出生缺陷家系对照病例遗传资源采集规范

1、 出生缺陷家系对照病例遗传资源采集规范完成人： 邓 莹朱 军完成单位： 中国出生缺陷监测中心版 本 号： 2008-01完成时间：2008年10月出生缺陷家系对照病例遗传资源采集规范第一章 总则1制定的目的和原则 目的: 出生缺陷家系对照病例遗传资源的采集具有重要意义和价值，制定出生缺陷家系的对照选取原则，规范采集对象和采集程序，规范对照病例的遗传资源信息，确保采集的对照病例遗传资源有正确的临床信息，从而为出生缺陷的病因和机制研究提供准确、客观的对照资料，同时促进实现对照病例遗传资源的共享。 对照选取的原则：严格意义上的对照是指不患有任何出生缺陷的正常个体，其直系亲属中也无出生缺陷的家系。这类

2、家系对任何出生缺陷家系而言，都是最为理想的对照。如实际工作中无法满足此条件，则只要不患有特定的出生缺陷的个体及其亲属组成的家系均可作为对照家系。遗传资源采集原则: 充分考虑遗传资源提供者的权利,采取自愿合作的原则,采集过程中尊重提供者的意愿,保证相关信息的安全.2范围的界定 本规范适用于全国各地区收集整理保存人类出生缺陷家系对照病例遗传资源的研究机构、大专院校、医院、企业等。3规范性引用文件下列文件中的条款通过本规范的引用而成为本规范的条款。凡是注日期的引用文件，其随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本规范。凡是不注日期的引用文件，其最新版本适用于本规范。ICD10 疾病和有

3、关健康问题的国际统计分类GB/T 2261.12003 人的性别代码GB/T 330491 中国各民族名称罗马字母拼写法和代码GB/T2260 中华人民共和国行政区划代码GB/T 12404 单位隶属关系代码GB/T 2261.32003 健康状况代码GB/T 7408 数据元交换格式 信息交换日期和时间表示法（GB/T 7408-1994,eqv ISO 8601:1998）SMITHS Recognizable Patterns of Human Malformation 6e,Kenneth Lyons Jones, MD ISBN: 1-7216-0615-6SMITH 人类先天性畸形

4、图谱分类、判定标准与遗传咨询。傅松滨主译，北京：人民卫生出版社，2007.5人类遗传资源管理暂行办法 自然科技资源共性描述规范4定义及注意事项4.1定义出生缺陷(birth defects)，又称先天异常(congenital anomalies)，是指胚胎或胎儿在发育过程中所发生的结构或功能异常。出生缺陷家系可分为核心家系、多代家系等.核心家系：指包括出生缺陷患者及其父母所组成的家系。多代家系：指包括出生缺陷患者及其三代以上具有血缘关系的直系亲属所组成的家系。出生缺陷家系对照病例可分为正常对照家系（核心家系、多代家系）、正常对照个体.正常对照家系指不患有已确定的出生缺陷类型的个体及其父母.亲

5、属组成的家系。正常对照个体.指不患有已确定的出生缺陷类型的个体。4.2注意事项1出生缺陷类型的诊断必须准确,这是确定对照的前提。尽可能利用与病例相同的诊断方法，并确定所选对照个体不具有所要研究的疾病。即一方面要求对照个体未患所研究疾病；另一方面，要求病例组和对照组的诊断手段最好一致。因为同一疾病用不同的诊断方法进行诊断时，可能有不同的敏感性和特异性；如果用于确定病例和对照的诊断方法不同，就有可能在对照中混入轻型病例。2对照与病例要有可比性。为了保证对照与病例的可比性，许多病例对照研究加上了相应的配对条件。在注重这种两组可比性的时候，也不应过份追求严格配对，如果要求病例和对照除研究因素以外，其他

6、因素都相同的话，就可能导致过度匹配。3在选择医院对照时，应将与研究因素有关的疾病从对照中排除。如果不排除这类疾病，可能就会出现研究因素的危险性做出过高或过低的估计。4. 遗传资源采集过程中,必须得到提供者的同意,不对提供者造成不必要的损伤.5. 遗传资源的保存须根据其类型的不同采用合适的方式,以将损失减少到最低为原则.6. 应当有专人对遗传资源进行管理,保证遗传资源的安全可用.7质量控制应当贯穿于对照病例收集的整个过程，因为在收集的过程中的各个环节产生的误差或偏倚均可影响后续的工作，导致最终研究结果的不精确和不真实。第二章 对照病例遗传资源采集程序1. 确定出生缺陷类型及对照 可根据各地的具体

7、情况，选取当地发病率较高、严重威胁生命的出生缺陷类型，根据其特征，确定诊断标准、制定选择对照的纳入和排除标准。2. 对照来源及类型由于出生缺陷家系的特殊性，在选择对照病例时需要考虑到与一般意义上的对照来源的不同之处。应当明确是来自社区还是医院，此外还可考虑病例的同胞，如双生子，养子，半同胞等。 人群或社区来源：选择与出生缺陷家系在同一地区，生活习惯、经济条件、社会地位等方面相似的家系。 医院或诊所来源：选择与出生缺陷患儿同一家医院或诊所出生或就诊的,不患任何畸形的孩子. 患者同胞: 如双生子中的健康者,或患者的 核心家系: 正常个体及其父母组成的家系. 多代家系: 家系成员均不患任何畸形,至少

8、三代以上的家系. 正常个体: 不患有任何出生缺陷的健康个体,与出生缺陷患者有无血缘关系均可.3采集遗传资源类型及相关资料 确定符合条件的对照家系后, 及时向其家系成员介绍本项目的目的,并宣读知情同意书,以征得各成员的同意. 遗传资源类型 收集对照家系各成员的静脉血; 对新生儿及其父母均收集纸血片.其他类型可参考中的人类遗传资源共性描述规范. 采集标本的原则 首先尽量采集静脉血(1-3ml), 如果有困难,则可选择采集静脉血制成血纸片。采血后尽早处理如提取其中的DNA，血纸片标本采集后需在清洁的空气中晾干再保存。 相关资料的收集 研究对象签署知情同意书后,对家系成员调查一般情况及其它暴露历史.调

9、查内容包括: 一般情况(妇女基本信息, 家族史, 既往病史, 婚育史, 家庭近亲结婚史, 生育畸形史等), 怀孕前后患病情况, 接触致畸因素情况, 孕期生活方式, 居住条件, 孕期叶酸服用等情况, 详细的调查内容可根据不同情况具体规定. 还应附有体格检查表。4遗传资源的保存及管理 遗传资源由于来源珍贵，其保存及管理就尤为重要。应当有专人专职负责遗传资源的保存及管理。遗传资源的保存应该有专用的空间及相应的设备。将遗传资源的信息数字化，有利于遗传资源的共享和交流。 相关资料的整理及管理 包括知情同意书，调查问卷，体格检查表，应当详细检查这些资料的填写情况，是否填写的完整，真实。第三章 描述规范1平

10、台资源号国家自然科技资源E平台统一的资源编号，由18位数字和字母组成，可分为两部分。第一部分由9位字母和数字组成，为E平台登记注册的单位编码，详见E平台附表，如1751C0001代表四川大学中国出生缺陷监测中心；第二部分由9位数字组成，为该样本的资源编号。详见重要疾病遗传资源数据规范中“平台资源编号”指标项。2 出生缺陷家系对照病例编号由11位字母和数字组成，出生缺陷家系对照病例标识符（JXDZ）分项目承担者编码（3位）家系流水号（4位）。如，QXDZ5150001表示分项目承担者编码为515的第一个对照家系。3出生缺陷家系对照病例个体编号由13位字母和数字组成，出生缺陷家系对照病例编号（11

11、位）个体流水号（2位）。如，QXDZ515000101表示缺陷家系对照病例编号为QXDZ5150001的第一个个体样本。4 对照病例家系名称字符型，不超过50个中文字符。参照已确定的出生缺陷家系，注明是该家系的对照家系。如已确定的出生缺陷家系为多指家系，则在相应的对照家系中注明为多指家系对照5 出生缺陷家系对照病例类型按照以下代码填写。家系类型代码多代家系Family核心家系Core正常个体CTRL6 对照病例的诊断资料 字符型，不超过100个中文字符的描述内容。目的是说明该对照病例无确定的出生缺陷。如对照病例照片、体检报告、染色体检查报告等诊断资料。7 基本信息7.1.性别根据国家标准人的性

12、别代码编写。代码性别0未知性别1男性2女性3两性9未说明的性别7.2 民族2位阿拉伯数字，人体生物标本涉及民族分类均采用经国家认定的民族名称，编码参考国家标准GB/T 3304-1991中华人民共和国各民族名称的罗马字母拼写法和代码。7.3 籍贯2位阿拉伯数字，编码按照国家标准全国县及县以上行政区划代码表国家标准GB/T 2260-1999的前两位编写，代码对应到省市自治区。同时补充“99”作为资料不详代码。7.4出生日期日期型，按照年月日顺序编写，格式为YYYY-MM-DD,没有相关记录者，记为99999999。7.5 家庭住址及联系方式字符型。7.6样本采集日期 按照公历填写，填写格式按照GB/T 7408数据元交换格式信息交换日期和时间表示法（GB/T 7408-1994, eqv ISO 8601: 1998）的要求。格式为YYYYMMDD.7.7样本保存期限 2位阿拉伯数字，单位位月，按照样本实际可保存的时间进行填写，其中99为永久保存。7.8样本保存条件 按照样本保存温度进行分类编码，1位阿拉伯数字 123459常温冷藏（2-8）低温冷冻（-20到-40）超低温冷冻（-70到-150）液氮其他8收藏单位信息8.1 保存地 字符型，填写保存地点的名称。8.2实物状态1位数字，表示该个体遗传资源实物的状态。“1”表示可用，“2”表示不可用，“3”表示无实物。