMC值的时候，去污剂分子将与膜值的时候，去污剂分子将与膜磷脂一起形成混合微团，膜蛋白以整合在微团中的磷脂一

15、起形成混合微团，膜蛋白以整合在微团中的形式存在。形式存在。一般选择非离子去污剂一般选择非离子去污剂来来保持膜蛋白生物活性保持膜蛋白生物活性 整理课件25 四、蛋白分子的稳定四、蛋白分子的稳定防止蛋白质分子可能被同时释放的蛋白质水解酶降防止蛋白质分子可能被同时释放的蛋白质水解酶降解、解、Pr空间结构可能被温度或化学试剂等环境因素空间结构可能被温度或化学试剂等环境因素破坏而丧失生物学活性等。破坏而丧失生物学活性等。处理处理：需要在缓冲液中加入蛋白酶抑制剂；：需要在缓冲液中加入蛋白酶抑制剂； 在低温下操作；在低温下操作； 加入稳定剂加入稳定剂(如甘油等）如甘油等）整理课件26五、细胞碎片的去除五、细

16、胞碎片的去除离心离心( centrifugation)( centrifugation) 原理：悬浮在溶液中的两个或多个不同质量或密度原理：悬浮在溶液中的两个或多个不同质量或密度的颗粒（如细胞、细胞器、大分子复合体、或分子的颗粒（如细胞、细胞器、大分子复合体、或分子等）沉降到试管的底部的速度是不一样的，质等）沉降到试管的底部的速度是不一样的，质量越大、或密度越高沉降的速度越快。量越大、或密度越高沉降的速度越快。沉淀：固体性的细胞碎片和细胞器沉降到离心管的沉淀：固体性的细胞碎片和细胞器沉降到离心管的底部形成；底部形成；上清：绝大多数蛋白分子或蛋白复合体保留在细胞上清：绝大多数蛋白分子或蛋白复合体

17、保留在细胞抽提液中即上清中抽提液中即上清中 整理课件27 六、目标蛋白质的分离、纯化六、目标蛋白质的分离、纯化 -蛋白质的分级沉淀和层析分离蛋白质的分级沉淀和层析分离将不同蛋白质分开的性质主要包括：将不同蛋白质分开的性质主要包括： 分子量的大小分子量的大小 带电情况带电情况 水溶性水溶性 与某种物质的特异高亲和力等与某种物质的特异高亲和力等 整理课件28蛋白质的胶体性质： 蛋白质颗粒表面多为亲水基团，可吸引水分子，使蛋白质颗粒表面多为亲水基团，可吸引水分子，使颗粒表面成有一层水膜颗粒表面成有一层水膜，蛋白质颗粒相互隔开，不，蛋白质颗粒相互隔开，不会聚集成大颗粒而沉淀。会聚集成大颗粒而沉淀。 此

18、外，蛋白质表面可带有电荷，可起胶粒稳定的此外，蛋白质表面可带有电荷，可起胶粒稳定的作用。作用。 若去除蛋白质胶体表面电荷和水化膜两个稳定若去除蛋白质胶体表面电荷和水化膜两个稳定因素因素 ，蛋白质极易从溶液中析出，蛋白质极易从溶液中析出 整理课件29#整理课件30 （一）蛋白质的分级沉淀（一）蛋白质的分级沉淀 常用的方法有：常用的方法有：u 盐析法盐析法u 有机溶剂法有机溶剂法整理课件31 盐析法盐析法 概念：将概念：将中性盐加入蛋白质溶液，破坏水化膜和电中性盐加入蛋白质溶液，破坏水化膜和电荷而使蛋白质沉淀，叫盐析。各种蛋白质盐析所需的荷而使蛋白质沉淀，叫盐析。各种蛋白质盐析所需的盐浓度及盐浓度

19、及pH不同，加入不同浓度的中性盐可不同，加入不同浓度的中性盐可使各种蛋使各种蛋白质依次分别沉淀出来。白质依次分别沉淀出来。 优点：操作简便优点：操作简便 对易变性的蛋白质有一定的保护作用，对易变性的蛋白质有一定的保护作用， 适用范围十分广泛。适用范围十分广泛。 缺点：分辨能力差缺点：分辨能力差整理课件32 1. 1.基本原理基本原理在蛋白质水溶液中添加无机盐，可以产生两种在蛋白质水溶液中添加无机盐，可以产生两种影响：影响： (1)(1)盐离子盐离子与与PrPr分子分子中的中的 极性基团极性基团 离子基团离子基团 作用作用 降低降低PrPr分子的活度系数，趋使其溶解度分子的活度系数，趋使其溶解度

20、 。(2)(2)盐离子盐离子也与也与水水这种偶极分子作用，使水分子的活这种偶极分子作用，使水分子的活 度降低，导致度降低，导致PrPr水合程度的减少，从而趋使水合程度的减少，从而趋使PrPr溶溶 解度解度 。整理课件33 * *盐溶（盐溶（salting in)salting in)-当溶液中的盐离子强度比较当溶液中的盐离子强度比较低的时候，蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而低的时候，蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而增加，这种现象叫做增加，这种现象叫做.* *盐析（盐析（salting out )-salting out )-但当溶液中的盐离子强度但当溶液中的盐离子强度比较高的时候，蛋白质的

21、溶解度会随着盐浓度的增比较高的时候，蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而降低，这种现象叫做加而降低，这种现象叫做 . .一定的盐浓度下，每一种蛋白都有一不同的特异溶一定的盐浓度下，每一种蛋白都有一不同的特异溶解度。解度。 整理课件34 影响盐析作用的因素影响盐析作用的因素（1 1）盐的种类）盐的种类（2 2）pHpH和温度和温度# #（3 3）蛋白质浓度）蛋白质浓度% %整理课件35（1 1）盐的种类）盐的种类对同一种对同一种PrPr而言，而言，价数愈高价数愈高的盐离子，盐析能力的盐离子，盐析能力也愈强也愈强: : PO3-4SO42-C2O42-（CHOHCOO-）2 ACCLNO3-Br -

22、I- K+Rb+Na+Cs+Li+NH4+ 负离子价数较高的中性盐负离子价数较高的中性盐（如硫酸盐、磷酸盐等）（如硫酸盐、磷酸盐等）的的KsKs值常较一价中性盐的值常较一价中性盐的KsKs值高。值高。 Ks:盐析常数（价数较高时，盐析常数（价数较高时，Ks 值也较大）。代表盐析的效值也较大）。代表盐析的效率，率， 是与是与Pr及盐种类有关的特性常数。及盐种类有关的特性常数。整理课件36硫酸铵硫酸铵（常用盐析剂）（常用盐析剂） 优点：盐析能力较强优点：盐析能力较强 具有较高的溶解度具有较高的溶解度 价格低廉价格低廉 不产生副作用。不产生副作用。 缺点：缓冲能力较差缺点：缓冲能力较差 pHpH难控

23、制难控制整理课件37（2 2）pHpH和温度和温度S S。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度 除取决于除取决于PrPr的种类，还受的种类，还受pHpH及温度影响及温度影响: : pH=pI pH=pI时，时，S S。的数值极小。的数值极小 S S。随温度增加而减低。随温度增加而减低。盐析过程中，若增高温度，有助于盐析过程中，若增高温度，有助于PrPr的析出。的析出。# #整理课件38（3 3）蛋白质浓度）蛋白质浓度 PrPr较高较高，在较低无机盐浓度时，在较低无机盐浓度时, ,蛋白质便开蛋白质便开 始析出，盐析界限比较宽。始析出，盐析界限比较宽。 PrPr较低较

24、低，需要无机盐的浓度也高，即盐析，需要无机盐的浓度也高，即盐析 界限变窄。界限变窄。 整理课件39 蛋白质浓度愈高，所需盐的饱和度极限愈低。蛋白质浓度愈高，所需盐的饱和度极限愈低。 但蛋白质浓度愈高时，其他蛋白质的共沉淀作用但蛋白质浓度愈高时，其他蛋白质的共沉淀作用 也愈强也愈强 所以当蛋白质溶液太浓时，应适当稀释，所以当蛋白质溶液太浓时，应适当稀释， 通常在通常在之间比较合适。之间比较合适。整理课件401.1.基本原理基本原理（1）在）在pI附近，附近，Pr主要以中性离子形式存在。此时若添加主要以中性离子形式存在。此时若添加 有机溶剂，由于有机溶剂，由于有机溶剂有机溶剂可使溶液可使溶液电离电

25、离常数常数减小，增强了减小，增强了 中性离子间静电引力，从而使分集合而沉淀出来。中性离子间静电引力，从而使分集合而沉淀出来。（2）有机溶剂有机溶剂本身的水合作用会破坏本身的水合作用会破坏Pr表面的水合层，也表面的水合层，也 促使促使Pr变得不稳定而聚集析出变得不稳定而聚集析出.常用的有机溶剂：乙醇和丙酮常用的有机溶剂：乙醇和丙酮 有机溶剂法有机溶剂法 分辨力比盐析方法高，提纯效果好分辨力比盐析方法高，提纯效果好 整理课件41 2. 2. 影响有机溶剂沉淀影响有机溶剂沉淀PrPr的因素的因素 （1 1） pHpH值值 pH=pIpH=pI时时 蛋白质的溶解度最低。按蛋白质的溶解度最低。按pIpI

26、来调节来调节pHpH值，值， 有利于分离。有利于分离。 （2 2）蛋白质浓度）蛋白质浓度 PrPr越高，加入一定量有机溶剂后，越高，加入一定量有机溶剂后，PrPr析出越多。析出越多。 此时溶液的此时溶液的介电常数介电常数也相应提高，可以减少也相应提高，可以减少PrPr的变性。的变性。 PrPr越高越高,Pr,Pr分子间作用引起的共沉淀现象也显著分子间作用引起的共沉淀现象也显著 增强，这样分离效果差，不利于分级沉淀。增强，这样分离效果差，不利于分级沉淀。 只有选择恰当的只有选择恰当的PrPr才有可能获得良好的分离效果才有可能获得良好的分离效果。整理课件42（3 3）离子强度）离子强度 中性盐的加

27、入能促使中性盐的加入能促使PrPr在有机溶剂中溶解，在有机溶剂中溶解， 并且能防止并且能防止PrPr的变性。但含盐过多，却会使的变性。但含盐过多，却会使PrPr 过度析出，不利于分级沉淀。过度析出，不利于分级沉淀。 一般一般的稀盐溶液。的稀盐溶液。（4 4）多价阳离子）多价阳离子 PrPr与多价的阳离子如（与多价的阳离子如（ ZnZn2+2+、 CuCu2+2+等）能结等）能结 合成复合物。这种复合物在有机溶剂中往往使合成复合物。这种复合物在有机溶剂中往往使PrPr 溶解度变小。溶解度变小。 整理课件43v常温下有机溶剂可使蛋白质变性，常温下有机溶剂可使蛋白质变性，低温条件低温条件下可减慢变性

28、速下可减慢变性速度。因此用有机溶剂沉淀蛋白质时应在低温条件下进行。度。因此用有机溶剂沉淀蛋白质时应在低温条件下进行。v如利用丙酮沉淀蛋白质时，必须在如利用丙酮沉淀蛋白质时，必须在0 044低温下进行，丙酮低温下进行，丙酮用量用量- -般般1010倍于蛋白质溶液体积。蛋白质被丙酮沉淀后，应倍于蛋白质溶液体积。蛋白质被丙酮沉淀后，应立即分离，否则蛋白质会变性。立即分离，否则蛋白质会变性。v缺点：缺点： 易使酶和具有活性的蛋白质变性。故操作时要求条件比盐析易使酶和具有活性的蛋白质变性。故操作时要求条件比盐析严格。对于某些敏感的酶和蛋白质，使用有机溶剂沉淀尤其严格。对于某些敏感的酶和蛋白质，使用有机溶

29、剂沉淀尤其要小心。要小心。 整理课件44 ( (二）二）蛋白质的层析分离法蛋白质的层析分离法 （色谱法）（色谱法） 原理原理层析法是利用不同物质理化性质的差异而建立起层析法是利用不同物质理化性质的差异而建立起来的技术。所有的层析系统都由两个相组成：一是固定相，另来的技术。所有的层析系统都由两个相组成：一是固定相，另一是流动相。当待分离的混合物随流动相通过固定相时，由于一是流动相。当待分离的混合物随流动相通过固定相时，由于各组分的理化性质存在差异，与两相发生相互作用（吸附、溶各组分的理化性质存在差异，与两相发生相互作用（吸附、溶解、结合等）的能力不同，在两相中的分配（含量比）不同，解、结合等）的

30、能力不同，在两相中的分配（含量比）不同，且随流动相向前移动，各组分不断地在两相中进行再分配。分且随流动相向前移动，各组分不断地在两相中进行再分配。分部收集流出液，可得到样品中所含的各单一组分，从而达到将部收集流出液，可得到样品中所含的各单一组分，从而达到将各组分分离的目的。各组分分离的目的。整理课件45 层析分离能力的实质层析分离能力的实质物质的分配问题物质的分配问题 *分配系数：分配系数： 当一种溶质分布在两个互不相溶的溶剂中时，它在当一种溶质分布在两个互不相溶的溶剂中时，它在固定相和移动相两相内的固定相和移动相两相内的浓度之比浓度之比是一个常数，这称是一个常数，这称为分配系数。为分配系数。

31、 Cs Cm *质量分配系数：质量分配系数：若不用浓度而用若不用浓度而用物质的绝对量的比值物质的绝对量的比值来表示，则称为来表示，则称为质量分配系数即：质量分配系数即： Vs Vm Vs : 固定相的体积固定相的体积 Vm : 流动相的体积流动相的体积K =D= K*整理课件46 种类：种类： 气相层析气相层析 按按两相状态两相状态来分来分 液相层析液相层析 吸附层析吸附层析 分配层析分配层析 按按层析机理层析机理来分来分 离子交换层析离子交换层析 凝胶排阻层析凝胶排阻层析 亲和层析亲和层析 柱层析柱层析 按按操作方式操作方式来分来分 薄层层析薄层层析 纸层析纸层析层析法分离、纯化：层析法分离

32、、纯化：Pr、多肽和多肽和AA整理课件47 离子交换层析法离子交换层析法*原理：原理：阴阴（阳）离子交换树脂颗粒（作为固定相）（阳）离子交换树脂颗粒（作为固定相） 填充在层析柱内，由于填充在层析柱内，由于阴阴（阳）离子交换树（阳）离子交换树 脂颗粒上带脂颗粒上带正正（负）电荷，能吸引溶液中的（负）电荷，能吸引溶液中的 阴阴（阳）离子。然后再用含阴（阳）离子的（阳）离子。然后再用含阴（阳）离子的 溶液洗柱。含负电量小的蛋白质首先被洗脱溶液洗柱。含负电量小的蛋白质首先被洗脱 下来，增加阴离子浓度，含负电量多的蛋白下来，增加阴离子浓度，含负电量多的蛋白 质也被洗脱下来，于是两种蛋白质被分开。质也被洗

33、脱下来，于是两种蛋白质被分开。整理课件48整理课件49固定相固定相：1.1.纤维素纤维素- - 二乙基氨基乙基纤维素（二乙基氨基乙基纤维素（DEAEDEAE纤维素）、纤维素）、 羧甲基纤维素（羧甲基纤维素（CMCM纤维素）纤维素）2.2.葡聚糖葡聚糖整理课件50u纤维素纤维素 : : 骨架为柔性长链骨架为柔性长链1.1. 加入量加入量 ： 加入层析柱的蛋白质量通常为纤维素量的加入层析柱的蛋白质量通常为纤维素量的 十分之一。十分之一。2.2. 提高分辨率，样品体积应尽可能地少。提高分辨率，样品体积应尽可能地少。3.3. 在洗脱时，可以通过在洗脱时，可以通过改变洗脱缓冲液的改变洗脱缓冲液的pHpH

34、， 而使蛋白质分子电荷减少而被解吸下来，也而使蛋白质分子电荷减少而被解吸下来，也 可以通过可以通过提高洗脱缓冲液中离子强度提高洗脱缓冲液中离子强度，减弱，减弱 蛋白质分子与载体亲和力的办法，将蛋白质蛋白质分子与载体亲和力的办法，将蛋白质 组分逐一洗脱下来。组分逐一洗脱下来。整理课件51u葡聚糖的离子交换树脂葡聚糖的离子交换树脂 : :骨架为三维网状结构骨架为三维网状结构 优点优点：1.1.同时具有分子筛的作用同时具有分子筛的作用2. 2. 因其高度的网状结构，所带有的交换基团也比纤维因其高度的网状结构，所带有的交换基团也比纤维 素多得多。交换容量为离子交换纤维素的素多得多。交换容量为离子交换纤

35、维素的3 35 5倍。倍。 缺点：缺点： 它的床体积常受它的床体积常受pHpH或盐浓度影响而变化，对分离或盐浓度影响而变化，对分离效果有一定程度的干扰。效果有一定程度的干扰。 整理课件52凝胶（排阻）层析凝胶（排阻）层析又称又称分子筛或凝胶过滤分子筛或凝胶过滤（gel filtrationgel filtration）原理：载体为有一定孔径的多孔性亲水性凝胶。原理：载体为有一定孔径的多孔性亲水性凝胶。 当分子大小不同的混合物通过这种凝胶柱时，当分子大小不同的混合物通过这种凝胶柱时， 直径大于孔径的分子将不能进入凝胶内部，直径大于孔径的分子将不能进入凝胶内部， 便直接沿胶粒间隙流出（全排出）。较

36、小的便直接沿胶粒间隙流出（全排出）。较小的 分子进入能容纳它的孔穴，绕道而行，在柱分子进入能容纳它的孔穴，绕道而行，在柱 内保留时间就比较长。这样，较大的分子被先内保留时间就比较长。这样，较大的分子被先 洗脱下来，而较小的分子后被洗脱下来，从而洗脱下来，而较小的分子后被洗脱下来，从而 达到相互分离的目的达到相互分离的目的. .整理课件53整理课件54用作凝胶的载体物质有三类用作凝胶的载体物质有三类： u 交联葡聚糖凝胶交联葡聚糖凝胶 商品名为商品名为 Sephadex GSephadex Gu 聚丙烯酰胺凝胶聚丙烯酰胺凝胶 商品名为商品名为Bio-gel PBio-gel P ( (丙烯酰胺丙

37、烯酰胺 + N+ N，N N- -次甲基二丙烯酰胺聚合而成次甲基二丙烯酰胺聚合而成 P P值表示不同的交联度值表示不同的交联度) )u 琼脂糖凝胶琼脂糖凝胶 商品名为商品名为 SepharoseSepharose或或 Bio-gel ABio-gel A （从海藻琼脂中分离除去琼脂胶后的中性级成分从海藻琼脂中分离除去琼脂胶后的中性级成分 是是D-D-半乳糖和半乳糖和3,6-3,6-脱水脱水-L-L-半乳糖相间重复结半乳糖相间重复结 合而成的链状化合物）合而成的链状化合物）整理课件55常用过滤层析凝胶的截留分子量范围整理课件56琼脂糖凝胶优点：琼脂糖凝胶优点：1.1.其机械强度比葡聚糖凝胶和聚丙

38、烯酰胺凝其机械强度比葡聚糖凝胶和聚丙烯酰胺凝 胶好得多。胶好得多。2.2.对蛋白质等高分子的吸附作用也小得多对蛋白质等高分子的吸附作用也小得多3.3.适用分子量的范围宽，最大可以到适用分子量的范围宽，最大可以到10108 8。整理课件57吸附层析法吸附层析法原理：原理：柱层析中，含有柱层析中，含有Pr分子的混合物随流动相通分子的混合物随流动相通 过由过由吸附剂吸附剂组成的固定相时，组成的固定相时，Pr分子通过各分子通过各 种次级作用能够吸附在吸附剂上种次级作用能够吸附在吸附剂上,由于不同分由于不同分 子的吸附能力不同，可以通过洗脱使它们逐子的吸附能力不同，可以通过洗脱使它们逐 一解脱出来，而使

39、混合物得以分离。一解脱出来，而使混合物得以分离。优点：优点：1.1. 物理吸附，吸附能量比较低，洗脱也比较容易。物理吸附，吸附能量比较低，洗脱也比较容易。2.2.操作简便，吸附剂容易获得，价格较低廉操作简便，吸附剂容易获得，价格较低廉 整理课件58固定相固定相：吸附剂吸附剂磷酸钙凝胶磷酸钙凝胶磷酸钙胶磷酸钙胶CaCa3 3（POPO4 4）2 2磷酸氢钙胶磷酸氢钙胶CaHPOCaHPO4 42H2H2 2O O羟基磷酸钙胶羟基磷酸钙胶CaCa5 5（POPO4 4）3 3OH OH 羟基磷灰石羟基磷灰石 磷酸钙胶对蛋白质的吸附作用原理磷酸钙胶对蛋白质的吸附作用原理: :主要是由于主要是由于 .

40、 Ca. Ca2+2+与与PrPr负电荷性基团负电荷性基团 结合。结合。 . . 磷酸基团与磷酸基团与PrPr正电荷基团正电荷基团整理课件59 流动相流动相： 洗脱剂洗脱剂-柠檬酸盐柠檬酸盐作用：柠檬酸离子因与作用：柠檬酸离子因与CaCa2+2+有更强的相互作用，有更强的相互作用， 它能大大它能大大降低降低蛋白质和凝胶的吸附能力。蛋白质和凝胶的吸附能力。 NaClNaCl，KClKCl甚至浓度高达甚至浓度高达3M3M时，也不影响时，也不影响PrPr负电荷负电荷的吸附，相反这些盐可以大大降低的吸附，相反这些盐可以大大降低PrPr正电荷正电荷的吸附。因的吸附。因此在高浓度的这些盐溶液中应用羟基磷灰

41、石进行层析时，此在高浓度的这些盐溶液中应用羟基磷灰石进行层析时，可以专门吸附酸性蛋白质及中性蛋白质而排除碱性蛋白可以专门吸附酸性蛋白质及中性蛋白质而排除碱性蛋白质。质。整理课件60亲和层析法亲和层析法1.1.原理原理：利用生物高分子具有能和某些相对应的专一：利用生物高分子具有能和某些相对应的专一 分子可逆结合的特性。分子可逆结合的特性。 如，如，酶的活性部位能和底物酶的活性部位能和底物 抑制剂抑制剂 辅助因子专辅助因子专 一性地结合一性地结合, ,改变条件又能使这种结合解除改变条件又能使这种结合解除. . 酶的变构中心与变构因子（或称效应物）之酶的变构中心与变构因子（或称效应物）之 间、抗体与

42、抗原之间、激素与受体之间，结间、抗体与抗原之间、激素与受体之间，结 合蛋白与结合物之间合蛋白与结合物之间 。 这些被作用的对象物质称之为这些被作用的对象物质称之为配基（配基（ligand) ligand) 。 整理课件61固定相固定相-配基配基固定在固定在固相载体固相载体上上整理课件62整理课件632.2.优点优点：具有高度的吸附专一性：具有高度的吸附专一性 层析过程简便、快速层析过程简便、快速3.3.载体的选择载体的选择：(1)(1)必须具有高度亲水性，使必须具有高度亲水性，使PrPr分子容易与它接近分子容易与它接近. .(2)(2)非专一性吸附要十分小。非专一性吸附要十分小。(3)(3)必

43、须具有大量可供活化而能与配基结合的基团。必须具有大量可供活化而能与配基结合的基团。 常用载体常用载体：纤维素、纤维素、 葡聚糖凝胶、琼脂糖凝胶、葡聚糖凝胶、琼脂糖凝胶、 聚丙烯酸胺凝胶和多孔玻璃聚丙烯酸胺凝胶和多孔玻璃等等。 整理课件64高效液相层析法（高效液相层析法（High Performance Liquid Chromatography ，HPLCHPLC）又称又称“高压液相色谱高压液相色谱，是，是色谱法色谱法的一个重要分支，以的一个重要分支，以液体液体为为流动相流动相，采用高压输液系统，将具有不同，采用高压输液系统，将具有不同极性极性的单一的单一溶溶剂剂或不同比例的混合溶剂、缓冲液等

44、流动相泵入装有固或不同比例的混合溶剂、缓冲液等流动相泵入装有固定相的定相的色谱柱色谱柱，在柱内各成分被分离后，进入检测器进，在柱内各成分被分离后，进入检测器进行检测，从而实现对试样的分析。行检测，从而实现对试样的分析。 整理课件65HPLC包括： 输液系统：输液系统：驱动流动相和样品通过色谱分离驱动流动相和样品通过色谱分离柱和检测系统柱和检测系统 层析柱：层析柱：分离样品中的各个物质分离样品中的各个物质 进样器：进样器：将待分析样品引入色谱系统将待分析样品引入色谱系统 检测系统：检测系统：将被分析组在柱流出液中浓度的将被分析组在柱流出液中浓度的变化转化为光学或电学信号变化转化为光学或电学信号

45、，并分析显示出来整理课件66整理课件67 蛋白质的检测和鉴定蛋白质的检测和鉴定整理课件68 一般可通过以下几个方面进行：一般可通过以下几个方面进行： 光谱学特性光谱学特性 电泳行为电泳行为 特异抗体反应特异抗体反应 特异生物学活性特异生物学活性 N N一末端氨基酸序列测定一末端氨基酸序列测定 质谱检测质谱检测 排阻层析排阻层析 整理课件69 一、光谱学特性一、光谱学特性 光谱特性的总原则是光谱特性的总原则是： 当一定波长的光（即电磁波）与当一定波长的光（即电磁波）与PrPr分子接触时，分子接触时，所吸收的或反射的辐射能量与所吸收的或反射的辐射能量与PrPr分子结构特征和浓分子结构特征和浓度是密

46、切相关的。度是密切相关的。 整理课件70 不同波长范围的电磁波与其作用后的剩余能量值反不同波长范围的电磁波与其作用后的剩余能量值反映的是蛋白质分子的不同特征映的是蛋白质分子的不同特征: :190 -200nm190 -200nm波长范围的光吸收反映的是波长范围的光吸收反映的是蛋白质主链蛋白质主链上的酰胺键中电子的被激发；上的酰胺键中电子的被激发；230 - 300nm230 - 300nm波长范围的光吸收谱（最大吸收值在波长范围的光吸收谱（最大吸收值在280nm280nm波长处）反映的是波长处）反映的是蛋白质分子中芳香族氨基酸蛋白质分子中芳香族氨基酸侧链上电子的被激发。侧链上电子的被激发。所以

47、一般情况下，溶液在所以一般情况下，溶液在280nm280nm波长处（属紫外波长处（属紫外光范围）的光吸收能力被当做是光范围）的光吸收能力被当做是存在存在蛋白质的证据。蛋白质的证据。整理课件71二、电泳检测二、电泳检测 蛋白质分子为两性电解质，在不同蛋白质分子为两性电解质，在不同pHpH的溶液中的溶液中带有不同的电荷，从而在直流电场中能够泳动，这带有不同的电荷，从而在直流电场中能够泳动，这就是就是电泳现象电泳现象。按按介质状态介质状态来分来分: :自由电泳自由电泳 区带电泳区带电泳按按操作原理操作原理可分为可分为: : 一般电泳一般电泳 等电电泳等电电泳 等电聚焦电泳等电聚焦电泳 免疫电泳等免疫

48、电泳等 整理课件72自由电泳自由电泳-以以溶液溶液为介质，在溶液中将蛋白质分离为介质，在溶液中将蛋白质分离 缺点缺点: :自由电泳过程中扩散严重，分辨率有限自由电泳过程中扩散严重，分辨率有限区带电泳区带电泳-在固体支持物上所进行的电泳在固体支持物上所进行的电泳 固体支持物有固体支持物有: :滤纸、滤纸、 醋酸纤维薄膜、醋酸纤维薄膜、 琼脂糖凝胶琼脂糖凝胶 聚丙烯酰胺凝胶聚丙烯酰胺凝胶 优点优点: :分辨率很高。分辨率很高。整理课件73SDS-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDSSDS ( (十二烷基硫酸钠十二烷基硫酸钠) )是阴离子型是阴离子型去污剂去污剂(Sodium dod

49、ecyl sulfate, SDS)(Sodium dodecyl sulfate, SDS)SDSSDS一凝胶电泳可以按一凝胶电泳可以按蛋白质分子大小的蛋白质分子大小的不同不同将其分开。将其分开。 这时，若以分子量的对数（这时，若以分子量的对数（logMlogM）对相对）对相对于染料前沿于染料前沿的迁移率（的迁移率（RfRf）作图，呈现线性关系。）作图，呈现线性关系。 ab整理课件74整理课件75 这种关系，对一种胶浓度时，只适用于一定的这种关系，对一种胶浓度时，只适用于一定的分子量范围：分子量范围： 5 5胶浓度时，适用于分子量胶浓度时，适用于分子量6 6200200万的区间；万的区间；

50、1010胶浓度时，适用于分子量胶浓度时，适用于分子量7 7万的区间；万的区间； 1515胶浓度时，适用于分子量万的区间。胶浓度时，适用于分子量万的区间。 等电聚焦电泳等电聚焦电泳（isoelectric focusing, IEF） 是一种根据样品的等电点不同而使它们在是一种根据样品的等电点不同而使它们在pH梯度梯度中相中相互分离的一种电泳技术。互分离的一种电泳技术。 利用特殊的一种缓冲液（两性电解质）在凝胶（常用利用特殊的一种缓冲液（两性电解质）在凝胶（常用聚丙烯酰胺凝胶）内制造一个聚丙烯酰胺凝胶）内制造一个pHpH梯度。梯度。 pH梯度制作利用的两性电解质（ampholyte，商品名为am

51、pholine），是脂肪族多胺和多羧类的同系物，他们具有相近但不同的pKa和pI值。在外电场作用下，自然形成pH梯度。凝胶可用：聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶、葡聚糖凝胶等整理课件77PrPr分子有一定的分子有一定的pIpI，它处在一个由，它处在一个由阳极到阴极阳极到阴极梯度逐渐增加的介质中，并通过以直流电时，梯度逐渐增加的介质中，并通过以直流电时，它便它便“聚焦聚焦”在与其在与其pIpI相同的相同的pHpH位置上。位置上。pIpI不同的蛋白质泳动后形成位置不同的区带而不同的蛋白质泳动后形成位置不同的区带而得到分离。得到分离。整理课件78优点：优点：1.1.有很高的分辨率；有很高的分辨率；2.2.

52、可以区分等电点只有可以区分等电点只有 0.01 pH0.01 pH单位差异的蛋白质；单位差异的蛋白质；3.3.根据其所在位置还能够测定蛋白质的分子量；根据其所在位置还能够测定蛋白质的分子量；4.4.对很稀的样品，最后达到高度的浓缩。对很稀的样品，最后达到高度的浓缩。整理课件79双向电泳双向电泳（two-dimensional gel electrophoresis） 第一向采用聚丙烯酸胺凝胶等电聚焦电泳第一向采用聚丙烯酸胺凝胶等电聚焦电泳-pIpI第二向采用第二向采用SDSSDS一一PAGEPAGE电泳电泳 -分子量分子量 由于结合了蛋白质的等电点和分子量两种完全不由于结合了蛋白质的等电点和分

53、子量两种完全不同的特一性来进行分离，因此具有非常高的分辨率同的特一性来进行分离，因此具有非常高的分辨率可同时分析成千上万个蛋白，分辨率高，分离度好。可同时分析成千上万个蛋白，分辨率高，分离度好。是蛋白质组学研究的核心技术。是蛋白质组学研究的核心技术。整理课件80双向PAGE整理课件81 双向电泳技术缺点，具有以下特征的蛋白质在二维双向电泳技术缺点，具有以下特征的蛋白质在二维电泳中还很难被检测到：电泳中还很难被检测到：等电点（等电点（pI)pI)值很大或很小的，比如大于值很大或很小的，比如大于8 8和小于和小于4 4的那些蛋白质；的那些蛋白质；分子质量很大的蛋白质，比如大于分子质量很大的蛋白质，

54、比如大于l00kDal00kDa的蛋白的蛋白质就比实际的少了，而大于质就比实际的少了，而大于150kDa150kDa的蛋白质就几的蛋白质就几乎完全探测不到了（尽管在一维电泳凝胶上这些乎完全探测不到了（尽管在一维电泳凝胶上这些大蛋白质都能清楚地被观察到；大蛋白质都能清楚地被观察到；疏水性蛋白质。疏水性蛋白质。 免疫电泳免疫电泳 将将电泳分离电泳分离和和专一性免疫沉淀专一性免疫沉淀相结合的分析方法：相结合的分析方法： 免疫电泳法是指利用凝胶电泳与双向免疫扩散两种技术结免疫电泳法是指利用凝胶电泳与双向免疫扩散两种技术结合的实验方法。在电场作用下标本中各组分因电泳迁移率不同而合的实验方法。在电场作用下

55、标本中各组分因电泳迁移率不同而分成区带，然后沿电泳平行方向将凝胶挖一沟槽，将抗体加入沟分成区带，然后沿电泳平行方向将凝胶挖一沟槽，将抗体加入沟槽内，使抗原与抗体相互扩散而形成沉淀线。根据沉淀线的数量、槽内，使抗原与抗体相互扩散而形成沉淀线。根据沉淀线的数量、位置及形状，以分析标本中所含组分的性质。位置及形状，以分析标本中所含组分的性质。由于免疫反应有由于免疫反应有很高的专一性，很高的专一性，可用于可用于鉴定鉴定PrPr的的纯度，分析样品纯度，分析样品中蛋白质的组分中蛋白质的组分。本实验常用于抗原分析及免疫性疾病的诊断。本实验常用于抗原分析及免疫性疾病的诊断。整理课件83整理课件84三、测定纯化

56、蛋白质的分子大小三、测定纯化蛋白质的分子大小 测定蛋白处于非变性条件下的大小一般可通过：测定蛋白处于非变性条件下的大小一般可通过：u凝胶层析凝胶层析u沉降平衡超速离心沉降平衡超速离心（sedimentation equlibrium ultracentrifugation) u动态光散射（动态光散射（dynamic light scattering)dynamic light scattering)u孔径梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳孔径梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳（pore gradient polyacrylamide gel electrophoresis）u 整理课件85凝胶层析 1.凝胶是一类多孔

57、性高分子聚合物凝胶是一类多孔性高分子聚合物,每个颗粒犹如一个筛子每个颗粒犹如一个筛子.当样品溶液通过凝胶柱时当样品溶液通过凝胶柱时,相对分子质量较大的物质由于直相对分子质量较大的物质由于直径大于凝胶网孔而只能沿着凝胶颗粒间的孔隙径大于凝胶网孔而只能沿着凝胶颗粒间的孔隙,随着溶剂流随着溶剂流动动,因此流程较短因此流程较短,向前移动速度快而首先流出层析柱向前移动速度快而首先流出层析柱; 2. 反之反之,相对分子质量较小的物质由于直径小于凝胶网孔相对分子质量较小的物质由于直径小于凝胶网孔,可可自由地进出凝胶颗粒的网孔自由地进出凝胶颗粒的网孔,在向下移动过程中在向下移动过程中,它们从凝胶它们从凝胶内扩

58、散到胶粒孔隙后再进入另一凝胶颗粒内扩散到胶粒孔隙后再进入另一凝胶颗粒,如此不断地进入如此不断地进入与逸出与逸出,使流量增长使流量增长,移动速率慢而最后流出层析柱移动速率慢而最后流出层析柱.整理课件863. 而中等大小的分子而中等大小的分子,它们也能在凝胶颗粒内外分布它们也能在凝胶颗粒内外分布,部分进入颗粒部分进入颗粒,从而在大分子物质与小分子物质之间从而在大分子物质与小分子物质之间被洗脱被洗脱.这样这样,经过层析柱经过层析柱,使混合物中的各物质按其使混合物中的各物质按其分子大小不同而被分离分子大小不同而被分离 。 VeblogMw C其中其中b,C为常数。即为常数。即Ve为洗脱体积，与为洗脱体

59、积，与logMw也成线也成线性关系。我们可以通过在一凝胶柱上分离多种已知性关系。我们可以通过在一凝胶柱上分离多种已知分子量的蛋白质后，并根据上述的线性关系绘出标分子量的蛋白质后，并根据上述的线性关系绘出标准曲线，然后用同一凝胶柱测出其它未知蛋白的分准曲线，然后用同一凝胶柱测出其它未知蛋白的分子量。子量。整理课件87沉降平衡超速离心沉降平衡超速离心（sedimentation equlibrium ultracentrifugation) 用该技术测定蛋白质分子质量的时候，测定的用该技术测定蛋白质分子质量的时候，测定的是几个绝对动力学参数。是几个绝对动力学参数。原理：原理：当当PrPr样品在相对

60、较低的离心速度（但还是处样品在相对较低的离心速度（但还是处于超速范围）下离心时，在一个从离心管顶部指向于超速范围）下离心时，在一个从离心管顶部指向底部的、越往底部越大的沉降力作用下，底部的、越往底部越大的沉降力作用下，PrPr分子很分子很快形成一个从离心管顶部往下逐渐增加的连续快形成一个从离心管顶部往下逐渐增加的连续r r浓浓度梯度；与此同时，将有一个方向与离心力相反的度梯度；与此同时，将有一个方向与离心力相反的扩散力作用于扩散力作用于PrPr上；当沉降离心进行一定时间之后，上；当沉降离心进行一定时间之后，作用于作用于PrPr上的离心力和扩散力上的离心力和扩散力（前者与蛋白在离心（前者与蛋白在