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文档简介

设计药物的三维结构三维结构搜索是以药效团结构作输入,在三维结构数据库中搜索含有该药效团的分子。搜索到的分子有可能具有药效团所对应的某种生物活性,即三维结构搜索方法可以在实验筛选之前为数据库中的分子的生物活性作可能性预报,而且,当搜索结果中有一些与已知活性分子结构不同的分子时,意味着可能有先导化合物的发现。三维结构搜索是一种开发三维结构数据库,发现先导化合物的快捷而有效的方法。举例1994年Narasinga及合作者研究具有消炎活性的选择素(selectin)抑制剂,他们使用MACCS-3D软件在FCD库中搜索含图所示药效团的分子,得到23个命中结构,其中有用于消炎的中草药甘草素，随后用不同的糖取代甘草素的葡糖醛酸,发现L型岩藻糖取代物的离体和活体生测活性都最高,但C型岩藻糖取代物更容易合成,活性也很高，是一个潜力很大的消炎新药,甘草素和其C型岩藻糖取代物的结构如下

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