2026年生物信息学常用数据库使用试题含答案

2026年生物信息学常用数据库使用试题含答案一、单选题（每题2分，共20题）1.在NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation）中，用于检索核苷酸序列的主要数据库是？A.PubMedB.GenBankC.ProteinDataBankD.UniProt答案：B解析：GenBank是NCBI的主要核苷酸序列数据库，收录了全球大部分的DNA和RNA序列数据。2.在欧洲分子生物学实验室联合会（EMBL-EBI）中，用于检索蛋白质序列的数据库是？A.EMBLB.UniProtC.PDBD.InterPro答案：B解析：UniProt是EMBL-EBI的核心蛋白质数据库，整合了多个蛋白质信息资源。3.在蛋白质结构研究中，哪个数据库提供三维蛋白质结构信息？A.GenBankB.PDBC.UniProtD.DDBJ答案：B解析：PDB（ProteinDataBank）是国际蛋白质结构数据库，存储了实验测定的蛋白质和核酸结构。4.在DDBJ（DNADataBankofJapan）中，用于检索核酸序列的数据库是？A.PDBB.UniProtC.EMBLD.DNABank答案：D解析：DDBJ的DNABank是其主要核苷酸序列数据库，与GenBank和EMBL并列全球三大核酸数据库。5.在UCSC（UniversityofCalifornia,SantaCruz）基因组浏览器中，哪个数据库提供人类基因组参考序列？A.hg38B.GRCh38C.b38D.Hg19答案：B解析：GRCh38是UCSC当前最新的人类基因组参考版本，广泛用于基因组研究。6.在Ensembl中，用于检索基因组注释信息的数据库是？A.EBIB.GenBankC.VegaD.EnsemblGenes答案：D解析：EnsemblGenes存储了详细的基因组注释信息，包括基因、转录本和蛋白质等。7.在NCBI中，用于检索基因表达谱数据的数据库是？A.GeneExpressionOmnibus(GEO)B.SRAC.PubMedD.dbGAP答案：A解析：GEO是NCBI的基因表达数据存储库，收录了各类转录组数据。8.在SRA（SequenceReadArchive）中，用于检索高通量测序数据的数据库是？A.GEOB.DDBJC.EBID.SRA答案：D解析：SRA是NCBI的高通量测序数据存储库，全球最大的测序数据库之一。9.在GTEx（Genotype-TissueExpression）数据库中，主要研究的是？A.基因组变异B.蛋白质表达C.基因型-组织表达关联D.转录组数据答案：C解析：GTEx研究不同组织中基因组变异与表达的关系，为复杂疾病研究提供数据支持。10.在PrimerBank中，主要提供哪种类型的数据库？A.基因组序列B.引物对数据库C.蛋白质结构D.转录组数据答案：B解析：PrimerBank存储了大量PCR引物对，常用于基因表达分析。二、多选题（每题3分，共10题）1.在NCBI中，哪些数据库与GenBank相关？A.PubMedB.EMBLC.DDBJD.GenBank答案：A、B、C解析：GenBank与PubMed（文献检索）、EMBL（欧洲数据库）和DDBJ（日本数据库）共同构成全球三大核酸数据库。2.在EMBL-EBI中，哪些数据库与蛋白质信息相关？A.UniProtB.PDBC.InterProD.EMBL答案：A、B、C解析：UniProt、PDB和InterPro是EMBL-EBI的核心蛋白质数据库，EMBL主要存储核酸序列。3.在基因组浏览器中，哪些数据库常被整合用于注释？A.EnsemblB.UCSCC.NCBID.Vega答案：A、B、D解析：Ensembl、UCSC和Vega提供基因组注释信息，NCBI主要是数据存储。4.在高通量测序数据管理中，哪些数据库常被用于数据存储和检索？A.GEOB.SRAC.DDBJD.EBI答案：A、B解析：GEO和SRA是主要的高通量测序数据存储库，DDBJ和EBI是核酸数据库。5.在基因功能研究中，哪些数据库提供实验证据？A.OMIMB.GeneCardsC.KEGGD.GO答案：A、B解析：OMIM和GeneCards提供基因功能注释，KEGG和GO偏向通路和本体分析。6.在蛋白质结构预测中，哪些数据库提供模板信息？A.PDBB.CDDC.Swiss-ModelD.ModBase答案：A、C、D解析：PDB提供结构模板，Swiss-Model和ModBase是常用的同源建模数据库。7.在转录组数据分析中，哪些数据库提供参考基因组？A.GRCh38B.hg38C.mm10D.GRCm38答案：A、B、C、D解析：这些都是常用的参考基因组版本，分别对应人类、小鼠等物种。8.在变异检测中，哪些数据库提供临床注释？A.ClinVarB.dbSNPC.LOVDD.VCF答案：A、C解析：ClinVar和LOVD提供变异的临床意义注释，dbSNP和VCF是变异格式和数据库。9.在系统发育研究中，哪些数据库提供物种树信息？A.NCBITaxonomyB.TreeBASEC.PhylomaticD.NCBIGenBank答案：A、B、C解析：NCBITaxonomy提供物种分类，TreeBASE和Phylomatic提供系统发育树。10.在药物研发中，哪些数据库提供靶点信息？A.DrugBankB.STITCHC.SwissTargetPredictionD.ChEMBL答案：A、C解析：DrugBank和SwissTargetPrediction提供药物靶点信息，STITCH和ChEMBL偏向药物-蛋白质相互作用。三、判断题（每题2分，共10题）1.GenBank是NCBI的主要核苷酸序列数据库，与EMBL和DDBJ并列全球三大核酸数据库。（正确）2.PDB数据库只存储蛋白质结构，不包含核酸结构。（错误）3.GEO数据库是EMBL-EBI的一部分，用于存储基因表达数据。（错误，GEO是NCBI的数据库）4.GTEx数据库主要研究人类不同组织中的基因表达模式。（正确）5.PrimerBank是NCBI的数据库，提供大量PCR引物对。（正确）6.UniProt是EMBL-EBI的核心蛋白质数据库，整合了蛋白质序列、结构和功能信息。（正确）7.SRA数据库是DDBJ的主要测序数据存储库。（错误，SRA是NCBI的数据库）8.KEGG数据库主要提供通路信息，不包含基因组数据。（错误，KEGG包含基因组注释）9.Swiss-Model是用于蛋白质结构预测的数据库，提供同源建模模板。（正确）10.ClinVar数据库提供变异的临床意义注释，不包含实验数据。（错误，ClinVar包含实验验证数据）四、简答题（每题5分，共4题）1.简述NCBI和EMBL-EBI在生物信息学中的主要区别。答案：-NCBI（美国）主要数据库包括GenBank（核酸）、GEO（基因表达）、SRA（测序数据）等，提供全面的生物数据检索和分析工具。-EMBL-EBI（欧洲）主要数据库包括EMBL（核酸）、UniProt（蛋白质）、PDB（蛋白质结构）等，更侧重于蛋白质和结构数据整合。解析：两者都是全球三大核酸数据库之一，但NCBI数据更全面，EMBL-EBI在蛋白质领域更突出。2.简述GEO数据库在转录组数据分析中的作用。答案：-GEO存储大量转录组数据（如RNA-Seq），支持用户上传和检索实验数据。-提供数据关联分析工具（如GEO2R），帮助比较不同样本的表达差异。解析：GEO是转录组研究的核心数据平台，支持标准化数据管理和分析。3.简述PDB数据库在蛋白质结构研究中的应用。答案：-存储实验测定的蛋白质和核酸三维结构，为结构生物学提供基础数据。-支持结构比对、功能预测和药物设计等研究。解析：PDB是结构生物学的核心数据库，广泛应用于结构功能关系研究。4.简述ClinVar数据库在遗传病研究中的作用。答案：-收集和注释基因变异的临床意义，整合实验验证数据。-帮助医生和研究人员评估变异致病性，支持遗传咨询。解析：ClinVar是遗传变异临床解读的重要工具，为遗传病诊断提供依据。五、操作题（每题10分，共2题）1.假设你需要检索人类基因HLA-B的序列，请说明在NCBIGenBank中如何操作。答案：-访问NCBI网站（）。-在搜索框输入“HLA-B”或“NM_000524.4”（基因ID）。-选择“Nucleotide”数据库进行检索。-查看结果，下载序列或查看注释信息。解析：GenBank检索需明确基因名称或ID，选择核酸数据库。2.假设你需要下载人类基因组GRCh38的参考序列，请说明在UCSCGenomeBrowser中如何操作。答案：-访问UCSCGenomeBrowser（）。-选择“Human”作为物种，选择“GRCh38”作为版本。-点击“Download”或“TableBrowser”选择下载区域（如chr1）。-选择FASTA格式下载序列。解析：UCSC提供多种基因组版本，下载需明确物种和版本。六、论述题（每题15分，共2题）1.论述GEO数据库在系统发育研究中的应用价值。答案：-GEO存储大量转录组数据，支持物种间基因表达模式比较。-可通过GEO2R等工具分析表达差异，推断进化关系。-结合系统发育树软件（如R