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4.4.5丝氨酸蛋白酶水解机制什么是丝氨酸蛋白酶?丝氨酸蛋白酶是一个蛋白酶家族,其激活是通过活性中心一组氨基酸残基变化实现的,它们之中一定有一个是丝氨酸(Ser,serine)。在哺乳类动物里面,丝氨酸蛋白酶扮演着很重要的角色,特别是在消化,凝血和补体系统方面。最典型的三种丝氨酸蛋白酶:胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶弹性蛋白酶同属消化酶系,在胰腺泡内合成并分泌到十二指肠中。均可催化肽键的水解反应,但对肽键的选择性则有所不同这一反应过程具有两相特征:快速反应相:对硝基苯酚离子快速形成,与酶的浓度成正比。恒态反应相:对硝基苯酚离子形成较缓慢,形成速率恒定。(决定反应速率的关键步骤)快速反应相过程中酶和底物结合释放出对硝基苯酚离子,同时形成乙酰基-酶中间体;而恒态反应相过程则是乙酰基-酶中间体缓慢水解,放出酶,使之与底物相结合继续释放出对硝基苯酚离子。由于乙酰基-酶的水解很慢,使体系中酶浓度下降,进而导致对硝基苯酚释放速率变慢。2.酶活化中心必需基团的测定(1)活性Ser基团:二异丙基磷酰氯(DIPF)能特异性与Ser基团的-OH反应,其结果导致作为酶活性中心的Ser的残基发生不可逆失活,此方法可有效确定胰凝乳蛋白酶中的Ser-195是酶活性中心必需氨基酸残基。
DIPF作用于动物上时,即可显示出很高的神经毒性,动物体内的乙酰胆碱酯酶(丝氨酸蛋白水解酶的一种)能够与DIPF反应,使其自身失活,失去对乙酰胆碱的水解作用。乙酰胆碱是一种生物体内常见的神经传导物质,自身具有很高的毒性,而负责水解完成传递信息任务后的乙酰胆碱的乙酰胆碱酯酶(乙酰胆碱酯酶可将乙酰胆碱分解成无毒性的乙酸和胆碱)失活之后就会导致乙酰胆碱在生物体内不断地积累,最终导致生物中毒死亡。(3)丝氨酸蛋白水解酶的空间结构:X射线衍射法:通常,都是将表达蛋白的基因PCR之后克隆到一种表达载体中,然后在大肠杆菌中诱导表达,提纯之后摸索结晶条件。结晶后,将晶体进行x射线衍射,收集衍射图谱,通过一系列的计算,很快就能得到蛋白质的原子结构。牛的胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶以及住的弹性蛋白酶在结构上很相似,这三种酶大约由240个氨基酸残基组成,三者的一级结构大约有40%是相同的,且活性中心的必需氨基酸也大致相同(Ser、His、Asp)3.催化作用机制(1)结构特性
以胰凝乳蛋白酶举例,其活性中心有三个必需氨基酸残基:Ser-195,His-57和Asp-102,这三部分通过氢键结合,整体呈三角形,即所谓的“催化三元区”。“催化三元区”的最显著特征是Ser-195的羟基高度极化,具有很高的亲核进攻能力。(2)亲核共价催化作用——易形成四联体结构的中间物Step1:Ser-195作用于底物的肽键酰基,发起亲核进攻,形成一个包括Ser-195的羟基、底物酰基和氨基在
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