病毒基因组核酸的主要类型

病毒基因组核酸的主要类型病毒基因组核酸的主要类型第1页Virusgenome病毒基因组核酸的主要类型第2页病毒基因组核酸主要类型1、双链DNA

多数动物病毒，如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒，环形、线形。2、单链DNA

动物病毒中仅微小病毒为单链病毒；噬菌体中仅含单链DNA。病毒基因组核酸的主要类型第3页RNA病毒基因组所携带遗传信息普通在同一条链上，序列与mRNA相同为正股（+），与mRNA互补为负股（—）3、双链RNA

以负链RNA为模板转录出mRNA如呼肠孤病毒及噬真菌体。4、单链负股RNA

5、单链正股RNA：如逆转录病毒病毒基因组核酸的主要类型第4页病毒基因组结构与功效1、不一样病毒基因组大小相差较大2、不一样病毒基因组能够是不一样结构核酸3、病毒基因组有连续也有不连续4、病毒基因组编码序列大于90%5、单倍体基因组除逆转录病毒外6、基因有连续和间断病毒基因组核酸的主要类型第5页7、相关基因丛集病毒基因组核酸序列中功效相关蛋白质基因往往丛集在基因组一个或几个特定部位，形成一个功效单位或转录单元。8、基因重合同一段核酸序列能够编码2种或2种以上蛋白质。重合基因即使共用一段核酸序列，但转录成mRNA链读框不一样，产生蛋白质分子大不相同。病毒基因组核酸的主要类型第6页（1）几个结构基因编码区无间隔：几个基因编码区是连续、不间断，即编码一条多肽链，翻译后切割成几个蛋白质。（2）mRNA没有5′端帽子结构5′

端非编码区RNA形成特殊空间结构称翻译增强子。（3）结构基因本身没有翻译起始序列，必须在转录后进行加工、剪接，与病毒RNA5′端帽结构相连，或与其它基因起始密码子连接，成为有翻译功效完整mRNA。病毒基因组核酸的主要类型第7页SV40病毒基因组动物病毒中以SV40研究较多，由sweet和Hilleman从恒河猴细胞分离。无包膜，直径45nm，双链环状DNA，DNA长5243bp。在自然界不引发疾病和肿瘤，当大量接种于免疫缺损动物或新生动物时，引发肿瘤发生。SV40基因编码两种抗原。病毒基因组核酸的主要类型第8页病毒基因组核酸的主要类型第9页病毒基因组核酸的主要类型第10页VP2和VP3是一个基因经过mRNA剪接形成不一样编码产物。其序列相同，只是N端长度不一样，VP3N端比VP2N端短1/3，它们有相同C端，只是N端编码区剪切掉序列长短不一样。VP1是另外一个基因，晚期基因是一个重合基因。VP1起始密码子位于VP2和VP3编码区内部，阅读框不一样。VP1需要经过转录后剪接取得5′端非编码区即翻译起始所需5′帽子结构，所以又是一个结构不规则基因。病毒基因组核酸的主要类型第11页乙型肝炎病毒（HBV）

基因组病毒基因组核酸的主要类型第12页病毒基因组核酸的主要类型第13页不一样毒株HBV以负股DNA为模板转录RNA都有4个开放阅读框架（openreadingframe,ORF):S、C、P、X。P与其它三个ORF重合。S区段编码病毒外膜蛋白，由S基因、前S1区段、前S2区段三个别组成。主要蛋白即S蛋白（HBsAg)由S基因编码；中蛋白由pre-S2和S基因编码；大蛋白由pre-S1、pre-S2和S基因编码。病毒基因组核酸的主要类型第14页C区段编码HBV关键抗原（HBcAg),长约183~214个氨基酸残基。前C（pre-C)富含疏水性氨基酸密码子，其编码产物可促进C抗原从细胞内排到细胞外，进入血液转变成e抗原。若pre-C缺失，将不会产生e抗原，而C抗原就积聚于肝细胞内。P区段编码DNA聚合酶，富含组氨酸为碱性蛋白，是依赖于RNADNA聚合酶（逆转录酶）。X区段位于C区段上游。病毒基因组核酸的主要类型第15页

逆转录病毒（retroviruses)基因组普通特征▲编码区：3个基础结构基因

gap编码病毒衣壳蛋白；pol编码肽链内切酶、一个逆转录酶和一个与前病毒整合相关酶；env编码包膜蛋白。有含癌基因。5′帽-R-U5-PB--DLS-Ψ-gap-pol-env-(onc)-C-PB+-U3-R-poly(A)n病毒基因组核酸的主要类型第16页▲非编码区（1）R区:两端都有,20~80个核苷酸。（2）引物结合区（primerbindingsite,PB):位于5端PB区引导起始负链cDNA合成，用PB-表示。（3）U区：位于R区与PB区之间。U5与转录终止和加polyA相关，U3含强开启子，起始转录RNA。（4）DLS、Ψ和C区。DLS是两条病毒（+）RNA链以氢键相结合位点。Ψ为包装信号。可使RNA包入病毒颗粒；C区不编码蛋白质，为调控区。病毒基因组核酸的主要类型第17页前病毒基因组转录和翻译逆转录病毒基因组复制和转录都需要经过DNA中间体，这种DNA中间体称为前病毒（provirus)。长末端重复序列（longtermialrepeated,LTR):U3-R-U5-PB--DLS-Ψ-gap-pol-env-(onc)-C-PB+-U3-R-U5病毒基因组核酸的主要类型第18页人类免疫缺点病毒（HIV）GenomeHIV(humanimmunodeficiencyvirus)俗称艾滋病毒(AIDS)是逆转录病毒一类，引发人类取得性免疫缺损综合症，长约9.3kb，除了逆转录病毒普通特征外，另外最少含有6个调控基因如tat、rev、nef、vif、vpu及vpr。已发觉HIV有两种：HIVⅠ和HIVⅡ.HIVⅠ从欧洲和美洲分离毒株,致病力强,是引发全球艾滋病流行主要病原;HIVⅡ毒力较弱主要局限于西部非洲。病毒基因组核酸的主要类型第19页病毒基因组核酸的主要类型第20页病毒基因组核酸的主要类型第21页tat(反式激活基因）编码一个反式激活蛋白（transactivator,Tat),Tat是HIV基因组复制和基因表示所必须反式激活因子。存在于两段分隔存在基因个别。失去tat功效则成为完全无感染性病毒。rev基因（regulatorofvirionproteins)编码产物对gag、pol、env、vpu、vpr、vif表示有正调控作用，对nef、tat、rev表示则行使负调控作用。病毒基因组核酸的主要类型第22页nef(negativeregulationfactor,nef)兼有正负调整效应。vif编码病毒感染因子(viralinfectivityfactor,vif)vpr编码病毒蛋白R(viralproteinR)激活基因表示。vpu:HIV-1vpx:HIV-2病毒基因组核酸的主要类型第23页ProkaryoteGenome1、常仅由一条环状双链DNA分子组成2、只有一个复制起始点。3、含有操纵子（operon)结构。4、编码次序普通不会重合。5、基因是连续，无内含子，转录后不需剪接。病毒基因组核酸的主要类型第24页病毒基因组核酸的主要类型第25页6、编码区在基因组中所占百分比远远大于真核基因组，小于病毒基因组。7、基因组中重复序列少。普通为单拷贝，但编码rRNA基因往往是多拷贝。8、含有编码同工酶基因（isogene).9、细菌基因组中存在可移动DNA序列，包含插入序列和转座子。10、在DNA分子中含有各种功效识别区域。病毒基因组核酸的主要类型第26页质粒（plasmid)质粒是细菌细胞内携带染色体外DNA分子，是共价闭合环状DNA分子（covalentclosedcircularDNAcccDNA),大小在1~200kb,能独立进行复制。质粒“友好”地借居于宿主细胞内。靠宿主细胞才能完成自己复制，而质粒对宿主细胞生存不是必需。质粒不是单纯寄生，所携带遗传信息能赋予细菌特定遗传性状。病毒基因组核酸的主要类型第27页质粒分类按功效：R质粒：抗药性质粒F质粒(fertilityfactor):性质粒（sexplasmid)可决定细菌性别Col质粒：大肠杆菌素质粒,合成大肠杆菌素，杀死不含大肠杆菌素质粒亲缘细菌。病毒基因组核酸的主要类型第28页依据质粒能否在细胞间进行传递：接合型质粒（conjugativeplasmid)：如F质粒，雌雄细胞经过性纤毛相互接触而结合，质粒便从一个细胞传递给另一个细胞。非接合型质粒：按复制机理：严紧型质粒（stringentplasmid):即低拷贝数质粒松弛型质粒（relaxedplasmid):高拷贝数质粒。病毒基因组核酸的主要类型第29页质粒特征1、能自主复制。2、质粒不相容性（incompatibility)两种亲缘关系亲密不一样质粒不能共存于一个宿