药效团的构建PPT幻灯片.ppt

1、DS2.5的药效团为基础的药物设计方法和应用，乔东梅昌腾技术有限公司，演讲14:0开始，听声音的老师和同学请举手，1，Whatsthis in DS2.5.5和DS2.5Visualizer的使用方法DS2.5的药效团为基础的药物设计方法和生物聚合物交互3D)方法实际生物实验数据介绍和应用登录管理系统-BioRegistration Spotfire提高生物信息学的数据库和分析工具中使用的药物开发速度的方法Neo-CADD帮助实验者更快地设计和优化药物分子，2010年网络教育，信息请求方法： 药物组、-药物组概述、药物组模型、药物分子和受体靶标作用时，分子内的组对活性的影响徐璐不同。1909年

2、，保罗埃里希提出，活动所需的特性原子是指分子框架。1977年，Peter Gund提到，分子中的一组能够识别受体，并形成分子生物活性的结构特征。指在药物活性分子中对活动起重要作用的“药效特性因素”及其空间排列形式。包含将性质、结构和性质约束结合在一起的资讯，做为从资料库中撷取的问题。药效特性元素，氢键受体：氢键物质：疏水中心：只要没有电荷的原子或电负性也连接到中心，连续的碳原子群就可以形成疏水中心，电荷中心：受体和盐桥，或者形成强静电相互作用，芳环中心：形成-相互作用，Catalyst HIV-1整合酶抑制剂5HT再摄取抑制剂5-还原酶抑制剂MC细胞增殖抑制剂TGF受体激酶抑制剂41拮抗剂5-

3、HT7受体拮抗剂CYP17抑制剂CDK(Pfmrk)抑制剂鼻病毒coat蛋白抑制剂FPT抑制剂Catalyst(Catalyst) .药效团应用，-基于配体的弱体模型，pharmacophoes，16 compounds (training set)，may bridge，scaffold 160677 compounds 可以构建自己的化合物库，还可以构建其他化合物库CNPD、ACD等DS中包含的化合物库、数据库、化合物活性相关药效团特性查找构建的药效团模型，具有活性预测功能，训练集分子的要求，分子结构为多样性活性分子的活性值至少每4个水平的活性数量为3个，共18-25个。抗活性水平很小的化

4、合物结构相似的化合物之间活性差至少一个等级，类似化合物之间的结构不同，需要建立包含Activ和Uncert特性、具有活性预测能力的药效团，3d-QSAR pharmacophore generation，hypo gen，实例分析2(试点化合物优化)，training 6个左右比较理想仅选择活性分子包括Principal和MaxOmitFeat特性的方法摘要发现化合物组的共同功效特性不需要SAR的信息使用活性化合物作为输入结构返回共同功效特性集结果作用器根据评分排序可以同时处理多个分子各种形式的分子(* *) CPD，*。mole2，*。mmod)，基于特性结构创建药效团，common fea

5、ture pharmacophone generation，hiphop (quanlitative)，实例分析3，qualitative，searchD in the Excl Volume！active，inactive，排除体积，28，HypoGen and HipHop，-基于受体的药动段模型，pharmacophores，药动段模型：基于受体结构的药动学应用，药动段模型：最终搜索结果显示，活性分子的份额比传统的Docking方法提高了25倍。DS Catalyst SBP结果，32，Ligand Profiler，pharmacoredb hypo db，hypo db:疗效组数据库

6、，1846个药效团模型，分类为187个独立目标在830个复合体中产生900多个药效团并逐渐增加的情况下，根据药理学的特点，分为15个类别User Pharmacophore Database，可以添加用户直接(基于结构或配体)生成的药效团，出现了PDE5 (phosphodiesterase 5)抑制剂，是男性勃起功能障碍的治疗剂、案例分析、旧药物新使用、反向目标查找、副作用预测、Compound:5个PDE5抑制剂PCDB:与INFLAMMATION相关的药效团模型-1 xos: pde4b和SILDENAFIL (sildenafil，whatsthis in DS2.5.5和DS2.5Visualizer的使用方法DS2.5中基于药效团的药物设计方法和应用生物聚合物相互作用的识别工具，以及在生命科学和药物设计中的应用(蛋白质-DNA相互作用；抗原-抗体相互作用；DNA-DNA相互作用；多肽药物设计)DS 2.5中的QSAR(2D、3D)方法实际生物实验数据介绍和应用登录管理系统-bio registration spotlfire可以加快生物信息学数据库和分析工具中药物开发的速度Neo-CADD可以帮助实验者更快地设计和优化药物分子，2010 上海Seminar将于7月(北京、上