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文档简介
1、实验六、 植物组织DNA的提取,王欢欢 二零一二.十,转基因作为一个外源DNA序列,在植物基因组中的整合方式如何?整合后的转基因结构和拷贝数是否变化?,转基因导入植物细胞后,通过细胞分裂时遗传物质的复制过程整合到核基因组中。转基因在寄主染色体内的整合位点是随机的,外源DNA可以插入植物基因组的任何一条染色体,也可以插入一条染色体上的任何位点,但在转录活跃区具有优先插入特性。,核DNA分子呈极不对称的线状结构,对任何机械力的作用都十分敏感,在分离纯化过程中,DNA分子的降解很难避免,因而,我们分离得到的只不过是植物核DAN分子的片段。 总DNA提取不必分离细胞核及细胞器,用温和的方法使细胞破碎后
2、,核蛋白体自然释放出来。,2CTAB法提取植物组织DNA,DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的,因此提取出脱氧核糖核蛋白复合物后,必须将其中蛋白质去除。 CTAB(Cetyltrimethyl ammonium-bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜并能与核酸形成复合物,该复合物在高盐溶液是可溶的(0.7mol/L NaCl )。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。 CTAB法最大优点是通过高盐缓冲液的选择性沉淀能很好去除糖类杂质。 二价离子螯合剂EDTA可消除外源及内源的DNase活性。 SDS法:利用高
3、浓度SDS,较高温度裂解细胞,是染色体离析,蛋白变性,释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的作法使蛋白质及多糖杂质沉淀。操作温和简单,但所得产物糖类杂质较多。,2CTAB法,100 mM TrisCl (pH 8.0) 20 mM EDTA 1.4 M NaCl 2% (w/v) CTAB * 1% (w/v) PVP * 使用前加0. 2 % 巯基乙醇,PVP:聚乙烯吡咯烷酮。防止褐化 巯基乙醇:在DNA提取过程中防止细胞内物质发生褐变对实验结果产生影响。其主要作用是降低氧对细胞产生的氧化损伤。,植物总DNA提取时如何使植物细胞壁有效破碎的同时尽量保持DNA的完整? 冷冻干燥的材料容易粉碎 冷冻干燥下DNase活力极低,研磨不会引起DNA降解。冷冻干燥的材料在脱水状态下储存几年DNA不会有明显变化。,2 CTAB法提取烟草叶片DNA,期间轻柔混匀几次,有必要可以重复一次,DNA琼脂糖电泳(1%),DNA提取注意事项,植物材料表面如有杂质要擦拭干净,水分要用滤纸吸干,否则液氮速冻会形成冰晶而妨碍研磨。 研钵加液氮前必须干燥,并先用液氮预冷 研磨要充分,至叶片粉末接近白色 研磨样品尚未解冻时添加提取Buffer,尽量减少暴露空气的时间,如果融化,内源DNase会引起DNA降解。 除研磨之外所有的抽提操作要温柔,DNA容易断裂 65水浴结束后,
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