医学ppt课件数据库查询系列讲座

数据库查询系列讲座 主讲：刘春华 外文医学信息检索 MEDLINE数据库 v MEDLINE是美国国立医学图书馆 (The National Library of Medicine, 简称 NLM)生产的国际性综合生 物医学信息题录型数据库，是当前国际上最有权威 的生物医学文献数据库。内容包括 美国医学索引 （ Index Medicus, IM） 的全部内容和牙科文献 索引（ Index to Dental Literature）、 国际护理 索引（ International Nursing Index） 的部分内容 ， 涉及 基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生 、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学 、社会医学 等领域 。 概况 收录范围 vMedline数据库收录了 1966年以来世界上 70 多个国家和地区出版的生物医学及其相关学 科期刊 4000多种，涉及 43个语种，其中 80% 为英文刊物，大多数有英文文摘。该库每月 以 3万条记录的进度更新，每年增加的文献量 约 36万条。 v该数据库包含四十多种中文 (含台湾）医学杂 志，如 中华系列杂志等。 一 数据库的库结构 MEDLINE光盘数据库的记录由 26个字段组成。其中 限制性字段 11个，常用的有： CP（ 出版国）、 ISSN （ 国际标准刊号）、 LA（ 语种）、 PT(出版物类型 ） 、 PY（ 出版年）。 例如：若特指在限制性字段检索文献，输入的检索词必须加 以限定。 如： English in la 或 la=English； 健入一个检索词时，将在所有非限制字段内检索，如果在检 索词后加上字段代码，可将检索字段限制在某个字段内。 检 索式则只能是： Johnson in au 二 MEDLINE光盘的运算符 布尔逻辑运算符 逻辑与（ AND)： A AND B 目的： 缩小检索范围，提高查准率 逻辑或（ OR）： A OR B 目的： 扩大检索范围，增加命中文献率 逻辑非（ NOT)： A NOT B 目的：缩小检索范围 A B A B A B 截词符 所谓截词，就是以符号取代检索词中部分字母。有 左截断、中间截断和右截断。 如： physic*可检出的词汇有： physic,physical,physician,physicians,physicis t,physicists 可以看出，截词检索具有 “ OR” 的运算特性。 中间截断： m?n； wom?n 左截断： “* mycin” 可检出 Garamycin ,Karamycin 等。 目的：用截词符可以解决检索词拼法及单负数形式不同造成 的漏检。 位置算符 v用于表示检索词间的相邻位置关系。 vNEAR： 表示检索词在同一句子中，次序可 以颠倒。（ A NEAR B) vNEAR后加正整数 N： 表示检索词之间最多可 插入 N-1个词。 (A NEAR6 B) vWITH： 表示检索词存在于同一字段中，如： 篇名、摘要等，次序可以颠倒。 （ A WITH B) 范围算符 v 1.时间及内容限定： 表示对检索结果进行时间或内容 的限定，有 “=” 、 “=” 、 “” 、 “=1998” 表示检索 1998年以来的文献。 “ PY=2002” 表示检索 2002年发表的文献。 “ TA=中华内科学杂志 ” 表示查找刊名为 “ 中华内 科学 杂志 ” 上的所有文献。 目的：利用范围算符可以缩小检索范围。 v 2.字段限定 ：表示将检索限制在某一个字段内。 如： 高血压 IN 主题词 三 数据库检索系统 主要检索界面 启动 WinSpirs 软件后，点击 start， 然后 在数据库中选择年份，继续点击 OK， 系 统显示 WinSpirs 主要检索屏幕。 主要检索屏幕分检索区、检索史区、检出 记录区和工具拦。工具拦上的按钮是 NEDLINE最常用的检索指令。 点击 选择 数据库 WinSpirs主要检索界面 菜单栏 工具栏 检索区 检索历史窗口 检索结果区 四 基本操作及检索 基本检索 （ 1）选择数据库 检索前，需要先确定 数据库检索年限，点击 “Add”按钮，所选数据库 进入空白处，然后再点击 “ OK” 按钮，检索就在所选 数据库中进行 。 (2) 自由词检索 v 数据库默认的是自由词检索。操作时直接在 “search” 框内输入检索词或检索式，点击 “search”或 “回车 ”， 即开始检索。 在 Search状态下 ,检索式可以是以下几种形式 : 任意的字母或数字，如 : ac,28, etc. 任意单词或词组 ;如 : cancer, vitamin A 连缀词组 ;如 : liver-neoplasms， lung-disease 词根 (截词 ): computer* 以前的检索式，如 : #3 逻辑检索式，如 : child and nutrition 输入 “针刺镇 痛 ”后，点击 “search” 检索 结果 检索 结果 Thesaurus v 检索时，首先点击 “Thesaurus”按钮，在输入框中输 入检索词后，再点击 “Look up”按钮，出现以该词开 始的轮排索引。 v 双击所选的词或点击 “TERM INFORMATION”则出 现选定词详解，根据注释、相关参照及树状结构等 信息确定所选词是否合适，如果合适再选择 “Single Term”进行单个主题词检索，或 “Explode”进行该主 题及下位词的扩展检索。 v 最后点击 “Search Now”进入副主题词选择界面，从左边的 “choose from these subheadings”框中选入到右边的 “Use these Subheadings”框中，点击 “OK”， 即开始检索。 点击 在输入框中输入 检索词 “kidney cancer”后点击 “Look Up”按钮 轮排索引 点击该词或按钮 注释、相关参照 树状结构号 单个主题词， 缩小检索范围 扩展检索 扩大检索范围 进入副主题词界面 选择 合适 的 副主题词 索引词表辅助检索 v检索时，单击 “Index”按钮，在输入框内输入 检索词，屏幕显示输入词所在的索引片段， 然后选择需要的检索词，最后单击 “Search” 按钮。也可从 Index索引中连续选词，单击 “Search”健，系统会将选中的所有词分别检 索一遍，最后用 “or”把检索结果合并。 v 用索引词检索首先可以检查词的拼写，其次可以根 据索引表查到与输入词词根相同的同义词等。 点击按钮 所有的 索引词 输入检索词，点击 Search 文 献 记 录数 频次 五 检索史区 六 辅助按钮 vLimit 进行限制检索。 vSuggest 提示规范化的主题词及与该主题词有关 的其它相关词。 v Retype 可将其中某个检索式直接粘贴到 Search检 索框内，以便重新检索或修改后检索，免去重复输 词的麻烦。 v Clear 可删除不必要的检索式。 v Show 在检出记录区显示所选检索式的检出结果 。 点击 “Limit”按钮 出现 11个限制字段 可供参考的主题词， 选择后点击 “search” 或 “explode” 选择合适 的副主题 词 vAll Fields 显示记录的全部字段 vFull Screen 全屏显示文献记录 vNext Hit 阅读浏览过程中的前进 vPrevious Hit 阅览过程中的后退 vAdd to Search 在浏览阅读记录时，若对文中 的某一词语或某一术语感兴趣，用光标加亮 该术语，点击 “ Add to Search” ， 则此词会 自动进入 Search检索框内，再点击 Search指 令，系统即对该词进行检索。 七 检索结果的输出 套录（ Download) 工具条中的 Download按钮提供套录功 能，系统能将检索结果存入软盘。 首先点击 Download按钮，出现套录记录 的对话框 Download Records。 在 Download Records中可作各种参数设置 。 选中要存盘的记录，点击 Download 打印 （ Print） v工具栏中的 Print 按钮提供打印功能。但只 对最后一次检出的记录进行打印，若要打印 前面的检索结果，则必须点击以前的检索式 ，使其显示，方可进行打印。 八 检索策略 1、 分析课题，确定主题词 2、 用医学主题词表或 Thesaurus将概念词 规范化 为主题词 3.不能转化为主题词的概念词作为 自由词 检索； 4.将主题词、自由词运用 逻辑运算符 组合进行 检索，发挥主题词的查准性和自由词的查全 特性。 举例 “呼吸机在慢性阻塞性肺疾病辅助治疗中的应用 ” （ 1996-2000） 分析： 1.慢性阻塞型肺疾病也称慢阻肺，其英文表达形式有： Chronic obstructive pulmonary disease ； pulmonary disease, Chronic obstructive ； COPD等。 MeSH词表中的规范主题词为 “lung disease, obstructive”。 2.慢性用自由词 chronic组配。辅助治疗一般包括治疗和药物治 疗，宜选副主题词 therapy， drug therapy。 3.呼吸机可用 ventilators mechanical主题的扩展检索。 网上外文医学信息检索 PubMed /pubmed 概况 vPubMed是美国国立医学图书馆 (NLM)附属国 立生物技术 信息中心 （ NCBI)研制开发的用 于检索 MEDLINE等数据库的网上检索系统， 免费提供医学、护理学、牙科学、兽医学等 领域的文献信息。收录了 1953年 以来的 70多 个国家， 40多个语种，近 4600种生物医学期 刊的文献，至今已有书目文摘条目 1400万余 条。 一 PubMed的特点 v1. 广泛的链接：任何一个界面都有许多链接。 （ 相关资源链接、功能链接、检索结果显示链接等） v2. 收录更加广泛： MEDLINE数据库、生命科 学方面的期刊论文。 v3. 更新及时：每周增添新的内容。 v4. 提供检索词自动转换功能：能够自动实现检 索词的匹配与转换。 二 基本检索界面 1 检索方法 v 在输入框内输入检索词，点 Go按钮或按回车 v 检索词的输入形式： 输入单 词或短语或表达式，也可用 *及 “ ” 如， aspirin； stomach ulcer ligustrazine AND pharmacology asthma Kamada A 或 asthma, Kamada A computer * 著者姓名： weng xz、 “ weng xz ”au 刊名标题：刊名全称、缩写、 ISSN Journal of leukocyte biology、 J leukoc biol、 0741-5400 1.由于 PubMed 具有词汇自动转换匹配功能，对用户的输词要 求不十分严格，只要具有实质性意义的词，一般不需要强调 该词是关键词、主题词、人名、还是期刊名等。 如 ： 检索 A. Kamada发表的有关哮喘的文献。 在检索框内输入检索词： asthma kamada a 2.短语检索：在检索词上加上双引号 “”， PubMed将不执行自动 转换，而将其作为特定的短语进行检索。 “tumor gene therapy” 3.如果用字段限定， 逻辑 运算符一定要大写， 缩 写字段名置于 检 索 词 后的方括号中。 检索式： arthritis mh AND 2000:2003 dp 特别提示 2 显示检索结果 PubMed检索结果界面设有不同的选项， 可显示特定的记录和记录的不同格式。 Display : summary(题录）、 abstract(摘 要） 等 Show: 5-500条题录 Sort： （ Author、 Journal、 Pub Date） 排序 Send to: Text(Files、 Clipboard、 E-mail、 Order) 存盘或打印 三 检索功能按钮及其应用方法 v1、 Limits 点击 Limits按钮，即进入 Limits界面 。可通过浏览选择字段、出版物类型、年龄组、语 种、时间范围、研究对象、数据库子集等下拉菜单 ，根据需要选取有关项目对检索结果进入限定，即 可缩小检索范围，提高查准率。 v 例如：查找 从 1995年 1月到 2001年 12月 ， PubMed中收录的有关 高血压 的 英语语种 的 综述 性 文献。 v2、 Preview/Index ： 点击该按钮，进入 preview/Index界 面。 v 方法 A： 选择字段，输入检索词，点击需要的逻辑运算符。 并以 检索式方式 出现在上方检索区输入框中。点击 输入框中右侧之 “Preview”， 可显示命中的文献数； 点击 “go”,将直接显示命中文献记录。 还可通过 ”Detail”按钮查看经过转换后的检索策略 满意 存盘或打印 不满意 重新检索 逻辑运 算符 v 方法 B： 选择字段，输入检索词，通过 “Index”功能健进行该 字段检索内容的选择，点击需要的逻辑运算符。 3 其它功能按钮 v检索史 （ History):可查看检索策略和检索结果， 包括每次检索的序号、检索式、检索时间及检出文 献数目。 v 剪贴板 （ Clipboard)： 可将一次检索的多个检索结 果存放，以便集中下载。最多保存 500条记录，保 存时间 8小时。 v 检索策略 （ Detail):点击该健可以详细地了解本次检 索的细节，可根据需要进行健所策略的修改、编辑 和保存。 检索史 四 Mesh Database （ 医学主题词浏览器） v 点击 PubMed主界面左边工具栏中的 Mesh Database 则进入该界面。 v 在 Mesh Database 的检索框内输入检索词，如 “Kidney Cancer”,然后点击 Go按钮，系统自动将该词转换为对应的 主题词，除了出现规范性主题词 “Kidney Neoplasms”外， 还提示多个相关入口词的选择，如 Kidney ancer, Kidney Cancers等。点击主题词 “Kidney Neoplasms”链接，可展 开该词的全部副主题词，同样将其 “Send to ”至 Search Box,最后点击 “Search PubMed”获得检索结果。 副主题词 在树状结构 中的位置 五 全文的获取