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文档简介

1、分子生物学复习资料第1页第1页AP site:全部细胞中都带有不同类型,能够识别受损核苷酸位点糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上N-糖苷键,在DNA链上形成区去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP site。 cDNA:在体外以mRNA为模板,利用反转录酶和DNA聚合酶合成一段双链DNAC value:通常是指一个生物单倍体基因组DNA总量,以每细胞内皮克数(pg)表示第2页第2页C value paradox:也称为C值谬误。值指C值往往与种系进化复杂性不一致现象,即基因组大小与遗传复杂性之间没有必定联络,一些低等生物C值却很大,如一些两栖动物C值甚至比哺乳动物还大。DNA polymerase

2、:一个催化由脱氧核糖核苷三磷酸合成DNA酶。因为它以DNA为模板因此又称为依赖于DNADNA聚合酶。不同种类DNA聚合酶能够参加DNA聚合或修复。DNA topoisomerase:能在闭环DNA分子中改变两条链围绕次数酶,它作用机制是首先切断DNA,让DNA绕过断裂点以后再封闭形成双螺旋或超螺旋DNA.第3页第3页GU-AG rule:多数细胞核mRNA前体中内含子5边界序列为GU。因此GU表示供体衔接点5端。AG代表接纳体3端序列,习惯上把这种保守序列模式称为GU-AG法则。RNA editing:是一些RNA,尤其是mRNA前体一个加工方式,如插入、删除或取代一些核苷酸残基,造成DNA所

3、编码遗传信息发生改变,因为经过编辑mRNA发生了不同于模板DNA改变RNA recoding:是指RNA编码和读码方式改变 RNA interference,RNAi:是利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源mRNA,从而阻断体内靶基因表示,使细胞出现靶基因缺失表型方法第4页第4页Shine-Dalgarno sequence:存在于原核生物起始密码子AUG上游712个核苷酸处一个47个核苷酸保守片段,它与16S rRNA3端反向互补,因此可将mRNAAUG起始密码子置于核糖体适当位子以便起始翻译作用依据初次辨认其功效意义科学家命名。SNP(Single nucleotide polyno

4、rphism):单核苷酸多态性,指基因组DNA序列中由单个核苷酸突变而引起物种多态性。 factor:是一个相对分子质量 六聚体蛋白,它能水解各种核苷三磷酸,是一个NTP酶,它通过催化NTP水解促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。第5页第5页sigma factor:是原核生物RNA聚合酶全酶一个亚基,是聚合酶别构效应物,帮助聚合酶专一性辨认并结合模板链上启动子,起始基因转录。operon:是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控原件构成基因表示单元。insertional squence,IS:是最简朴转座子,是细菌一段可转座原件,它不含任何宿主基因因而常被称

5、为插入序列,它是细菌染色体或质粒DNA正常构成部分LTR:指反转录病毒基因组两端长末端重复序列,不含编码蛋白质,但含有启动子,增强子等调控原件,病毒基因组LTR整合到原癌基因邻近处,使这些原癌基因在LTR强启动子和增强子作用下被激活,将正常细胞转化为肉瘤细胞第6页第6页missence mutation:由于结构基因中某个核苷酸改变使一个氨基酸密码变成另一个氨基酸密码。monosicstronic messenger RNA:只编码一个蛋白质mRNA称为单顺反子mRNA。polycistronic messengerRNA:一个能够作为两种或各种多肽链翻译模板信使RNA,由DNA上邻近顺反子所

6、界定ubiquitin:含有高度保守76个氨基酸小分子热稳性蛋白质,末端与蛋白质赖氨酸氨基缩合,起始蛋白质降解。第7页第7页superhelix,supercoil:双螺旋DNA深入扭曲盘旋所形成特定空间结构,是V高级结构主要形式,可分为正超螺旋和负超螺旋两大类。按DNA双螺旋相反方向缠绕称为负超螺旋,全部天然超螺旋DNA都是负超螺旋。overlapping(nested) gene:含有部分共用核苷酸序列基因,即同一段DNA携带了两种或两种以上不同蛋白质编码信息。重合部分能够在调控区,也能够在结构基因区。常见于病毒和噬菌体基因组中。mismatch repair:是对DNA错配区修复,经过母

7、链甲基化标准找出区分母链与子链从而修正子链上错配碱基。第8页第8页molecular chaperone:它是细胞中一类能够辨认并结合到不完全折叠或装配蛋白质上以帮助这些多肽正确折叠、转运或预防它们汇集蛋白质,其本身不参与终产物形成。replicon:单独复制一个DNA单元被称为一个复制子,它是一个可移动单位,一个复制子在任何一个细胞周期只复制一次。site-derected mutagenesis:向靶基因片段中引入所需要改变,包括碱基添加、 删除或改变,是分子生物学研究中一个非常有效手段第9页第9页gene knock-out:针对一个序列功效已知但功效未知基因从DNA水平上设计试验,彻底

8、破坏该基因功效或消除其表示机制,从而推测该基因生物学功效。cDNA/genomic DNA library:是某一个生物体所有或部分基因集合。将整个生物基因组DNA或cDNA片段与适当载体在体外重组后,转化宿主细胞,所得菌落或噬菌体集合即为该生物基因组DNA或cDNA文库。degeneracy:两种或各种核苷酸三联体决定同一个氨基酸。相应于同一个氨基酸密码子称为同义密码子第10页第10页proofreading:在复制、转录或翻译过程中校正错误机制,包括从正在伸长核实或蛋白质链中清除不正确掺入核苷酸或氨基酸,并以正确单元取代。magic spot nucleotide:受严紧控制细菌生长过程中

9、一旦缺乏氨基酸供应,细菌会产生一个应急反应,使蛋白质和RNA合成速率快速降下来,魔斑核苷酸指就是此过程由大量GTP合成鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp),他们主要作用也许是影响RNA聚合酶与启动子结合专一性,诱发应急反应,帮助细菌度过难关。第11页第11页excision repair:DNA损伤一个修复机制,直接切除受损一条DNA片段,以其互补链为模板新合成DNA来取代切除受损片段。entenuator:是指原核生物操纵子中能显著减弱甚至终止转录作用一段核苷酸序列,该区域能形成不同二级结构,利用原核生物转录与翻译偶联机制对转录进行调整peptide-tRNA:指在蛋白质合成

10、过程中,在肽键合成之后,连接在新生肽链上tRNA分子。peptidyl transferase:蛋白质合成过程中一个酶,它催化正在延伸多肽链与下一个氨基酸之间形成肽键第12页第12页Satellite DNA:又称为随体DNA。因为真核细胞DNA一部分是不被转录异染色质,其碱基组成与主体DNA不同,因此有用密度梯度沉降技术分离如氯化铯梯度离心将它与主体DNA分离卫星DNA通常是高度串联重复DNANonsense mutation:在DNA序列中任何造成编码氨基酸密码子转变为终止子突变,它使蛋白质合成提前终止,合成无功效或无意义多肽。Physical map:利用限制性内切酶将染色体切成片段,再依据重合序列确定片段间连接次序以及遗传标志间物理距离图谱第13页第13页Signal peptide:在起始密码子后,有一段编码疏水性氨基酸序列RNA区域,被称为信号肽序列,它负责把蛋白质引导到细胞内不同膜结构亚细胞器内。Primer:是指一段较短单链RNA或DNA,它能与DNA一条链配对提供游离3-OH末端以作为DNA聚合酶合成脱氧核苷酸链起始点。Enhancer:能提升转录起始效率序列被称为增强子或者强化子。增强子可位于起始点5或3末端,而且普通与所调控靶基因距离无关transposon,Tn:是存在于染色体DNA上可自主复制和移

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