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文档简介
1、专题五 DNA和蛋白质技术,课题1 DNA的粗提取与鉴定课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片断课题3 血红蛋白的提取和分离,课题1 DNA的粗提取与鉴定,一、提取DNA的方法,1、提取生物大分子的基本思路 (1) 选用一定的_或_方法分离具有 不同物理或化学性质的生物大分子。 (2) DNA的粗提取就是利用DNA与_、_和_等在物理或化学性质方面的差异,提取DNA,去除其他成分。,物理,化学,RNA,蛋白质,脂质,(1)利用DNA的溶解性 DNA的溶解度,2、提取DNA分子的基本原理, DNA不_酒精溶液,但是细胞中的某些蛋白质则_酒精。利用这一原理,可将DNA与蛋白质进一步分离。,溶于,溶于,
2、蛋白酶能水解蛋白质,但对_没有影响。 大多数蛋白质不能忍受_的高温,而 DNA在80以上才会变性。 洗涤剂能够瓦解_,但对_没 有影响。,温度,洗涤剂,DNA,60-80,细胞膜,DNA,(2)利用DNA和蛋白质对酶、_和_的耐受性不同,(3)DNA的鉴定: DNA在沸水浴的条件下,遇_反应会 呈现_,二苯胺,蓝色,二、DNA的粗提取与鉴定的实验设计,(一)实验材料的选取,材料:新鲜的鸡血,注意: 本实验中,要往鸡血中加入抗凝剂(柠檬酸钠溶液),原则上只要含DNA的生物材料都可以,但是选取DNA含量相对较高的生物组织,成功率更大。,(1)先将新鲜的鸡血离心,获得鸡血细胞 (2)在鸡血细胞中加入
3、一定量的蒸馏水,同时用玻璃棒搅 拌,过滤后收集滤液即可,(二)破碎细胞,获取含DNA的滤液,1、破碎细胞,讨论:为什么加入蒸馏水能使鸡血细胞破裂? 利用了什么原理?,2、过滤,获取含DNA的滤液,(三)去除滤液中的杂质,讨论:为什么反复地溶解与析出DNA,能够去除杂质,答:用高盐浓度的溶液溶解DNA,能除去在高盐中不能溶解的杂质;用低盐浓度使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。因此,通过反复溶解与析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质,讨论:方案二与方案三的原理有什么不同?,方案二是利用蛋白酶分解杂质蛋白,从而使提取的DNA与蛋白质分开; 方案三利用的是DNA和蛋白质对高温耐
4、受性的不同,从而使蛋白质变性,与DNA分离 方案二利用了酶的专一性;方案三利用了DNA的稳定性。,(四) DNA的析出与鉴定,DNA的析出用的是与滤液体积相等的冷却的酒精溶液(体积分数为95),静置2-3min,溶液中会出现白色丝状物,这就是粗提取DNA。用玻璃棒沿一个方向搅拌,卷起丝状物,并用滤纸吸取上面的水,1、DNA的析出,A:2mol/L 的NaCl溶液5ml + DNA丝状物 + 二苯胺试剂4ml B:2mol/L 的NaCl溶液5ml + 二苯胺试剂4ml 混合均匀后,将试管置于沸水中加热5min,待试管冷却后,比较两只试管中溶液颜色的变化,看看溶解有DNA的溶液是否有蓝色,2、D
5、NA的鉴定,以鸡血为实验材料进行DNA的粗提取,鸡血细胞极易吸水胀破,而用动物肝脏细胞作实验材料常常需要匀浆和离心,对设备要求较高,操作繁琐,历时较长,1、鸡血细胞做实验材料的原因,鸡血细胞核的DNA含量丰富,材料易得,2、实验原理, DNA在NaCl溶液中的溶解度,是随着NaCl的浓度的变化而改变的。当NaCl的物质的量浓度为0.14 molL时,DNA的溶解度最低。利用这一原理,可以使溶解在NaCl溶液中的DNA析出。, DNA不溶于酒精溶液,但是细胞中的某些蛋白质可以溶于酒精溶液。利用这一原理,可以进一步提取出含杂质较少的DNA。, DNA遇二苯胺(沸水浴)会染成蓝色,因此,二苯胺可以作
6、为鉴定DNA的试剂。,实验材料和用具,实验材料: 1、鸡血细胞液(510ml); 2、体积分数为95%的冷酒精溶液(实验前置于冰箱内冷却24h); 3、蒸馏水; 4、质量浓度为0.1g/ml的柠檬酸钠溶液(抗凝剂) 5、物质的量浓度分别为2mol/L和0015mol/L的NaCl溶液; 6、二苯胺试剂,答:因为DNA不溶于冷酒精,而其他物质可以溶解在酒精中,使含杂质较少的DNA丝状物可以析出,悬浮于溶液中,讨论:,(2)观察丝状物呈什么颜色?,答:白色,(1)为什么要加50mL的冷酒精?,答:有丝状物的试管变成蓝色,另一试管还是原来颜色,(4)这一鉴定结果说明什么问题?,(3)比较两个试管中溶
7、液的颜色有什么不同?,答:提取出的丝状物是DNA,(5) DNA的直径约为2010-10 m,实验中出现的丝状物的粗细是否表示1个DNA分子直径的大小?,答: DNA分子直径只有2 nm。丝状物是多个DNA子聚在一起形成的,答:整个实验共“两次蒸馏水,三次过滤,六次搅拌”,总结:,两次蒸馏水,第一次:使鸡血细胞吸水胀破,提取核DNA 第二次:稀释NaCl溶液,使DNA黏稠物析出,(1)此实验过程中有几次使用蒸馏水?几次过滤,几次搅拌?,三次过滤,第一次: 过滤核外物质,除去不溶的杂质 第二次: 过滤除DNA的其他核内物质,尤其是蛋白质 第三次: 过滤含DNA的NaCl溶液,得到滤液,六次搅拌:
8、,DNA的溶解,均匀稀释以析出更多DNA,DNA的溶解,含杂质较少的DNA,DNA的溶解,观察你提取的DNA颜色,如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多;二苯胺鉴定出现蓝色说明实验基本成功,如果不呈现蓝色,可能所提取的DNA含量低,或是实验操作中出现错误,需要重新制备,四、课题成果评价,(一)是否提取出了DNA,本实验提取的DNA粗制品有可能仍然含有核蛋白、多糖等杂质,(二)分析DNA中的杂质,课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片断,DNA分子的结构,C、H、O、N、P,1.元素组成:,脱氧核苷酸,2.基本单位:,3.DNA分子的双螺旋结构,(1)DNA分子是由 的(脱氧核苷酸长链盘旋而成的
9、规则 结构。,(2) 与 交替连结,排列在外侧,构成基本骨架; 排列在链的内侧。,(3)两条链上的碱基通过 连结起来,形成碱基对。碱基对的组成有特定的规律:即腺嘌呤一定与 配对, 一定同胞嘧啶配对。,双螺旋,两条反向平行,脱氧核糖,磷酸,碱基,氢键,胸腺嘧啶,鸟嘌呤,4.DNA的复制,b.时期,有丝分裂间期减数第一次分裂前的间期。,c.场所,细胞核(主要)、线粒体、叶绿体。,a.概念,由一个DNA形成两个完全相同的DNA的过程。,d.基本条件,酶:解旋酶、DNA聚合酶 能量:ATP 原料:四种脱氧核苷酸 模板:DNA的两条链,一、PCR技术,是一种体外迅速扩增DNA片段的技术。能以极少量的DN
10、A为模板,在几小时内复制出上百万份的DNA拷贝。,(1) 3端和5端:为了明确地表示DNA的方向,通常将DNA的羟基(OH)末端称为_,而含_的末端称为_;一个双链DNA分子中含两个3端和两个5端,如果一条链的方向是_,则另一条链的方向就是_,这就是反向平行的含义。,3端,5端,磷酸基团,53,35,1、PCR扩增方向,(2) DNA分子中相邻两个脱氧核苷酸残基通过 _相连,该化学键是由一分子脱氧核苷 酸中3号碳原子上的羟基(OH),与相邻的另一分子脱氧核苷酸中5号碳原子上的磷酸基团脱水聚合而成。所以DNA的合成方向总是从子链的_向_延伸。,35磷酸二酯键,5端,3端,2、PCR技术原理 (1
11、)PCR: DNA分子在一定条件下可以进行 _复制。,(2)DNA的热变性原理: 在_的温度范围内,DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为_;当温度缓慢下降后,两条被分离的DNA链又会重新结合成双链,这个过程称为_。,体外,80-100,变性,复性,二、PCR的反应过程,DNA模板,与模板DNA两条链相结合的两种引物,1、反应条件,稳定的缓冲液环境,四种脱氧核苷酸,耐热的DNA聚合酶,严格控制温度变化的控温设备,第一步:变性(90-95),2、反应过程,3、结果(P60页图5-9复制结果),(1)PCR的每一轮循环包括变性、复性和延伸三步,从第二轮循环开始,每次循环的产物也做模板参与
12、反应,并且由引物延伸而成的DNA单链会与引物结合,进行DNA的延伸。这样,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的DNA序列呈_。,指数扩增,(2)PCR一般要经历三十多次循环,处于两引物间固定长度的序列数目约为_。,230,1、PCR仪,(一).设备及用具,实质上一台能够自动调控温度的仪器。,三、PCR的实验操作,2、微量离心管,一种薄壁塑料管,总容积为0.5ml,3、微量移液器,用于定量转移PCR配方中的液体,其上的一次性吸液枪头用一次更换一次。,1.准备,2.移液,(二)实验操作步骤,按照PCR反应体系的配方将所需用的试剂摆放在实验桌上。,用微量移液器按照
13、PCR反应体系配方往微量离心管里面加入各种试剂。,混合后盖严微量离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁。,3.混合,(1)过程:将微量离心管放在离心机上,离 心约10s。,4.离心,(2)离心目的:使反应液体集中在离心管底部,提高反应效果。,将离心管放入PCR仪上,设置好PCR仪的循环程序。,5.反应,PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤变性、复性和延伸.,PCR技术高度灵敏,为了避免外源DNA等因素的污染而造成干扰实验,PCR操作时要注意做到:,6.注意事项,(1)隔离操作区,所用微量离心管、枪头、缓 冲液以及蒸馏水等在使用必须进行高压灭菌;,(2)分装试剂,简化操作程序,使
14、用一次性枪 头,(一)、理论上DNA扩增数目的计算,三、课题成果评价,1.一条DNA,复制n次,DNA为2n,2.a条DNA,复制n次,DNA为a2n,(二)、实验中DNA含量的测定,1.原理,可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果,DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关。,2.过程,(1)稀释,2uLPCR反应液,加入98uL蒸馏水,即将样品进行50倍稀释.,以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零。,取DNA稀释液100uL至比色杯中,测定260nm处的光吸收值,DNA含量(g)50(260nm的读数)稀释倍数,50:在
15、标准厚度为1cm比色杯中,OD260为1相当于50g/mL的双链DNA分子,(2)对照调零,(3)计算,(4)计算,光吸收,波长nm,260,240,220,280,0.1,0.2,比色杯,课题3 血红蛋白的提取和分离,一、分离蛋白质的基本方法原理,1、凝胶色谱法(分配色谱法):,a .凝胶:,一些微小多孔的球体(内含许多贯穿的通道,由多糖类构成如葡聚糖、琼脂糖,具多孔的凝胶就叫分子筛),b.概念:根据相对分子质量的大小分离蛋白质的 有效方法,利用具有网状结构的凝胶的分子筛作 用来进行分离。,大于,凝胶外部,快,小于,慢,2、 缓冲溶液的作用和组成:,(1)作用:能够抵制_的对溶液_ 的影响,
16、维持pH基本不变。,外界的酸或碱,pH值,(2)缓冲溶液的配制,通常由_种缓冲剂溶解于水中配制而成。调 节缓冲剂的_就可以制得_ 使用的缓冲液。,1-2,比例,在不同pH范围内,思考:在血红蛋白整个实验室中用的缓冲液是什么?它的目的是什么?,使用的是磷酸缓冲液,目的是利用缓冲液模拟细胞内的pH环境,保证血红蛋白的正常结构和功能,便于观察红色和材料的科学研究活性。,在同一电场下,由于各种分子带电性质(正电荷或负电荷)的差异及分子本身大小、形状的不同,而使带电粒子产生不同的迁移速度,从而实现样品中各种分子的分离。,(2)原理:,(1)概念:带电粒子在电场的作用下发生迁移的过程,3、电泳:,(3)常
17、见方法,琼脂糖凝胶电泳 聚丙稀酰胺凝胶电泳,二 、粗提取血红蛋白,蛋白质的提取和分离一般分为四步:,血液,血浆,血细胞,白细胞,血小板,红细胞 (最多),血红蛋白,两个a肽链,两个一肽链,样品处理粗分离纯化纯度鉴定,(1)目的:去除_,1、红细胞的洗涤,杂质蛋白,(2)方法:,采集血样:为防止血液凝固,需在采血器中加入 抗凝血剂柠檬酸钠,低速短时间离心:500 r/min,离心2min,这样做的目的是防止红细胞与白细胞一同沉淀,达不到分离效果,吸去血浆:用胶头吸管吸去上层黄色血浆,:直至上清液中没有黄色,表明红细胞已经洗涤干净,否则需重复洗涤,生理盐水洗涤:向盛有暗红色红细胞液体的烧杯中加入五
18、倍体积的生理盐水,缓缓搅拌10min,低速短时间离心,重复步骤3次:直至上清液中没有黄色,表明红细胞已经洗涤干净,否则需重复洗涤,(1)方法:加_到原血液体积,再加40体 积的甲苯,置于磁力搅拌器上充分搅拌10分钟。,(2)目的:使红细胞吸水_,血红蛋白释放出来。,涨破,蒸馏水,2、血红蛋白的释放,(3)原理:渗透作用,3、分离血红蛋白溶液:将搅拌好混合液转移到离心管内,以2000r/min的速度离心10 min ,试管中的溶液分为4层:,第1层 无色透明甲苯层,第2层 脂溶性物质沉淀层,白色薄层固体,第3层 红色透明液体(血红蛋白水溶液),第4层 其他杂质的暗红色沉淀,4、透析,(1)原理:_能使小分子自由进出,而将大分子保留在袋内。 (2)过程:取1mL的血红蛋白溶液装入透析袋中,将透析袋放入盛有300 mL的物质的量浓度为20 mmol/L的磷酸缓冲液中(pH为7.0),透析12
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