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文档简介
Chapter4TheReplicationofDNA
Chapter8ofthebookIntroductionWhenwilltheDNAreplicationhappen?
(4)细菌(E.coli)DNA每个细胞周期只复制一次1、Semi-ConservativeReplication
1958Meselson-stahl设计的CsCl超离心试验证实了
DNA复制的这一特性概念:复制过程中各以双螺旋DNA的其中一条链为模
板合成其互补链,新生的互补链与母链构成子
代DNA分子
聚合反应:substrate--dNTPPoly(核苷酸)n-3’-OH+dNTP→
Poly(核苷酸)n+1-3’-OH+
2PiThedirectionofreplication子链DNA延伸方向只能是5’-3’5’OHTCATCAC5’OH3’ppp
OH
C++
ppi
如果DNA的延伸方向是3’→5’
ATCG
+5’pppOH3’GpppOHGATCG5’pppOH3’ATCG
+5’pppOH3’GpppOH
G
5’
pppa、因能量的需要,
DNA的5’端必须带有PPP游离dNTP具有ppppppOH3’ATCG
在0.2MNacl的生理环境中,使dNTP难以聚合到DNA的5’端
需要其他机制以解脱
1)、解螺旋酶(helicase):又称解旋酶,通过水解ATP获得能量,解开DNA双链.
2).
单链结合蛋白(SSB):结合在DNA单链上,有时有协同效应.3)、
DNA旋转酶:消除复制叉前进过程中产生的正超螺旋,产生负超螺旋.TheinitiationofDNAreplication(1)OriCinE.colichromosomalDNA♦四个9bp的重复序列
dnaA结合位点♦三个13bp的重复序列若干GATC位点Replicationfork
真核生物(Eukaryote):多复制起点即--一个genome中有多个复制单位TheinitiationofDNAreplicationDnaAistheinitiator
引发体(包括引发酶)pppRNA引物DNApolymeraseIIIpppDNApolymeraseIDNApolymeraseIDNAligase
DNALigase
所需条件:
a、
切刻的3’-OH和5’-P相邻
b、
切刻各自碱基处于配对状态
c、需要能量原核(ATP、NAD)真核(ATP)
用途:复制过程中,5’端RNA引物被置换后切刻的连接修复、重组3’-5’exonucleaseactivity(polymeraseI,II,III)
校对功能(proofreading)
5’-3’
exonucleaseactivity(polymeraseI,III)
DNApolⅠ的5’-3’外切活性有以下三个特点:
♦必须有5’-磷酸末端♦被除去的核苷酸必须是已经配对的♦被除去的可以是脱氧核糖核苷酸,也可以是核糖核苷酸(切刻平移)
其中DNApolⅢ
全酶有十种共22个亚基β二聚体--滑动钳InteractionbetweenDNAandDNApolymeraseTheinitiationofDNAsynthesisinE.coli
2、真核生物的DNA聚合酶
α、β、δ、ε、γ五种
位置核内核内核内核内
线粒体
合成
与引发修复合成合成,修复复制功能酶结合前导链
后随链3’-5’校NONOYesYesYes正活性
α
β
δ
ε
γActivationofthepre-RCleadstotheassemblyoftheeukaryoticreplicationforkTheactivationofpre-RCsistightlyregulatedbycyclin-dependentkinases(Cdks)
(3)复制终止a、终止序列
E.coli有两个终止区域,分别结合专一性的终止蛋白
序列一:terEterDterA
序列二:terFterBterC
每个区域只对一个方向的复制叉起作用
b、专一性终止蛋白
E.coli中由tusgene编码(terminusutilizationsubstance)通过抑制DNA螺旋酶而发挥终止作用每次复制时只使用一个终止位点ter5、复制忠实性的保证
1、DNApol的3’5’外切酶活性
(exonucleaseactivity)
2、DNApol只能从引物的3’
端延伸DNA
(需要RNA引物)
a、碱基配对协同性导致最初几个碱基错配率高,且不易校正
b、RNA引物最终被降解而避免错误
3、后随链的不连续合成因其有利于错配碱基的校正
3.6.真核生物DNA的复制(DNAreplicationinEukaryote)
3.真核生物DNA复制的引发酶
●DNApolα+primase形成紧密的复合物
6-9NtRNAasprimer
●引发酶(primase):50-60kd
●作用方式为阵发性的,每次作用拷贝6~15个核苷酸
●既能利用NTP,又能利用dNTP
●SV40体外DNA复制情况分析
端粒位于真核生物染色体DNA的3’末端,由独特的DNA重复序列及相关蛋白组成的复合体。端粒的功能:①维持染色体的完整性,决定细胞的寿命。若无端粒,两个染色体末端很可能融合一起。②解决末端复制问题,端粒酶能与端粒作用,延伸其长度。端粒的结构①DNA端粒由简单的串联重复序列组成人和其他脊椎动物:AGGGTT纤毛原生动物四膜虫:GGGGTT和GGGGTTTT面包酵母:G1-3T和G1-5A共同特点:富含G;长度达几百到几kb;人类DNA端粒长几kb到几十kb。端粒酶(Telomerase)是催化端粒合成的酶。它是由一条RNA和多种蛋白质构成的核糖核蛋白复合体。端粒酶中的蛋白部份具有逆转录酶活性,能以其自身携带的RNA为模板逆转录合成端粒DNA。端粒酶的作用机制:端粒酶的RNA分子与端粒DNA配对,以RNA为模板进行类似逆转录合成DNA,向5’→3’延伸端粒至模板RNA末端后,延长的DNA末端与RNA模板解离,端粒酶移动,重新定位于延长后的DNA3’端,开始下一轮延长过程,如此反复可达数百次合成几百个或数千个重复序列。(3)补齐过程
通过TG链的回折形成发夹结构(G·G氢键)---尺蠖模型
→→实现端粒酶位置的调整大多数体细胞不合成端粒酶,每次分裂后端粒就变短(约30~200bp)。当端粒比正常的长度短数kb时细胞就不再分裂。所以端粒变短是一种老化的象征。实验证明将端粒酶加进体细胞,可以增加体细胞分裂次数。癌细胞主要特性是能无限期的分裂增生,这需要不断表达端粒酶。实验发现癌细胞的端粒酶活性很强。这点可被用来检验癌细胞。实验表明--人体细胞通过监测失去的端粒的重复数而计数细胞分裂次数,当端粒长度下降到某一临界值时,细胞终止分裂---衰老、死亡“多莉”的衰老
研究端粒丢失的速率,预测人类的寿命
>XXXYwhy?研究推测端粒酶与肿瘤的关系ColE1质粒DNA的复制是从一个特定的复制起点(ori)开始,并沿着环DNA分子单向性地进行。控制此种质粒DNA复制启动的两种关键因素RNAI和RNAⅡ两种RNA分子,都是由ColE1DNA转录产生的。其中RNAⅡ也叫做复制引物。RNAⅡ分子在转录起点附近同互补的模板DNA形成一种杂交分子,被RnaseH酶所切割,从而释放出3′-OH末端,作为供DNA聚合酶Ⅰ合成DNA的引物。RNAⅠ可以通过同RNAⅡ结合,以阻止其与模板DNA发生杂交作用。原核细胞DNA复制的调控
真核生物的复制起始受许可因子的控制a、复制子的大小(Sizesofreplicon):Yeastorfly 平均40kbMam
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