循证医学-3：Part Three Literature Retrieval of EBM课件

1、循证医学()Evidence-Based MedicinePart Three: Literature Retrieval of EBM1 80的知识来自于第二课堂 更新知识的能力 解决临床问题的需要 科研的需要 一、医学文献检索的重要性2文献检索Literature Retrieval：以获取文献信息为目的的信息检索。就是查找文献，即以科学的方法利用专门的工具，从大量的文献资料中迅速、准确、完整地查找到所需文献资料的过程。3二、文献的基本知识文献的类型按载体形式分：1、印刷型：图书；期刊；资料2、缩微型3、视听型4、电子型4文献的级别根据内容性质及加工深度分：1、一次文献；2、二次文献；3、

2、三次文献；4、零次文献。5二次文献定义 ：将分散的无组织的一次文献进行加工、压缩、提炼、简化、整理的产物。即检索工具。范畴：书目、索引、文摘、题录、简介特点：汇集性、工具性、综合性、系统性功能：检索、通报、控制一次文献，用于查找一次文献的线索。7三次文献定义：利用二次文献为基础，选用大量一次文献经过综合、分析撰写的。范畴：综述研究、参考工具、文献指南特点：内容更集中、针对性更强、具有参考性和指引性功能：情报调研的结果8常用文献检索算符逻辑“与” and /*检索式“A and B”表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。如：查找“胰岛素治疗糖尿病”的检索式为 insulin (

3、胰岛素) and diabetes（糖尿病）。 A AND B10逻辑“或” OR/+检索式“A or B”表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。如：查找“肿瘤”的检索式为cancer（癌） or tumor（瘤）or carcinoma（癌） 。A OR B11逻辑“非” NOT/-检索式“A not B”表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。如：查“动物的乙肝病毒（不要人的）”的文献的检索式为hepatitis B virus（乙肝病毒） not human（人类）。A NOT B12邻近度算符Near检索式“A near B”

4、表示检索词A和检索词B不仅要同时出现在一条记录的同一字段里，还必须在同一个子字段（同一句话）里的文献才是命中文献。如：drug near abuse检索出的是同一句话中同时出现这两个词的记录。（也可说成是两个词之间没有句号的文献）。14查全率（Recall ratio）： 大约6070%查准率（Precision ratio）： 大约4050%15关系：查全率与查准率为互逆相关性,目前国内外查全率一般为60%70%,查准率约为40%50%,当查全率超过70%时,若想再提高查全率就必然降低查准率。二者是互逆关系。17Science Citation Index （SCI ）SCI简介 美国科学引

5、文索引(SCI)由美国费城科学情报研究所(The Institute for Scientific Information, 简称ISI)在1963年创刊。创办人为加菲尔德(Garfield)。 是目前国际上公认的最具权威的科技文献检索工具之一。18引文和来源文献： 一篇文章的参考文献称为引文(Citation) ，该篇文章称为来源文献(Source Item) 。刊载来源文献的期刊或专著丛书等称为来源出版物(Source Publications)。191976年，ISI在SCI的基础上推出期刊引用报告(Journal Citation Report，JCR)，提供了一套统计数据，展示学术期

6、刊的被引用情况、发表论文的数量以及论文的平均被引情况。在JCR中，根据SCI的来源期刊可计算出每种期刊的影响因子（Impact Factor，IF）。20期刊的影响因子(Impact factor，IF)：是表征期刊影响大小的一项定量指标。也就是某刊平均每篇论文的被引用数，它实际上是某刊在某年被全部源刊物引证该刊前两年发表论文的次数，与该刊前两年所发表的全部源论文数之比。21计算公式：IF（k） = (nk-1+nk-2)/（Nk-1+Nk-2）以计算2007年IF 为例:IF 2007= （该杂志2006被引次数 + 该杂志2005被引次数）/(该杂志2006文章数量 + 该杂志2005文章

7、数量)22引文索引提供了一种全新的文献检索手段，即从已知的某一作者的一篇论文开始，查到所有引用过这一论文的其他论文，再以这些引用论文的作者为新的检索起点，查到更多的被引论文。经过多轮循环，可以检索到大量相关的文献线索。SCI作为文献检索的一种工具。242007年SCI影响因子最高的期刊为美国癌症学会主办的CA-CANCER J CLIN（0007-9235，临床肿瘤杂志），IF=69.026；影响因子最低的期刊为TCE-THE CHEM ENG（0302-0797）IF=0.003。2007年SCI 的IF最高值是最低值的23008倍。252010年的影响因子：共有7347个期刊杂志被贴上了影

8、响因子的标签，其中影响因子超过10的期刊有128个，IF15的期刊有62个，IF20的期刊有36个，IF30的期刊13个，影响因子超过40的杂志有4个，分别为 CA-Cancer J. Clin.（IF=87.925），Acta Crystallogr. Sect. A（IF=49.926）, New England Journal of Medicine(IF=47.050), Nature Reviews Molecular Cell Biology(IF=42.198 ) 。27中国出版的期刊杂志有114个被SCI索引，其中23个期刊影响因子超过1，影响因子超过2的有9个，影响因 子超过

9、3的期刊有Cell Research（IF=8.151）, Nano Research (IF=4.370), Fungal Diversity(IF=3.803) 。28国际标准书号International Standard Book Number， ISBNISBN7-8106-1435-5 医学细胞生物学 第一段：代表国家、地区、语种，如0，1英，2法，3德，4日，7中第二段：出版者号,由国家或地区ISBN中心分配；第三段：书名号，由出版者按出版顺序所给第四段：校验位292 检索工具的类型 *按摘录方式划分如下： 目录 题录或索引 文摘 全文30目录（Catalogue）含义：目录是对

10、文献的外表特征的著录。它通常以完整出版物（如一本书或一种刊或一个会议录的名称）作为著录的基本单位来报道和记录文献。著录内容：文献名称、著者、出版项与馆藏信息等内容。31题录（Title）或索引（Index）概念：其一，是指检索工具，它揭示文献的外表特征和内容特征，即著录文献是以一个完整出版物的某一部分（如书的章节或刊中一篇论文题目）为著录单位。其二，是指检索途径（附录式索引），如，分类索引、主题索引、生物体索引、著者索引等。著录内容：论文题目、著者、文献出处（刊名、发表年月、卷、期、页码）及文种等。如，中目、IM、CNKI免费题录等。32文摘（Abstract, Digest）含义: 文摘是指

11、对文献内容选择重要部分以简练的形式作为摘要，并按一定的原则和方法编排而成的一种检索工具。著录内容：论文题目、著者、文献出处 文摘。如，中国医学文摘,中国药学文摘, 中国生物学文摘,CA,BA,CBM,CMCC,MEDLINE/PubMed等。33全文（Full-text） 全文检索是指以文献所含的全部信息作为检索内容的文献检索。中文：CNKI数据库、万方数据库、重庆维普外文： Elsevier Science， HighWire Press数据库， Ovid系统， Springer电子全文期刊， Nature电子全文期刊 34三、检索的途径与步骤检索途径从文献外表特征：题名途径-Title I

12、ndex著者途径-Author Index 号码途径-Number Index35从文献内容特征：分类途径-Classified Index关键词途径-Keyword Index主题词途径-Subject Index 分类主题途径-Classified and Subject Index其它-Formular Index 36文献检索的途径外部特征1 题名途径2 著者途径3 序号途径内部特征4 关键词途径5 分类途径6 主题途径7 其他37使用著者途径应注意： 书写格式 姓前（全称）、名后（缩写，即用首字母）Willian Henry HarrisonHarrison W H中国人著者-按汉语

13、拼音著录；38Julia RobertsRoberts JMichael JordanJordan M39Wang LwWang L王老五4041文献检索的步骤分析检索课题选择检索工具选择检索途径和方法制定、调整检索策略查找文献线索索取原始文献42制定检索策略根据检索目的和要求，确定检索的学科范围、文献类型、回溯年限、语种；选择检索手段和检索系统；确定检索途径，注意各种检索途径的配合使用；确定检索标识 ，正确使用各种运算符，编制检索提问式 ；检索过程方案调整，通过上下位词的选择和逻辑算符的应用，可进行扩大或缩小检索范围，使检出的结果符合要求。 43索取原文记录文献线索掌握各种缩写的还原向著者索

14、取利用馆藏目录、公共查询系统、联合目录*利用网上全文传递服务*检索网上全文数据库*利用网上出版社、杂志*44文献的利用略读：了解材料的目录、大意、写作意图。略读以后，要作出初步判断，做上记号。速读：全面地、不加删减地读完材料全文，通过速读把材料分为三类：有一般参考价值或有待斟酌的；值得引用、内容精辟、观点新颖的；没有参考价值或观点前后矛盾的。精读：很少是通读，一般是读选出的材料。45介绍5个常用医学文献数据库 利用武汉科技大学已经购买的数据库资源掌握3个中文数据库、2个外文数据库检索技巧1.中国期刊全文数据库（CNKI数据库）；2.中文科技期刊全文数据库（重庆维普）；3.万方数据库 (北京万方

15、) ；4.Pubmed ;5.Elsevier SDOL 或者springer 数据库。46武科大图书馆: 47中国知识基础设施建成了世界上全文信息量规模最大的“CNKI数字图书馆”，并启动建设中国知识资源总库及CNKI网格资源共享平台，包括源数据库（如中国期刊全文数据库等）和专业知识仓库（如中国医院知识仓库等）。中国期刊全文数据库是目前世界上最大的连续动态更新的中国期刊全文数据库，收录1994年至今（部分刊物回溯至创刊）国内8200多种综合期刊与专业特色期刊的全文，全文文献总量2200多万篇。1. 中国期刊全文数据库（CNKI数据库）48点击某一个数据库名称即进入某一数据库检索页，进行检索4

16、9选择查询范围篇名、关键词、摘要中文篇名、英文篇名中文关键词、英文关键词、机标关键词中文摘要、英文摘要选择检索项作者中文名、作者汉语拼音名、作者英文名中文刊名、英文刊名利用联想、比较、判断、推理、学习等手段，综合考查文献的内容和外部属性特征与检索词的相关性，对检索结果进行内容排序后再输出的检索结果以2 位字符表示如:01,表示第1 期增刊以“s”表示，如:s1,表示增刊1直接以分类号检索，如：B82以ISSN 原有形式进行检索，如：1000-2871检索方式50点击 减少一逻辑检索行。点击减少一逻辑检索行点击增加一逻辑检索行输入检索词将弹出一个窗口，显示以输入词为中心的相关词。相关词可以三种方

17、式自动增加检索词或替代原输入词：单词自动增加、多词自动增加、相关词取代原输入词。指检索词在相应检索项内容中出现的次数，可从下拉列表中选择。词频为空，表示至少出现1次，如果为数字，例如3，则表示至少出现3次，以此类推最近词系统记录本次登录最近输入并进行检索操作过的10 个检索词。当进行了多次检索操作而又未能得出最满意的检索结果时，可点击图标，在弹出窗口上所列出的检索词中选择，点击您所需要的检索词，则该检索词自动进入检索框中。51逻辑与（并且）、逻辑或（或者）、逻辑非（不包含）。并且”、“或者”、“不包含”的优先级相同，即按先后顺序进行组合逻辑关系表示示例含义逻辑与并且A 并且 B包含A 和B逻辑

18、或或者A 或者 B包含A 或者包含B逻辑非不包含A 不包含 B包含A 排除B52精确：检索结果完全等同或包含与检索字/词完全相同的词语；模糊：检索结果包含检索字/词或检索词中的词素。532.中文科技期刊全文数据库（重庆维普） 中文科技期刊数据库是在重庆维普公司 1989年创办的中文科技期刊篇名数据库的基础上建立的，其全文版与题录文摘版完全对应。该库收录 1989年以来自然科学、工程技术、农业科学、医药卫生、经济管理、教育科学及图书情报等学科领域 10000余种科技期刊上的论文。54检索流程 登录简单检索传统检索高级检索分类检索期刊导航在结果中检索检索结果（概览）文献详细信息全文阅览及下载55提

19、供五种检索方式：快速检索、传统检索、高级检索、分类检索、期刊导航。其中又分别提供：题名、刊名、关键词、作者、第一作者、作者机构、文摘、分类号等检索入口。以高级检索方式为例进行演示。点击某一个数据库名称即进入某一数据库检索页，进行检索。56向导式检索57逻辑运算符逻辑运算符逻辑运算符*+-并且、与、and或者、or不包含、非、not向导式检索的检索操作严格按照由上到下的顺序进行，在检索是可根据检索需求进行检索字段的选择。注意5859显示方式选择检索入口选择全文下载概览页在结果中检索：检索结果中必须出现所有的检索词。相当于布尔逻辑的“与”、“and” 、“*”。在结果中添加：检索结果至少出现任一检

20、索词。相当于布尔逻辑的“或”、“or” 、“+”。在结果中去除：检索结果中不应该出现包含某一检索词的文章。相当于布尔逻辑的“非”、“not”、“_”。二次检索输入框603. 万方数据库 万方数据资源系统是以中国科技信息所（万方数据集团公司）全部信息服务资源为依托建立起来的一个以科技信息为主，集经济、金融、社会、人文信息为一体，以Internet为网络平台的大型科技、商务信息服务系统。目前，内容被整合为科技信息系统数字化期刊、企业服务系统。按照资源类型可分为全文类信息资源、文摘题录类信息资源及事实型动态信息资源。61万方数据的资源系统万方数据的资源系统科技信息数字期刊企业服务学位论文 会议论文科

21、技成果 专利技术中外标准 政策法规科技文献 机构名人科技要闻8大类100多个类目5800多种期刊期刊企业产品查询企业技术企业报告行业知识62万方数据的网站中文：http:/ 英文：http:/ 或大学图书馆镜像站点登录 数据库检索63检索流程 64点击某一个数据库名称即进入某一数据库检索页，进行检索，以数字化期刊数据库为例进行讲解。65期刊全文数据库检索区期刊刊名数据库检索区不同学科分类浏览区期刊按学科分类导航栏66点击减少一逻辑检索行点击增加一逻辑检索行输入检索词“与”：检索结果中同时包含所输入的两个关键词。“或”：表示查找包括这两项或仅其中任一项的记录。“非”：检索结果中包含第一个关键词但

22、不包含所输入的第二个关键词。674. Medline与PubMed Medline概述 Medline由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)建立和维护,是国际权威的生物医学文献书目型数据库。Medline收录了80多个国家和地区的5 000多种生物医学及相关学科期刊，累积了1950年至今的1 500多万篇文献，年收录文献约40万篇，其中大约70%为英文文献，约79%为作者撰写的英文摘要。68Medline涉及的学科范围包括基础医学、临床医学、药理学、预防医学、护理学、口腔医学、兽医学、生物学、环境科学、卫生管理和情报科学等。Medline是1

23、964年NLM开发的MEDLARS（Medical Literature Analysis and Retrieval System ，医学文献分析与检索系统）中的主要联机数据库之一，1971年正式建成并投入联机检索服务。6920世纪80年代，由美国银盘公司（SilverPlatter）出版的Medline光盘数据库问世。20世纪90年代以来，Medline更是纳入许多基于互联网的信息检索系统中，如PubMed、NLM Gateway、OVID、Dialog、ISI Web of Knowledge、EBSCO等。自1997年6月26日起PubMed向用户免费提供Medline检索服务，已成为

24、科研人员检索Medline最主要的途径。 70PubMed概述 PubMed ()是NLM下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发和维护的基于Web的生物医学文献检索系统，是Entrez集成检索系统的重要组成部分。 PubMed具有信息资源丰富、信息质量高、更新及时、检索方式灵活多样，链接功能强大、使用免费等特点，因而深受广大用户的喜爱，成为目前世界上使用最广泛的免费Medline检索系统。 71PubMed检索途径与方法 进入PubMed主页，有3个检索功能分区：基本检索区、辅助检索区和个性化检索区。72检索提问框辅助检索区个性化检索区基本检索区73PubMed的Limits页面74显示格

25、式每页显示记录数结果排序记录输出题录结果总数相关文献链接外部资源链接著者篇名出处75 PubMed 是一个关于生物医药科学的检索系统，包括引用、摘要和杂志的索引术语。PubMed包括包括 Medline以及 Medline references in process 和 References supplied by publishers的完整内容。 Medline数据库是美国国立医学图书馆的重要书目数据库系统，覆盖医学、护理、牙科、兽医、卫生保健等学科。 因此PubMed是比Medline的更大的集合。765. Elsevier SDOL全文数据库 荷兰爱思唯尔（Elsevier）出版集团是全

26、球最大的科技与医学文献出版发行商之一，已有180多年的历史。ScienceDirect系统是Elsevier公司的核心产品，自1999年开始向读者提供电子出版物全文的在线服务，目前包括Elsevier出版集团所属的2200多种同行评议期刊和2000多种系列丛书、手册及参考书等，其中收录生物医学相关期刊达800余种。 77数据库检索方法该数据库为用户提供了期刊浏览、快速检索、高级检索、专家检索及为用户提供个性化定制服务等辅助检索功能。78SD平台主页面79检索功能快速检索（Quick search）高级检索（Advanced search） 专家检索（Expert Search）期刊浏览（Bro

27、wse Journal）8081快速检索（Quick search）在文章的标题、文摘或关键词等文本中查找所输入的关键词，或将文献的题录信息输入相应检索框内，即可检索到所需文献。适用于特定文献检索。82 83 84高级检索（Advanced search)是Science & Direct平台上最常用的检索界面。可以通过将检索词限定在不同字段（Abstract, Title, Keyword, Author, Journal name等），同时将两个词进行（and, or, not）逻辑组配。8586876. Springer Link全文期刊数据库 Springer数据库介绍 德国Sprin

28、ger出版公司所出版的期刊的电子版，2005年将Kluwer出版社合并，目前此电子刊库可以为用户提供1550余种的期刊，其中生物医学方面的期刊约为500余种。 该数据库使用方法简单，查找方便。88数据库主页简单检索文献学科分类浏览文献类型浏览89数据库检索方法浏览检索（按文献类型及字顺、学科分类等浏览)简单检索高级检索指令检索 辅助检索功能 90按文献类型浏览91按期刊字顺浏览92文献按学科分类浏览93简单检索94 五、循证医学及其数据库使用指南 Evidence-based Medicine & Database95循证医学文献的类型Meta-analysisRCTSystematic re

29、viewsCochrane reviewsReview of effects or clinical trails9697Cochrane协作网性质： 国际性非赢利民间学术团体，旨在总结各地随机化分组、有对照的临床试验的所有结果，并使其实现电子化，其文章的摘要可以在因特网可以免费查到，网址: 目的： 通过制作、保存、传播和不断更新医疗卫生各领域的系统评价结果，给临床医生制定医疗决策提供最佳证据。98网址: 99网址：100循证医学文献的类型Cochrane reviewsSystematic reviewsMeta-analysisRCT（Randomize controlled trials

30、) Review of effects or clinical trials101循证医学信息检索 通过网络医学数据库 检索 使用EBM专业 期刊 检索 使用EBM专业 指南 检索 使用EBM专业 网站 检索 102发现和提出问题 提出问题确定检索词和检索工具 检索证据检索方法和过程 检索结果的分析 评价证据将得到的结论用运到实际 临床决策循证医学检索循证医学实践103EBM 常用的外文数据库PubMed: Cochrane library: Ovid 数据库： /104Pubmed 的ebm检索方法利用 limits 限制文献类型 在检索输入框: cochrane database syst

31、 rev”3.使用PUbMed service : 105106107Cochrane library 主要资源The Cochrane Database of Systematic Reviews（Cochrane系统评价数据库，CDSR） The Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness（疗效评价文摘数据库，DARE） The Cochrane Controlled Trials Register /CENTRAL（Cochrane临床对照试验数据库和CENTRAL管理数据库，CCTRCENTRAL）The Cochrane Rev

32、iew Methodology Database（Cochrane系统评价方法学数据库，HTA）108Cochrane library 检索方法109110Abstract（系统综述数的格式）Background 背景Objectives 目的Search strategy 检索策略Selection criteria 选择标准Data collection and analysis 数据收集和分析Main results 主要结果Authors conclusions 作者结论111Ovid 医学数据库 OVID公司是世界著名的数据库提供商，目前已包涵医学、生物等多领域数据库上百个，如临床各

33、科专著及教科书（BookOvid）、循证医学（EBM）、MEDLINE、EMBASE以及医学期刊全文数据库（journalsOvid full Text）等。后者集中了上千种重要的医学期刊，其中最早的可回溯至1993年。112Ovid循证医学期刊及数据库期刊和数据库113Ovid数据库检索方法关键词作者题目期刊字段限制检索114循证医学 期刊 循证医学杂志（Evidence-Based Medicine，EBM）双月刊 由BMJ和美国内科医生学院（American College of Physicians ACP）联合主办。为医疗卫生工作者提供外科、儿科、产科和妇科方面的研究证据。 美国内科医生学院杂志（ACP Journal Club） 双月刊， 由ACP和美国内科协会（ACPAmerican Society of Internal Medicine，ASIM）联合主办。旨在通过筛选和提供已出版的研究报道和文献综述的详细文摘，使医疗卫生工作者掌握治疗、诊断、预后和卫生经济学等方面的重要进展。 循证护理杂志（Evidence-Based Nursing） 季刊， 由英国皇家护士学院和BMJ联合主办。是一个提供与护理相关的最好研究和最新证据的高质量国际性杂志。 循证卫生保健杂