表观遗传学学时详解演示文稿

表观遗传学学时详解演示文稿现在是1页\一共有52页\编辑于星期五优选表观遗传学学时现在是2页\一共有52页\编辑于星期五现在是3页\一共有52页\编辑于星期五2023年4月3日4一、概述表观遗传学研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传变化的，或者说是研究从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴的遗传学分支。表观遗传通过有丝分裂或减数分裂来传递非DNA序列信息的现象。所谓表观遗传就是不基于DNA序列差异的核酸遗传。即细胞分裂过程中，DNA序列不变的前提下，全基因组的基因表达调控所决定的表型遗传，涉及染色质重编程、整体的基因表达调控（如隔离子，增强子，弱化子，DNA甲基化，组蛋白修饰等功能),及基因型对表型的决定作用。2023年4月3日4现在是4页\一共有52页\编辑于星期五表观遗传修饰机制

DNA甲基化和组蛋白修饰非编码小RNA分子调节基因组印迹基因表达的重新编程x染色体失活现在是5页\一共有52页\编辑于星期五拉马克与长颈鹿用进废退现在是6页\一共有52页\编辑于星期五2023年4月3日72023年4月3日7发展历史1939年，WaddingtonC

首先在《现代遗传学导论》中提出了epihenetics这一术语，1975年，HollidyR不仅在发育过程，而且应在成体阶段研究可遗传的基因表达改变，这些信息能经过有丝分裂和减数分裂在细胞和个体世代间传递，而不借助于DNA序列的改变，也就是说表观遗传是非DNA序列差异的核遗传。

2007AdrianBird,(nature,Aunifyingdefinitionofepigenetics）thestructuraladaptationofchromosomalregionssoastoregister,signalorperpetuatealteredactivitystates.Thisdefinitionisinclusiveofchromosomalmarks,becausetransientmodificationsassociatedwithbothDNArepairorcell-cyclephasesandstablechangesmaintainedacrossmultiplecellgenerationsqualify现在是7页\一共有52页\编辑于星期五2023年4月3日8特点概括表观遗传学的特点：可遗传的，即这类改变通过有丝分裂或减数分裂，能在细胞或个体世代间遗传；可逆性的基因表达调节，也有较少的学者描述为基因活性或功能的改变；没有DNA序列的改变或不能用DNA序列变化来解释。2023年4月3日8现在是8页\一共有52页\编辑于星期五人类基因组计划完成带来的挑战1.100多个物种的基因组测序已经完成；2.>4,000个物种的基因组计划正在进行；3.比较基因组学：比较多个物种的基因、蛋白质的序列来揭示功能的保守性，并发现新的规律。现在是9页\一共有52页\编辑于星期五DNA双螺旋现在是10页\一共有52页\编辑于星期五基因的结构现在是11页\一共有52页\编辑于星期五基因：可遗传1.遗传的基本功能单位2.基因由DNA编码3.一个基因编码一条蛋白质4.基因序列的改变可能导致功能及表型的改变基因型(Genotype)->

表型(Phenotype)现在是12页\一共有52页\编辑于星期五基因概念的延伸：生物体的复杂性1.人类基因组：~22，000个基因vs.100,000个蛋白质——可变剪切(AlternativeSplicing)2.表观遗传学现在是13页\一共有52页\编辑于星期五遗传信息的传递：中心法则1.DNA自身通过复制传递遗传信息；2.DNA转录成RNA；3.RNA自身能够复制(RNA病毒)；4.RNA能够逆转录成DNA；5.RNA翻译成蛋白质。现在是14页\一共有52页\编辑于星期五表观遗传学1.概念：基因的DNA序列不发生改变的情况下，基因的表达水平与功能发生改变，并产生可遗传的表型。2.特征:(1)可遗传；(2)可逆性；(3)DNA不变3.表观遗传学修饰机制：(1)DNA甲基化和组蛋白修饰(2)非编码小RNA分子调节(3)基因组印迹(4)基因表达的重新编程(5)x染色体失活现在是15页\一共有52页\编辑于星期五遗传信息1.遗传编码信息：提供生命必需蛋白质的模板2.表观遗传学信息：何时、何地、以何种方式去应用遗传信息(1)DNA的甲基化：CpG位点，>5,000万个(2)组蛋白修饰：组蛋白密码(Histonecode)现在是16页\一共有52页\编辑于星期五表观遗传学的研究内容1.基因选择性转录表达的调控2.基因转录后的调控3.蛋白质的翻译后修饰现在是17页\一共有52页\编辑于星期五二、表观遗传修饰机制(1)DNA甲基化和组蛋白修饰(2)非编码小RNA分子调节(3)基因组印迹(4)基因表达的重新编程(5)x染色体失活现在是18页\一共有52页\编辑于星期五2.1DNA甲基化SAH,S-adenosylhomocysteine;SAM,S-adenosylmethionine现在是19页\一共有52页\编辑于星期五甲基转移酶（DNMTs）

的作用Dnmt1的作用Dnmt3aDnmt3b的作用现在是20页\一共有52页\编辑于星期五DNA中5-mC的分布哺乳动物基因组DNA中5-mC约占胞嘧啶总量的2%--7%，绝大多数5-mC存在于CpG二联核苷(CpGdoublets)。

结构基因5’端附近富含CpG二联核苷的区域称为CpG岛(CpGislands)。

现在是21页\一共有52页\编辑于星期五DNA去甲基化1）被动途径：由于核因子NF粘附甲基化的DNA，使粘附点附近的DNA不能被完全甲基化，从而阻断DNMT1的作用2）主动途径：是由去甲基酶（DNAdemethylase)的作用，将甲基基团移去的过程TET家族(TET1、TET2、TET3）的去甲基化功能TET（ten-eleventranslocation）蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸（α-KG）和Fe2+依赖的双加氧酶，在靠近C的一端拥有一个催化结构域，该结构域具有3个金属离子（Fe2+）和1个α-KG的结合位点，催化结构域前还有一段富含半胱氨酸区，TET蛋白可以催化5-甲基胞嘧啶（5-mC）转化为5-羟甲基胞嘧啶（5-hmC），是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶，对于维持干细胞的多能性有重要作用。TET基因的突变可以引起多种肿瘤尤其是造血系统肿瘤。[1]

现在是22页\一共有52页\编辑于星期五TET介导的去甲基化途径和机制现在是23页\一共有52页\编辑于星期五TET3在合子表观遗传重编程过程中起重要作用现在是24页\一共有52页\编辑于星期五重编程过程甲基化变化humanEScellsDifferentiatedfibroblastsHumaniPScellsHumaniPScells现在是25页\一共有52页\编辑于星期五DNA甲基化与癌症的发生现在是26页\一共有52页\编辑于星期五组蛋白修饰

组成核小体的组蛋白可以被多种化学加合物所修饰，如磷酸化、乙酰化和甲基化等，组蛋白的这类结构修饰可使染色质的构型发生改变，称为染色质构型重塑。组蛋白中不同氨基酸残基的乙酰化一般与活化的染色质构型常染色质(euchromatin)和有表达活性的基因相关联；而组蛋白的甲基化则与浓缩的异染色质(hetero-chromatin)和表达受抑的基因相关联。现在是27页\一共有52页\编辑于星期五ChromatidDNANucleosomeSolenoidSuperSolenoidChromosome7X6X40X5XTotal:7x6x40x5=8400染色质重塑现在是28页\一共有52页\编辑于星期五Modelformethylation-dependentgenesilencing.

Thestructuralelementofchromatinisthenucleosomalcore,whichconsistsofa146-bpDNAsequencewrappedaroundcorehistones.Acetylationofthehistonescausesanopenchromatinconfig-urationthatisassociatedwithtranscriptionalactivity.Methylatedcytosinesarerecognizedbymethyl-CpG-bindingproteins(MBDs),whichinturnrecruithistonedeacetylases(HDACs)tothesiteofmethylation,convert-ingthechromatinintoaclosedstructurethatcannolongerbeaccessedbythetranscriptionalmachinery.现在是29页\一共有52页\编辑于星期五1.2非编码小RNA分子的调节1.shortinterferingRNAs(siRNA)2.MicroRNA(miRNA)3.piwi-interactingRNA(piRNA)现在是30页\一共有52页\编辑于星期五siRNAshorthairpinRNA(shRNA)RNA-inducedsilencingcomplex(RISC)现在是31页\一共有52页\编辑于星期五Antisense现在是32页\一共有52页\编辑于星期五2.3基因组印记GenomicImprinting:两条染色体需要随机沉默其一Beckwith-WiedemannSyndrome:1/15,000BWS：20%的致死率BWS:embryonictumor现在是33页\一共有52页\编辑于星期五现在是34页\一共有52页\编辑于星期五(Prader-WilliSyndrome,PWS)1956年A.Prader和H.Willi父源染色体15q11-13区段缺失Prader-Willi综合征现在是35页\一共有52页\编辑于星期五Beckwith-WiedemannSyndromeH19andIgf2aregenesthatareexpressedfromonlythematernalorthepaternalchromosome.H19isexpressedfromthematernalchromosomeonly;Igf2isexpressedonlyfromthepaternalchromosome.Thetwogenesshareanenhancerregion,locateddownstreamofH19.Thenewpapers1,2,3,4showthattheICR(imprinting-controlregion)ofH19isaboundaryelement,controlledbyDNAmethylation.TheCTCFproteinbindstotheunmethylatedmaternalICR.ThispreventsthepromoterslocatedintheIgf2genefrominteractingwiththeenhancersdownstreamoftheH19gene,resultingintranscriptionalsilencingofIgf2.ThepaternalICRismethylated(filledcircles),preventingbindingofCTCF.ThisallowstheenhancerstocontactthepromotersofthepaternalIgf2,allowingthegenetobetranscribed.ThepaternalH19geneisthoughttobesilencedbymethylation.DifferentiallymethylatedregionsarealsofoundinIgf2,butarenotshownhere.现在是36页\一共有52页\编辑于星期五Angelman综合征

1968年H.Angelman

母源染色体15q11-13区段缺失(AngelmanSyndrome，AS)现在是37页\一共有52页\编辑于星期五

PWS和AS这一对综合征表明父亲和母亲的基因组在个体发育中有着不同的影响，这种现象被称为基因组印迹(genomicimprinting)。

现在是38页\一共有52页\编辑于星期五近年研究表明，基因组印迹是两个亲本等位基因的差异性甲基化型造成了一个亲本等位基因的沉默，另一个亲本等位基因保持单等位基因活性(monoallelic

activity)。

现在是39页\一共有52页\编辑于星期五

在父源和母源染色体上，这些调控元件的CpG岛呈现甲基化型的明显差异。

在PWS和AS患者中发现，微小染色体缺失集中的区域有成簇排列的富含CpG岛的基因表达调控元件，称为印迹中心(imprintingcenters,ICs)。SNRPN的23个CpG二联核苷父源非甲基化完全甲基化母源例如

差异甲基化(differentialmethylation)：父源和母源染色体上的ICs的甲基化呈现出分化状态。现在是40页\一共有52页\编辑于星期五

基因组印迹是性细胞系的一种表观遗传修饰，这种修饰有一整套分布于染色体不同部位的印迹中心来协调，印迹中心直接介导了印迹标记的建立及其在发育全过程中的维持和传递，并导致以亲本来源特异性方式优先表达两个亲本等位基因中的一个，而使另一个沉默。研究表明，在哺乳动物中相当数量的印迹基因是与胎儿的生长发育和胎盘的功能密切相关的。

现在是41页\一共有52页\编辑于星期五2.4基因表达重编程

已完全分化的细胞，其基因组在特定条件下经历表观遗传修饰重建而为胚胎发育中的基因表达重新编程(reprogramming)并赋予发育全能性，为胚胎发育和分化发出正确的指令。胚胎发育中表观基因组重新编程的差误将会导致多种表观遗传缺陷性疾病。现在是42页\一共有52页\编辑于星期五2.4基因表达重编程现在是43页\一共有52页\编辑于星期五重编程方法比较现在是44页\一共有52页\编辑于星期五多莉：死掉了…Ian