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文档简介
医学文献检索张晗医学信息系ch1-基础知识ch1-基础知识医学文献检索第一
部分基础知识ch1-基础知识信息、知识、情报、文献信息资源的类型与特征
图书馆文献利用文献检索系统文献检索工具与步骤计算机文献检索
内容提要ch1-基础知识信息、知识、情报与文献
一、信息、知识、情报、文献(一)定义信息(information):是物质存在的一种方式、形态或运动状态,是事物的一种普遍属性。知识(knowledge):是人们在认识和改造客观世界的实践中所获得的认识和经验的总和。是人们对客观事物的本质和规律的认识。情报(intelligence)
:是满足一定需求的、激活了的知识ch1-基础知识信息、知识、情报与文献
文献(literature,document):是记录有知识的一切载体。三要素:内容、标识符号、物质载体记录知识的具体内容;记录知识的手段:如文字、图像、符号、声频、视频等;记录知识的物质载体:如纸张、光盘、录像带等;记录知识的表现形态:如图书、期刊、专利说明书等。ch1-基础知识信息、知识、情报、文献的关系:文献是信息、知识、情报存储、传递、利用的重要方式;知识是系统化、理论化的信息;情报是知识或信息经传递并在一定的时间内起作用的部分。
信息、知识、情报与文献
ch1-基础知识信息资源的类型与特征
(一)按载体的不同,常将文献划分为:1.书写型2.印刷型3.缩微型4.视听型5.电子型(二)按出版类型,又常将文献划分为:1.图书2.期刊3.会议文献4.学位论文5.科技报告6.专利文献7.WHO出版物ch1-基础知识信息资源的类型与特征
期刊论文的组成:文章题目、作者、摘要、关键词、(分类号、)正文(原始论文的正文一般包括前言、材料与方法、结果、分析与讨论、结论、(致谢、))参考文献。参考文献格式(P56):(作者要求列出前六位)*(1)VegaKJ,PinaI,KrevskyB.Hearttransplantationisassociatedwithanincreasedriskforpancreatobiliarydisease.AmInternMed1996Jun1;124(11):980-3(2)…SeminOncol1996;23(1Suppl2):89-97(3)…ClinOrthop1995;(320):110-4ch1-基础知识信息资源的类型与特征
图书的组成普通图书的结构:主要包括封面、封底(常印有图书的书名、责任者、出版者、丛书名)、书脊、书名页、出版说明、前言(序)、目次、附录、后记等参考文献格式(NLM采用的“ANSI标准格式”):*(1)NormanIJ,RedfernSJ,editors.Mentalhealthcareforelderlypeople.NewYork:ChurchillLivingstone;1996(2)书中的章节:PhilipsSJ,WhisnantJP.Hypertensionandstroke.In:LaraghJH,BrennerBM,editors.Hypertension:pathophysiology,diagnosis,andmanagement.2nded.NewYork:RavenPress;1995.p.465-78ch1-基础知识(三)按内容的加工深度分:1.零次文献(ZeroDocument)
零次文献指未经正式发表或未进入学术交流的最原始的文献。
如:实验数据、观测记录、设计草图、调查材料、文章草稿、会议记录等。
特点:内容新颖但不成熟,不公开交流,比较难得信息资源的类型与特征
ch1-基础知识2.一次文献(PrimaryDocument):是指作者以其本人的研究成果(如实验、观察、调查研究等的结果)为基本素材写成的原始创作。
如:专著、专利说明、期刊论文、科技报告、学位论文等。特点:内容先进、叙述具体、数量庞大且分散
信息资源的类型与特征
ch1-基础知识3.二次文献(SecondaryDocument):是将大量无序、分散的一次文献收集、整理、加工、著录其特征,如著者、篇名、分类、主题、出处等,并按一定的顺序加以编排,形成供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式。
如索引、文摘、目录以及其相应的数据库等。特点:汇集性、工具性、综合性、系统性因其具有的检索功能而称之为检索工具或检索系统。信息资源的类型与特征
ch1-基础知识
4.三次文献(TertiaryDocument):是科技人员围绕某一专题,借助于二次文献,在充分研究与利用大量一次文献的基础上,经过阅读、分析、归纳、概括,撰写而成的新的文献。如:综述(Review)、述评(Comment)、进展(Progress、Advance)、现状(Update)、发展趋势(Trend)等期刊文献和百科全书、年鉴、手册等参考工具书。
特点:浓缩性、针对性、参考性、指引性
信息资源的类型与特征
ch1-基础知识文献级别举例ch1-基础知识文献级别举例ch1-基础知识文献级别举例ch1-基础知识
研究活动(实验、观察、思考)
信息的直接记录或传递
零次文献(创造知识的素材)
将知识以文字等形式固化
一次文献(初始的知识产品)
将分散的文献序列化
二次文献(一次文献的替代品)将知识重新组合,使知识序列化
三次文献(浓缩的新的信息产品)ch1-基础知识(三)按内容的公开出版状况划分:白色文献、灰色文献和黑色文献。
1.白色文献:一切公开出版并在社会中公开传播交流的文献,包括图书、报纸、期刊等公开出版物以及网络信息资源。信息资源的类型与特征
ch1-基础知识2.灰色文献:非公开发行的内部文献或限制流通的文献。3.黑色文献:具有密级性质的、非公开出版发行和交流的文献。信息资源的类型与特征
ch1-基础知识二、医学信息资源的特点
1.数量庞大:医学文献占科技文献1/4
2.载体多样化
3.语言障碍增加
4.重复发表、学科交叉与出版分散
5.知识信息更新加快:老化周期5-10年6.时滞问题网络信息资源的类型与特征
ch1-基础知识文献信息的社会功能1.科技文献是科学表现的存在形式,是汇集人类财富的主要场所。2.科技文献是衡量科学技术水平的重要依据。3.科技文献是传播科学知识的最基本、最主要的手段4.科技文献是确认科学发现与技术发明优先权的认证记录。ch1-基础知识一、图书分类《中国图书馆分类法》(简称《中图法》)分为5大部类,22个基本大类,每个大类用一个大写字母表示:图书馆文献利用ch1-基础知识马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论 A 马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论哲学、宗教 B 哲学、宗教社会科学 C 社会科学总论 D 政治、法律 E 军事 F 经济 G 文化、科学、教育、体育 H 语言、文字 I
文学
J 艺术 K 历史、地理图书馆文献利用
ch1-基础知识自然科学 N 自然科学总论 O 数理科学和化学 P 天文学、地球科学 Q 生物科学 R 医药、卫生 S 农业科学 T 工业技术 U 交通运输 V 航空、航天 X 环境科学综合性图书
Z 综合性图书图书馆文献利用
ch1-基础知识医药、卫生大类又细分为以下二级类目:R1预防医学、卫生学 R2中国医学
R3基础医学 R4临床医学
R5内科学 R6外科学R71妇产科学 R72儿科学R73肿瘤学 R74神经病学与精神病学
R75皮肤病学与性病学 R76耳鼻咽喉科学
R77眼科学 R78口腔科学R8特种医学 R9药学图书馆文献利用
ch1-基础知识
R47护理学
R471护理学基础科学
R472护理一般技术
R472.1消毒法和保管法
R472.2护理急救法
R472.3手术室护理操作
R472.4保护具的使用
R472.5架类及沙袋的使用
R472.6隔离技术
R472.9诊疗技术
R472.92泌尿器的处理
R472.99其他诊疗技术
R473专科护理学
R473.1卫生保健护理学
R473.2家庭护理学
R473.3理疗科护理学
R473.5内科护理学
R473.6外科护理学
R473.71妇产科护理学
R473.72儿科护理学
R473.73肿瘤科护理学
R473.74神经病、精神病护理学
R473.75皮肤病、性病护理学
R473.76耳鼻咽喉科护理学
R473.77眼科护理学
R473.78口腔科护理学
R473.82军队护理学ch1-基础知识图书分类的体系结构:R 医药、卫生(第一级类目)R4 临床医学(第二级类目)R47 护理学...(第三级类目)R473 专科护理学(第四级类目)R473.5内科护理学(第五级类目)
R473.52危重病人的监护...
(第六级类目)图书馆文献利用
ch1-基础知识图书分类的体系结构:R 医药、卫生(第一级类目)R5 内科学
(第二级类目)R56 呼吸系及胸部系统疾病...(第三级类目)R563 肺疾病
(第四级类目)R563.1 肺炎
(第五级类目)第三节图书馆文献利用
ch1-基础知识图书《恶性肿瘤化疗方案》
分类号R730.53
索书号R730.53/12ch1-基础知识二、图书馆目录目录:著录一批相关文献,并按照一定次序排列而成的一种揭示与报道文献的工具。图书馆目录通过揭示图书馆馆藏文献的内容来宣传图书,达到辅导阅读的目的。图书馆文献利用
ch1-基础知识三、图书、期刊排架及查找方法
1.排架方法:分类排架法、刊名排架法、固定排架法、代号排架法。排架顺序是同一个书架上从上到下、从左到右排列。2.查找方法:直接到书架上查找;馆藏目录查到索书号书架图书馆文献利用
ch1-基础知识ch1-基础知识可按书名、著者、分类号、主题进行查询联合目录、馆际互借ch1-基础知识文献检索系统文献检索:存储与检索两过程文献检索过程:根据需求,确定检索概念及其范围,选择一定的检索语言或检索途径,在检索工具中查找特定文献资源。ch1-基础知识一、检索语言又称文献存储与检索语言、索引语言、标引语言等是信息检索系统存贮与检索共同遵循的一种专用语言是在文献检索领域中用来描述文献特征和表达信息检索提问的一种专用语言文献检索系统ch1-基础知识文献检索的原理文献中的词——检索词问题:心力衰竭?ch1-基础知识文献检索系统检索语言的分类:规范化语言:对文献检索用语的概念加以人工控制和规范,对同义词、多义词、近义词等进行规范化处理,一个概念仅用一个词表达。艾滋病AIDS获得性免疫缺陷综合征√非规范化语言(自然语言):关键词keyword、文本词textwordch1-基础知识ch1-基础知识ch1-基础知识检索语言的分类:描述文献信息外部特征的检索语言
著者题名刊名出版时间文献类型文献序号引文:参考文献描述文献信息内部特征的检索语言
分类语言主题语言
MedicalSubjectHeadings代码语言文献检索系统ch1-基础知识分类语言ch1-基础知识ch1-基础知识ch1-基础知识二、文献检索途径1.篇名途径 6.关键词途径2.著者途径 7.分类途径3.著者地址 8.序号途径4.刊名途径 9.其它途径5.主题词途径文献检索系统ch1-基础知识主题词:能代表文献内容实质的经过严格规范化的专业名词术语或词组特点:规范性、唯一性、动态性
高血压/治疗关键词:从文献中抽出来的、有实质内容的、未经或略经规范化了的名词术语以及增添的相关概念词,属于自然语言
高血压AND(治疗OR处理)举例:阿司匹林引起的消化性溃疡的治疗主题词途径与关键词途径ch1-基础知识医学主题词表
MedicalSubjectHeadings,MeSHNLM研制的用于标引和检索生物医学文献的受控词表PubMed数据库(Medline;IM)中国生物医学文献数据库(CBM)主要包括3种类型的词汇:主题词headings;descriptors副主题词subheading;qualifiers入口词entrytermch1-基础知识主题词树形结构(类目):大类
Anatomy[A]
Organisms[B]
Diseases[C]
ChemicalsandDrugs[D]
Analytical,DiagnosticandTherapeuticTechniquesandEquipment[E]
PsychiatryandPsychology[F]
PhenomenaandProcesses[G]
DisciplinesandOccupations[H]
Anthropology,Education,SociologyandSocialPhenomena[I]
Technology,Industry,Agriculture[J]
Humanities[K]
InformationScience[L]
NamedGroups[M]
HealthCare[N]
PublicationCharacteristics[V]
Geographicals[Z]ch1-基础知识ch1-基础知识ch1-基础知识副主题词MeSH中83个,中医11个94个11棵词树:/anatomy&histology解剖学和组织学/etiology病因学/analysis分析/chemistry化学/pharmacology药理学/diagnosis诊断ch1-基础知识副主题词/therapy治疗/physiology生理学/statistics&numericaldata统计学和数值数据/organization&administration组织和管理/therapeuticuse治疗应用未进入树状表的12个副主题词ch1-基础知识/anatomy&histology
/解剖学和组织学/bloodsupply/血液供给/cytology/细胞学
/pathology/病理学
/ultrastructure/超微结构/embryology/胚胎学
/abnormalities/畸形/innervation/神经支配ch1-基础知识/etiology/病因学/chemicallyinduced/化学诱导/complications/并发症
/secondary/继发性/congenital/先天性/embryology/胚胎学/genetics/遗传学/immunology/免疫学/microbiology/微生物学
/virology/病毒学/parasitology/寄生虫学/transmission/传播ch1-基础知识/analysis/分析/blood/血液/cerebrospinalfluid/脑脊髓液/urine/尿/isolation&purification/分离和提纯ch1-基础知识/chemistry/化学/analogs&derivatives/类似物和衍生物/chemicalsynthesis/化学合成/Antagonists&inhibitors/拮抗剂和抑制剂/agonists/激动剂ch1-基础知识/pharmacology/药理学/administration&dosage/投药和剂量/diagnosticuse/诊断应用/pharmacokinetics/药代动力学/contraindications/禁忌证/adverseeffects/副作用
/poisoning/中毒
/toxicity/毒性/agonists/激动剂/antagonists&inhibitors/拮抗剂和抑制剂ch1-基础知识/diagnosis/诊断/pathology/病理学/radiography/放射摄影术/radionuclideimaging/放射性核素显像/ultrasonography/超声检查ch1-基础知识/therapy/治疗/diettherapy/膳食疗法/drugtherapy/药物疗法/radiotherapy/放射疗法/surgery/外科学
/transplantation/移植/prevention&control/预防和控制/nursing/护理/rehabilitation/康复ch1-基础知识/physiology/生理学/physiopathology/病理生理学/genetics/遗传学/Growth&development/生长和发育/immunology/免疫学/secretion/分泌/metabolism/代谢
/blood/血液
/cerebrospinalfluid/脑脊髓液
/urine/尿
/biosynthesis/生物合成
/enzymology/酶学
/pharmacokinetics/药代动力学
/dificiency/缺乏ch1-基础知识/statistics&numericaldata
/统计学和数值数据/epidemiology/流行病学
/ethnology/人种学
/mortality/死亡率ch1-基础知识/organization&administration
/组织和管理/economics/经济学/legislation&jurisprudence/立法和法学/supply&distribution/供应和分配/manpower/人力/utilization/利用/standards/标准/trends/发展趋势ch1-基础知识/therapeuticuse/治疗应用/administration&dosage/投药和剂量/adverseeffects/副作用/contraindications/禁忌证/poisoning/中毒ch1-基础知识检索工具的作用:存储、检索、报道检索工具的特点:收录文献的有限性报道文献的时滞性文献标引深度的有限性文献检索工具ch1-基础知识文献检索步骤分析检索课题,明确检索要求选择检索工具,确定检索方法选择检索途径,确定检索标识检索文献获取原始文献例:抗高血压药物的研究进展绿脓杆菌的生物学特性你研究生导师的论文被引多少次?现有数据库:PubMed,BIOSIS,SCI检索途径:主题,著者,文献类型…检索词:主题词,副主题词,关键词,
著者名……检索结果:著者.题目.刊名.年;卷(期):页ch1-基础知识文献检索步骤如何获取原始文献?网络数据库直接下载原文本馆馆藏联合目录/馆际互借
医知网向原文作者索取ch1-基础知识查全率recallsensitive查准率precisionspecific查全率=[检出的相关文献量/文献库内相关文献总量]×100%
查准率
=[检出相关文献量/检出文献总量]×100%
文献检索效果评价ch1-基础知识影响检索效果的因素:1.影响查全率的因素从文献存储来看,主要有:文献库收录文献不全;索引词汇缺乏控制和专指性;词表结构不完整;词间关系模糊或不正确;标引不详;标引前后不一致;标引人员遗漏了原文的重要概念或用词不当。
文献检索效果评价ch1-基础知识从情报检索来看,主要有:检索策略过于简单;选词和进行逻辑组配不当;检索途径和方法太少;检索系统功能不完备,如不具备主题词检索功能等。文献检索效果评价ch1-基础知识2.影响查准率的因素
索引词不能准确描述文献主题和检索要求;选词及词间关系不正确;检索式中使用的组配错误;检索词(或检索式)专指度不够,检索面宽于检索要求;组配规则不严密;标引过于详尽。文献检索效果评价ch1-基础知识计算机文献检索
一、数据库基本知识1.计算机文献检索系统5部分:
计算机硬件计算机软件数据库通讯线路检索终端ch1-基础知识计算机文献检索
一、数据库基本知识2.数据库的类型(1)事实数据库factdatabase
(2)数值数据库numericdatabase
(3)书目数据库(二次文献数据库)bibliographicdatabase
(4)全文数据库full-textdatabase(5)超文本型数据库hypertextdatabasech1-基础知识3.数据库的结构字段记录文档
fieldrecordfile文献数据库中:一篇文献记录篇名、作者、刊名、主题词等字段计算机文献检索
ch1-基础知识字段1字段2字段3记录1记录2记录3文档1文档2文档3数据库数据库结构ch1-基础知识主文档序号:N5序号:N4序号:N3序号:N2序号:N1主题词:S1著者:Au1标题:t1……S1:N1,N3S2:N2,N3S3:N1,N4……Au1:N1,N4Au2:N3Au3:N4……主题词倒排档著者倒排档……主题词检索途径著者检索途径其它检索途径主文档和倒排文档的关系示意图ch1-基础知识二、计算机文献检索类型
光盘检索
网络检索:主要方式计算机文献检索
ch1-基础知识三、计算机文献检索的基本技术1.布尔逻辑检索与(AND)、或(OR)、非(NOT)
AandBAorBAnotB布尔逻辑运算示意图
计算机文献检索
ch1-基础知识逻辑“与”,检索表达式为“AandB”。数据库中同时含有检索同A和B的文献为命中文献;作用是缩小检索范围,提高查准率;例如,查找“胰岛素治疗糖尿病”的文献
胰岛素/治疗应用AND糖尿病/药物治疗ch1-基础知识逻辑“或”,检索表达式为“AorB”。数据库中的文献中含有检索词A或B的文献为命中文献;作用是扩大检索范围;例如,查找“艾滋病”的文献AIDSOR艾滋病OR获得性免疫缺陷综合症ch1-基础知识逻辑“非”,检索表达式为“AnotB”。数据库中凡含有检索词A而不含B的文献为命中文献(注意前后顺序);作用是缩小检索范围,提高查准率;例如,查“高血压的非英文文献”hypertensionNOTenglish[la]ch1-基础知识布尔逻辑运算符的运算次序:()>NOT>AND>OR例:维生素C或维生素E对糖尿病患者肾脏的保护作用(维生素Cor
维生素E)and糖尿病and
肾ch1-基础知识2.截词检索、通配检索截词符*:代表0-N个字符,可以检索词根相同但词尾不同的检索词。例:gene*通配符?
:代表有或无一个字
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