答辩——赵柏闻——黄瓜性别决定基因M第三外显子的转座特性分析

1、中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所 Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences黄瓜性别决定基因黄瓜性别决定基因M M第三外显子第三外显子的转座特性分析的转座特性分析赵柏闻人大附中中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences研究背景研究背景为什么研究？雌花与完全花雌花与完全花黄瓜的花有三种：雌花、雄花和两性花

2、（即完全花）。三种花在植株中排布的情况又进一步产生了七种性别情况不同的植株。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences 黄瓜是研究植物性别表达的模式作物。 黄瓜的性别由多个性别决定基因（而非性染色体或是染色体数目）共同作用所决定。其中最重要的有F基因、A基因和M基因。F基因和A基因已经被其他实验室克隆，而 M基因仍旧没有详尽的研究。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables

3、 and FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesM基因MMmm中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences外显子内含子对于真核细胞基因组的基因：中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences外显子表达蛋白质中国农业科学院蔬

4、菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences 一般来说，同一基因内不同的内含子在整个基因组内拷贝数应是相等的。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesM基因各外显子的测序覆盖深度中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and

5、 FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesM基因第一个外显子与第三个外显子在黄瓜顶芽中的表达量分析中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Scienceshttp:/转座(因)子是基因组中一段可移动的DNA序列，可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置。 中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables an

6、d FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesM基因的第三个外显子是转座子？基因的第三个外显子是转座子？假设中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences试验目的 通过Southern杂交和生物信息学方法分析黄瓜性别决定基因M基因第三个外显子在不同材料中插入位点差异进而确定其是否为转座子。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetabl

7、es and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences试验方案设计试验方案设计怎么做？中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesSouthern杂交材料：七份黄瓜（1983G,

8、 1983H, 9930, 9110Gt, Gy14, 西双版纳黄瓜, 印度野生黄瓜hardwickii ）、两份甜瓜（中蜜五号、黄流星）两份西瓜。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural SciencesSouthern杂交流程图提取基因组DNA酶切电泳转膜杂交洗膜检测探针制备中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agri

9、cultural Sciences试验安排5月4日-5月20日提取基因组DNA、制备探针、准备试剂。5月21日-6月7日进行Southern印迹杂交6月8日-6月30日重提DNA，换内切酶消化再次进行Southern杂交。7月15日-8月20日（预计）在深圳华大基因研究院，利用黄瓜重测序产生的全基因组序列检索目标片段的旁侧序列，从而对实验假设进行验证。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences预期结果 确定M基因第三个外显子在不同材料中的拷贝数，判断其是否为转座子。 利用测序结果分析M基因第三个外显子插入位置，与Southern杂交结果互为验证。 利用实验结果预测M基因第三个外显子对黄瓜性别决定的影响。中国农业科学院蔬菜花卉研究所中国农业科学院蔬菜花卉研究所Institute of Vegetables and FlowersChinese Academy of Agricultural Sciences特别感谢：张忠华 博士Southern Blotting探针设计、生物信息学