pnas科学家构建肿瘤进化树解析癌转移机制-medsci

1、PNAS：科学家构建肿瘤“进化树”，癌转移机制2016-9-13 作者：佚名 来源：生物探索 我要评论11Tags: 肿瘤 进化树转移导语：近期，PNAS期刊象。科学家们开发出一种了一篇文章揭示了同一肿瘤组织的细胞存在差异的现Canopy，可以通过分析细胞的外显子数据获取肿瘤的“进化史”，从而筛选出精确治疗的生物标志物，有望实现个性化医疗、解决耐药性问题。肿瘤学家认为，对患者的肿瘤样本进行活检可以获取组织的生理学和组学信息。是一种顺应“适者生存”法则而发展的疾病。随着病情的发展，肿瘤组织的细胞会不断进化。即便是同一种，患者的肿瘤类型也存在差异。那么，如何实现个性化治疗呢？来自种开源性医学院和和

2、宾夕法尼亚大学Canopy，它可以通过分析细胞的的科学家们通过跨学科合作，开发出一拷贝数量变化和单核苷酸多态断出肿瘤的进化史。研究团队分析了多种，包括白血病、癌。总体而言，肿瘤的进化历程与所有影响癌细胞命运的突变有关。同一肿瘤组织常常混合着多种不同的癌细胞系，它们在组成、表达和生理学上均有差异。这种异质性会导致靶向治疗，同时耐药性问题。Canopy：绘制肿瘤的“进化树”组学和生物信息学专业的博士生（音译，Yuchao Jiang）、放射肿瘤学助理教授Andy Minn的博士后（音译，Yu Qiu）和统计学Nancy R Zhang合作并将其研究成果在PNAS期刊。他们研究的亮点在于了同一肿瘤组

3、织不同位置、不同时间的多份样本，并对这些样本进行全外显子分析。随后，研究将包括正常组织、组织在内的这些数据输入Canopy，从而获取肿瘤的“进化树”。借助Canopy，肿瘤学家能够更好地了解肿瘤的发展趋势，以及筛选出肿瘤样本中不同癌细胞的潜在生物标志物。这些生物标志物与耐药性、侵袭性等有关联，从而有助于早期患者得到准确的和预后。进化树（来源：宾夕法尼亚大学）转移机制同时，研究团队以动物为模型，研究了的转移机制。他们将人类细胞注入小鼠体内，发现这些性会转移至肺、骨骼或其他组织中，随后对这些性癌细胞以及转移癌细胞进行全外显子组，分析它们之间的单核苷酸多态和拷贝数变化。结果显示，相比于变模式。性癌细

4、胞，来自于不同组织的转移性癌细胞型不同，且均有特定突通过将突变类型与肿瘤 “进化树”的不同分支相匹配，肿瘤学家能够肿瘤的转移部位和严重程度，从而制定出更好的治疗方案。将Canopy应用于更大的样本库是团队今后的主攻方向之一。研究表示，最近单细胞技术发展迅速，有望应用于肿瘤研究中。但是，可靠的同步分析仍然处于初期阶段。这一研究表明，传统的大容量可以用于鉴定肿瘤亚克隆，大样本对于肿瘤异质性的研究很重要。未来，或以将大样本与单细胞分析结合，用于挖掘疾病的致病机理和治疗线索。原始出处：Jiang Y1, Qiu Y2, Minn AJ2, Zhang NR3.Assessingratumor heterogeneity and tracking longitudinal and spatial clonal evolutionary histo