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I.中性演化论 1一 自然界中的遗传变自然选择的基础:遗传变异
2 突变:单3 Dobzhansky的果蝇实验(1938-1940年) 4 Watson&CrickDNA双螺旋结构(double5 G6组(一般 中的
最终形成7
举例:编码蛋白质
搬运 RNA上的三联 相应的氨基 豌豆天冬氨酸氨基转移酶(AAT)的多态AATAAT AAT2与AAT3: MotooKimura(11.13.1924–假设一个哺乳动物有个独立分离的loci,2alleles/locus;杂合子有选择优势,纯合子的选择系数(s)为 若要维持原来种群的大小,每 结论:不可能! 变率和遗传漂变(geneticdrift)而定。1968年Kimura Evolutionaryrateatthemolecularlevel.Nature(1968)217:624-中性理论中sutrs= 基本的公式:p2+2pq+q2= 0,selected 0,selectNearly|s|
1/(2Ne),或|s|定义:一个种群中能将其连续传递到下一代的平均数。实际上相当于理想状态下(种群大小稳定,世代之间没有,所有个人以相同的 Ne=4NmNf/Nm:雄 Nf:雌 (Elaphurusdavidianus原产亚洲东部,1898年仅剩18 (江苏省大丰市:N=819/Ne=50)种群恢复很快,2003年从国际“红皮书”中“除名”从“濒 群(7只)kN:population中的 每代Population中新的突变=u:单个突变在Population每代被固定在Population中的中性突变的概率=因此,当skv)(1/2N)v,与Population三 中性或近中性突变,随机选择(遗传漂变承认负选择(negativeselection) King&Science(1969)164:788- 兼并性Neutral偏爱性——水 NaturalselectionTomokoOhta(太田朋子,1933-NearlyNeutralTheoryofEvolution 提出了一个slightlydeleteriousmodel,Slightlydeleteriousmutantsubstitutionsinevolution.Nature(1973)246:96-五.分子演化的主要研究
DNA、RNA、蛋白质分长短(核苷酸和氨基酸的数目序列(核苷酸和氨基酸的排列顺序),MERPWKCCDNI
一致性(identity)相似性(Similarity) 或蛋白质的序列一致性或相似性很钟南山 并系同源paralogous:由
直系同 a2,a2,a3,a4,a2’,a2’,a4’,
a2
a2’,a4’,a2’,a4’,a2,a3,a4,物种 物种中性演化理 分子演化的一些术语:相似性,同源性(直系、并系MotooKimura,1983,TheNeutralTheoryofMolecularEvolution,CambridgeUniversityPressWen-HsiungLi,1997,MolecularEvolution,SinauerAssociatesInc.,,OhtaT,2010,
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