氨基酸酸与核苷酸课件

蛋白质的基本结构单体是氨基酸核酸的基本结构单体是核苷酸生物大分子蛋白质、核酸都是由基本结构单位组成的多聚体（polymer）；可形成聚合体的基本结构单位称为单体（monomer）。氨基酸的结构与功能第一节TheStructureandFunctionofAminoAcids一、构成人体蛋白质氨基酸均为L--氨基酸虽然存在于自然界中的氨基酸有300余种，但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种，且均属L-

-氨基酸（除甘氨酸外）。H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R(1)侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸二、氨基酸的侧链结构决定其功能包括丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸和脯氨酸。此类氨基酸在水溶液中溶解度小。（一）氨基酸的差异在于侧链结构-R基团中文名英文名缩写符号结构式等电点（pI）含脂肪烃侧链的氨基酸甘氨酸GlycineGlyG5.97丙氨酸AlanineAlaA6.00缬氨酸ValineValV5.96亮氨酸LeucineLeuL5.98异亮氨酸IsoleucineIleI6.02(1)侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸侧链含有羟基的氨基酸丝氨酸SerineSerS5.68苏氨酸ThreonineThrT5.60酪氨酸TyrosineTyrY见芳香族类5.66侧链含有硫的氨基酸半胱氨酸CysteineCysC5.07甲硫氨酸MethionineMetM5.74(2)侧链含羟基或含巯基是极性中性氨基酸甘氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、苏氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺。N原子在杂环中移动的自由度受到限制，常位于多肽链的转角处脱氧胞苷deoxycytidine天然存在的核酸可以分为：碱基位置存在顺式和反式结构此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。N6-m6AN6-甲基腺嘌呤鸟嘌呤guanine(G)碱基位置存在顺式和反式结构腺嘌呤adenine(A)核苷酸一般为白色粉末或结晶状物，平均分子量约为340。此类氨基酸有赖氨酸、精氨酸和组氨酸，其侧链分别含有氨基、胍基和咪唑基，均可发生质子化，使之带正电荷。核苷酸可以作为细胞内信号转导信使tRNA中含有较多的稀有碱基，可高达10%。（二）核苷酸中的戊糖有核糖和脱氧核糖两类重要的L--氨基酸的主要功能特点胞嘧啶cytosine(C)N6-m6AN6-甲基腺嘌呤参加合成尿素的鸟氨酸循环薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法例如，薄层层析、离子交换层析、毛细管电泳等技术都可用于分离和纯化核苷酸。(3)侧链含酸性基团及其衍生物的氨基酸此类氨基酸有天冬氨酸、谷氨酸，其侧链都含有羧基，均可解离而带负电荷。侧链含酸性基团及其氨基衍生物的氨基酸天冬氨酸AsparticacidAspD2.97天冬酰胺AsparagineAsnN5.41谷氨酸GlutamicacidGluE3.22谷氨酰胺GlutamineGlnQ5.65(4)侧链含碱性基团的氨基酸属于碱性氨基酸此类氨基酸有赖氨酸、精氨酸和组氨酸，其侧链分别含有氨基、胍基和咪唑基，均可发生质子化，使之带正电荷。侧链含碱性基团的氨基酸精氨酸ArginineArgR10.76赖氨酸LysineLysK9.74组氨酸HistidineHisH7.59(5)侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸，其侧链分别有苯基、酚基和吲哚基。侧链含芳香环的氨基酸组氨酸HistidineHisH见上7.59苯丙氨酸PhenylalaninePheF5.48酪氨酸TyrosineTyrY5.66色氨酸TryptophanTrpW5.89亚氨基酸脯氨酸ProlineProP6.30几种特殊氨基酸

脯氨酸（亚氨基酸）

半胱氨酸+胱氨酸二硫键-HH（二）-R基团赋予氨基酸不同的极性蛋白质中的L--氨基酸依据极性的分类类别主要氨基酸非极性脂肪族氨基酸丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸芳香族氨基酸苯丙氨酸亚氨基酸脯氨酸极性中性氨基酸甘氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、苏氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、酪氨酸、色氨酸酸性氨基酸天冬氨酸、谷氨酸碱性氨基酸赖氨酸、精氨酸、组氨酸重要的L--氨基酸的主要功能特点名称结构与功能特点半胱氨酸氧化状态下，多肽链中不相邻的两个半胱氨酸通过二硫键相连，增强蛋白质结构的稳定性；巯基易与重金属离子结合天冬氨酸、谷氨酸携带强负电荷，常位于水溶性蛋白的表面；可结合带正电荷的分子或金属离子苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸侧链结构大且极性较弱或无极性，常位于水溶性蛋白的内部甘氨酸是唯一不存在不对称立体结构的氨基酸，有较大的旋转自由度，赋予多肽链更多的柔性；是最小的氨基酸，能够存在于空间致密的蛋白质中，如胶原组氨酸咪唑基团容易发生质子化，进而影响其所在的蛋白质构象，因此是许多蛋白质功能的调节机制异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸均含有较大的疏水侧链，其刚性结构特征及疏水相互作用都对蛋白折叠有重要的影响力，常作为水溶性蛋白的内部支撑结构赖氨酸、精氨酸有带正电荷的柔性侧链，常作为蛋白的亲水表面，且易于结合带有负电荷的其他分子，如DNA甲硫氨酸是多肽链生物合成的起始氨基酸；参与体内含硫化合物代谢及甲基化反应脯氨酸N原子在杂环中移动的自由度受到限制，常位于多肽链的转角处丝氨酸、苏氨酸侧链短，所含羟基常作为酶反应中的供氢体；亲水性强，位于水溶性蛋白表面（三）氨基酸-R基团直接影响多肽链结构（四）氨基酸的侧链可有其他化学基团修饰体内常见的蛋白质翻译后发生化学修饰的氨基酸残基常见的化学修饰种类发生修饰的主要氨基酸残基磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸N-糖基化天冬酰胺O-糖基化丝氨酸、苏氨酸羟基化脯氨酸赖氨酸甲基化赖氨酸、精氨酸、组氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、谷氨酸乙酰化赖氨酸、丝氨酸硒化半胱氨酸三、氨基酸及其衍生物具有除形成多肽链外的多种重要功能组成蛋白质的氨基酸的其他功能及重要衍生物举例氨基酸名称重要功能及衍生物甘氨酸神经递质；参加体内嘌呤类、卟啉类和肌酸的合成谷氨酸神经递质；其-脱羧产物γ-氨基丁酸亦是重要的神经递质色氨酸转化生成重要的神经递质5–羟色胺精氨酸产生重要的信号物质一氧化氮（NO）；参加合成尿素的鸟氨酸循环甲硫氨酸为体内的毒物或药物甲基化代谢提供甲基，起到解毒的作用天冬氨酸神经递质；三羧酸循环中的重要成分；参加合成尿素的鸟氨酸循环酪氨酸黑色素组氨酸脱羧形成的组胺具有血管舒张作用，并参与多种变态反应非蛋白质组成氨基酸及其衍生物功能举例氨基酸名称功能瓜氨酸、鸟氨酸参加体内尿素合成同型半胱氨酸转甲基作用的产物β-丙氨酸泛酸（一种维生素）的成分之一L-肉毒碱化学结构为L-β-羟--三甲胺丁酸，参加脂质转运四、氨基酸的理化性质是其分离和鉴定的依据（一）氨基酸具有两性离子特征由于所有氨基酸都含有可解离的-氨基和-羧基，因此，氨基酸溶解在水中是一种偶极离子（dipolarion），又称两性离子（zwitterion）。其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。在某一pH的溶液中，氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等，成为兼性离子，呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。等电点(isoelectricpoint,pI)pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性离子阳离子阴离子氨基酸具有特征性的滴定曲线甘氨酸滴定曲线（二）氨基酸的化学反应特性决定其体内功能

一个氨基酸的羧基可与另一个氨基酸的氨基反应成肽，形成共价的肽键。通过连续的肽键，许多氨基酸即可聚合成多肽或蛋白质分子-氨基参与体内多种化学反应。氨基酸的-氨基能与醛类化合物生成弱碱，称为Schiff碱，这是体内氨基酸转氨基作用的中间代谢物体内氨基酸化学反应胸腺嘧啶(thymine,T)（二）核苷酸的解离特征可用于其分离纯化（三）可利用氨基酸理化特性对其进行定性核苷酸是重要的药物研究对象是最小的氨基酸，能够存在于空间致密的蛋白质中，如胶原参加体内嘌呤类、卟啉类和肌酸的合成稀有碱基种类很多，大多数都是甲基化碱基。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。为体内的毒物或药物甲基化代谢提供甲基，起到解毒的作用N6，N6-2m6AN6，N6-二甲基腺嘌呤此类氨基酸有赖氨酸、精氨酸和组氨酸，其侧链分别含有氨基、胍基和咪唑基，均可发生质子化，使之带正电荷。（二）-R基团赋予氨基酸不同的极性腺苷酸(AMP)adenosinemonophosphate٭参加合成尿素的鸟氨酸循环此类氨基酸有赖氨酸、精氨酸和组氨酸，其侧链分别含有氨基、胍基和咪唑基，均可发生质子化，使之带正电荷。赖氨酸、精氨酸、组氨酸异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸腺嘌呤(adenine,A)（一）氨基酸具有两性离子特征核酸中还有一些含量甚少的碱基，称为稀有碱基(rarebase)。（二）核苷酸中的戊糖有核糖和脱氧核糖两类（三）可利用氨基酸理化特性对其进行定性定量分析氨基酸与茚三酮试剂发生呈色反应氨基酸与2，4-二硝基氟苯反应生成二硝基苯基氨基酸氨基酸与亚硝酸反应生成氮气含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm

附近。大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基，所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收（四）氨基酸定量定性分析已进入自动化时代随着毛细管电泳（capillaryelectrophoresis，CE；液相层析（liquidchromatography,LC）自动化及质谱（massspectrometry，MS）技术的发展，目前氨基酸的检测分析可以在自动分析仪器中快速完成。核苷酸的结构与功能第二节TheStructureandFunctionofNucleotides脱氧核糖核酸：其基本组成单位是脱氧核糖核苷酸（deoxyribonucleotide，DNA）核糖核酸：其基本组成单位是核糖核苷酸（ribonucleotide，RNA）核酸（nucleicacid）是生物信息大分子天然存在的核酸可以分为：核酸的化学组成

元素组成C、H、O、N、P（9%~10%）

分子组成——碱基(base)：嘌呤碱，嘧啶碱——戊糖(pentose)：核糖，脱氧核糖——磷酸(phosphate)脱氧胞苷deoxycytidine虽然存在于自然界中的氨基酸有300余种，但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种，且均属L--氨基酸（除甘氨酸外）。大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基，所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。T胸腺嘧啶N6，N6-2m6AN6，N6-二甲基腺嘌呤脱氧胞苷酸(dCMP)deoxycytidinemonophosphate（一）氨基酸的差异在于侧链结构-R基团脱氧鸟苷酸(dGMP)deoxyguanosinemonophosphate三羧酸循环中的重要成分；Asparticacid（四）氨基酸定量定性分析已进入自动化时代tRNA中常见的稀有碱基N6-m6AN6-甲基腺嘌呤此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。参加合成尿素的鸟氨酸循环NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD等都含有AMP等电点(isoelectricpoint,pI)碱基位置存在顺式和反式结构鸟苷酸(GMP)guanosinemonophosphate核酸（nucleicacid）是生物信息大分子一、戊糖、磷酸和碱基是核苷酸的基本成分核苷酸由碱基(base)、戊糖(pentose)和磷酸3种成分以共价键依次连接而成。核酸在酶的作用下水解为核苷酸（nucleotide）。

核酸核苷酸磷酸核苷或脱氧核苷核酸酶水解核苷酶核糖脱氧核糖碱基戊糖嘌呤嘧啶核苷酸由碱基(base)、戊糖(pentose)和磷酸3种成分以共价键依次连接而成。（一）核酸中的碱基分为嘧啶碱和嘌呤碱两类核酸中常见的5种碱基嘌呤(purine)腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤(guanine,G)碱基:嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)碱基可发生互变异构烯醇式酮式氨式亚氨式核酸中存在稀有碱基核酸中还有一些含量甚少的碱基，称为稀有碱基(rarebase)。稀有碱基种类很多，大多数都是甲基化碱基。tRNA中含有较多的稀有碱基，可高达10%。DNARNA嘌呤m7G7-甲基鸟嘌呤N6，N6-2m6AN6，N6-二甲基腺嘌呤N6-m6AN6-甲基腺嘌呤N6-m6AN6-甲基腺嘌呤m7G7-甲基鸟嘌呤嘧啶m5C5-甲基胞嘧啶DHU二氢尿嘧啶Hm5C5-羟甲基胞嘧啶T胸腺嘧啶核酸中部分稀有碱基DNA或RNA的定量（二）核苷酸中的戊糖有核糖和脱氧核糖两类腺苷adenosine四、氨基酸的理化性质是其分离和鉴定的依据此类氨基酸有天冬氨酸、谷氨酸，其侧链都含有羧基，均可解离而带负电荷。脱氧腺苷deoxyadenosine氨基酸的-氨基能与醛类化合物生成弱碱，称为Schiff碱，这是体内氨基酸转氨基作用的中间代谢物鸟嘌呤guanine(G)m7G7-甲基鸟嘌呤核苷酸一般为白色粉末或结晶状物，平均分子量约为340。此类氨基酸有赖氨酸、精氨酸和组氨酸，其侧链分别含有氨基、胍基和咪唑基，均可发生质子化，使之带正电荷。含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质泛酸（一种维生素）的成分之一薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法（四）氨基酸的侧链可有其他化学基团修饰环化核苷酸:cAMP，cGMP发生修饰的主要氨基酸残基（三）碱基和和戊糖缩合成核苷酸dAMP,dGMP,dTMP,dCMPN6，N6-2m6AN6，N6-二甲基腺嘌呤N,N二甲基鸟嘌呤N6-异戊烯腺嘌呤双氢尿嘧啶4-巯尿嘧啶

稀有碱基tRNA中常见的稀有碱基（二）核苷酸中的戊糖有核糖和脱氧核糖两类核糖核苷酸：β-D-核糖脱氧核糖核苷酸：β-D-2-脱氧核糖

戊糖是核苷酸的另一个基本成分。

戊糖（构成RNA）1´2´3´4´5´核糖(ribose)（构成DNA）脱氧核糖(deoxyribose)H（三）碱基和和戊糖缩合成核苷酸1.

碱基和戊糖缩合成核苷

β-N-糖苷键

2.糖苷键是可以旋转碱基位置存在顺式和反式结构

顺式鸟嘌呤核苷反式鸟嘌呤核苷反式胞嘧啶核苷反式胞嘧啶脱氧核苷核苷酸：AMP,GMP,UMP,CMP脱氧核苷酸：dAMP,dGMP,dTMP,dCMP

核苷（脱氧核苷）和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸（脱氧核苷酸）。

（四）核苷与磷酸以酯键连接成核苷酸

腺嘌呤核苷三磷酸ATP腺嘌呤脱氧核苷一磷酸dAMP环式腺苷一磷酸cAMP环式鸟苷一磷酸cGMP鸟苷四磷酸ppGpp参与构成核酸的主要碱基、核苷及相应的核苷酸的中英文对照RNA碱基base核苷ribonucleoside核苷酸nucleosidemonophosphate（NMP）或ribonucleotide腺嘌呤adenine(A)鸟嘌呤guanine(G)胞嘧啶cytosine(C)尿嘧啶uracil(U)腺苷adenosine鸟苷guanosine胞苷cytidine尿苷uridine腺苷酸(AMP)adenosinemonophosphate٭鸟苷酸(GMP)guanosinemonophosphate胞苷酸(CMP)cytidinemonophosphate尿苷酸(UMP)uridinemonophosphateDNA碱基base脱氧核苷deoxyribonucleoside脱氧核苷酸deoxyribonucleosidemonophosphate（dNMP）或deoxyribonucleotide腺嘌呤adenine(A)鸟嘌呤guanine(G)胞嘧啶cytosine(C)胸腺嘧啶thymine(T)脱氧腺苷deoxyadenosine脱氧鸟苷deoxyguanosine脱氧胞苷deoxycytidine胸苷thymidine脱氧腺苷酸(dAMP)deoxyadenosinemonophosphate٭脱氧鸟苷酸(dGMP)deoxyguanosinemonophosphate脱氧胞苷酸(dCMP)deoxycytidinemonophosphate胸苷酸(dTMP)thymidinemonophosphate二、核苷酸在人体具有除构成核酸外的多种功能

核苷酸是细胞内化学能载体核苷酸可以作为细胞内信号转导信使核苷酸是一些重要辅酶的结构成分核苷酸是重要的药物研究对象

鸟苷酸(GMP)guanosinemonophosphateT胸腺嘧啶DNA纯品:OD260/OD280=1.此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。薄层层析是鉴定氨基酸及其修饰的经典方法C、H、O、N、P（9%~10%）环化核苷酸:cAMP，cGMP核苷酸可以作为细胞内信号转导信使鸟嘌呤(guanine,G)——戊糖(pentose)：核糖，脱氧核糖鸟嘌呤guanine(G)DHU二氢尿嘧啶脱氧胞苷酸(dCMP)deoxycytidinemonophosphateRNA纯品:OD260/OD280=2.泛酸（一种维生素）的成分之一（一）核酸中的碱基分为嘧啶碱和嘌呤碱两类（三）碱基和和戊糖缩合成核苷酸嘌呤(purine)嘧啶(pyrimidine)腺嘌呤adenine(A)体内重要的游离核苷酸及其衍生物含核苷酸的生物活性物质：NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD

等都含有

AMP

多磷酸核苷酸：NMP，NDP，NTP

环化核苷酸:cAMP，cGMPAMPADPATPcAMPNADP+NAD+三、核苷酸的理化性质是其分离鉴定的基础核苷酸一般为白色粉末或结晶状物，平均分子量约为340。溶于水，水溶液呈酸性。不溶于丙酮、乙醇等有机溶剂。（一）核苷酸的紫外吸收特征可用于其定性定量分析1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相当于50μg/ml双链DNA40μg/ml单链DNA（或RNA）20μg/ml寡核苷酸2.判断核酸样品的纯度DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0OD260的应用（二）核苷酸的解离特征可用于其分离纯化核苷酸分子在特定溶液中各基团的解离常数（pK）和等电点（pI）均为特征性常数，这些特性赋予核苷酸以层析和电泳行为的差异，因此被广泛用于核苷酸的分离和纯化。例如，薄层层析、离子交换层析、毛细管电泳等技术都可用于分离和纯化核苷酸。(5)侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸，其侧链分别有苯基、酚基和吲哚基。侧链含芳香环的氨基酸组氨酸HistidineHisH见上7.59苯丙氨酸PhenylalaninePheF5.48酪氨酸TyrosineTyrY5.66色氨酸TryptophanTrpW5.89亚氨基酸脯氨酸ProlineProP6.30几种特殊氨基酸

脯氨酸（亚氨基酸）核酸的化学组成

元素组成C、H、O、N、P（9%~10%）

分子组成——碱基(base)：嘌呤碱，嘧啶碱——戊糖(pentose)：核糖，脱氧核糖——磷酸(phosphate)核酸中存在稀有碱基核酸中还有一些含量甚少的碱基，称为稀有碱基(rarebase)。稀有碱基种类很多，大多数都是甲基化碱基。tRNA中含有较多的稀有碱基，可高达10%。DNARNA嘌呤m7G7-甲基鸟嘌呤N6，N6-2m6AN6，