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文档简介
第一部分
IKAR0S6在急性淋巴细胞白血病中的表达和临床意义目的:
本研究旨在探讨初发成人急性淋巴细胞白血病(acutelymphoblasticleukemia■ALL)患
者中Ikaros6的发生率,重点研究Ikaros6与其它分子标志之间的关系以及对预后的影
响。
方法:收集从2006年9月到2013年6月,179例(B-ALL为105例,T-ALL为74例)
初治成人ALL骨髓•分离骨髓单个核细胞并提取RNA•采用逆转录聚合酶链反应
(RT-PCR)获得cDNA,进行聚合酶链反应(PCR),反应产物连接载体进行测序分析,
确定Ikaros6序列的正确性。用Genescanning和实时定量PCR(Real-timePCR)动态监
测初诊、部分缓解'完全缓解、复发四个时间点的BCR-皿和Ikaros6表达水平。此
外,分析Ikaros6阳性患者临床特征,与其它分子标志之间的相关性以及对预后的影响。
结果:在179例成人ALL患者中,检测到53例(29.61%)表达Ikaros6•其中105
例B-ALL患者中检测到37例Ikaros6阳性(35.24%)74例T-ALL患者中检测到16
例阳性(21.62%)。在B-ALL中•Ikaros6阳性患者主要分布在commonB-ALL亚型
(24of37,64.86%)。染色体核型分析发现阳性患者主要集中在高危核型(23of37,
62.16%)尤其是Ph染色体(17of37,45.95%)•并且Ikaros6与BCR-ABL1(P=
0.011)'髓系相关抗原(尸=0.032)的表达密切相关°利用Genescanning和Real-time
PCR动态监测患者诊治过程中BCR-ABL1和Ikaros6的表达水平,发现两者具有相同
变化趋势。生存分析发现Ikaros6独立于8CR-48ZJ和髓系相关抗原,提示不良预后
和高复发风险。COX风险比例模型表明Ikaros6可作为一个独立的因素评估B-ALL
患者的预后(OSP=0.043,HR=1.905;EFSP=0.044,HR=1.822;RFSP=0.002,
HR=4.992)。
在T-ALL中•Ikaros6主要表达于medullaryT-ALL亚型(8of16,50.00%)•而
与pro-T-ALL亚型存在显著的负相关性(P=0.036)。另外,在16例Ikaros6阳性患
者中,有10例(62.50%)发生髓外浸润,明显高于阴性患者(34.48%)•差异存在统
计学意义(P=0.043》Ikaros6对T-ALL患者的生存也有明显不良影响,总生存期(P
=0.032)和无事件生存期(尸=0.014)显著缩短,缓解后更容易复发(RFS,尸=0.011)。
结论:Ikaros6在成人急性淋巴细胞白血病中表达率较高•无论在B-ALL中,还是在
T-ALL中,Ikaros6阳性患者均具有一定的临床特征。Ikaros6、BCR-ABL1'髓系相关
抗原三者之间存在显著相关性,但Ikaros6独立于和髓系相关抗原,提示
高复发风险。因此,Ikaros6可作为成人急性淋巴细胞白血病分层治疗和评估复发风险
的理想指标。
关键词:Ikaros6;急性淋巴细胞白血病;临床意义
ExpressionandClinicalSignificanceofIKAROS6isoformin
acutelymphoblasticleukemiapatients
Objective:ThepurposeofthestudywastoinvestigatetheexpressionofIkaros6inadult
acutelymphoblasticleukemia(ALL)•Moreover,thisstudyfocusedontherelationship
betweenIkaros6andothermolecularmarkers,aswellasprognosticvalueofIkaros6.
Methods:WeexaminedtheexpressionofIkaros6inbonemarrowfrom179denovo
patientswithALL(B-ALL,n=105andT-ALL,n=74)fromSep2006toJul2013.RNAwas
extractedfrommononuclearcellsofbonemarrow,andthentheexpressionofIkaros6was
detectedbyreversetranscription-PCR,andconfirmedtheresultsbygenescanningand
sequencing.TheexpressionofBCR-ABL1andIkaros6weredynamicallymonitoredby
genescanningandreal-timePCRfrominitialdiagnosistorelapse.Furthermore,we
analysedtheclinicalfeatureofpatientspositiveforIkaros6,therelationshipbetween
Ikaros6andothermolecularmarkersandprognosticsignificanceofIkaros6inALL.
Results:Inthetotalof179adultpatientswithALL(B-ALL,n=105andT-ALL,n=74),
Ikaros6wasobservedin53patients(29.61%),Amongthem,37of105caseswithB-ALL
(35.24%)and16of74caseswithT-ALL(21.62%)weredetectedIkaros6.InB-ALL,
Ikaros6waspredominantlyfoundinthecommonB-ALLsubtype(24of37,64.86%).
Ikaros6wasprincipallyfoundinhigh-riskgroup(23of37,62.16%),especiallyincasesof
Ph+ALL(17of37,45.95%).Ikaros6wasfoundtobeassociatedwithBCR-ABL1(P=
0.011)significantly.Moreover,theexpressionpatternsofBCR-ABL1andIkaros6were
similarfrominitialdiagnosistorelapse.PatientspositivefbrIkaros6,26of37(70.27%)
expressedmyeloid-associatedantigensandtherewasasignificantassociationbetween
Ikaros6andmyeloid-associatedantigens(P=0.032).Thus,therewasclosecorrelation
betweenBCR-ABL1,myeloid-associatedantigensandIkaros6.However,Ikaros6was
associatedwithincreasedriskofrelapse,whichwasindependentofBCR-ABL1and
myeloid-associatedantigens.InmultivariableCoxanalysis,Ikaros6wasanindependent
prognosticmarkerfbroverallsurvival(P=0.043,hazardratio=1.905),event-freesurvival
(P=0.044,hazardratio=1.822)andrelapse-freesurvival(P=0.002,hazardratio=
4.992).
In74T-cellpatients,Ikaros6wasprincipallyfoundinmedullaryT-ALLsubtype(8of16,
50.0%),moreover,itwasfoundnegativelycorrelatedwithpro-T-ALL(P=0.036).
Extramedullaryinfiltrationoccurredin10of16(62.50%)patientspositivefbrIkaros6,
whichwasmorefrequentlythancasesnegativefbrIkaros6(34.48%),andthedifference
hadstatisticalsignificance(P=0.043).Meanwhilethesehadinferiorsurvival(OS,P=
0.032;EFS,P=0.014)andincreasedriskofrelapse(RFS,P=0.011)ascomparedwiththe
Ikaros6-negativepatients.
Conclusion:TheincidenceofIkaros6washighinadultALLpatients.Patientspositivefor
Ikaros6weremorelikelytohavesomeclinicalfeatures.Ikaros6wascloselyrelatedto
BCR-ABL1andmyeloid-associatedantigens,butIkaros6predictedworseRFSwas
independentonotherprognosticfactors.ThusIkaros6mayserveasavaluablefactorfor
riskstratificationandprognosisevaluationinadultALL.
Keywords:Ikaros6,acutelymphoblasticleukaemia,clinicalsignificance
、,—1—
月US
急性淋巴细胞白血病(Acutelymphoblasticleukaemia■ALL)是一种异质性明显
的血液系统恶性疾病。通过有效的个体化治疗和日趋完善的支持治疗,ALL治愈率可
达80%⑴,但是仍有超过20%患者在初次治疗后出现复发⑵。既往评估ALL风险分
级主要是根据包括亚二倍体、超二倍体't(9;22)等在内的染色体异常和MLL基因
重排等,治疗失败多见于BCR-ABL1阳性和MLL基因重排阳性的患者,而疾病复发
却没有标志性的细胞遗传学异常。人类全基因组分析发现在ALL患者中存在大量重
现性基因改变【36],其中超过40%的基因突变对B淋巴细胞的发育有重要的转录调控
作用⑶"KZ"就是这样一类基因,其编码转录因子Ikaros在淋巴细胞的发育过程中
发挥重要作用。
Ikaros作为Kruppel家族成员之一,是具有DNA结合能力的"锌指"样蛋白。
Ikaros6作为一种显著负性剪接变异体不能结合DNA却能够与其它剪接变异体相互
作用进而干扰结构完整的Ikaros与DNA结合•降低Ikaros蛋白活性阳°】。早期研究
关注IKZF1基因的缺失,尤其是Ik6等显著负性剪接变异体在儿童ALL患者中的发
生率及其对预后的影响口“⑶。Sun等研究发现94%的T-ALL和100%的B-ALL都表
达无DNA结合能力的Ikaros剪接变异体网。Mullighan等报道在83.7%ALL患者中
存在IKZF1基因异常,并且认为显著负性剪接变异体对白血病的发展有重要的影响
⑸。动物实验发现:在小鼠模型中-Ikaros缺失会促进T细胞淋巴瘤/白血病的发生
发展,提示Ikaros发挥重要的抑癌作用口°,山。随着研究深入,显著负性Ikaros剪接
变异体同样能够阻碍人类淋巴细胞正常发育,促进白血病发生和发展区凹。
在B-ALL中•Ikaros6和BCR-ABL1之间存在显著的相关性0°,川,与此同时,
一些研究表明IKZF1缺失与8CR45ZJ阴性患者发病密切相关,并且同样提示不良预
后〔小以⑸。最新研究认为IKZFI异常可以作为一项可靠指标用来监测微小残留病变
(minimalresidualdisease,MRD)〔的,并且与高复发风险显著相关口,5,⑸。此外,研
究发现约30%-87%的ALL患者表达髓系相关抗原"2",并且髓系相关抗原与
BCR-ABL1存在相关性口7,电22]。虽然髓系相关抗原对ALL预后的影响仍存在争议
[|8-21],但大多数研究表明其提示不良预后口%2。〕。在ikaros6'8CRZ8A/和髓系相关
抗原这三个因素中Ikaros6与BCR-ABL1密切相关而BCR-ABL1与髓系相关抗原存
在相关性,所以Ikaros6与髓系相关抗原之间可能也存在关联。
本研究检测成人ALL患者Ikaros6的表达并分析临床特征•探索性分析Ikaros6'
BCA-ZEJ和髓系相关抗原之间的相关性进一步明确Ikaros6对预后的影响。
材料和方法
-'病例选择及临床资料收集
武汉同济医院血液科2006年9月至2013年6月初诊的成人ALL患者其中B-ALL
为105例T-ALL为74例•年龄>16岁,诊断根据MICM诊断体系,即骨髓细胞形
态学(Morphology,FAB)'流式免疫分型(Immunology)、细胞遗传学(Cytogenetics)
和分子生物学(MolecularBiology),同时收集整理初诊时血常规等临床资料以及跟踪
整理随访资料。
二'主要试剂
红细胞裂解液(北京Solarbio公司);淋巴细胞分离液(天津市潮洋公司);PBS
缓冲液(自配);1640培养基(美国Thermo公司);胎牛血清(美国Gibco公司);
Trizol试剂(加拿大Fermentas公司);氯仿;异丙醇;无水乙醇;DEPC水(自配);
DNA提取试剂盒(美国QIAGEN公司);LATaq(日本TaKaRa公司);2'EasyTaqPCR
Supermix(美国Thermo公司);KOD酶(日本TaKaRa公司);GeneScan1M-500LIZ
(美国ABI公司);Hi-Di1MFormamide(美国ABI公司)。三'主要仪
器
台式低速离心机及低温高速离心机(德国Sigma公司);PCR仪(德国Biometra
公司和美国ABI公司);电泳仪(东洋纺公司);电子天平(MettlerToledo公司);
凝胶成像系统(Syngene公司);-80℃低温冰箱(德国Harrs公司);曝光系统
(美国Bio-red公司);基因分析仪3500(美国ABI公司);恒温振荡培养摇床
(中国电子器件工业总公司);NANOdrop2000C(美国Thermo公司)。
四、方法
1.分离骨髓标本中的单个核细胞
(1)准备人淋巴细胞分离液(4℃避光保存,复温至37℃使用),红细胞裂解液(4℃
保存•复温至37℃使用)IxPBS溶液•无菌超净工作台•银子•15ml离心
管,滴管,无菌手套等。
(2)向15ml离心管内加入复温至37℃的淋巴细胞分离液。
(3)按1:1体积比例,将标本缓慢加入淋巴细胞分离液室温下,2500rpm离心
20min。此时液体由上至下可分为4层,其中第二层乳白色环状物为分离获得
的单个核细胞。
(4)用滴管吸取单个核细胞层,并转移至另一个15ml离心管内。若分离效果佳•
可直接进行步骤(6),若分离效果不佳,进行步骤(5)。
(5)向离心管内加入ImllxPBS溶液,轻柔吹打混匀,按1:3体积比例加入复温至
37℃的红细胞裂解液•吹打混匀静置5min■室温下,1200rpm离心5min0
(6)弃上清•加入5mlIxPBS溶液清洗一次,显微镜下计数室温下,1200rpm离
心5min。
(7)弃上清,加入适量IxPBS溶液将细胞密度调整为"1()6个/ml,分装至1.5mlEP
管,室温下,1200rpm离心5min•弃上清后储存于-80℃冰箱。
2.RNA提取及逆转录PCR
(1)向装有患者骨髓标本的1.5mlEP管加入ImlTrizol试剂,充分吹打混匀•室温
静置5-10min°
(2)向上述L5mlEP管中加入0.2ml氯仿,充分颠倒震荡室温静置lOmin,4℃低
温112000rpm离心15min°
(3)离心后可见液体分为上层水相和下层有机相,中间可见白色絮蛋白。小心吸取
上层水相0.4ml转移到另一个新的1.5mlEP管内。
(4)按照1:1体积比例加入异丙醇,充分震荡混匀并静置lOmin后,4℃低温,
12000rpm离心lOmin°
(5)小心吸弃上清,加入1ml75%乙醇洗涤一次■4℃低温■12000rpm离心5min°
(6)小心吸弃乙醇,将沉淀置于室温下风干。
(7)按沉淀大小加入适量的DEPC水,取1g使用NANOdrop2000C测定RNA浓
度。
(8)向0.2mlPCR管中加入
RNA2gg
OligodTIgl
用DEPC水补足至12gl•混匀后•65℃变性5min立即置于冰浴中5min。
(9)立即向PCR管中加入
5xBuflfer4|il
dNTP2gl
RiblockRI1pl
RevertAidRT1pil
震荡混匀•25℃反应5min-42℃反应Ih•70°C反应5min■反应结束后置于
-80℃冰箱保存。
3.Ikaros6检测
(1)引物:
上游:5'-ATGGArGCTGATGAGGGTCAAGAC-3'下游:5'-
GATGGCTTGGTCCATCACGTGG-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/gl的储存液•再配成lOpmol/可的工作液。
(3)PCR反应体系:
ddH2O19.2川
lOxLAPCRBuffer2.5gl
lOmMdNTPIgl
Primers1pl
TaKaRaLATaq0.3ul
cDNAl|il
(4)PCR反应条件:
95℃3min
95℃30s
62℃30s35个循环
72℃50s,
72℃lOmin
4℃保存
(5)取4glPCR产物行1.5%琼脂糖凝胶电泳进行凝胶成像系统采图分析。
4.Ikaros6目的片段纯化后与pGM-T载体连接、转化及蓝白斑筛选
(pEASY-T1SimpleCloningKit步骤)
4.1RT-PCR产物切胶回收纯化
(1)取100WPCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳后在紫外线照射下切取目的条带•
计算胶条的质量并放入L5mlEP管中-按照每100mg胶条加100口1BindingBuffer的
比例加入适量BindingBuffer°
(2)将EP管置于50-60℃水浴锅中孵育10min•每隔几分钟振荡混匀一次直至
胶条完全溶解,转移至GeneJETpurificationcolumn°
(3)因目的片段<500bp•向上述混合液中按1:2体积比例加入100%异丙醇震
荡混匀。
(4)将上述溶液转移至GeneJETpurificationcolumn中•室温下,12000rpm离心1
min1弃去废液。
(5)向GeneJETpurificationcolumn中力□人700plWashBuffer,室温下,12000rpm
离心1min■弃去废液。
(6)将上述GeneJETpurificationcolumn再次室温12000rpm离心1min,以便去除
残余的WashBuffer。打开盖子■室温下放置2-3min。
(7)将GeneJETpurificationcolumn转移到—新的干净的1.5mlEP管中,悬空加
入50(1LElutionBuffer•室温下孵育2-3min后112000rpm离心1min■收集到的液体
即为切胶纯化后的PCR产物。
4.2连接反应体系:
切胶纯化后的PCR产物0.5-4gl
pEASY-T1SimpleCloningVector1gl
轻轻混合,37°C反应5min-后将其置于冰上。
4.3连接产物的转化
(1)将连接产物加入50WTransl-Tl感受态细胞中,轻弹混匀•冰浴20-30min。
(2)42℃热激30s•立即置于冰上2min。
(3)加入250ulSOC/LB溶液(室温)-200转•37℃孵育lh。
(4)取即1500mMIPTG和40^120mg/mlX-gal混合后均匀涂抹于琼脂糖培养板上•
37℃放置30min°
(5)待IPTG和X-gal被吸收后,取200^1菌液铺板,培养过夜。
4.4蓝白斑筛选
挑选培养板上的白色菌落在含氨节青霉素的液体LB培养基中,37℃培养过夜。
挑取5个克隆测序。
4.5测序
用M13F和R引物测序,进行正反向测序分析(深圳华大基因公司武汉分公司),
DNAbaser3.0软件分析核甘酸序列。
5.Genescanning检测
Genescanning检测IKZF1基因A4-7
(1)引物:参考Caye等研究中的引物网»A4:
5'-TGTGAAGGTCACACCTCTG-3'A7:5'-
AAAGAACCCTCAGGCATTCA-3'GL:5'-
CACCTTGTGGTCCAGGCTA-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/gl的储存液•再配成10pmol/gl的工作液。
(3)PCR反应体系:
ddH2O19.2gl
lOxLAPCRBuffer2.5|il
lOmMdNTPIgl
Primersmixture1pl
TaKaRaLATaq0.3ul
DNA
(4)PCR反应条件:
95℃4min
95℃30s1
60℃30s35个循环
72℃Imin
72℃4min
4℃保存
(5)PCR产物置于4°C冰箱储存•待上机检测。
Genescanning检测Ikaros6
(1)引物:
上游:5'-ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGAC-3'
下游:5'-GATGGCTTGGTCCATCACGTGG-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/pil的储存液,再配成lOpmol/似的工作液。
(3)PCR反应体系:
ddH2O19.2川
10xLAPCRBuffer2.5M1
lOmMdNTPIjil
PrimersmixtureIpl
TaKaRaLATaq0.3ul
cDNAIjil
(4)PCR反应条件:
95℃3min
95℃30s
62℃30s35个循环
72℃50s
72℃lOmin
4℃保存
(5)PCR产物行纯化(步骤同前所述)。
Genescanning上机检测
(1)反应体系:
切胶纯化后的PCR产物1位
Hi-Di™Formamide10四1
GeneScan™-5OOLIZ0.5gl
(2)变性:
95℃5min
4℃5min
(3)ABI3500上进行毛细管电泳。
6.BCR-ABL1的检测
(1)引物:
上游1:5'-GCTTCTCCCTGACATCCGTG-3'下
游1:5'-CGAGCGGCTTCACTCAGACC-3'上游
2:5'-CGCATGTTCCGGGACAAAAGC-3'下游2:
5'-CGAGCGGCTTCACTCAGACC-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/gl的储存液,再配成lOpmol/诅的工作液。
(3)PCR反应体系:
lOxPCRBuffer2.5位
ddH2O18.2川
Primersmixture皿
MgCL皿
dNTP1口1
cDNA山1
Taq酶0.3g1
(4)PCR反应条件:
95℃15min
95℃30s
60℃45s35个循环
72℃Imin
72℃7min
4℃保存
(5)取4glPCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳进行凝胶成像系统采图分析。
7.E27-P5XZ的检测
(1)引物:
上游:5'-CACCAGCCTCATGCACAAC-3'下游:5'-
TCGCAGGAGATTCATCAGG-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/pl的储存液•再配成10pmol/|il的工作液。
(3)PCR反应体系:
2xEasyTaqPCRSupermix10(11
ddH2O8pl
Primersmixture1gl
cDNAl|il
(4)PCR反应条件:
94℃5min
94℃30s1
65℃imin35个循环
72℃Imin,
72℃lOmin
4℃保存
(5)取4MPCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳进行凝胶成像系统采图分析。
8.MLL-/E/的检测
(1)引物:
上游:5'-CCGCCTCAGCCACCTAC-3'
下游:5'-TGTCACTGAGCTGAAGGTCG-3'
(2)分别将上下游引物配成lOOpmol/山的储存液,再配成lOpmol/pil的工作液。
(3)PCR反应体系:
2xEasyTaqPCRSupermixlOjil
ddH2O8m
Primersmixture1|xl
cDNAIgl
(4)PCR反应条件:
94℃5min
94℃30s、
65℃Imin35个循环
72℃Imin,
72℃lOmin
4℃保存
(5)取4R1PCR产物行1.5%琼脂糖凝胶电泳,进行凝胶成像系统采图分析。
TEL-AML1的检测
(1)第一轮引物:
上游:5'-TGCACCCTCTGATCCTGAAC-3'
下游:5'-AACGCCTCGCTCATCTTGC-3'
第二轮引物:
上游:5'-AAGCCCATCAACCTCTCTCATC-3'
下游:5'-TGGAAGGCGGCGTGAAGC-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/gl的储存液•再配成10pmol/Ml的工作液。
(3)第一轮PCR
反应体系:
2xEasyTaqPCRSupermix10g!
ddH2O8gl
PrimersmixtureIgl
cDNA1M1
PCR反应条件:
94℃5min
94℃30s
65℃Imin35个循环
72℃Imin
72℃lOmin
4℃保存
(4)第二轮PCR
反应体系:
2xEasyTaqPCRSupermixlOgl
ddH2O7M
Primersmixture2gl
第一轮PCR产物Igl
PCR反应条件:
94℃5min
94℃30s
65℃Imin35个循环
72℃Imin
72℃7min
4℃保存
(5)取4MPCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳进行凝胶成像系统采图分析。
10.SIL-TAL1的检测
(1)引物:
上游:5'-TCCCGCTCCTACCCTGCAA-3'
下游:5'-CGCGCCCAGTTCGATGAC-3'
(2)分别将上下游引物配成100pmol/gl的储存液•再配成lOpmol/gl的工作液。
(3)PCR反应体系:
2xEasyTaqPCRSupermix10pl
ddH2O8gl
Primersmixture1|il
cDNA1M1
(4)PCR反应条件:
94℃5min
94℃30s1
65℃Imin35个循环
72℃Imin
72℃lOmin
4℃保存
(5)取4川PCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳进行凝胶成像系统采图分析。
11•流式细胞仪检测髓系相关抗原
(1)向190诅10%冰乙酸中加入10gl骨髓细胞计数将白细胞计数调整为(1.0-2.0)
X105/L»
(2)转移至流式管中,按抗体说明书向骨髓样品中加入髓系相关表面抗原标记
(CD13/CD33/CD15/MPO)12孤置于室温避光孵育15-30min。
(3)加入0.5mlBeckmanCoulter,充分混匀,室温下,避光孵育10~15min°
(4)室温下11200rpm离心5min•弃上清后加入1ml1xPBS溶液洗涤一次,振
荡混匀。
(5)重复上述步骤,洗涤一次。
(6)弃上清•加入1ml1xPBS溶液制备成单细胞悬液。
(7)FCM检测髓系相关抗原的表达。
12.染色体分析
(1)准备1640培养基,小牛血清,秋水仙胺(20pg/ml)-0.075mol/L氯化钾低渗液,
甲醇,胰蛋白酶溶液•PHA(0.5mg/ml),冰醋酸-Hank's液■无菌超净工作台■酒
精灯,银子,高压灭菌15ml离心管,20ml培养瓶,吸管等。
(2)将患者骨髓标本1200rpm离心5min后■按照1-3xio'的密度接种至含10%
小牛血清的1640培养基中置于37°C,5%CO2培养箱中培养。
(3)培养23小时后加入lOOgl5ug/ml秋水仙胺,轻轻混匀后,继续培养1小时。
(4)取出培养瓶•用吸管轻轻吹打混匀后转移至15ml离心管室温下,1200rpm
离心5min。
(5)弃上清后,加入已预热至37℃的8ml0.075M氯化钾低渗液,吹打混匀后置
于37℃水浴箱中低渗处理30min-此期间每间隔lOmin轻柔吹打混匀一次。
(6)甲醇:冰醋酸按3:1体积比例配置固定液,在终止低渗后向离心管中加入1ml
固定液,用吸管吹打混匀后,室温下,1200rpm离心5min0
(7)弃上清后1加入8ml固定液•吹打混匀固定lOmin1室温下■1200rpm离心
5min■重复一次。
(8)弃上清后加入适量固定液,吹打混匀后,滴1〜2滴至干燥洁净的载玻片上晾
干,70℃烤片4〜5小时。
(9)将载波片放入胰蛋白酶溶液中消化8-〜12s后,迅速投入碳酸氢钠缓冲液中终
止消化,然后放入吉姆萨工作液中染色8~lOmin»
(10)自来水冲洗载玻片,晾干后,显微镜观察分析核型。
五、数据分析
采用SPSS19.0统计软件(Chicago,USA)•计量资料采用独立样本t检验•计数
资料采用W检验进行差异检验,双侧p<0.05表示差异有统计学意义。随访时间点定
义:总生存期(overallsurvival,OS)•从开始治疗的第一天至因任何原因引起死亡的
时间;无事件生存期(event-freesurvival,EFS)•从开始治疗的第一天至首次出现治
疗失败'疾病进展、完全缓解后复发或任何原因引起死亡的时间;无复发生存期
(rel叩se-fi*eesurvival,RFS),骨髓细胞形态学显不完全缓解的患者,从缓解后至第
一次复发的时间。
结果
1.急性淋巴细胞白血病患者Ikaros6的发生率
Ikaros6阳性ALL患者PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳结果显示在255bp处可见
一条清晰的条带(图1A),测序发现缺失第4-7号外显子•3号外显子与8号外显子
直接相连,接连处以GGGGG为特征(图1B)。毛细管电泳分析显示阳性患者RT-PCR
产物在250bp左右出现单克隆信号峰(图1C)。若在120bp-180bp之间出现单克隆信
号峰,说明基因组存在/KZHA4-7缺失,若在大于720bp位置出现矮小的GL信号峰,
说明该缺失为杂合缺失;若存在/KZHA4-7缺失,同时没有GL信号峰,说明该缺失
为纯合缺失(图1D)。
图1.Ikaros6的检测。(A)RT-PCR产物电泳结果•阳性对照为BV-173阴性对照为
无核酸去离子水,在255bp处出现目的条带为Ikaros6阳性;(B)RT-PCR产物测序分
析结果;(C)RT-PCR产物进行毛细管电泳分析结果,不同的信号峰代表Ikaros不同
的剪接变异体,x轴表示PCR产物大小经过仪器内部校正后的模拟信号,y轴表示荧
光信号的峰高。(D)毛细管电泳检测IKZF1M-1基因缺失,GL是质控内参。
在105例B-ALL患者中-37例患者检测到Ikaros6,阳性率为35.24%。根据2013
年NCCN指南分类•表达Ikaros6的患者主要分布在commonB-ALL亚型(24of37,
64.86%),5例患者分布在earlyprecursorB-ALL(5of37,13.51%),8例患者分布在
precursorB-ALL(8of37,21.62%)(表1)■统计学分析发现Ikaros6的分布与亚型分
类无统计学差异(尸=0.890)。
在74例T-ALL患者中16例检测到Ikaros6表达阳性率为21.62%■明显低于
其在B-ALL中的表达。Ikaros6主要分布在medullaryT-ALL亚型(8of16,50.00%)•
在corticalT-ALL亚型(4of16,25.00%)和precursorT-ALL亚型(4of16,25.00%)
的发生率比较低,而在pro-T-ALL亚型中没有检测到Ikaros6的表达。与58例Ikaros6
阴性患者(medullaryT-ALL的24.14%'corticalT-ALL的13.79%'precursorT-ALL
的34.48%和pro-T-ALL的27.59%的发生率)相比,Ikaros6表达与T-ALL亚型分类
存在显著的统计学相关性(尸=0.036)(表2)。
2.Ikaros6阳性患者临床特征
在37例Ikaros6阳性B-ALL患者中,22例为男性,15例为女性,性别之间无统
计学差异(P=0.353》Ikaros6阳性患者与阴性患者相比,外周血白细胞计数更高(中
位数:13.70X109/L比12.15X1()9/L-P=0.056);而乳酸脱氢酶水平相对较低(中位
数:369.00比564.50P=0.062),但统计学分析均无显著差异。另外,从年龄、血
红蛋白、血小板计数以及骨髓原始细胞比例等临床资料进行比较,发现Ikaros6阳性
组和阴性组之间均无统计学差异(表1)。
表1.在B-ALL中•Ikaros6与临床常规资料之间的关系
Ikaros6PositiveIkaros6Negative
Characteristic(n=37)(n=68)
No.%No.%P
Age,years0.793
Median3036
Range15—681567
Sex0.353
Male2259.463450.00
Female1540.543450.00
WBCcount,X109/L0.056
Median13.7012.15
Range1.17-522.000.87363.00
Hemoglobin,g/dL0.177
Median72.0075.70
Range32.80-122.0027.00140.00
Plateletcount,X109/L0.529
Median33.0037.50
Range3.00-252.002.20-279.00
LDH,U/L0.062
Median369564.50
Range40.001892.0032.00-3768.00
Missing1022
Bonemarrowblasts,%0.584
Median92.8092.50
Range32.49-99.5031.0099.20
Missing5
MajorALLsubtypes0.890
EarlyprecursorB-ALL513.511116.18
CommonB-ALL2464.86(4058.82
Precurso
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