显微镜说明书axiovision users guide

1、sQKUKP 版本用户指南OMNNKVj SMJPJMMQM MMMMMMJNVSUJNSP司敬请用户注意，由于司产品的不断发展，本文档所含信息和参考文献可能会作一定的技术修改。所附文档不包含任何司关于本文档所描述的技术流司已经知道这些错误或者是由于卡程或产品特性的保。此外，除非能证明尔蔡司的故意忽视造成，否则司不对本文档中任何印刷错误或其它不确之处负责。司在此敬请用户注意，本手册仅包含技术流程和相关信息的一般描述，并不适用于所有情形。疑问，建议咨询司。本手册受保护。司保留对本手册的所利。除非个人使用，部分或把本手册翻译成其它任何语言。司敬请注意，根据产品的技术改进和补充，本手册所含信息将定期

2、更新。本手册仅反映了印刷当时司的工艺情况。Copyright 2011 by Carl ZeissCarl Zeiss MicroImaging GmbH07740 Jena, DeutschlandBioScien| Standort GttingenP.O.B. 4041, 37030 Gttingen, Germany:传真: HYPERLINK mailto:microzeiss.de microzeiss.de, Windows, 和Excel 是微软公司在及其他国家的商标。Adobe 和 Acrobat Reader 是 Adobe Systems 公司在商标。QuickTime

3、是苹果电脑公司的商标。及其他国家的商标或QuickTime可以从。免责除非作者已知本文存在不合法内容且能够阻拦读者其页面站点，否则作者对任何从本文或的相关内容概不负责。若因本文所提供的信息引起损失，仅相关页面的作者可能承担一定责任，而非到这些页面的作者。此外，作者对任何用户公布在其页面或信息概不负责。区，留言板或邮件列表的帖子产品通告该产品 (AxioVi) 是在认证过程环境下设计，实现，核实，验证并发布的。质量管理系统由DIN EN ISO 9001 规则认证.的使用包括个别显微成像的常见任务和应用(因此称作 “Off-The-ShelfSoftware”). 尽管用户知可在任何情况下使用，

4、出于考虑到所有法律规范(例如 FDA/21 CFR part 11, IvDD 等)的要求，的最终使用者均有责任对软件进行验证。必要，最终使用者须创建，补充和保存该特殊流程，以满足符合法律规范的验证规则的全部要求。司对除上述定义的应用场所以外的该的特殊使用不予担保。安全警告在安装或使用之前(同样需要仔细阅读AxioVi安全注意事项, AxioViAC, B 48-0044 e (SAP 000000-1339-887)，请先仔细阅读所有设备(如显微镜外设，照相机，计算机及附件等)手册中的安全注意事项和说明。目录目录1导言1-11.1概念1-1图像获取1-1显微镜控制1-1图像处理和注释 ima

5、ge prosing1-1图像分析1-2文档1-2配置1-2模块1-3图像获取模块1-3自动聚焦1-3扩展景深1-3标记与查找1-3快速自动拼图1-3自动拼图1-3全景1-4延时1-4Z 轴序列1-4HDR 成像(高动态范围)1-4图像处理模块1-5Imaging Plus1-5图像分析模块1-5交互式测量1-5自动测量1-5高级自动测量1-6球体膜厚测量1-6TIC 测量1-6颗粒度分析1-6NMI1-7晶粒度评级1-7多相含量测定1-8图谱比较1-8石墨评级1-91.2AxioVi用户指南, 4.8.3 版本i目录三维表面形貌1-9测量1-9煤反射率1-9图谱比较1-10存档模块1-10资

6、源存档1-10 Windows1-111-111.31.41.5AxioVi和用户指南和备份1-122概览与操作2-12.12.22.32.42.52.6概览2-1工作区2-2工作流程2-3和框2-5自定义快捷指令单2-6属性窗口2-73图像获取3-13.13.23.3概述3-1首先3-1条件3-2标准工作流程3-3获取图像的快速指南3-43.4AxioVi具体注意事项3-10实时图像速度3-10AxioVi最佳色彩重现的注意事项3-113.5HDR 高动态范围3-13概述3-13HDR 成像3-144显微镜控制4-14.14.24.34.44.5概述4-1显微镜配置的配置显微镜4-2用MTB

7、2004 配置显微镜配置4-2显微镜配置激活4-3设置编辑器4-5iiM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月目录如何创建一个硬件设置?4-5图像处理5-155.1概述5-1处理图像的不同途径5-1图像格式5-2注释5-2运用图像处理功能5-3概述5-3平滑图像 (基本)5-3阴影校正 (基本)5-8校正多通道图像XY 像素位移(基本)5-10校正多通道z 轴序列图像的z 像素位移5-14增强显示器上的图像显示5-18添加和格式化注释5-18指定注释的标准设定5-215.25.35.45.55.66图像分析6-16.1概述6-1执量的可能方式6-1测量条件6-1标尺确定6-

8、1若选定图像没有标尺6-1显示测量数据6-2保存数据6-2保存测量数据6-2另存为独立数据表6-2配置测量工具6-3测量工作流程: 简单测量及保存6-3测量工作流程: 概览6-4执行交互式测量功能6-5显示和输出测量数据6-6用测量数据分类和执行计算6-76.26.36.4创建数据 6-8用文件扩展ZDR 修改和创建模版6-8 6-8模版AxioVi用户指南, 4.8.3 版本iii目录修改模版6-9创建一个模版6-14用若干打开的图像创建6-28用扩展ZDR 创建为图像创建一个, 打印并另存为PDF 文件6-326-32在打开的打印一个模版中采用新图像6-346-35另存为 PDF 文件6-

9、35为多通道荧光图像创建6-36荧光通道为延时器创建一个 用图像，数据表和直方图创建一个6-386-41用已保存的数据表创建一个6-45用存档文件夹创建一个6-496.5创建图表6-55图表属性6-55用创建一个数据表6-55创建一个条形图6-57创建一个 X-Y 点图6-60创建一个 X-Y 线图6-64保存并重置图表设置6-68为任意表格并改变图表设置6-69从图表创建一个图像6-69导出一个图表作为 meta 文件6-69文档管理7-177.17.2概述7-1AxioViZVI - 用于数字显微镜的图像格式ZVI 格式的优势.7-1保存 2D 图像7-2保存图像7-27.3用图像文件浏览

10、器管理文件7-4图像文件浏览器窗口7-4图像文件浏览器的功能7-5图像文件浏览器的背景菜单7-6幻灯片放映的背景菜单7-7改变数据编目表7-87.4用文件扩展ZVR 生成，打印和输出7-9ivM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月目录创建打印 输出 表格和告7-10 7-11 7-12的模版7-13编辑模版设定7-14移动和删除域7-17新域和改变域值7-18改变域属性7-20图像编辑器7-21创建一个 Asset Archive7-23创建新项目7-24创建联系7-24添加一个资源到存档7-25处理值列表7-26视图7-27分类7-27查找7-28关键字查找7-28创建

11、一个用户定义的查找7-28管理存档7-30设置一个7-30管理域7-30指定位置7-31改变项目属性7-317.57.68配置8-18.18.2概述8-1概览:设置 AxioVi 8-1安装8-1设置 AxioVi 8-2备份配置并为个别用户恢复8-2用户文件对所有用户可用8-3用户和数据管理8-3Windows 用户管理8-3用户文件8-4共享帐号 All Users8-58.3AxioVi用户指南, 4.8.3 版本v目录创建新用户8-6AxioVi下的数据管理8-7数据文件夹8-7AxioV图像8-8临时文件8-9AxioV配置文件8-9移动“Mys”文件夹8-10移动临时文件夹8-11

12、8.4标尺8-11概述8-11生成标尺8-12调整用户界面8-168.58-16创建给功能定义组合键8-19创建自定义框8-20定义工作流程8-24一般设定8-26导出和导入用户配置8-27概述8-27导出8-27导入8-28导入配置文件8-28导入用户文件8-288.68.78.8为用户创建不同的AxioVi配置8-29背景8-29创建个人配置8-299图像获取模块9-19.1自动聚焦9-1概述9-1校准自动调焦9-1准备9-1校准9-2使用自动调焦9-3取图9-5如何创建一个实验?9-59.2viM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月目录多通道荧光模块9-9如何创建一

13、个多通道实验?9-9如何管理通道设置 (使用通道库)?9-17Z-Stack 模块9-21如何创建一个 z-stack?9-22时序模块9-24如何创建一个时间序列?9-25高级成像:标记与查找9-27如何创建一个标记&查找实验?9-28景深扩展9-34概述9-34获取景深扩展的图像9-34在景深扩展中使用z 序列图像9-36标记与查找9-37概述9-37如何创建一个 标记与查找列表?9-38例 1: 载玻片9-38例 2: 多孔板 (96)9-49手动拼图9-55概述9-55系统要求9-56手动拼图图特征9-56手动拼图图像的获取9-57从单张图像创建手动拼图图像9-609.39.49.5转

14、换标题图像为常规AxioVi图像9-649.6MosaiX9-66概述9-66系统要求9-68MosaiX 图像的特征9-68MosaiX 图像9-68设置相机和扫描台9-69图像定位9-70载物台移动的方向9-71相机和载物台的对齐9-73MosaiX 图像的获取9-75AxioVi用户指南, 4.8.3 版本vii目录固定参数9-81转换标题图像为标准AxioVi图像9-8310图像处理模块10-110.1 图像增强10-1常规10-1图像强化10-1灰度形态学10-2图像算术10-2变换10-3色彩空间转换10-3使用图像处理功能10-4缩小或放大图像或图像区域10-4一个图像不同区域并

15、生成一个新的图像。10-11使用单个色彩通道10-20将彩色图像转换为黑白图像10-26图像分析模块11-11111.1交互测量11-1概述11-1测量程序向导11-1生成测量程序11-2载入并执量程序11-3自动测量程序11-5概述11-5自动测量模块概念11-7生成测量程序的向导11-8程序管理11-8图像增强11-10分割11-11对象分离11-12执量任务（二进制图像处理）11-13测量11-14计算11-1511.2执量程序11-1511.3自动测量增强11-17viiiM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月目录概述11-17高级自动测量模块概念11-17使用分

16、割功能11-18动态分割11-18多通道 z-stack 图像中一个荧光通道的自动分割11-21进行二进制图像处理11-29显示结构/使用逻辑函数11-39使用自动测量功能11-47生成测量属性文件和测量11-47晶粒度评级11-54概念11-56操作和配置11-56准备系统11-56材料分析存档11-59工程和测试规程11-61导入输出测试规程11-62调整测试规程11-63硬件设置11-64图象源11-64导入格式11-65修改模板11-66选项-自动11-66选项-截点法11-66测量程序11-67执量11-67结果文件11-68生成11-69创建并执行晶粒分析11-70如何创建一个文档

17、？11-70如何创建一个测试规程？11-72如何执量?11-75多相含量测定11-77概念11-78操作和配置11-79准备系统11-7911.411.5AxioVi用户指南, 4.8.3 版本ix目录材料分析存档11-81工程和测试规程11-83导入输出测试规程11-84修改测试规程11-85硬件设置11-86图象源11-86导入格式11-87修改模板11-88测量程序11-88执量11-88结果文件11-89生成11-90创建并执行多相分析11-91如何创建一个文档？11-91如何创建一个测试规程？11-93如何执量?11-96图谱比较评级11-98概念11-98操作和配置11-99准备系

18、统11-99材料分析存档11-102工程和测试规程11-104导入输出测试规程11-104修改测试规程11-105硬件设置11-106图象源11-106导入格式11-107修改模板11-108执行图谱比较评级对比11-108生成11-109创建并执行一个图谱比较评级对比11-109如何创建一个文档？11-109如何创建一个测试规程?11-112如何执行图谱比较评级对比?11-115石墨11-11611.611.7xM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月目录概念11-117操作和配置11-117准备系统11-117材料分析存档11-120工程和测试规程11-122导入导出测

19、试规程11-122修改测试规程11-123硬件设置11-124图象源11-125导入格式11-125修改模板11-126测量程序11-126执量11-126结果文件11-127创建并执行石墨分析11-128如何创建一个文档？11-128如何创建一个测试规程?11-131如何执量？11-134配置模块12-11212.1 12-1介绍12-1有关创建的特殊点12-1批处理在多个图像中应用 12-2限制12-2一个系统中多用户对的使用12-2在其他系统中安装 12-3录制12-4在已有中命令12-8改变执行单独命令的方式，选择显示图像12-12自动执行12-14准备批处理 12-16重复 12-1

20、812.2简洁模式12-21常规12-21不同的简洁模式用户文件12-21AxioVi用户指南, 4.8.3 版本xi目录设置简洁模式12-23关闭简洁模式12-26xiiM 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言N导言NKN概念AxioVi是一基于现显微镜的模块化图像处理和分析系统。其基本功能为图像获取，显微镜控制，图像处理和注释，图像分析，存档，可以通过整合乱外的模块到系统扩展以实现特定的功能 (见 1.2 模块).基版包括以下功能模块:图像获取AxioVi可使用多不同的。Carl Zeiss AxioCam，包括从简单的 TV到高分率高的可保证最佳整合果。由于摄像和

21、 AxioVi美的结合，用户通过简单点哴标可以获复的图像和图像序列。显微镜控制利用 AxioVi可以全自动和互动控制任何电动的 Carl Zeiss 显微镜(当可以使用手动的标准显微镜)。控制可以提供以下优势:显微镜的参数设定可以要求保存，以供将测试时重用自动测放大数复操作更快，并且于在任何时现。图像处理和注释 获的图像立显示在显示器上，并可以利用多技术进行优化对比度，度和色彩调 ，平滑和增强 增强度/强调细校正光照影和白平AxioVi可以要求给图像添加任何注释。所有素，从比例尺和色彩标记到文本和图示，是整合在程序中的。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本1-1导言图像分析用户可以在基程序

22、进行简单的交互式测量。测的值(例如 度，面和度) 显示在一个工作表面，并可用扩展的工作表程序如进行处理。交互式测量可以经由特定的向导执行，可以通过菜单或意执行。Excel文档除了图像本，AxioVi图像格式 ZVI 保存其它相关数据，如图像序号，取图期，显微镜设置，值，尺和细标尺信息，使用的度等等。注释和测量值和图像一起保存。注是加在独立的面上而不是”在图像上，因此不会图像，而且时可以修改。所以使在若干年，图像可以在同样条件下现。图像文件浏览器对大数据库的内容进行管理。通过这个浏览器，用户可以快速进行文件操作，并且能显示图像相关的所有关键数据。AxioVi提供乘先设置的模版，可以方生成。所有这

23、些可以单独时进行修改或者全现。配置AxioVi在个人工作环境配置方面给予用户大的。为了加快操作速度，用户可以定义组合键执行任何命令。个用户可以定义自的，菜单栏和功能。用户可以把或显微镜控制相关的一组控制件以独立框的形式组合起，而这需要哴标点可成。为重复常规过程，简单的操作可以通过工作流成，这样在大程度上除了操作的可能。1-2M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言NKO模块可在基本系统的基上扩展下列模块:图像获取模块自动聚焦该模块可以电动显微镜自动计算出最佳焦面位置。该功能在反射光，射光，明场，场和荧光实验中均可使用，并适用于所有 AxioVi直接控制的和取器。扩展景深

24、的图像是进行确分析的关键。取于对象及设置，显微镜的景深常常不足以生成一张具有所有焦面信息的图像。这时 AxioVi扩展景深模块可以这个问题。获取一定数量的不同焦平面上的图像，把个图像的细组一整的利的图像。标记与查找该模块使用电动 x/y 载物台和自动移动载玻片上或者，多孔板上的不同位置。快速自动拼图Fast MosaiX 扩展了 AxioVi在时间内获取大量高分率图像的功能。的使用确保样品受保护，同时由于硬件和间的最佳互动使张图像可在一分内获。自动拼图MosaiX 的开发是用于分析大表面的。为了生成单一大图，MosaiX 扫描一个样品区。这样生成的数码图像可用作浏览样品的图并提供了深度分析的基

25、。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本1-3导言全景全景适用于法在图像视中全部显示的样品。高分率全景或览图像可以通过对独立的摄图像经过确的像素别。的图像可以准确结合，这样所有样品的重要细被在一张图像。延时该模块用户获取延时图像，可与 Z-Stack, 多通道荧光，自动拼图和标记与查找模块合用。w轴序列该模块用户获取Z 轴序列图像，可与多通道荧光，延时和标记与查找模块合用。，自动拼图eao成像E高动态范围FAxioVi的 HDR 模块用户测试它的功能。这意用户在空时可以意试验该获取技术，以能测出特定应用时的果。在图像获取同时，HDR 图像中会入一个印。一用户了该模块，可使用。HDR 成像将提

26、供用户比相机技术的动态范围更高的图像。在特定的获取环境，图像场景的动态范围，例如当前强度的范围，可能过一部的数码相机提供的动态范围。个例子，材料学乚域的光的截面的获取。同时获取反射表面和黑色夹物组图像并非事。另一个例子自经生物学，用户常常不仅需要获取的荧光GFP 标记的经的细核图像，而且需要获取发出较信号的axons 和dendrites 图像。利用 HDR 技术, 可在增加时间的过程中生成图像序列。的图像作为起点。图像数量和动态增加程度是可调的。1-4M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言在起图像中被的图像内容一定会在更的时间获取的图像中以显示的对比度显示。另一方面

27、，在最时间可以获的图像的图像内容将会在使用更时间时过度。加的图像，在明区域同时获优的对比度的结果图像成为可能。最大 16 bits, 65,535 灰度级别是保存图像的最大的可能动态范围，所有像素点的同样被保存在这一条件下。助 AxioVi的可调显示特性线的帮助, 高动态范围的数据能够以最合适的方式现在显示上。图像处理模块f mImaging Plus 模块提供所有要的数字图像处理技术。该模块包括图像增强，灰度形态学，图像算法和色彩空间转换的功能。图像分析模块交互式测量该模块可以对多参数进行交互式测量，如尺，数目等。测量仅仅要在上点点可实现。测的数据和图像一并保存，可供将进一评。自动测量利用该

28、模块，可以在向导的帮助下快速生成测量程序。一个图像分析过程需要的所有功能可以乎序被一个接一个调用。测量任务要求的功能参数被设定，并被保存为一个测量程序。一测量程序定义成，用户可以通过执行一系列的分析对任意数目的的图像进量。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本1-5导言高级自动测量该模块扩展了自动测量模块的功能，包括为单独分离操作和二值化图像处理提供更范围的乱外功能。在此这些功能不可以在向导中执行，而且可以菜单功能的形式单独出现。他可以量程序。组合，用户创建自的测球体膜厚测量在材料的加工过程中，质量控制是据 DIN V ENV 1071 标准通过测量厚度保证的。球体膜厚测量应用模块用户测定球

29、截面的厚度。为球体截面样品,一个已定义直径的球在样品上会生成一个球形的。这些生成的形或形的，直径可以由描测量的测定。厚将自动计算据描的测量的直径和球的直径。qf 测量TIC 模块 (Totalerference Contrast，仅与 Carl Zeiss 的 TIC 滑块联用)可以在到微的范围内简确测定目标结构的高度和厚度而不接样品。与常规的厚度测量器(表面光度，子显微镜)相比，TIC 方法的优点在于能在较的测量和分析时间内到高度结果。光的使用使测量与样品组方位关，因此不需要载物台转。这方法可以分析具有较大表面的样品。颗粒度分析颗粒度分析模块用户创建和实颗粒度分析项目。其目的是基于可选的测量

30、参数(多数情况:最大直径)对颗粒进行分类。该分类发生在基于已乘定义的态或用户自定义分类区间的情况。一的测量均作为独立项目在存档内管理。测量会立生成分析的图表和统计数据结果并以该模块的使用可分成个任务区:形式输出。生成定一个分析的序列的项目模板: 图像获取类(MosaiX, 单个图像等), 导入表格和的模板, 图像处理和测量的序列等 (仅对管理).实测量 (对所有用户).1-6M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言kjfNMI 模块用户定的非属含量。若干面 200 mm 的样品可在单一测量中分析。可同时据多 5 个的标准执行分析操作。ASTM E45-05 方法 A 和

31、 DDIN 50 602:1998 方法 K 和 MJIS G0555:2003; 方法 A 和BISO 4569:1998; 方法 A 和 BEN 10247:2007; 方法 K, P 和 M一测量均可作为独立项目在存档中管理。测量会立从图表和统计度分析结果并以的形式打印。该模块的使用可分成个任务区:生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件导入等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量 (对所有用户).的模板, 图像处理的工作流程和测量等。晶粒度评级晶粒度评级模块根据当前国标准定晶粒度大小级别。共有三个模式选择:交互式，利用加比较图像(比较法)直接比照; 使用多截线

32、模式(截 自动截和基于重建平均晶界(面法)的全自动面法。)的面法: 晶界的自动重建 基于 DIN EN ISO 643, ASTM E 112, ASTM 1382 标准截:截 基于 DIN EN ISO 643, ASTM E 112, ASTM 1382 标准比照法:用比较图谱比照 基于SEP151061, ASTM Plate IA, ASTM Plate IB, ASTM Plate II, ASTM Plate III, ASTM Plate IV, BS4990 标准一测量均可作为独立项目在存档中管理。测量会立从图表和统计度分析结果并以的形式打印。该模块的使用可分成个任务区:Axi

33、oVi用户指南, 4.8.3 版本1-7导言生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量 (对所有用户).的模板, 图像处理的工作流程和测量等。多相含量测定该模块用于多相样品分析。可用于测任何灰度或彩图的位相。如下为测量和分类可用的测量参数:面，直径，最大卡尺直径, 形因子, (径和径)球体, 球体, 灰度值, 色彩值一测量均可作为独立项目在存档中管理。测量会立从图表和统计度分析结果并以的形式打印。该模块的使用可分成个任务区:生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量

34、(对所有用户).的模板, 图像处理的工作流程和测量等。图谱比较图谱比较模块显微图像与比较图谱相互比较。该结果包含张图像相对应的比较图谱级别和包含统计分析结果的表格。用户可以在显微图像上面加显示比较的图谱。一测量均可作为独立项目在存档中管理。测量会立从图表和统计度分析结果并以的形式打印。该模块的使用可分成个任务区:生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量 (对所有用户).的模板, 图像处理的工作流程和测量等。1-8M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言石墨评级石墨评级模块自动分析样品中石墨颗粒的大小，据

35、EN ISO 945 和 SAE J 1887 标准。如下分析可用:石墨球化率:根据EN ISO 945 对球形石墨进行球化率分析 石墨度:根据 EN ISO 945 对石墨进行度分析石墨化率:根据SAE J 1887 进行石墨进行化率分析一测量均作为一个独立的项目在存档中管理。测量立从图表和统计数据分析结果并以形式打印。该模块的使用可分成个任务区:生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量 (对所有用户).的模板, 图像处理的工作流程和测量等。三维表面形貌利用该模块，用户可以从 z-stack 中获一个高度形貌图(形图)和据 E

36、N ISO 4287 标准进行度测量。为了用户显示形图的形貌，除 4个不同的 3D 视图(结构，影，网格，表面)外有一个转和模式可用。测量该模块用户使用交互式测量工具执行图像的测量。因此，用户可以需获取图像而快速生成测量值。此外，乘定义或生成的网格可以图像并与图像(例如验组件)结构对比。煤反射率该模块测量非光下的煤样品的反射率。该功能包含一个对用户标准的活的校准过程和使用自动聚焦功能对多个样品进行分析。在分析过程中，用户可以测对当前视场和已视场的AxioVi用户指南, 4.8.3 版本1-9导言反射率的测量过程。测量结果会以反射率和 V 数据的形式现中。在从生成的样品数据可生成一个由个单独合并

37、的理论合体。图谱比较使用图谱比较模块可实现用显微图像与比较图谱的相互比较。多视图可用:显微图像和一个比较图谱显微图像 和个比较图谱显微图像 和个比较图谱显微图像 和个比较图谱如果需要，可以获包含表格形式与显微图像一起的结果。比较图谱可能适于高 5 个定义的维度。一测量均作为一个独立的项目在存档中管理。测量立从图表和统计数据分析结果并以形式打印。该模块的使用可分成个任务区:生成定分析流程的项目模板: 图像获取类 (从相机或文件等获取单个的图像), 导入表格和(仅对管理)。实测量 (对所有用户)。的模板, 图像处理的工作流程和测量等。存档模块资源存档利用资源存档模块，用户可以保存图像，测量数据列表

38、和输出等。在分级结构的数据库中作为”assets”。可以选择创建多项目类以保存的资源。联系管理功能用户分配项目到不同的户等。用户可以在自规的类别中分类和安资源。全文档查找的选项使用户可以快速查找单独的数据。此外，asset-或project-相关的镜器用户实在单独数据乚域的目标信息查找。1-10M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月导言期存档是可能的，并且用户可以选择转移项目和相关资源到 CD, DVD 或。NKPs 和j tAxioViWindows 标准:全现有的Windows 规则在特定的文件夹中(My文件全部照s, s and Settings), 所以用户可以找

39、到所需文件。在多用户环境中，不需要为 AxioVi建立独立的设定分别保单个用户Windows的设定和数据和止非中的设置。存取。用户管理全基于NKQ用户指南和AxioVi用户手册和是相相成的，联合使用它可以及时为用户提供全面的信息。用户手册包含所有程序模块的介绍，以及所有基本功能的细操作指南，并描述了常见的一些情况。在一的前言有程序相关部分或的细背景介绍，可能是相关的概念信息或者是理论细的描述。由于 AxioVi提供的功能范围，所以不可能细描述一个可能的操作情况。而，要了手册中所描述的操作偸，用户应该能运用这些操作特定的任务。提供了一个功能的参数和设定选项的所有细，是用户手册的美补充。如果对特定

40、的参数有疑问，可以下 F1 键获关于它的进一信息。不包括在用户手册中已经描述过的偸。强建议用户在开使用 AxioVi进行独立实验前本手册中描述的程序实例。要了常规的操作偸，其他信息可以在中找到。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本1-11导言NKR备份强建议所有用户定期备份创建的数据，例如图像，测量数据，存档，报告，表格和文档，否则有可能由于操作或硬件故导数据失。CarlZeiss 和 Carl Zeiss Vi对因数据保护不引起的任何损失概不负责。1-12M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月概览与操作O概览与操作OKN概览AxioVi的主窗口分为两个主要部分: 左

41、侧的工作区 和 工作流程 , 右侧的文档区。工作区和工作流程 用于选择和运行图像处理功能以及控制显微镜的功能。头和在文档区显示和编辑所有文档类型(图像，存档，表格)。主窗口还包括微软窗口特定的控制单元，如主菜单，和状态栏。AxioV的主窗口AxioVi用户指南, 4.8.3 版本2-1概览与操作OKO工作区工作区内的单元 (见下图)可用于选择工作栏上的处理功能。设定属性页上处理功能的参数。用户可以通过拖放标题栏来分开 工作区和 工作流程, 或把一个放到另一个上面。激活 显微镜 属性页功能参数设定.在 工作流程 和工作区之间切换的2-2M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月

42、概览与操作注意:工作区的所有功能都可以在 AxioVi主菜单上找到.默认情况下工作区和工作流程一个显示在另一个上面，单击底部的来进行切换.如果工作流程被隐藏，再次显示时它显示在工作区旁边，用户可以通过拖放标题栏来把它放回工作区上面，以获取更大空间显示文档.共有两种方式来显示或隐藏工作区: 通过菜单命令 View Windows Workarea 或者通过标准上的按钮.被隐藏了, 选择菜单命令 View Windows 如果 标准Standard.OKP工作流程执行 AxioVi那些需要多次执行的常规操作最简便的方法就是通过工作流程。只要一个一个地单击工作流程上的功能，就可以迅速方便地得到想要的

43、结果。隐藏所有不必需的单元如工作区和有助户集中精力于实验本身。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本2-3概览与操作激活的 标准 工作流程.上一次执行的功能用一个箭头显示.单击以激活其他工作流程，它们就向上滚动.在 工作区 和 工作流程 之间切换的.注意:所有 AxioVi中可用的功能都可用于工作流程中 (参见第 8 章 配置).默认情况下工作区和工作流程一个显示在另一个上面，单击底部的来进行切换.如果工作流程被隐藏，再次显示时它显示在工作区旁边，用户可以通过拖放标题栏来把它放回工作区上面，以获取更大空间显示文档.2-4M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月概览与操作共

44、有两种方式显示或隐藏工作区: 通过菜单命令 View Windows Workflow 或通过标准上的按钮:.被隐藏了, 选择菜单命令 View Windows 如果标准StandardOKQ自定义和框用户可以按照自己的要求生成自定义的和框。如果用户工作中需要针对头和显微镜的控制的框的设置选项的范围是清楚的，那么用户可以就可以生成满足您工作需要的控制单元框（仅仅需要点击几次鼠标）。该框可以放在自动生成的上，而其他所有默认单元都可以隐去。这样用户就有了适合自己需求的系统。可以通过功能.调用框注意:.可以生成任意数目的个人.用户自定义框也可以用作默认AxioVi用户指南, 4.8.3 版本2-5概

45、览与操作框 包含设定改变物镜和聚焦栏的选项.时间和控制扫描镜台的功能在第二页 扫描镜台.OKR快捷指令单快捷指令单包括频繁使用于文件(如图像)和 AxioVi能。这是调用这些功能最快捷的方式。界面上特定单元的功用户界面上的每一个单元都有快捷指令，可以在任何时候通过右击相应单元激活 (见如下快捷菜单的图像):2-6M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月概览与操作OKS属性窗口如您想仔细观察或者改变文档(如图像)或 AxioVi界面上任一特定单元的外信息都需要利用属性窗口。在属性窗口的页(显示,外观，动作或特属性, 色彩等)，用户可以找到相关信息(例如一个图像)的列表和/或给

46、出正在输入或修改的特定单元的选项。它可以是保存的日期和图像文件的保存位置的信息，举个例子，也可以是文本关联的格式（属性），线条和您加入图像中的对象（注释信息）。AxioVi用户指南, 4.8.3 版本2-7概览与操作见属性窗口的图像如下:属性窗口在 AxioVi操作中具有中心地位，它可以通过多种方式打开:通过快捷指令中的属性功能(见上节).通过视图菜单中的属性功能.通过组合键 Alt+Enter.2-8M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取P图像获取PKN概述在用计算机处理图像之前必须获取PC 别格式的图像。这要求使用电子机从显微镜获取图像信息，并将其转换成电子信

47、号。这些数字信号经过处理显示在计算机上。与模技术相比，现数字机在信号质量和分率方面具有优势，数据直接在机进行数字化。为了把数据传到计算机，需要接口转换器或标准数字接口，它通过的(称为偅动程序)进行操作。通过在 AxioVi系统整合的这些设备偅动程序，经由这些设备图像变为可能。在安装接口转换器和接口等时请使用 Carl Zeiss 或相应制造商提供的相应偅动程序和手册。下面的内容均定或接口转换器及相应偅动已经正确安装。关于 AxioVi的机/的细信息参见 AxioVi帮助AxioCam HR/MR/MRc5 安装和参考手册以及产品光中的 PDF 格式手册。PKO首先开使用本系统时最用相对简单的样

48、品以户断结果。把样品放在显微镜下，调显微镜以使通过目镜可以到的图像。把显微换到 TV 适配器, 例如 50%机 和 50% 目镜.AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-1图像获取注意:如果对机不熟悉, 请随时参阅相关手册。本文介绍图像获取的主要步骤。关于 AxioVi所支持的机功能解释和设定请参阅相关手册。Carl Zeiss AxioCam 系列产品的描述仅为所有支持的机举的一个例子。PKP条件下面将介绍如何仅仅用几次鼠标点击来利用 AxioVi获取图像(以 AxioCamHR 为例). 利用 标准 工作流程是实现图像获取最容易的方法。如果没有显示工作流程窗口，从视图 菜单选择窗口 功

49、能, 再选择工作流程 命令.注意:工作流程窗口可能已经打开，只是被工作区窗口遮住了. 这时单击工作区底部的工作流程就可以打开工作流程窗口。.3-2M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取标准工作流程预览 启动和关闭实时窗口.预览属性 打开和关闭一个窗口，在这里用户可以调节显示特征曲线和控制的设定.机(时间, 白平衡等)拍摄 使用有效的机获取图像.显示属性 用曲线特征调节图像显示并打开图像参数.标尺条比例尺.添加注释 在已获得的图像中明和比例尺.说导航 打开缩放的导航窗口.保存 保存图像.由于图标在所有的菜单上都是一样的，下列各项描述对通过程进行操作都适用.和工作流A

50、xioVi用户指南, 4.8.3 版本3-3图像获取获取图像的快速指南选择使用的机 (如果只安装了一个机, 则不需要这一步).将光路设定到机. 然后点击预览图像图标. 打开实时窗口显示图像.机该功能也可以通过拍摄设置 预览菜单调用.现在调整机焦距并选择用户要获取的视场位置.在页脚的可用比例尺列表中选择合适的比例尺.(过亮)区域将单击该图标，过度以红色显示在实时图像.单击实时图像底部的伽获得最佳色彩重现.图标以在下拉列表栏中选择实时图像的速度(慢速, 中速, 快速).单击 预览属性 图标以打开实时属性.3-4M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取这里用户可以看见图像

51、显示设置如亮度, 对比度和伽取的图像. 设定将应用于已获注意: 这里仅改变显示设置而机设定保持不变.AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-5图像获取改变机的以下控制设置:主要的单元是设置数字机的时间。使用 测量按钮可以确定一个最佳时间。这时需要检查曝光时间对实时图像质量的影响。可使用箭头按钮和滑块来精细调节曝光时间。时间可通过键盘编辑。测量. 预览时自动 会在实时图像中获取图像前，拍摄时自动 会执行连续调节时间.如果使用彩色机，需要对图像进行白平衡。如果选择自动白平衡 (自动 按钮),最佳值.机将试图自己测定一个使用 暖色/冷色 滑块可以将白平衡的目标值改变至暖色调( 偏红) 或冷色调(

52、 偏蓝).若想手动变化每个通道白平衡的目标值，可以利用显示颜色通道 检查箱转换到可调的设置选项.3-6M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取如果使用彩色机，需要对图像进行白平衡。如果选择自动平衡(自动按钮),佳值.机将试图自己测定一个最移动滑块以增加或减小获取图像的彩色强度.在 调节, 设置 和 常规 属性页输入选定机的进一步设置.单击机图标以获取图像，或者在拍摄设置 菜单单击拍摄.单击 显示属性 图标以激活显示 栏。用户所作的任何改变都实时地显示在图像窗口里.AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-7图像获取移动滑块伽对比度亮度 大约为向上或下以调节图像。伽

53、0.45 时色彩可以在显示器上得到较好重现.单击 M的最佳设置.ax 以找到对比度和亮度单击 原始状态以撤销所有改变.用户可以用这个图标来给图像比例尺。必须预先生成和选择适当的比例。该图标用于打开生成注释的窗口.3-8M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取利用 添加注释(s) 窗口可以和标记.图标在添加注释(s)窗口中，菜单栏的比例尺,文本, 线,矩形,轮廓,曲线 和椭圆 图标可用.在 添加注释(s)窗口中，所选标注的参数 和字体 同样可用. 若激活显示标记名称,用户可用单中的图标. 打开选择窗口，可选择标记参数.下拉菜在添加注释(s)窗口中，在图像窗口底部有放大

54、图标和两个转换色彩通道按钮可用.利用导航可以调整在概貌窗口中显示的图像大小和位置.AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-9图像获取单击该图标以保存用户生成的图像到计算机的硬盘上。注意:一旦找到了一个好的机设置，用户可以通过工具 菜单中的界面控制来保存并在将来重新调用它. 这样用户可以在不同时间以同样条件来获取特定样品的图像.为了在获取实时图像时正确显示比例尺信息，用户需要预先创建比例尺。如果使用电动或编码的显微镜，会自动分配比例尺。信息参见本手册第九章配置.详细PKQs具体注意事项下面是几个关于实时图像速度，色彩调节，具栏的注意事项。时间，荧光图像和可调节工实时图像速度关于 AxioCa

55、m HR 的实时图像有三种可用的速度模式。如果单击实时图像底,则会弹出一个设置选项菜单。当前设置显示在实时图像底部的图标部。每一个模式都有自己的优缺点.模式快速中等慢速说明分辨率大幅度降低，快帧频中等分辨率，中等帧频高分辨率，慢帧频3-10M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取可以通过关闭其他 AxioVi功能来进一步增加帧速率:关闭聚焦条.关闭实时图像比例调节 (1:1 显示图像).在机属性设置页面激活实时图像(大小)的帧.在常规属性页设定图像原始方向不变(没有旋转).注意:上述只对短时间.时间有效，对于长时间，获取速度主要取决于对于长时间，如果自动放大被激活，

56、则实时图像会出现纹状，但是这不会影响最终图像的质量.s最佳色彩重现的注意事项下面详细描述了如何设置 AxioVi以利用 AxioCam HR 实现最佳色彩重现.注意:先利用合适的图像来调好显示器，这样才能得到最佳色彩重现.调节 AxioVi的显示特征曲线:为了使 AxioCam HRc 的数据在显示器上得到图像的最佳色彩重现，必须使用显示特征曲线来设定伽补偿. 优点是只有显示受到影响而实际数据保持不变。下面会描述进一步的细节。可设置如下:用鼠标单击实时图像底部图标线以得到显示器的最佳色彩重现(伽. 这样可以自动调节显示特征曲= 0.45).AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-11图像获

57、取或在已获取的图像中:在属性窗口, 调节显示页中的伽特征曲线直方图.注意:该操作也会影响色彩饱和度.对于荧光图像，可以通过移动特征曲线设定来进行背景校正.回到数据原来的线性显示.单击图标3-12M 60-3-0040 c / 印制于 2011 年 9 月图像获取- HDRPKReao 高动态范围概述AxioVi的 HDR 模块用户验证它的功能,可根据需要试该获取技术并测应用的实影. 在图像获取时，HDR 图像会入印.一用户了该模块,可以使用.HDR 成像提供了用户增加相机特定的动态范围 的可能性. 若对比度的全部目标信息, 通常有必要获取若干个图像,且需要调到相关环境.论结构可以准确. 利用

58、HDR 模块可能将全部信息存档在单一图像中.为实现该果,据参数设置，若干图像在不同的用增强对比范围整合为一张图像.数下自动获取，并为获最佳图像, 最关键的是准确设置时间. 样品不大可能有过度的部分. 这是保证最结构获取的信息可以分的一途径，同时有利于 HDR成像. 在这情况下，获取前定准确时间的简单测量不适用，因为这包含执行从属于的平均计量。相反，过度警告应当被激活，而且调整非对数显示的显示特性，以确保任何像素过度。该技术优势大程度于样品和正在使用的显微技术. 射光区域的样品通常有一个相对平的动态范围. 这意用户使用的 HDR 方法将不会引起对比度的增加，而仅仅图像. 用其他对比技术获取的样品

59、图像，例如场区域，反射光或荧光，据考虑的结构可以显示增强的对比度，因为此时通常有比机使用的更高的动态范围.在大多数 HDR 图像与通图像比较时, 不可能立到 HDR 图像在获取 方面的改. 这是由于显示器显示深度的限制通常在 8bits 对比度范围. 由于 AxioVi没有色调制增加显示器的动态范围, 有利于设置能调(显示线的非线性度).AxioVi用户指南, 4.8.3 版本3-13图像获取- HDR执量时，从扩大动态范围得到的额外信息是最显而易见的.鉴于多分辨显示, 用户可选择亮度级别，即在区分亮度结构的同时，图像暗区域同样存在微妙的色彩.这使得分割执行更准确而且测量结果趋于精确.注意:关

60、于个别功能和参数的详细信息,请简单参考(F1 键).eao 成像接下来用户会发现使用 AxioCam 的 HDR 成像是多么简单. 只需记住一些基础内容方面, 用户即可快速获得优质的结果.如果用户使用另一家厂商的机, 即使是最简单的 HDR 成像，可能也有必要改变 HDR Setup 的参量. 相关要点中将会提及这一方面，并在最后的”HDR 设置的基本设置”中对该过程给出更详细的解释.HDR 模式使用 AxioCam 获取 HDR 图像最快的方式就是选择 HDR 模式.该模式独立于其它图像获取模块而且可以为所有获取功能进行独立激活.通过拍摄设置 菜单的 HDR 按钮模式.，用户可以简单的激活/